Primary Headwater Stream Analyses
Nathan Byer
2022-10-28
Reading in data
phwh<-read.csv("PHWH_postgresexport.csv",header=T,na.strings=c("","NA"))creating summary files for downstream analysis
sitechecks<-data.frame(phwh$stream_name,phwh$date)
colnames(sitechecks)<-c("stream_names","date")
sitechecks$date<- as.Date(sitechecks$date , format = "%Y/%m/%d")
sitechecks$datecount<-as.numeric(sitechecks$date-min(sitechecks$date)+1)
sitechecks_surveyhistory<-sitechecks %>%
group_by(stream_names) %>%
mutate(check=as.character(dense_rank(date))) %>%
arrange(stream_names) %>%
distinct(stream_names, datecount, .keep_all = TRUE) %>%
spread(check,datecount) %>%
summarise(`1` = mean(`1`,na.rm=T),
`2`=mean(`2`,na.rm=T),
`3`=mean(`3`,na.rm=T),
`4`=mean(`4`,na.rm=T),
`5`=mean(`5`,na.rm=T),
`6`=mean(`6`,na.rm=T),
`7`=mean(`7`,na.rm=T),
`8`=mean(`8`,na.rm=T),
`9` = mean(`9`,na.rm=T),
`10`=mean(`10`,na.rm=T),
`11`=mean(`11`,na.rm=T),
`12`=mean(`12`,na.rm=T),
`13`=mean(`13`,na.rm=T),
`14`=mean(`14`,na.rm=T),
`15`=mean(`15`,na.rm=T),
`16`=mean(`16`,na.rm=T))
phwh_subset<-phwh %>%
dplyr::select(stream_name,reservation,river_basin,latitude,longitude,date,substrate_metric_total,percent_best_types,per_boulder_slabs,per_boulder_256mm,per_bedrock,per_cobble,per_gravel,per_sand,per_silt,per_leaf_woody,per_detritus,per_clay_hardpan,per_muck,per_artificial,pool_metric_total,pool_depth_.cm.,bankfull_metric_total,average_bankfull_.m.,sinuosity,base_flow,date_last_rain,amt_last_rain,X._canopy_open,temp,dissolved_oxygen_mgl,ph,conductivity,fish_observed,fish_time_collecting_minutes,frogs_tadpoles_observed,salamanders_observed,salamander_time_collecting_minutes,aquatic_macros_observed,macro_time_collecting_minutes,mountain_dusky_larvae,mountain_dusky_juveniles,mountain_dusky_adults,northern_dusky_larvae,northern_dusky_juveniles,northern_dusky_adults,two_lined_larvae,two_lined_juveniles,two_lined_adults,long_tailed_larvae,long_tailed_juveniles,long_tailed_adults,northern_red_larvae,northern_red_juveniles,northern_red_adults,mole_larvae,mole_juveniles,mole_adults,four_toed_larvae,four_toed_juveniles,four_toed_adults,red_backed_juveniles,red_backed_adults,slimy_juveniles,slimy_adults,blacknose_dace,bluegill_sunfish,bluntnose_minnow,brindled_madtom,brook_stickleback,brook_trout,central_mudminnow,central_stoneroller_minnow,common_shiner,creek_chub,eastern_sand_darter,fantail_darter,fathead_minnow,golden_shiner,goldfish,grass_pickerel,greenside_darter,green_sunfish,johnny_darter,largemouth_bass,longear_sunfish,longnose_dace,mottled_sculpin,northern_hog_sucker,pumpkinseed_sunfish,rainbow_darter,rainbow_trout,redbelly_dace,redside_dace,river_chub,silverjaw_minnow,smallmouth_bass,spotfin_shiner,stonecat_madtom,striped_shiner,trout_perch,warmouth_sunfish,white_sucker,yellow_bullhead_catfish,unidentified_fish_fry,sessile_animals,aquatic_worms,sow_bugs,scuds,water_mites,damselfly_nymphs,alderfly_larvae,other_beetles,crayfish,dragonfly_nymphs,riffle_beetles,other_flies,midges,snails,clams,fishfly_larvae,water_penny_beetles,cranefly_larvae,ameletidae,arthropleidae,baetidae,baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,pseudironidae,siphlonuridae,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae,brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae,total_mayfly,total_stonefly,total_caddisfly,total_ept,hhei_score,hmfei_score,hmfei_narrative) %>% distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_abiotic<- phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,substrate_metric_total,percent_best_types,per_boulder_slabs,per_boulder_256mm,per_bedrock,per_cobble,per_gravel,per_sand,per_silt,per_leaf_woody,per_detritus,per_clay_hardpan,per_muck,per_artificial,pool_metric_total,pool_depth_.cm.,bankfull_metric_total,average_bankfull_.m.,sinuosity,base_flow,date_last_rain,amt_last_rain,X._canopy_open,temp,dissolved_oxygen_mgl,ph,conductivity) %>% distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_salamander<- phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,mountain_dusky_larvae,mountain_dusky_juveniles,mountain_dusky_adults,northern_dusky_larvae,northern_dusky_juveniles,northern_dusky_adults,two_lined_larvae,two_lined_juveniles,two_lined_adults,long_tailed_larvae,long_tailed_juveniles,long_tailed_adults,northern_red_larvae,northern_red_juveniles,northern_red_adults,mole_larvae,mole_juveniles,mole_adults,four_toed_larvae,four_toed_juveniles,four_toed_adults,red_backed_juveniles,red_backed_adults,slimy_juveniles,slimy_adults) %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_fish<- phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,blacknose_dace,bluegill_sunfish,bluntnose_minnow,brindled_madtom,brook_stickleback,brook_trout,central_mudminnow,central_stoneroller_minnow,common_shiner,creek_chub,eastern_sand_darter,fantail_darter,fathead_minnow,golden_shiner,goldfish,grass_pickerel,greenside_darter,green_sunfish,johnny_darter,largemouth_bass,longear_sunfish,longnose_dace,mottled_sculpin,northern_hog_sucker,pumpkinseed_sunfish,rainbow_darter,rainbow_trout,redbelly_dace,redside_dace,river_chub,silverjaw_minnow,smallmouth_bass,spotfin_shiner,stonecat_madtom,striped_shiner,trout_perch,warmouth_sunfish,white_sucker,yellow_bullhead_catfish,unidentified_fish_fry) %>%
replace(is.na(.),0) %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE) %>% dplyr::select(-stream_name,-date)
phwh_fish<-sapply(phwh_fish,as.numeric)
phwh_macro<- phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,sessile_animals,aquatic_worms,sow_bugs,scuds,water_mites,damselfly_nymphs,alderfly_larvae,other_beetles,crayfish,dragonfly_nymphs,riffle_beetles,other_flies,midges,snails,clams,fishfly_larvae,water_penny_beetles,cranefly_larvae,total_mayfly,total_stonefly,total_caddisfly) %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
replace(.=="rare", 1) %>% distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE) %>% dplyr::select(-stream_name,-date)
phwh_macro<-sapply(phwh_macro,as.numeric)
phwh_ept<-phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,ameletidae,arthropleidae,baetidae,baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,pseudironidae,siphlonuridae,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae,brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae) %>%
replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_e<-phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,ameletidae,arthropleidae,baetidae,baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,pseudironidae,siphlonuridae) %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_p<-phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae) %>%
replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_t<-phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae) %>%
replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
fish_sum<-phwh_subset$fish_observed
sala_sum<-phwh_subset$salamanders_observed
macro_sum<-phwh_subset$aquatic_macros_observed
frog_sum<-phwh_subset$frogs_tadpoles_observed
total_ept<-phwh_subset$total_ept
hhei<-phwh_subset$hhei_score
hmfei<-phwh_subset$hmfei_score
score<-phwh_subset$hmfei_narrative
reservation<-phwh_subset$reservation
stream_name<-phwh$stream_name
watershed<-phwh$watershed
reservationsum<-phwh_subset %>%
distinct(stream_name, .keep_all = TRUE) %>%
dplyr::select(stream_name,reservation) %>%
arrange(., stream_name)
reservationsum<-na.omit(reservationsum)
reservationcol<-as.numeric(factor(reservationsum$reservation))
scoresum<-phwh_subset %>%
distinct(stream_name, .keep_all = TRUE) %>%
dplyr::select(stream_name,hmfei_narrative) %>%
arrange(., stream_name)
scoresum<-na.omit(scoresum)
scorecol<-as.numeric(factor(scoresum$hmfei_narrative))
streambiotic<-cbind(phwh_salamander,phwh_fish,phwh_macro)
streambioticsum<-streambiotic %>%
group_by(stream_name) %>%
dplyr::select(!date) %>%
summarise_all(list(sum))
streambiotic_nosite<-streambioticsum[-1,-1] %>%
select_if(colSums(.) != 0)
taxatype<-c(rep("salamander",19),rep("fish",20),rep("macro",21))which sites are surveyed sufficiently?
sitechecks_surveyhistory_rename<-sitechecks_surveyhistory %>% rename(stream_name=stream_names)
sitechecks_surveyhistory_res<-merge(sitechecks_surveyhistory_rename,reservationsum,by="stream_name")
sitechecks_surveyhistory_ressum<-sitechecks_surveyhistory_res %>%
group_by(reservation)
greenlightsites<-read.csv("PHWH_greenlightsites.csv")
sitechecks_surveyhistory_res_suff<-sitechecks_surveyhistory_res[sitechecks_surveyhistory_res$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam , ]
phwh_subset_suff<-phwh_subset[phwh_subset$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam ,]just salamanders
class(phwh_subset_suff$stream_name)<-"character"
phwh_subset_suff_env_detecthistory<-phwh_subset_suff %>%
dplyr::select(stream_name,reservation,river_basin,latitude,longitude,date,substrate_metric_total,percent_best_types,per_boulder_slabs,per_boulder_256mm,
per_bedrock,per_cobble,per_gravel,per_sand,per_silt,per_leaf_woody,per_detritus,per_clay_hardpan,per_muck,per_artificial,pool_metric_total,
pool_depth_.cm.,bankfull_metric_total,average_bankfull_.m.,sinuosity,X._canopy_open,temp,
dissolved_oxygen_mgl,ph,conductivity,hmfei_narrative) %>%
group_by(stream_name, reservation,date)
phwh_salamander_suff<-phwh_salamander[phwh_salamander$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam ,]
phwh_salamander_suff_detecthistory<-phwh_salamander_suff %>%
group_by(stream_name, date)
mtdusky<-phwh_salamander_suff_detecthistory$mountain_dusky_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$mountain_dusky_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$mountain_dusky_adults
nodusky<-phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_dusky_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_dusky_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_dusky_adults
twolined<-phwh_salamander_suff_detecthistory$two_lined_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$two_lined_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$two_lined_adults
longtail<-phwh_salamander_suff_detecthistory$long_tailed_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$long_tailed_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$long_tailed_adults
red<-phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_red_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_red_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_red_adults
mole<-phwh_salamander_suff_detecthistory$mole_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$mole_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$mole_adults
fourtoed<-phwh_salamander_suff_detecthistory$four_toed_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$four_toed_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$four_toed_adults
redback<-phwh_salamander_suff_detecthistory$red_backed_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$red_backed_adults
slimy<-phwh_salamander_suff_detecthistory$slimy_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$slimy_adults
stream_name<-phwh_salamander_suff_detecthistory$stream_name
date<-phwh_salamander_suff_detecthistory$date
phwh_salamander_suff_sum<-data.frame(stream_name,date,
mtdusky,nodusky,twolined,longtail,red,
mole,fourtoed,redback,slimy)
sitechecks<-phwh_salamander_suff_sum[,c(1,2)]
sitechecks$date<- as.Date(sitechecks$date , format = "%Y/%m/%d")
sitechecks$dayofyear<-format(sitechecks$date, "%j")
sitechecks$datecount<-as.numeric(sitechecks$date-min(sitechecks$date)+1)
sitechecks_surveyhistory<-sitechecks %>%
group_by(stream_name) %>%
mutate(check=as.character(dense_rank(date))) %>%
arrange(stream_name) %>%
distinct(stream_name, datecount, .keep_all = TRUE) %>%
spread(check,datecount) %>%
summarise(`1` = mean(`1`,na.rm=T),
`2`=mean(`2`,na.rm=T),
`3`=mean(`3`,na.rm=T),
`4`=mean(`4`,na.rm=T),
`5`=mean(`5`,na.rm=T),
`6`=mean(`6`,na.rm=T),
`7`=mean(`7`,na.rm=T),
`8`=mean(`8`,na.rm=T),
`9` = mean(`9`,na.rm=T),
`10`=mean(`10`,na.rm=T),
`11`=mean(`11`,na.rm=T),
`12`=mean(`12`,na.rm=T),
`13`=mean(`13`,na.rm=T),
`14`=mean(`14`,na.rm=T),
`15`=mean(`15`,na.rm=T),
`16`=mean(`16`,na.rm=T))all taxa
phwh_subset_biotic<-phwh %>%
dplyr::select(stream_name,date,mountain_dusky_larvae,mountain_dusky_juveniles,
mountain_dusky_adults,northern_dusky_larvae,northern_dusky_juveniles,northern_dusky_adults,two_lined_larvae,two_lined_juveniles,
two_lined_adults,long_tailed_larvae,long_tailed_juveniles,long_tailed_adults,northern_red_larvae,northern_red_juveniles,northern_red_adults,
mole_larvae,mole_juveniles,mole_adults,four_toed_larvae,four_toed_juveniles,four_toed_adults,red_backed_juveniles,red_backed_adults,
slimy_juveniles,slimy_adults,blacknose_dace,bluegill_sunfish,bluntnose_minnow,brindled_madtom,brook_stickleback,brook_trout,
central_mudminnow,central_stoneroller_minnow,common_shiner,creek_chub,eastern_sand_darter,fantail_darter,fathead_minnow,golden_shiner,
goldfish,grass_pickerel,greenside_darter,green_sunfish,johnny_darter,largemouth_bass,longear_sunfish,longnose_dace,mottled_sculpin,
northern_hog_sucker,pumpkinseed_sunfish,rainbow_darter,rainbow_trout,redbelly_dace,redside_dace,river_chub,silverjaw_minnow,smallmouth_bass,
spotfin_shiner,stonecat_madtom,striped_shiner,trout_perch,warmouth_sunfish,white_sucker,yellow_bullhead_catfish,unidentified_fish_fry,
sessile_animals,aquatic_worms,sow_bugs,scuds,water_mites,damselfly_nymphs,alderfly_larvae,other_beetles,crayfish,dragonfly_nymphs,
riffle_beetles,other_flies,midges,snails,clams,fishfly_larvae,water_penny_beetles,cranefly_larvae,ameletidae,arthropleidae,baetidae,
baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,
pseudironidae,siphlonuridae,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae,
brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,
limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_subset_biotic_2<-phwh_subset_biotic %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE) %>% dplyr::select(-stream_name,-date)
phwh_subset_biotic_3<-data.frame(sapply(phwh_subset_biotic_2,as.numeric))
phwh_subset_biotic_3$stream_name<-phwh_subset_biotic$stream_name
phwh_subset_biotic_3$date<-phwh_subset_biotic$date
streambiotic<-phwh_subset_biotic_3
streambioticsum<-streambiotic %>%
group_by(stream_name) %>%
dplyr::select(!date) %>%
summarise_all(list(sum))
streambioticsum_suff <-streambioticsum[streambioticsum$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam , ]
streambioticsum_suff_mtdusky<-streambioticsum_suff$mountain_dusky_larvae+
streambioticsum_suff$mountain_dusky_juveniles+
streambioticsum_suff$mountain_dusky_adults
streambioticsum_suff_nodusky<-streambioticsum_suff$northern_dusky_larvae+
streambioticsum_suff$northern_dusky_juveniles+
streambioticsum_suff$northern_dusky_adults
streambioticsum_suff_twolined<-streambioticsum_suff$two_lined_larvae+
streambioticsum_suff$two_lined_juveniles+
streambioticsum_suff$two_lined_adults
streambioticsum_suff_longtail<-streambioticsum_suff$long_tailed_larvae+
streambioticsum_suff$long_tailed_juveniles+
streambioticsum_suff$long_tailed_adults
streambioticsum_suff_red<-streambioticsum_suff$northern_red_larvae+
streambioticsum_suff$northern_red_juveniles+
streambioticsum_suff$northern_red_adults
streambioticsum_suff_mole<-streambioticsum_suff$mole_larvae+
streambioticsum_suff$mole_juveniles+
streambioticsum_suff$mole_adults
streambioticsum_suff_fourtoed<-streambioticsum_suff$four_toed_larvae+
streambioticsum_suff$four_toed_juveniles+
streambioticsum_suff$four_toed_adults
streambioticsum_suff_redback<-streambioticsum_suff$red_backed_juveniles+
streambioticsum_suff$red_backed_adults
streambioticsum_suff_slimy<-streambioticsum_suff$slimy_juveniles+
streambioticsum_suff$slimy_adults
streambioticsum_suff_sal<-data.frame(streambioticsum_suff_mtdusky,streambioticsum_suff_nodusky,streambioticsum_suff_twolined,
streambioticsum_suff_longtail,streambioticsum_suff_red,streambioticsum_suff_mole,
streambioticsum_suff_fourtoed,streambioticsum_suff_redback,streambioticsum_suff_slimy)
streambioticsum_suff_fish<-streambioticsum_suff[,27:65]
streambioticsum_suff_macro<-streambioticsum_suff[,67:126]
streambioticsum_suff_biotic<-data.frame(streambioticsum_suff_sal,streambioticsum_suff_fish,streambioticsum_suff_macro)
streambioticsum_suff_biotic_bin<- streambioticsum_suff_biotic %>% mutate_if(is.numeric, ~1 * (. >= 1))make new dataset for occupancy
streambiotic_suff<-phwh_subset_biotic_3[phwh_subset_biotic_3$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam , ]
streambiotic_suff_mtdusky<-streambiotic_suff$mountain_dusky_larvae+
streambiotic_suff$mountain_dusky_juveniles+
streambiotic_suff$mountain_dusky_adults
streambiotic_suff_nodusky<-streambiotic_suff$northern_dusky_larvae+
streambiotic_suff$northern_dusky_juveniles+
streambiotic_suff$northern_dusky_adults
streambiotic_suff_twolined<-streambiotic_suff$two_lined_larvae+
streambiotic_suff$two_lined_juveniles+
streambiotic_suff$two_lined_adults
streambiotic_suff_longtail<-streambiotic_suff$long_tailed_larvae+
streambiotic_suff$long_tailed_juveniles+
streambiotic_suff$long_tailed_adults
streambiotic_suff_red<-streambiotic_suff$northern_red_larvae+
streambiotic_suff$northern_red_juveniles+
streambiotic_suff$northern_red_adults
streambiotic_suff_mole<-streambiotic_suff$mole_larvae+
streambiotic_suff$mole_juveniles+
streambiotic_suff$mole_adults
streambiotic_suff_fourtoed<-streambiotic_suff$four_toed_larvae+
streambiotic_suff$four_toed_juveniles+
streambiotic_suff$four_toed_adults
streambiotic_suff_redback<-streambiotic_suff$red_backed_juveniles+
streambiotic_suff$red_backed_adults
streambiotic_suff_slimy<-streambiotic_suff$slimy_juveniles+
streambiotic_suff$slimy_adults
streambiotic_suff_sal<-data.frame(streambiotic_suff_mtdusky,streambiotic_suff_nodusky,streambiotic_suff_twolined,
streambiotic_suff_longtail,streambiotic_suff_red,streambiotic_suff_mole,
streambiotic_suff_fourtoed,streambiotic_suff_redback,streambiotic_suff_slimy)
streambiotic_suff_fish<-streambiotic_suff[,26:64]
streambiotic_suff_macro<-streambiotic_suff[,66:125]
streambiotic_suff_biotic<-data.frame(streambiotic_suff_sal,streambiotic_suff_fish,streambiotic_suff_macro)
streambiotic_suff_biotic_bin<- streambiotic_suff_biotic %>% mutate_if(is.numeric, ~1 * (. >= 1))
phwh_alltax_suff_env_detecthistory<-cbind(phwh_subset_suff_env_detecthistory,streambiotic_suff_biotic_bin)
phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date<- as.Date(phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date , format = "%Y/%m/%d")
phwh_alltax_suff_env_detecthistory$datecount<-as.numeric(phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date-min(phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date)+1)
phwh_alltax_suff_env_detecthistory$dayofyear<-format(phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date, "%j")
phwh_alltax_suff_env_detecthistory<-phwh_alltax_suff_env_detecthistory %>%
dplyr::select(!c(latitude,longitude))
phwh_alltax_suff_env_detecthistory_firstcheck<- phwh_alltax_suff_env_detecthistory %>% group_by(stream_name) %>%
arrange(datecount) %>%
summarise_all(funs(list(.[1]))) %>%
unnest(cols = c(reservation, river_basin, date, substrate_metric_total, percent_best_types,
per_boulder_slabs, per_boulder_256mm, per_bedrock, per_cobble,
per_gravel, per_sand, per_silt, per_leaf_woody, per_detritus,
per_clay_hardpan, per_muck, per_artificial, pool_metric_total,
pool_depth_.cm., bankfull_metric_total, average_bankfull_.m.,
sinuosity, X._canopy_open, temp, dissolved_oxygen_mgl, ph,
conductivity, hmfei_narrative, streambiotic_suff_mtdusky,
streambiotic_suff_nodusky, streambiotic_suff_twolined, streambiotic_suff_longtail,
streambiotic_suff_red, streambiotic_suff_mole, streambiotic_suff_fourtoed,
streambiotic_suff_redback, streambiotic_suff_slimy, blacknose_dace,
bluegill_sunfish, bluntnose_minnow, brindled_madtom, brook_stickleback,
brook_trout, central_mudminnow, central_stoneroller_minnow,
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phwhall_occobject$occ.covs## substrate_metric_total percent_best_types per_boulder_slabs per_boulder_256mm per_bedrock per_cobble per_gravel per_sand per_silt per_leaf_woody per_detritus per_clay_hardpan per_muck per_artificial pool_metric_total pool_depth_.cm. bankfull_metric_total average_bankfull_.m. X._canopy_open
## [1,] 22.33333 9.000000 0.0000000 1.6666667 0.0000000 7.3333333 45.000000 30.666667 0.6666667 5.0000000 0.6666667 7.3333333 0.0000000 1.6666667 20.000000 51.066667 30.000000 5.243333 33.00000
## [2,] 27.50000 42.000000 0.0000000 2.0000000 35.5000000 4.5000000 29.000000 20.000000 1.0000000 5.5000000 0.0000000 2.5000000 0.0000000 0.0000000 27.500000 18.100000 17.500000 1.480000 15.50000
## [3,] 25.00000 36.000000 0.3333333 7.0000000 19.6666667 9.0000000 33.333333 13.000000 10.3333333 5.0000000 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.6666667 23.333333 36.800000 26.666667 3.753333 21.66667
## [4,] 21.33333 19.333333 2.3333333 5.0000000 0.0000000 12.0000000 40.000000 20.000000 2.6666667 2.0000000 0.0000000 9.0000000 1.0000000 6.0000000 23.333333 46.200000 28.333333 5.043333 21.33333
## [5,] 32.33333 66.333333 0.0000000 14.0000000 47.6666667 4.6666667 17.333333 9.000000 2.6666667 3.0000000 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.0000000 25.000000 14.066667 20.000000 1.993333 14.33333
## [6,] 22.50000 10.500000 0.0000000 0.5000000 0.0000000 10.0000000 36.000000 22.500000 3.5000000 10.0000000 1.5000000 15.5000000 0.5000000 0.0000000 20.000000 40.850000 22.500000 2.850000 22.00000
## [7,] 18.00000 7.000000 0.0000000 3.6666667 0.6666667 2.6666667 15.333333 26.666667 23.3333333 2.0000000 0.3333333 17.6666667 7.0000000 0.0000000 20.000000 15.333333 25.000000 3.446667 17.00000
## [8,] 28.00000 24.666667 0.0000000 8.0000000 10.0000000 6.6666667 31.666667 20.000000 4.6666667 5.6666667 0.0000000 13.3333333 0.0000000 0.0000000 23.333333 17.000000 18.333333 1.566667 15.66667
## [9,] 23.53333 14.000000 0.0000000 1.6666667 3.2000000 9.8666667 44.266667 23.600000 1.7333333 6.6000000 0.4666667 5.9333333 0.6666667 0.0000000 23.666667 30.040000 27.666667 4.108000 18.73333
## [10,] 21.68750 11.312500 0.0312500 1.2187500 0.0000000 10.0625000 36.937500 27.187500 5.4062500 3.5312500 0.6875000 14.0625000 0.8750000 0.0000000 23.125000 32.393750 27.187500 4.171875 22.56250
## [11,] 21.50000 15.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 15.0000000 42.500000 26.000000 1.5000000 2.5000000 0.5000000 12.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 47.750000 22.500000 2.680000 18.00000
## [12,] 30.33333 47.000000 2.6666667 2.0000000 20.0000000 22.3333333 33.666667 13.000000 1.0000000 3.3333333 0.0000000 2.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 33.866667 26.666667 3.966667 26.00000
## [13,] 22.66667 29.666667 4.0000000 3.3333333 3.6666667 18.6666667 36.666667 10.000000 5.0000000 6.0000000 0.0000000 12.6666667 0.0000000 0.0000000 26.666667 18.166667 20.000000 1.743333 17.00000
## [14,] 36.00000 65.000000 14.2500000 3.2500000 23.0000000 24.5000000 16.750000 8.750000 2.5000000 5.5000000 0.0000000 1.5000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 25.200000 21.250000 2.575000 25.75000
## [15,] 23.33333 23.666667 1.0000000 3.3333333 0.0000000 19.3333333 27.333333 19.333333 6.3333333 8.6666667 0.0000000 14.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 37.833333 23.333333 2.866667 21.66667
## [16,] 15.00000 7.000000 0.3333333 0.6666667 0.0000000 6.0000000 14.666667 12.333333 9.6666667 4.6666667 0.0000000 51.6666667 0.0000000 0.0000000 16.666667 11.233333 20.000000 2.086667 21.33333
## [17,] 28.50000 45.750000 4.2500000 3.0000000 17.0000000 21.5000000 24.250000 10.750000 7.2500000 5.0000000 0.0000000 6.5000000 0.5000000 0.0000000 21.250000 27.825000 26.250000 4.090000 15.25000
## [18,] 32.33333 51.333333 10.3333333 3.3333333 17.3333333 20.3333333 31.000000 11.000000 3.3333333 2.6666667 0.0000000 0.6666667 0.0000000 0.0000000 23.333333 19.133333 25.000000 3.500000 14.50000
## [19,] 27.00000 33.500000 5.0000000 1.3333333 4.8333333 22.3333333 41.333333 15.333333 3.3333333 2.3333333 0.0000000 4.1666667 0.0000000 0.0000000 23.333333 28.433333 25.000000 3.293333 18.66667
## [20,] 27.00000 31.666667 6.3333333 1.0000000 6.6666667 17.6666667 41.666667 15.333333 2.3333333 3.3333333 0.3333333 5.3333333 0.0000000 0.0000000 23.333333 32.033333 20.000000 2.623333 16.00000
## [21,] 18.75000 0.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 30.000000 43.750000 11.0000000 4.2500000 0.2500000 10.7500000 0.0000000 0.0000000 22.500000 34.500000 18.750000 1.970000 41.25000
## [22,] 33.66667 66.333333 10.3333333 4.3333333 37.6666667 14.0000000 19.666667 7.333333 2.6666667 2.3333333 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.0000000 21.666667 15.300000 20.000000 2.466667 13.33333
## [23,] 20.66667 19.000000 1.0000000 3.0000000 7.6666667 7.3333333 38.666667 22.666667 4.6666667 2.0000000 0.0000000 12.6666667 0.3333333 0.0000000 28.333333 23.300000 23.333333 3.663333 17.33333
## [24,] 22.00000 14.500000 0.0000000 0.7500000 0.0000000 13.7500000 32.750000 23.750000 10.0000000 3.5000000 0.0000000 15.2500000 0.2500000 0.0000000 22.500000 50.275000 22.500000 3.212500 22.00000
## [25,] 24.00000 10.000000 0.0000000 1.3333333 0.0000000 8.6666667 41.666667 26.666667 2.6666667 6.0000000 0.0000000 13.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 69.766667 25.000000 3.453333 18.00000
## [26,] 33.00000 55.333333 1.6666667 2.6666667 38.6666667 12.3333333 35.666667 7.000000 0.6666667 1.3333333 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 23.333333 24.533333 26.666667 4.796667 28.66667
## [27,] 28.00000 37.666667 1.0000000 4.0000000 18.0000000 14.6666667 43.333333 14.000000 1.0000000 1.6666667 0.0000000 2.3333333 0.0000000 0.0000000 23.333333 59.133333 23.333333 3.243333 26.00000
## [28,] 21.33333 5.333333 0.0000000 0.3333333 0.0000000 5.0000000 45.000000 31.666667 6.6666667 3.6666667 0.0000000 7.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 38.966667 20.000000 2.370000 17.00000
## [29,] 15.00000 1.000000 0.0000000 0.3333333 0.0000000 0.6666667 20.000000 39.333333 8.3333333 3.0000000 0.6666667 26.6666667 1.0000000 0.0000000 18.333333 29.766667 18.333333 1.766667 18.00000
## [30,] 24.00000 24.000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 23.0000000 40.000000 22.000000 1.6666667 4.0000000 0.0000000 8.3333333 0.0000000 0.0000000 21.666667 28.100000 21.666667 2.670000 48.33333
## [31,] 19.00000 13.250000 0.0000000 1.2500000 0.0000000 12.0000000 45.000000 18.000000 1.2500000 1.5000000 0.0000000 21.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 35.700000 20.000000 2.350000 17.50000
## [32,] 27.33333 36.000000 1.3333333 3.6666667 16.6666667 14.3333333 36.333333 18.666667 2.3333333 5.0000000 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.0000000 21.666667 10.300000 18.333333 1.866667 23.00000
## [33,] 22.33333 14.333333 0.0000000 7.0000000 0.0000000 7.3333333 38.333333 26.666667 3.0000000 4.6666667 0.3333333 9.3333333 0.0000000 0.0000000 20.000000 40.000000 20.000000 2.336667 17.66667
## [34,] 18.33333 5.000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 4.0000000 26.666667 29.000000 4.6666667 7.6666667 0.0000000 27.0000000 0.0000000 0.0000000 26.666667 18.933333 18.333333 1.836667 28.00000
## [35,] 21.00000 17.333333 0.3333333 5.6666667 0.0000000 11.3333333 43.333333 21.000000 2.6666667 2.6666667 0.3333333 11.6666667 1.0000000 0.0000000 23.333333 40.266667 20.000000 2.493333 21.33333
## [36,] 20.66667 15.000000 0.3333333 6.3333333 0.0000000 8.3333333 31.333333 24.333333 4.3333333 7.0000000 1.6666667 15.3333333 1.0000000 0.0000000 25.000000 14.133333 18.333333 1.646667 18.33333
## [37,] 21.50000 10.000000 0.0000000 3.7500000 0.0000000 6.2500000 32.000000 37.250000 5.7500000 4.5000000 0.0000000 10.5000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 27.875000 20.000000 2.305000 20.00000
## [38,] 20.00000 10.500000 0.0000000 1.5000000 0.0000000 9.0000000 40.666667 24.666667 2.0000000 4.0000000 0.1666667 18.0000000 0.0000000 0.0000000 23.333333 21.000000 20.000000 2.373333 18.66667
## [39,] 30.50000 60.625000 8.7500000 3.2500000 28.7500000 19.8750000 28.000000 7.000000 1.1250000 2.7500000 0.5000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 26.250000 23.925000 27.500000 3.920000 18.75000
## [40,] 31.25000 49.500000 4.7500000 6.2500000 23.5000000 15.0000000 33.250000 10.000000 2.8750000 2.8750000 0.1250000 1.3750000 0.0000000 0.0000000 26.250000 32.350000 28.750000 4.205000 17.75000
## [41,] 34.25000 75.750000 4.7500000 5.0000000 55.5000000 10.5000000 15.750000 4.750000 0.3750000 2.8750000 0.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 14.375000 22.500000 2.915000 17.75000
## [42,] 33.25000 56.000000 4.7500000 4.7500000 31.2500000 21.2500000 26.000000 6.250000 1.7500000 1.1250000 0.1250000 2.7500000 0.0000000 0.0000000 27.500000 22.975000 22.500000 2.872500 18.50000
## [43,] 25.40000 28.600000 0.0000000 4.0000000 0.0000000 24.6000000 40.600000 21.000000 1.6000000 3.4000000 0.2000000 4.6000000 0.0000000 0.0000000 22.000000 43.980000 27.000000 4.478000 34.80000
## [44,] 19.33333 18.333333 0.3333333 11.6666667 0.0000000 6.3333333 21.666667 35.000000 1.0000000 7.6666667 0.3333333 16.0000000 0.0000000 0.0000000 15.000000 8.300000 16.666667 1.390000 17.33333
## [45,] 19.00000 9.333333 0.0000000 5.0000000 0.0000000 4.3333333 21.000000 30.666667 3.3333333 5.3333333 0.0000000 30.3333333 0.0000000 0.0000000 26.666667 18.400000 8.333333 1.060000 19.66667
## [46,] 29.62500 45.875000 1.3750000 11.1250000 10.5000000 22.8750000 33.625000 14.000000 1.1875000 3.3125000 0.1250000 1.8125000 0.0625000 0.0000000 25.625000 22.300000 26.250000 4.570000 28.50000
## [47,] 38.14286 80.214286 0.0000000 9.0000000 66.2857143 4.9285714 5.571429 7.857143 2.2142857 3.0000000 0.4285714 0.1428571 0.5714286 0.0000000 25.000000 20.642857 24.285714 3.270000 20.00000
## [48,] 21.66667 18.666667 1.6666667 4.3333333 0.0000000 13.0000000 25.000000 36.666667 0.6666667 6.3333333 1.6666667 10.6666667 0.0000000 0.0000000 11.666667 4.526667 15.000000 1.273333 15.33333
## [49,] 19.33333 6.000000 0.0000000 2.5000000 0.0000000 3.5000000 29.000000 34.000000 1.3333333 3.6666667 1.0000000 25.0000000 0.0000000 0.0000000 18.333333 8.733333 15.000000 1.313333 24.66667
## [50,] 18.50000 9.250000 0.0000000 4.5000000 0.0000000 4.7500000 25.750000 27.500000 4.0000000 4.0000000 0.7500000 22.0000000 0.0000000 0.0000000 18.750000 24.975000 21.250000 2.467500 20.75000
## [51,] 19.66667 5.666667 0.0000000 1.3333333 0.0000000 4.3333333 25.666667 44.666667 3.3333333 3.3333333 2.3333333 15.0000000 0.0000000 0.0000000 21.666667 23.066667 20.000000 2.020000 17.66667
## [52,] 10.75000 4.000000 0.0000000 2.5000000 0.0000000 1.5250000 6.750000 23.875000 2.4750000 6.6250000 4.2500000 52.0000000 0.0000000 0.0000000 11.250000 6.300000 10.000000 1.107500 19.00000
## [53,] 15.00000 11.250000 0.7500000 3.7500000 0.0000000 6.7500000 10.500000 32.000000 1.7500000 6.2500000 2.7500000 35.5000000 0.0000000 0.0000000 8.750000 5.475000 12.500000 1.080000 17.75000
## [54,] 22.66667 28.000000 1.3333333 9.0000000 2.6666667 15.0000000 22.333333 42.333333 0.5000000 2.5000000 2.5000000 1.8333333 0.0000000 0.0000000 20.000000 13.233333 11.666667 1.226667 19.33333
## [55,] 22.33333 12.333333 0.1666667 0.5000000 0.0000000 11.6666667 41.000000 24.666667 2.0000000 4.3333333 0.6666667 14.6666667 0.3333333 0.0000000 20.000000 43.000000 28.333333 3.743333 21.00000
## [56,] 29.00000 47.666667 7.0000000 6.3333333 1.3333333 33.0000000 26.000000 16.000000 1.0000000 3.6666667 0.3333333 5.3333333 0.0000000 0.0000000 21.666667 30.900000 18.333333 1.420000 15.33333
## [57,] 26.33333 32.333333 1.3333333 4.0000000 13.6666667 13.3333333 19.000000 29.666667 3.3333333 6.3333333 2.6666667 6.6666667 0.0000000 0.0000000 11.666667 7.333333 13.333333 1.323333 20.33333
## [58,] 18.00000 8.666667 0.0000000 0.3333333 0.0000000 8.3333333 28.000000 21.666667 2.6666667 5.3333333 1.3333333 32.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 27.500000 18.333333 2.113333 43.33333
## [59,] 19.33333 2.666667 0.0000000 0.3333333 0.0000000 2.3333333 32.666667 32.666667 3.0000000 3.3333333 0.0000000 25.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 39.333333 21.666667 2.736667 19.33333
## [60,] 19.00000 6.300000 0.0000000 0.7000000 0.0000000 5.6000000 24.800000 44.800000 3.4000000 4.4000000 0.3000000 15.4000000 0.6000000 0.0000000 23.000000 20.840000 16.000000 1.740000 19.40000
## [61,] 22.66667 17.666667 0.6666667 4.3333333 0.0000000 12.6666667 30.000000 23.333333 5.0000000 5.0000000 1.6666667 17.3333333 0.0000000 0.0000000 15.000000 8.796667 18.333333 1.563333 17.66667
## [62,] 20.00000 2.666667 0.0000000 1.0000000 0.0000000 1.6666667 27.000000 27.666667 7.3333333 9.6666667 0.0000000 25.6666667 0.0000000 0.0000000 21.666667 10.800000 11.666667 1.026667 15.33333
## [63,] 20.33333 9.666667 0.0000000 0.6666667 0.0000000 9.0000000 29.666667 28.333333 5.0000000 2.0000000 0.3333333 22.6666667 2.3333333 0.0000000 23.333333 17.133333 16.666667 1.843333 16.33333
## [64,] 22.33333 4.666667 0.0000000 1.0000000 0.0000000 3.6666667 41.666667 28.333333 2.6666667 6.3333333 0.0000000 16.0000000 0.3333333 0.0000000 20.000000 34.166667 21.666667 3.076667 15.33333
## [65,] 20.66667 22.000000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 14.0000000 29.333333 30.000000 3.6666667 1.3333333 0.0000000 12.0000000 0.0000000 0.0000000 26.666667 18.233333 18.333333 1.690000 26.00000
## [66,] 19.50000 13.500000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 5.5000000 22.500000 25.000000 2.5000000 3.0000000 0.0000000 32.0000000 1.5000000 0.0000000 27.500000 23.150000 12.500000 1.240000 22.00000
## [67,] 22.33333 17.000000 0.0000000 7.6666667 0.0000000 9.3333333 30.333333 32.333333 5.3333333 4.0000000 1.0000000 10.0000000 0.0000000 0.0000000 18.333333 10.100000 18.333333 1.840000 16.00000
## [68,] 22.00000 17.333333 0.3333333 3.0000000 0.0000000 14.0000000 39.000000 31.000000 1.6666667 3.0000000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 42.733333 26.666667 3.540000 18.66667
## [69,] 22.33333 14.333333 0.6666667 2.3333333 0.0000000 11.3333333 43.333333 32.666667 1.3333333 2.6666667 0.0000000 5.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 17.733333 20.000000 2.300000 18.00000
## [70,] 23.00000 4.500000 0.0000000 1.5000000 0.0000000 3.0000000 38.000000 33.000000 4.0000000 9.0000000 2.5000000 8.5000000 0.5000000 0.0000000 20.000000 13.800000 15.000000 1.330000 17.00000
## [71,] 19.00000 2.500000 0.0000000 0.5000000 0.0000000 2.0000000 30.000000 32.500000 3.5000000 2.5000000 0.5000000 28.5000000 0.0000000 0.0000000 30.000000 28.450000 15.000000 1.335000 32.50000
## [72,] 17.50000 2.500000 0.0000000 0.5000000 0.0000000 2.0000000 24.500000 37.000000 2.0000000 4.0000000 0.5000000 29.5000000 0.0000000 0.0000000 27.500000 22.650000 17.500000 1.915000 36.50000
## [73,] 22.00000 12.000000 0.0000000 1.5000000 0.0000000 10.5000000 44.000000 28.000000 2.5000000 5.5000000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 52.800000 30.000000 5.950000 37.50000
## [74,] 21.33333 1.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 37.333333 33.000000 5.6666667 4.6666667 1.6666667 9.6666667 1.3333333 0.0000000 21.666667 31.666667 21.666667 2.933333 31.00000
## [75,] 31.66667 56.333333 0.0000000 1.6666667 43.0000000 11.6666667 28.333333 11.666667 0.6666667 3.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 13.800000 26.666667 4.233333 21.66667
## [76,] 22.66667 33.666667 0.0000000 4.0000000 15.6666667 14.0000000 28.333333 23.666667 2.6666667 8.3333333 0.0000000 3.3333333 0.0000000 0.0000000 20.000000 51.100000 28.333333 4.330000 19.00000
## [77,] 13.66667 1.000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 20.666667 15.000000 7.3333333 12.0000000 1.0000000 41.6666667 1.3333333 0.0000000 23.333333 14.466667 16.666667 1.346667 20.33333
## [78,] 24.50000 21.500000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 20.5000000 45.000000 22.500000 1.5000000 0.5000000 0.0000000 9.0000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 34.900000 15.000000 1.300000 56.50000
## [79,] 31.75000 67.750000 0.0000000 1.2500000 63.5000000 3.0000000 14.750000 11.250000 2.7500000 2.5000000 0.2500000 0.7500000 0.0000000 0.0000000 25.000000 18.175000 26.250000 3.812500 18.00000
## [80,] 23.00000 12.375000 0.0000000 1.1250000 3.2500000 8.0000000 41.250000 35.250000 1.2500000 4.3750000 0.5000000 5.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 31.225000 25.000000 3.317500 23.25000
## [81,] 21.66667 13.333333 0.3333333 0.3333333 0.0000000 12.6666667 46.333333 24.666667 1.6666667 3.0000000 0.0000000 11.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 17.700000 21.666667 2.933333 21.00000
## [82,] 31.66667 42.000000 1.3333333 3.0000000 22.6666667 15.0000000 35.333333 13.333333 1.3333333 5.3333333 0.3333333 2.3333333 0.0000000 0.0000000 30.000000 26.600000 25.000000 4.560000 22.00000
## [83,] 28.33333 52.666667 8.0000000 3.0000000 12.0000000 29.6666667 34.000000 11.333333 0.6666667 1.3333333 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 63.600000 30.000000 4.560000 34.00000
## [84,] 22.33333 14.666667 0.6666667 0.3333333 1.6666667 12.0000000 43.666667 25.000000 0.6666667 5.0000000 0.6666667 10.3333333 0.0000000 0.0000000 26.666667 21.033333 23.333333 3.053333 20.33333
## [85,] 34.66667 60.833333 0.0000000 0.8333333 56.6666667 3.3333333 19.000000 11.666667 1.1666667 2.8333333 0.1666667 4.3333333 0.0000000 0.0000000 11.666667 6.233333 18.333333 1.940000 16.66667
## [86,] 27.00000 44.875000 0.0000000 12.5000000 8.3750000 24.0000000 32.375000 13.625000 2.8750000 1.1250000 0.3750000 4.0000000 0.0000000 0.7500000 23.750000 31.437500 27.500000 4.882500 51.25000
## [87,] 23.00000 25.000000 0.6666667 3.0000000 13.0000000 8.3333333 45.000000 19.333333 1.3333333 4.0000000 1.0000000 4.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 14.800000 18.333333 2.013333 16.66667
## [88,] 21.66667 16.000000 0.0000000 1.3333333 0.0000000 14.6666667 37.333333 26.666667 3.6666667 2.6666667 0.0000000 13.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 50.200000 21.666667 2.653333 63.33333
## [89,] 21.66667 16.000000 0.0000000 2.0000000 0.0000000 14.0000000 40.000000 25.666667 3.3333333 1.3333333 0.6666667 13.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 44.533333 23.333333 2.983333 40.00000
## [90,] 26.33333 33.666667 4.0000000 3.6666667 0.0000000 26.0000000 40.333333 18.666667 3.6666667 1.0000000 0.3333333 2.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 17.733333 26.666667 3.853333 16.00000
## [91,] 28.50000 34.500000 2.5000000 5.5000000 0.7500000 25.7500000 41.250000 13.750000 2.5000000 2.0000000 0.2500000 5.5000000 0.2500000 0.0000000 20.000000 48.525000 27.500000 4.480000 36.25000
## [92,] 33.25000 71.500000 2.2500000 7.5000000 51.2500000 10.5000000 19.250000 5.500000 2.1250000 1.6250000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 26.250000 17.100000 26.250000 3.697500 20.75000
## [93,] 32.66667 61.000000 1.6666667 4.3333333 45.0000000 10.0000000 26.000000 6.666667 1.6666667 1.6666667 0.3333333 2.6666667 0.0000000 0.0000000 28.333333 19.566667 23.333333 3.073333 14.33333
## [94,] 24.33333 33.333333 2.3333333 9.0000000 0.0000000 22.0000000 37.000000 19.333333 1.3333333 2.5000000 0.1666667 6.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 24.466667 25.000000 3.220000 16.00000
## [95,] 32.25000 58.000000 6.2500000 2.5000000 37.2500000 9.7500000 26.000000 10.750000 2.5000000 4.2500000 0.7500000 0.0000000 0.0000000 0.2500000 28.750000 22.975000 26.250000 4.160000 21.25000
## [96,] 22.33333 5.000000 0.0000000 0.6666667 0.0000000 4.3333333 37.333333 30.000000 7.3333333 2.0000000 0.6666667 16.3333333 1.3333333 0.0000000 20.000000 54.233333 23.333333 3.600000 23.00000
## [97,] 18.00000 5.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 5.0000000 43.500000 22.500000 6.5000000 4.0000000 2.5000000 17.5000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 23.250000 20.000000 1.865000 19.50000
## [98,] 35.00000 79.000000 0.6666667 2.6666667 70.6666667 5.0000000 11.666667 5.000000 0.8333333 0.8333333 0.1666667 0.1666667 0.0000000 2.3333333 23.333333 28.300000 28.333333 5.533333 31.00000
## [99,] 29.33333 45.666667 0.0000000 2.6666667 36.0000000 7.0000000 36.333333 14.000000 1.1666667 0.8333333 0.1666667 0.1666667 0.0000000 1.6666667 26.666667 15.633333 18.333333 1.833333 43.33333
## [100,] 25.33333 29.666667 1.6666667 2.3333333 16.6666667 9.0000000 41.666667 17.333333 2.0000000 2.6666667 0.0000000 6.6666667 0.0000000 0.0000000 11.666667 12.333333 21.666667 2.553333 16.00000
## [101,] 25.00000 14.000000 0.0000000 0.6666667 5.3333333 10.0000000 50.000000 17.000000 4.0000000 4.0000000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 0.0000000 26.666667 20.666667 25.000000 3.520000 19.00000
## [102,] 20.66667 3.333333 0.0000000 1.6666667 0.0000000 1.6666667 36.000000 38.333333 3.3333333 2.6666667 1.3333333 15.0000000 0.0000000 0.0000000 23.333333 47.333333 25.000000 3.676667 53.33333
## [103,] 19.75000 3.250000 0.0000000 0.1250000 0.0000000 3.1250000 18.750000 63.250000 8.2500000 2.7500000 0.0000000 3.7500000 0.0000000 0.0000000 27.500000 20.000000 20.000000 2.047500 36.25000
## [104,] 27.00000 38.000000 3.3333333 5.0000000 1.3333333 26.6666667 35.000000 15.333333 4.0000000 2.0000000 2.0000000 7.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 40.666667 23.333333 2.910000 23.33333
## [105,] 25.33333 60.000000 2.3333333 4.3333333 39.3333333 14.0000000 27.666667 8.666667 2.3333333 3.6666667 0.3333333 0.0000000 0.0000000 0.0000000 28.333333 24.700000 21.666667 2.756667 25.33333
## [106,] 23.75000 15.000000 0.7500000 0.7500000 0.0000000 13.5000000 44.500000 21.250000 5.7500000 4.7500000 0.7500000 8.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 46.375000 21.250000 2.735000 28.75000
## [107,] 28.25000 47.750000 3.2500000 6.5000000 0.0000000 38.0000000 33.250000 10.000000 2.3750000 2.6250000 0.0000000 4.0000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 35.000000 30.000000 6.555000 28.75000
## [108,] 29.80000 50.800000 10.2000000 3.2000000 7.4000000 30.0000000 27.000000 13.200000 4.4000000 2.0000000 0.0000000 2.6000000 0.0000000 0.0000000 24.000000 21.920000 24.000000 3.198000 18.20000
## [109,] 20.66667 15.333333 0.0000000 0.0000000 0.0000000 15.3333333 41.666667 26.666667 3.6666667 3.3333333 0.0000000 9.3333333 0.0000000 0.0000000 23.000000 41.333333 21.666667 2.426667 21.66667
## [110,] 22.00000 11.666667 0.0000000 1.3333333 0.0000000 10.3333333 37.666667 37.666667 2.6666667 4.3333333 0.3333333 5.0000000 0.6666667 0.0000000 20.000000 47.266667 26.666667 3.636667 31.66667
## [111,] 23.33333 13.333333 0.0000000 0.3333333 0.0000000 13.0000000 41.000000 36.666667 1.0000000 2.6666667 0.0000000 4.6666667 0.6666667 0.0000000 28.333333 26.366667 23.333333 3.230000 21.66667
## [112,] 33.50000 73.250000 0.0000000 1.0000000 70.5000000 1.7500000 16.500000 8.500000 0.7500000 0.5000000 0.2500000 0.2500000 0.0000000 0.0000000 27.500000 21.000000 25.000000 3.530000 40.00000
## [113,] 15.33333 10.666667 0.0000000 3.3333333 0.3333333 7.0000000 23.333333 19.333333 4.0000000 10.6666667 0.6666667 31.3333333 0.0000000 0.0000000 6.666667 4.666667 16.666667 1.580000 20.00000
## [114,] 22.00000 13.666667 0.0000000 6.0000000 0.0000000 7.6666667 47.000000 20.333333 6.0000000 3.3333333 2.0000000 7.6666667 0.0000000 0.0000000 18.333333 13.100000 21.666667 2.226667 19.00000
## [115,] 22.00000 25.500000 0.0000000 12.0000000 0.0000000 13.5000000 29.000000 9.500000 1.0000000 7.0000000 0.5000000 27.5000000 0.0000000 0.0000000 15.000000 8.000000 25.000000 3.065000 18.00000
## [116,] 26.00000 37.500000 8.7500000 4.0000000 13.7500000 11.0000000 26.500000 14.000000 1.5000000 8.0000000 10.0000000 2.7500000 0.0000000 0.0000000 10.000000 6.250000 21.250000 2.437500 18.00000
## [117,] 35.75000 80.750000 9.0000000 4.5000000 60.0000000 7.2500000 11.250000 4.750000 2.7500000 5.7500000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 23.000000 26.250000 3.922500 25.25000
## [118,] 24.80000 46.000000 4.0000000 4.6000000 26.0000000 11.4000000 17.000000 10.800000 11.2000000 3.0000000 0.2000000 12.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 16.500000 22.000000 2.752000 14.20000
## [119,] 26.33333 57.000000 18.3333333 14.0000000 1.3333333 23.3333333 26.000000 9.666667 1.0000000 1.3333333 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.0000000 26.666667 22.000000 26.666667 3.746667 17.00000
## [120,] 22.00000 33.333333 3.0000000 9.0000000 2.3333333 19.0000000 33.333333 18.333333 1.0000000 3.0000000 0.0000000 12.6666667 0.0000000 0.0000000 26.666667 20.333333 21.666667 2.656667 16.33333
## [121,] 31.25000 64.000000 10.7500000 16.0000000 3.5000000 29.2500000 23.250000 10.750000 1.2500000 2.2500000 0.2500000 2.7500000 0.0000000 0.0000000 26.250000 20.250000 30.000000 4.695000 16.50000
## [122,] 31.33333 55.666667 10.6666667 4.3333333 14.0000000 26.6666667 33.666667 8.333333 1.3333333 3.3333333 0.0000000 0.3333333 0.0000000 0.0000000 26.666667 25.333333 26.666667 3.876667 16.00000
## [123,] 32.66667 64.000000 0.0000000 2.3333333 57.6666667 3.3333333 15.000000 6.666667 4.3333333 2.3333333 0.0000000 3.3333333 3.3333333 1.6666667 25.000000 26.333333 23.333333 3.820000 17.00000
## [124,] 28.00000 39.666667 3.6666667 6.6666667 14.6666667 14.6666667 37.000000 16.000000 3.3333333 2.6666667 0.0000000 1.3333333 0.0000000 0.0000000 21.666667 31.333333 23.333333 3.183333 20.33333
## [125,] 11.66667 1.666667 0.0000000 0.3333333 0.0000000 1.3333333 20.000000 8.666667 15.6666667 3.6666667 0.0000000 37.0000000 13.3333333 0.0000000 18.333333 17.100000 16.666667 1.950000 31.00000
## [126,] 23.00000 15.333333 0.0000000 2.0000000 0.0000000 13.3333333 36.666667 21.666667 7.6666667 2.6666667 1.0000000 13.3333333 0.0000000 1.6666667 23.333333 27.333333 18.333333 1.976667 38.66667
## [127,] 26.20000 29.750000 0.2000000 3.4000000 2.2000000 18.0000000 33.000000 16.000000 1.8000000 1.6000000 0.0000000 3.8000000 0.0000000 0.0000000 22.000000 45.200000 28.000000 4.720000 22.25000
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## [129,] 24.00000 34.000000 1.0000000 9.6666667 0.0000000 23.3333333 33.333333 23.666667 4.0000000 1.3333333 0.0000000 7.0000000 0.0000000 0.0000000 26.666667 31.000000 25.000000 3.486667 23.33333
## [130,] 24.50000 27.250000 0.0000000 5.5000000 0.0000000 21.7500000 35.500000 25.750000 3.2500000 4.7500000 0.0000000 3.5000000 0.0000000 0.0000000 23.750000 25.666667 27.500000 4.352500 18.33333
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## [135,] 24.40000 27.800000 0.4000000 8.0000000 2.2000000 17.2000000 46.000000 19.800000 0.6000000 1.4000000 0.0000000 2.0000000 0.0000000 2.4000000 25.000000 29.880000 23.000000 3.344000 18.00000
## [136,] 26.60000 25.200000 2.4000000 2.0000000 1.6000000 19.2000000 46.600000 17.200000 1.0000000 2.4000000 0.2000000 7.4000000 0.0000000 0.0000000 22.000000 33.520000 22.000000 2.748000 32.00000
## [137,] 29.00000 42.333333 4.3333333 5.0000000 9.6666667 23.3333333 34.333333 13.333333 0.6666667 6.0000000 0.0000000 3.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 30.933333 26.666667 3.626667 30.66667rownames(phwhall_occobject$y)<-rownames(firstcheck_all)RDAs
library(vegan)
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set.seed(12345)
p_alltax_step<- ordistep(p_alltax_step_0, scope = formula(p_alltax_step_1))##
## Start: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ 1
##
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## + average_bankfull_.m. 1 564.89 3.5160 0.005 **
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## + per_cobble 1 565.86 2.5359 0.005 **
## + per_clay_hardpan 1 565.96 2.4355 0.005 **
## + pool_metric_total 1 566.01 2.3875 0.005 **
## + X._canopy_open 1 566.27 2.1300 0.005 **
## + percent_best_types 1 565.54 2.8599 0.010 **
## + per_gravel 1 566.65 1.7526 0.015 *
## + per_bedrock 1 566.73 1.6741 0.030 *
## + per_silt 1 566.66 1.7438 0.040 *
## + per_artificial 1 566.65 1.7454 0.075 .
## + per_boulder_256mm 1 566.87 1.5294 0.075 .
## + per_boulder_slabs 1 566.92 1.4825 0.075 .
## + per_muck 1 567.22 1.1831 0.240
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm.
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - pool_depth_.cm. 1 566.41 4.1322 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
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## + percent_best_types 1 563.17 3.0763 0.005 **
## + bankfull_metric_total 1 563.54 2.7100 0.005 **
## + average_bankfull_.m. 1 563.75 2.5019 0.005 **
## + per_clay_hardpan 1 563.90 2.3513 0.005 **
## + per_leaf_woody 1 564.08 2.1727 0.005 **
## + per_cobble 1 563.74 2.5100 0.010 **
## + pool_metric_total 1 564.21 2.0439 0.010 **
## + per_bedrock 1 564.23 2.0277 0.010 **
## + per_silt 1 564.41 1.8427 0.030 *
## + per_detritus 1 564.22 2.0324 0.045 *
## + per_boulder_slabs 1 564.70 1.5532 0.075 .
## + per_artificial 1 564.64 1.6183 0.105
## + per_boulder_256mm 1 564.97 1.2931 0.125
## + X._canopy_open 1 564.97 1.2863 0.215
## + per_muck 1 564.94 1.3240 0.225
## + per_gravel 1 565.57 0.6971 0.890
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - per_sand 1 564.28 3.6289 0.005 **
## - pool_depth_.cm. 1 565.08 4.4344 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
## + per_cobble 1 561.91 2.6569 0.005 **
## + percent_best_types 1 562.07 2.4969 0.005 **
## + per_leaf_woody 1 562.65 1.9312 0.010 **
## + per_silt 1 562.65 1.9248 0.010 **
## + pool_metric_total 1 562.79 1.7932 0.010 **
## + per_clay_hardpan 1 562.73 1.8472 0.020 *
## + bankfull_metric_total 1 563.23 1.3598 0.075 .
## + average_bankfull_.m. 1 563.23 1.3592 0.075 .
## + per_detritus 1 562.87 1.7137 0.085 .
## + per_boulder_256mm 1 563.18 1.4046 0.090 .
## + per_artificial 1 563.10 1.4892 0.135
## + X._canopy_open 1 563.22 1.3697 0.135
## + per_muck 1 563.27 1.3181 0.195
## + per_boulder_slabs 1 563.52 1.0785 0.310
## + per_gravel 1 563.68 0.9192 0.540
## + per_bedrock 1 563.81 0.7918 0.790
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - per_cobble 1 562.62 2.6569 0.010 **
## - per_sand 1 563.74 3.7688 0.005 **
## - pool_depth_.cm. 1 564.77 4.8046 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
## + pool_metric_total 1 562.04 1.8145 0.010 **
## + percent_best_types 1 562.08 1.7802 0.010 **
## + per_bedrock 1 561.92 1.9380 0.015 *
## + per_leaf_woody 1 562.27 1.5962 0.050 *
## + per_detritus 1 562.06 1.7929 0.060 .
## + per_gravel 1 562.44 1.4297 0.060 .
## + per_silt 1 562.36 1.5061 0.075 .
## + X._canopy_open 1 562.47 1.3990 0.105
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## + bankfull_metric_total 1 562.64 1.2280 0.180
## + per_artificial 1 562.57 1.2961 0.235
## + per_clay_hardpan 1 562.70 1.1776 0.245
## + average_bankfull_.m. 1 562.75 1.1212 0.325
## + per_muck 1 562.94 0.9401 0.450
## + per_boulder_slabs 1 563.23 0.6611 0.940
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - pool_metric_total 1 561.91 1.8145 0.010 **
## - per_cobble 1 562.79 2.6719 0.010 **
## - per_sand 1 563.70 3.5715 0.005 **
## - pool_depth_.cm. 1 564.62 4.4818 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
## + per_bedrock 1 562.04 1.9289 0.005 **
## + percent_best_types 1 562.15 1.8243 0.010 **
## + per_gravel 1 562.60 1.3912 0.080 .
## + per_silt 1 562.42 1.5582 0.085 .
## + per_detritus 1 562.43 1.5542 0.090 .
## + X._canopy_open 1 562.58 1.4093 0.125
## + per_artificial 1 562.67 1.3194 0.195
## + bankfull_metric_total 1 562.84 1.1530 0.200
## + per_boulder_256mm 1 562.75 1.2398 0.225
## + per_leaf_woody 1 562.82 1.1779 0.230
## + average_bankfull_.m. 1 562.89 1.1057 0.245
## + per_clay_hardpan 1 562.84 1.1542 0.265
## + per_muck 1 563.06 0.9419 0.340
## + per_boulder_slabs 1 563.37 0.6471 0.945
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total + per_bedrock
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - pool_metric_total 1 561.92 1.8063 0.020 *
## - per_bedrock 1 562.04 1.9289 0.015 *
## - per_sand 1 563.70 3.5434 0.005 **
## - per_cobble 1 564.03 3.8716 0.005 **
## - pool_depth_.cm. 1 564.41 4.2421 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
## + per_detritus 1 562.30 1.6618 0.065 .
## + bankfull_metric_total 1 562.69 1.2835 0.085 .
## + X._canopy_open 1 562.53 1.4434 0.095 .
## + per_artificial 1 562.62 1.3544 0.125
## + per_boulder_256mm 1 562.73 1.2494 0.175
## + per_silt 1 562.71 1.2648 0.200
## + average_bankfull_.m. 1 562.83 1.1512 0.250
## + per_clay_hardpan 1 562.94 1.0494 0.380
## + per_gravel 1 562.97 1.0200 0.410
## + per_muck 1 563.12 0.8754 0.425
## + percent_best_types 1 563.03 0.9610 0.430
## + per_leaf_woody 1 563.10 0.8918 0.645
## + per_boulder_slabs 1 563.35 0.6550 0.935
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1p_alltax_step## Call: rda(formula = streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total + per_bedrock, data = occcov_3[, -1], scale = T)
##
## Inertia Proportion Rank
## Total 62.0000 1.0000
## Constrained 6.1754 0.0996 5
## Unconstrained 55.8246 0.9004 62
## Inertia is correlations
##
## Eigenvalues for constrained axes:
## RDA1 RDA2 RDA3 RDA4 RDA5
## 2.7451 1.5905 1.0407 0.5293 0.2697
##
## Eigenvalues for unconstrained axes:
## PC1 PC2 PC3 PC4 PC5 PC6 PC7 PC8
## 7.962 3.141 2.795 2.343 2.035 1.878 1.758 1.663
## (Showing 8 of 62 unconstrained eigenvalues)anova(p_alltax_step)## Permutation test for rda under reduced model
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## Model: rda(formula = streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total + per_bedrock, data = occcov_3[, -1], scale = T)
## Df Variance F Pr(>F)
## Model 5 6.175 2.8983 0.001 ***
## Residual 131 55.825
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1anova(p_alltax_step,by="term")## Permutation test for rda under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## Model: rda(formula = streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total + per_bedrock, data = occcov_3[, -1], scale = T)
## Df Variance F Pr(>F)
## pool_depth_.cm. 1 1.841 4.3210 0.001 ***
## per_sand 1 1.586 3.7223 0.001 ***
## per_cobble 1 1.147 2.6920 0.002 **
## pool_metric_total 1 0.779 1.8272 0.012 *
## per_bedrock 1 0.822 1.9289 0.013 *
## Residual 131 55.825
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1library(ggord)
phwh_salamander_suff_sum_bin<-phwh_salamander_suff_sum %>% mutate_if(is.numeric, ~1 * (. >= 1))
phwh_salamander_suff_env_detecthistory<-cbind(phwh_subset_suff_env_detecthistory,phwh_salamander_suff_sum_bin[,-1:-2])
phwh_salamander_suff_env_detecthistory$datecount<-sitechecks$datecount
phwh_salamander_suff_env_detecthistory$dayofyear<-sitechecks$dayofyear
phwh_salamander_suff_env_detecthistory<-phwh_salamander_suff_env_detecthistory %>%
dplyr::select(!c(latitude,longitude))
phwh_subset_suff_env_detecthistory_first<- phwh_salamander_suff_env_detecthistory %>% group_by(stream_name) %>%
arrange(datecount) %>%
summarise_all(funs(list(.[1]))) %>%
unnest(cols = c(date, reservation, river_basin,hmfei_narrative, substrate_metric_total, percent_best_types, per_boulder_slabs,
per_boulder_256mm, per_bedrock, per_cobble, per_gravel, per_sand,
per_silt, per_leaf_woody, per_detritus, per_clay_hardpan,
per_muck, per_artificial, pool_metric_total, pool_depth_.cm.,
bankfull_metric_total, average_bankfull_.m., sinuosity, X._canopy_open,
temp, dissolved_oxygen_mgl, ph, conductivity, mtdusky, nodusky,
twolined, longtail, red, mole, fourtoed, redback, slimy,
datecount, dayofyear))
hmfei_narrative<-phwh_subset_suff_env_detecthistory_first$hmfei_narrative
ggord(p_alltax_step, xlim=c(-1,1.25),ylim = c(-1.25, 0.75),txt=4,arrow=TRUE,ptslab=TRUE,addsize=3, size =4,grp_in=hmfei_narrative)
This sets up a fairly clear contrast between substrate sandiness and most other substrate metrics.
taxa most differentiated with axes
## most differentiated taxa
plot_df <- scores(p_alltax_step, display = "sites") %>%
as.data.frame()
plot_df$stream_name<-streambioticsum_suff$stream_name
plot_df <- plot_df %>%
full_join(streambioticsum_suff, by = "stream_name")
# envfit() takes the output of metaMDS() and the species matrix you created
fitrdaall <- envfit(p_alltax_step, streambioticsum_suff_biotic_bin, perm = 999)
# extract p-values for each species
fitrdaall_pvals <- fitrdaall$vectors$pvals %>%
as.data.frame() %>%
rownames_to_column("species") %>%
dplyr::rename("pvals" = ".")
# extract coordinates for species, only keep species with p-val = 0.001
fit_spp <- fitrdaall %>%
scores(., display = "vectors") %>%
as.data.frame() %>%
rownames_to_column("species") %>%
full_join(., fitrdaall_pvals, by = "species") %>%
filter(pvals == 0.001)
rdaall_plot_new <- ggplot(plot_df, aes(x = RDA1, y = RDA2)) +
coord_fixed() +
geom_point(aes(color = hmfei_narrative), size = 3, alpha = 0.8) +
stat_ellipse(aes(color = hmfei_narrative)) +
geom_segment(data = fit_spp, aes(x = 0, xend = RDA1, y = 0, yend = RDA2),
col = "black") +
geom_text(data = fit_spp, aes(label = species))
rdaall_plot_new
fit_spp## species RDA1 RDA2 pvals
## 1 streambioticsum_suff_mtdusky 0.17507595 -0.293644216 0.001
## 2 streambioticsum_suff_nodusky -0.27809375 -0.455284029 0.001
## 3 streambioticsum_suff_twolined -0.23822398 -0.638763319 0.001
## 4 streambioticsum_suff_longtail -0.39010575 0.062736629 0.001
## 5 streambioticsum_suff_red -0.75209043 0.031090809 0.001
## 6 streambioticsum_suff_redback -0.57734190 0.056641061 0.001
## 7 streambioticsum_suff_slimy -0.26432911 -0.250839261 0.001
## 8 blacknose_dace 0.15197211 -0.398865246 0.001
## 9 creek_chub 0.24147283 -0.269644637 0.001
## 10 sow_bugs 0.46853803 -0.130358924 0.001
## 11 water_mites 0.16203348 -0.342627989 0.001
## 12 damselfly_nymphs 0.42542871 -0.310468854 0.001
## 13 alderfly_larvae -0.23820548 -0.333107571 0.001
## 14 crayfish -0.31541526 -0.410797605 0.001
## 15 dragonfly_nymphs -0.14737034 -0.429481237 0.001
## 16 riffle_beetles 0.27450885 -0.486189992 0.001
## 17 snails 0.57051982 -0.210491614 0.001
## 18 fishfly_larvae -0.55491700 -0.373586567 0.001
## 19 water_penny_beetles -0.22680148 -0.608803917 0.001
## 20 cranefly_larvae -0.01779661 -0.436764317 0.001
## 21 ameletidae 0.30401485 -0.527521148 0.001
## 22 baetidae 0.01304353 -0.541866582 0.001
## 23 heptageniidae -0.31608809 -0.225105120 0.001
## 24 leptophlebiidae -0.71022889 -0.216865922 0.001
## 25 chloroperlidae -0.16974936 -0.383511797 0.001
## 26 leuctridae -0.56275788 -0.533921998 0.001
## 27 nemouridae -0.65902418 -0.278665497 0.001
## 28 perlidae -0.42901318 -0.196722395 0.001
## 29 hydropsychidae -0.14487030 -0.605885309 0.001
## 30 lepidostomatidae -0.77744388 0.056448603 0.001
## 31 limnephilidae -0.61638586 0.054267650 0.001
## 32 molannidae -0.43848282 0.042280512 0.001
## 33 odontoceridae -0.52357619 0.001948575 0.001
## 34 philopotamidae -0.12128870 -0.609498640 0.001
## 35 polycentropodidae -0.02254012 -0.553853773 0.001
## 36 rhyacophilidae -0.58742278 -0.315837496 0.001
## 37 uenoidae -0.36293897 -0.392353341 0.001cooccurrence networks
summarizing all taxa
phwh_subset_biotic<-phwh %>%
dplyr::select(stream_name,date,mountain_dusky_larvae,mountain_dusky_juveniles,
mountain_dusky_adults,northern_dusky_larvae,northern_dusky_juveniles,northern_dusky_adults,two_lined_larvae,two_lined_juveniles,
two_lined_adults,long_tailed_larvae,long_tailed_juveniles,long_tailed_adults,northern_red_larvae,northern_red_juveniles,northern_red_adults,
mole_larvae,mole_juveniles,mole_adults,four_toed_larvae,four_toed_juveniles,four_toed_adults,red_backed_juveniles,red_backed_adults,
slimy_juveniles,slimy_adults,blacknose_dace,bluegill_sunfish,bluntnose_minnow,brindled_madtom,brook_stickleback,brook_trout,
central_mudminnow,central_stoneroller_minnow,common_shiner,creek_chub,eastern_sand_darter,fantail_darter,fathead_minnow,golden_shiner,
goldfish,grass_pickerel,greenside_darter,green_sunfish,johnny_darter,largemouth_bass,longear_sunfish,longnose_dace,mottled_sculpin,
northern_hog_sucker,pumpkinseed_sunfish,rainbow_darter,rainbow_trout,redbelly_dace,redside_dace,river_chub,silverjaw_minnow,smallmouth_bass,
spotfin_shiner,stonecat_madtom,striped_shiner,trout_perch,warmouth_sunfish,white_sucker,yellow_bullhead_catfish,unidentified_fish_fry,
sessile_animals,aquatic_worms,sow_bugs,scuds,water_mites,damselfly_nymphs,alderfly_larvae,other_beetles,crayfish,dragonfly_nymphs,
riffle_beetles,other_flies,midges,snails,clams,fishfly_larvae,water_penny_beetles,cranefly_larvae,ameletidae,arthropleidae,baetidae,
baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,
pseudironidae,siphlonuridae,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae,
brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,
limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_subset_biotic_2<-phwh_subset_biotic %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE) %>% dplyr::select(-stream_name,-date)
phwh_subset_biotic_3<-data.frame(sapply(phwh_subset_biotic_2,as.numeric))
phwh_subset_biotic_3$stream_name<-phwh_subset_biotic$stream_name
phwh_subset_biotic_3$date<-phwh_subset_biotic$date
streambiotic<-phwh_subset_biotic_3
streambioticsum<-streambiotic %>%
group_by(stream_name) %>%
dplyr::select(!date) %>%
summarise_all(list(sum))
streambioticsum_suff <-streambioticsum[streambioticsum$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam , ]
streambioticsum_suff_mtdusky<-streambioticsum_suff$mountain_dusky_larvae+
streambioticsum_suff$mountain_dusky_juveniles+
streambioticsum_suff$mountain_dusky_adults
streambioticsum_suff_nodusky<-streambioticsum_suff$northern_dusky_larvae+
streambioticsum_suff$northern_dusky_juveniles+
streambioticsum_suff$northern_dusky_adults
streambioticsum_suff_twolined<-streambioticsum_suff$two_lined_larvae+
streambioticsum_suff$two_lined_juveniles+
streambioticsum_suff$two_lined_adults
streambioticsum_suff_longtail<-streambioticsum_suff$long_tailed_larvae+
streambioticsum_suff$long_tailed_juveniles+
streambioticsum_suff$long_tailed_adults
streambioticsum_suff_red<-streambioticsum_suff$northern_red_larvae+
streambioticsum_suff$northern_red_juveniles+
streambioticsum_suff$northern_red_adults
streambioticsum_suff_mole<-streambioticsum_suff$mole_larvae+
streambioticsum_suff$mole_juveniles+
streambioticsum_suff$mole_adults
streambioticsum_suff_fourtoed<-streambioticsum_suff$four_toed_larvae+
streambioticsum_suff$four_toed_juveniles+
streambioticsum_suff$four_toed_adults
streambioticsum_suff_redback<-streambioticsum_suff$red_backed_juveniles+
streambioticsum_suff$red_backed_adults
streambioticsum_suff_slimy<-streambioticsum_suff$slimy_juveniles+
streambioticsum_suff$slimy_adults
streambioticsum_suff_sal<-data.frame(streambioticsum_suff_mtdusky,streambioticsum_suff_nodusky,streambioticsum_suff_twolined,
streambioticsum_suff_longtail,streambioticsum_suff_red,streambioticsum_suff_mole,
streambioticsum_suff_fourtoed,streambioticsum_suff_redback,streambioticsum_suff_slimy)
streambioticsum_suff_fish<-streambioticsum_suff[,27:65]
streambioticsum_suff_macro<-streambioticsum_suff[,67:126]
streambioticsum_suff_biotic<-data.frame(streambioticsum_suff_sal,streambioticsum_suff_fish,streambioticsum_suff_macro)
streambioticsum_suff_biotic_bin<- streambioticsum_suff_biotic %>% mutate_if(is.numeric, ~1 * (. >= 1))
streambioticsum_suff_biotic_bin_t<-t(streambioticsum_suff_biotic_bin)library(netassoc)
m_obs<-matrix(streambioticsum_suff_biotic_bin_t,ncol=137,nrow=108)
m_obs<-m_obs[rowSums(m_obs[])>0,]
m_obs<-m_obs[rowSums(m_obs[])<137,]
# Number of m species
nsp <- nrow(m_obs)
# Number of n sites
nsi <- ncol(m_obs)
m_nul <- floor(matrix(rbernoulli(nsp*nsi,p=0.5),ncol=nsi,nrow=nsp))
n <- make_netassoc_network(m_obs, m_nul,
method="partial_correlation",
args=list(method="shrinkage"), # for alternative estimators see ?partial_correlation
p.method='fdr',
numnulls=100,
plot=TRUE,
alpha=0.001)
## Calculating observed co-occurrence scores...
## Generating null replicate 1...
## Generating null replicate 2...
## Generating null replicate 3...
## Generating null replicate 4...
## Generating null replicate 5...
## Generating null replicate 6...
## Generating null replicate 7...
## Generating null replicate 8...
## Generating null replicate 9...
## Generating null replicate 10...
## Generating null replicate 11...
## Generating null replicate 12...
## Generating null replicate 13...
## Generating null replicate 14...
## Generating null replicate 15...
## Generating null replicate 16...
## Generating null replicate 17...
## Generating null replicate 18...
## Generating null replicate 19...
## Generating null replicate 20...
## Generating null replicate 21...
## Generating null replicate 22...
## Generating null replicate 23...
## Generating null replicate 24...
## Generating null replicate 25...
## Generating null replicate 26...
## Generating null replicate 27...
## Generating null replicate 28...
## Generating null replicate 29...
## Generating null replicate 30...
## Generating null replicate 31...
## Generating null replicate 32...
## Generating null replicate 33...
## Generating null replicate 34...
## Generating null replicate 35...
## Generating null replicate 36...
## Generating null replicate 37...
## Generating null replicate 38...
## Generating null replicate 39...
## Generating null replicate 40...
## Generating null replicate 41...
## Generating null replicate 42...
## Generating null replicate 43...
## Generating null replicate 44...
## Generating null replicate 45...
## Generating null replicate 46...
## Generating null replicate 47...
## Generating null replicate 48...
## Generating null replicate 49...
## Generating null replicate 50...
## Generating null replicate 51...
## Generating null replicate 52...
## Generating null replicate 53...
## Generating null replicate 54...
## Generating null replicate 55...
## Generating null replicate 56...
## Generating null replicate 57...
## Generating null replicate 58...
## Generating null replicate 59...
## Generating null replicate 60...
## Generating null replicate 61...
## Generating null replicate 62...
## Generating null replicate 63...
## Generating null replicate 64...
## Generating null replicate 65...
## Generating null replicate 66...
## Generating null replicate 67...
## Generating null replicate 68...
## Generating null replicate 69...
## Generating null replicate 70...
## Generating null replicate 71...
## Generating null replicate 72...
## Generating null replicate 73...
## Generating null replicate 74...
## Generating null replicate 75...
## Generating null replicate 76...
## Generating null replicate 77...
## Generating null replicate 78...
## Generating null replicate 79...
## Generating null replicate 80...
## Generating null replicate 81...
## Generating null replicate 82...
## Generating null replicate 83...
## Generating null replicate 84...
## Generating null replicate 85...
## Generating null replicate 86...
## Generating null replicate 87...
## Generating null replicate 88...
## Generating null replicate 89...
## Generating null replicate 90...
## Generating null replicate 91...
## Generating null replicate 92...
## Generating null replicate 93...
## Generating null replicate 94...
## Generating null replicate 95...
## Generating null replicate 96...
## Generating null replicate 97...
## Generating null replicate 98...
## Generating null replicate 99...
## Generating null replicate 100...
## Calculating standardized effect sizes...
## Adjusting p-values for multiple comparisons...
## Building network...
n$network_all## IGRAPH bacd885 DNW- 62 2788 --
## + attr: name (v/c), weight (e/n)
## + edges from bacd885 (vertex names):
## [1] Species 1->Species 2 Species 1->Species 3 Species 1->Species 4 Species 1->Species 5 Species 1->Species 6 Species 1->Species 7 Species 1->Species 8 Species 1->Species 10 Species 1->Species 11 Species 1->Species 13 Species 1->Species 15 Species 1->Species 17 Species 1->Species 19 Species 1->Species 20 Species 1->Species 21 Species 1->Species 22 Species 1->Species 23 Species 1->Species 24 Species 1->Species 25 Species 1->Species 26 Species 1->Species 27 Species 1->Species 28 Species 1->Species 29 Species 1->Species 30 Species 1->Species 31 Species 1->Species 33 Species 1->Species 34
## [28] Species 1->Species 35 Species 1->Species 36 Species 1->Species 38 Species 1->Species 39 Species 1->Species 43 Species 1->Species 44 Species 1->Species 45 Species 1->Species 46 Species 1->Species 47 Species 1->Species 48 Species 1->Species 49 Species 1->Species 50 Species 1->Species 51 Species 1->Species 53 Species 1->Species 55 Species 1->Species 56 Species 1->Species 57 Species 1->Species 59 Species 1->Species 60 Species 1->Species 61 Species 2->Species 1 Species 2->Species 3 Species 2->Species 4 Species 2->Species 5 Species 2->Species 6 Species 2->Species 7 Species 2->Species 8
## [55] Species 2->Species 10 Species 2->Species 16 Species 2->Species 17 Species 2->Species 18 Species 2->Species 19 Species 2->Species 20 Species 2->Species 21 Species 2->Species 23 Species 2->Species 25 Species 2->Species 26 Species 2->Species 27 Species 2->Species 29 Species 2->Species 30 Species 2->Species 31 Species 2->Species 33 Species 2->Species 34 Species 2->Species 35 Species 2->Species 36 Species 2->Species 38 Species 2->Species 40 Species 2->Species 41 Species 2->Species 42 Species 2->Species 44 Species 2->Species 45 Species 2->Species 46 Species 2->Species 49 Species 2->Species 50
## [82] Species 2->Species 51 Species 2->Species 52 Species 2->Species 54 Species 2->Species 55 Species 2->Species 56 Species 2->Species 57 Species 2->Species 59 Species 2->Species 60 Species 2->Species 61 Species 2->Species 62 Species 3->Species 1 Species 3->Species 2 Species 3->Species 5 Species 3->Species 6 Species 3->Species 7 Species 3->Species 8 Species 3->Species 9 Species 3->Species 10 Species 3->Species 11 Species 3->Species 12 Species 3->Species 13 Species 3->Species 15 Species 3->Species 16 Species 3->Species 18 Species 3->Species 20 Species 3->Species 23 Species 3->Species 24
## [109] Species 3->Species 28 Species 3->Species 29 Species 3->Species 31 Species 3->Species 32 Species 3->Species 33 Species 3->Species 34 Species 3->Species 35 Species 3->Species 36 Species 3->Species 37 Species 3->Species 38 Species 3->Species 39 Species 3->Species 40 Species 3->Species 41 Species 3->Species 42 Species 3->Species 43 Species 3->Species 44 Species 3->Species 45 Species 3->Species 46 Species 3->Species 49 Species 3->Species 50 Species 3->Species 52 Species 3->Species 54 Species 3->Species 56 Species 3->Species 58 Species 3->Species 60 Species 3->Species 61 Species 4->Species 1
## [136] Species 4->Species 2 Species 4->Species 5 Species 4->Species 6 Species 4->Species 7 Species 4->Species 8 Species 4->Species 9 Species 4->Species 11 Species 4->Species 12 Species 4->Species 14 Species 4->Species 16 Species 4->Species 17 Species 4->Species 18 Species 4->Species 22 Species 4->Species 24 Species 4->Species 25 Species 4->Species 26 Species 4->Species 27 Species 4->Species 28 Species 4->Species 30 Species 4->Species 33 Species 4->Species 35 Species 4->Species 36 Species 4->Species 37 Species 4->Species 39 Species 4->Species 40 Species 4->Species 42 Species 4->Species 44
## [163] Species 4->Species 45 Species 4->Species 46 Species 4->Species 48 Species 4->Species 49 Species 4->Species 50 Species 4->Species 51 Species 4->Species 53 Species 4->Species 54 Species 4->Species 55 Species 4->Species 56 Species 4->Species 57 Species 4->Species 58 Species 4->Species 59 Species 4->Species 60 Species 4->Species 61 Species 4->Species 62 Species 5->Species 1 Species 5->Species 2 Species 5->Species 3 Species 5->Species 4 Species 5->Species 6 Species 5->Species 7 Species 5->Species 9 Species 5->Species 13 Species 5->Species 16 Species 5->Species 17 Species 5->Species 20
## [190] Species 5->Species 22 Species 5->Species 23 Species 5->Species 24 Species 5->Species 25 Species 5->Species 26 Species 5->Species 27 Species 5->Species 30 Species 5->Species 31 Species 5->Species 33 Species 5->Species 34 Species 5->Species 35 Species 5->Species 36 Species 5->Species 37 Species 5->Species 38 Species 5->Species 39 Species 5->Species 40 Species 5->Species 43 Species 5->Species 44 Species 5->Species 45 Species 5->Species 46 Species 5->Species 47 Species 5->Species 48 Species 5->Species 49 Species 5->Species 50 Species 5->Species 51 Species 5->Species 52 Species 5->Species 53
## + ... omitted several edgesplot(n$network_all)
# presence/absence across plots
streambioticsum_suff_biotic_bin_t_2<-streambioticsum_suff_biotic_bin_t[rowSums(streambioticsum_suff_biotic_bin_t[])>0,]
streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3<-streambioticsum_suff_biotic_bin_t_2[rowSums(streambioticsum_suff_biotic_bin_t_2[])<137,]
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co <- print(cooccur(streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3, spp_names = TRUE))##
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## Call:
## cooccur(mat = streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3, spp_names = TRUE)
##
## Of 1891 species pair combinations, 585 pairs (30.94 %) were removed from the analysis because expected co-occurrence was < 1 and 1306 pairs were analyzed
##
## Cooccurrence Table:
## sp1 sp2 sp1_inc sp2_inc obs_cooccur prob_cooccur exp_cooccur p_lt p_gt sp1_name sp2_name
## 1 1 2 24 51 22 0.065 8.9 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_nodusky
## 2 1 3 24 102 22 0.130 17.9 0.99560 0.02403 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_twolined
## 27 1 43 24 40 1 0.051 7.0 0.00134 0.99990 streambioticsum_suff_mtdusky heptageniidae
## 31 1 47 24 68 18 0.087 11.9 0.99873 0.00548 streambioticsum_suff_mtdusky leuctridae
## 32 1 48 24 46 4 0.059 8.1 0.04100 0.98845 streambioticsum_suff_mtdusky nemouridae
## 33 1 49 24 44 3 0.056 7.7 0.01717 0.99635 streambioticsum_suff_mtdusky perlidae
## 38 1 55 24 45 1 0.058 7.9 0.00037 0.99998 streambioticsum_suff_mtdusky limnephilidae
## 41 1 60 24 56 15 0.072 9.8 0.99514 0.01657 streambioticsum_suff_mtdusky polycentropodidae
## 44 2 3 51 102 48 0.277 38.0 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_twolined
## 46 2 5 51 17 12 0.046 6.3 0.99945 0.00317 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_red
## 47 2 7 51 60 28 0.163 22.3 0.98593 0.03299 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_redback
## 48 2 8 51 8 7 0.022 3.0 0.99975 0.00424 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_slimy
## 55 2 21 51 4 4 0.011 1.5 1.00000 0.01779 streambioticsum_suff_nodusky sessile_animals
## 61 2 27 51 59 29 0.160 22.0 0.99643 0.00985 streambioticsum_suff_nodusky alderfly_larvae
## 63 2 29 51 104 46 0.283 38.7 0.99965 0.00177 streambioticsum_suff_nodusky crayfish
## 64 2 30 51 100 44 0.272 37.2 0.99864 0.00517 streambioticsum_suff_nodusky dragonfly_nymphs
## 69 2 35 51 52 29 0.141 19.4 0.99989 0.00045 streambioticsum_suff_nodusky fishfly_larvae
## 70 2 36 51 39 23 0.106 14.5 0.99976 0.00097 streambioticsum_suff_nodusky water_penny_beetles
## 73 2 39 51 117 48 0.318 43.6 0.99568 0.02029 streambioticsum_suff_nodusky baetidae
## 79 2 45 51 53 27 0.144 19.7 0.99754 0.00714 streambioticsum_suff_nodusky leptophlebiidae
## 81 2 47 51 68 36 0.185 25.3 0.99997 0.00014 streambioticsum_suff_nodusky leuctridae
## 82 2 48 51 46 23 0.125 17.1 0.99118 0.02262 streambioticsum_suff_nodusky nemouridae
## 85 2 52 51 107 48 0.291 39.8 0.99997 0.00025 streambioticsum_suff_nodusky hydropsychidae
## 87 2 54 51 30 17 0.082 11.2 0.99624 0.01210 streambioticsum_suff_nodusky lepidostomatidae
## 90 2 57 51 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00629 streambioticsum_suff_nodusky odontoceridae
## 91 2 58 51 62 30 0.168 23.1 0.99583 0.01128 streambioticsum_suff_nodusky philopotamidae
## 93 2 60 51 56 28 0.152 20.8 0.99700 0.00847 streambioticsum_suff_nodusky polycentropodidae
## 94 2 61 51 24 18 0.065 8.9 0.99999 0.00004 streambioticsum_suff_nodusky rhyacophilidae
## 95 2 62 51 46 27 0.125 17.1 0.99994 0.00024 streambioticsum_suff_nodusky uenoidae
## 97 3 5 102 17 16 0.092 12.7 0.99545 0.03606 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_red
## 101 3 9 102 19 19 0.103 14.1 1.00000 0.00228 streambioticsum_suff_twolined blacknose_dace
## 104 3 13 102 36 32 0.196 26.8 0.99643 0.01475 streambioticsum_suff_twolined creek_chub
## 116 3 27 102 59 52 0.321 43.9 0.99977 0.00105 streambioticsum_suff_twolined alderfly_larvae
## 118 3 29 102 104 90 0.565 77.4 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined crayfish
## 119 3 30 102 100 82 0.543 74.5 0.99971 0.00126 streambioticsum_suff_twolined dragonfly_nymphs
## 120 3 31 102 79 69 0.429 58.8 0.99999 0.00006 streambioticsum_suff_twolined riffle_beetles
## 124 3 35 102 52 48 0.283 38.7 0.99999 0.00009 streambioticsum_suff_twolined fishfly_larvae
## 125 3 36 102 39 39 0.212 29.0 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined water_penny_beetles
## 126 3 37 102 125 100 0.679 93.1 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_twolined cranefly_larvae
## 127 3 38 102 56 52 0.304 41.7 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_twolined ameletidae
## 128 3 39 102 117 95 0.636 87.1 0.99999 0.00006 streambioticsum_suff_twolined baetidae
## 132 3 43 102 40 35 0.217 29.8 0.99509 0.01788 streambioticsum_suff_twolined heptageniidae
## 134 3 45 102 53 52 0.288 39.5 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined leptophlebiidae
## 135 3 46 102 19 18 0.103 14.1 0.99772 0.02030 streambioticsum_suff_twolined chloroperlidae
## 136 3 47 102 68 64 0.370 50.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined leuctridae
## 137 3 48 102 46 43 0.250 34.2 0.99999 0.00013 streambioticsum_suff_twolined nemouridae
## 138 3 49 102 44 42 0.239 32.8 1.00000 0.00003 streambioticsum_suff_twolined perlidae
## 141 3 52 102 107 93 0.581 79.7 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined hydropsychidae
## 143 3 54 102 30 28 0.163 22.3 0.99941 0.00427 streambioticsum_suff_twolined lepidostomatidae
## 144 3 55 102 45 38 0.245 33.5 0.98388 0.04504 streambioticsum_suff_twolined limnephilidae
## 147 3 58 102 62 57 0.337 46.2 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_twolined philopotamidae
## 149 3 60 102 56 51 0.304 41.7 0.99998 0.00013 streambioticsum_suff_twolined polycentropodidae
## 150 3 61 102 24 23 0.130 17.9 0.99962 0.00440 streambioticsum_suff_twolined rhyacophilidae
## 151 3 62 102 46 42 0.250 34.2 0.99987 0.00077 streambioticsum_suff_twolined uenoidae
## 152 4 7 5 60 5 0.016 2.2 1.00000 0.01462 streambioticsum_suff_longtail streambioticsum_suff_redback
## 159 4 27 5 59 5 0.016 2.2 1.00000 0.01340 streambioticsum_suff_longtail alderfly_larvae
## 165 4 33 5 99 1 0.026 3.6 0.02091 0.99866 streambioticsum_suff_longtail snails
## 167 4 35 5 52 5 0.014 1.9 1.00000 0.00696 streambioticsum_suff_longtail fishfly_larvae
## 168 4 36 5 39 4 0.010 1.4 0.99846 0.02312 streambioticsum_suff_longtail water_penny_beetles
## 173 4 45 5 53 5 0.014 1.9 1.00000 0.00768 streambioticsum_suff_longtail leptophlebiidae
## 174 4 47 5 68 5 0.018 2.5 1.00000 0.02790 streambioticsum_suff_longtail leuctridae
## 175 4 48 5 46 5 0.012 1.7 1.00000 0.00367 streambioticsum_suff_longtail nemouridae
## 178 4 54 5 30 4 0.008 1.1 0.99962 0.00823 streambioticsum_suff_longtail lepidostomatidae
## 179 4 55 5 45 5 0.012 1.6 1.00000 0.00327 streambioticsum_suff_longtail limnephilidae
## 182 4 62 5 46 4 0.012 1.7 0.99633 0.04342 streambioticsum_suff_longtail uenoidae
## 183 5 7 17 60 16 0.054 7.4 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_red streambioticsum_suff_redback
## 185 5 13 17 36 0 0.033 4.5 0.00380 1.00000 streambioticsum_suff_red creek_chub
## 187 5 23 17 42 1 0.038 5.2 0.01222 0.99878 streambioticsum_suff_red sow_bugs
## 190 5 26 17 78 4 0.071 9.7 0.00328 0.99946 streambioticsum_suff_red damselfly_nymphs
## 193 5 29 17 104 16 0.094 12.9 0.99348 0.04809 streambioticsum_suff_red crayfish
## 194 5 30 17 100 16 0.091 12.4 0.99684 0.02679 streambioticsum_suff_red dragonfly_nymphs
## 195 5 31 17 79 6 0.072 9.8 0.04226 0.98778 streambioticsum_suff_red riffle_beetles
## 197 5 33 17 99 4 0.090 12.3 0.00001 1.00000 streambioticsum_suff_red snails
## 199 5 35 17 52 13 0.047 6.5 0.99991 0.00070 streambioticsum_suff_red fishfly_larvae
## 202 5 38 17 56 1 0.051 6.9 0.00095 0.99994 streambioticsum_suff_red ameletidae
## 207 5 45 17 53 16 0.048 6.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red leptophlebiidae
## 209 5 47 17 68 16 0.062 8.4 1.00000 0.00005 streambioticsum_suff_red leuctridae
## 210 5 48 17 46 14 0.042 5.7 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_red nemouridae
## 213 5 52 17 107 17 0.097 13.3 1.00000 0.01102 streambioticsum_suff_red hydropsychidae
## 215 5 54 17 30 16 0.027 3.7 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red lepidostomatidae
## 216 5 55 17 45 15 0.041 5.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red limnephilidae
## 217 5 58 17 62 13 0.056 7.7 0.99894 0.00586 streambioticsum_suff_red philopotamidae
## 219 5 61 17 24 11 0.022 3.0 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red rhyacophilidae
## 220 5 62 17 46 10 0.042 5.7 0.99478 0.02088 streambioticsum_suff_red uenoidae
## 232 7 8 60 8 7 0.026 3.5 0.99898 0.01292 streambioticsum_suff_redback streambioticsum_suff_slimy
## 241 7 23 60 42 12 0.134 18.4 0.01311 0.99547 streambioticsum_suff_redback sow_bugs
## 244 7 26 60 78 27 0.249 34.2 0.01020 0.99620 streambioticsum_suff_redback damselfly_nymphs
## 245 7 27 60 59 33 0.189 25.8 0.99620 0.01020 streambioticsum_suff_redback alderfly_larvae
## 251 7 33 60 99 32 0.316 43.4 0.00001 1.00000 streambioticsum_suff_redback snails
## 253 7 35 60 52 34 0.166 22.8 0.99999 0.00007 streambioticsum_suff_redback fishfly_larvae
## 254 7 36 60 39 24 0.125 17.1 0.99768 0.00720 streambioticsum_suff_redback water_penny_beetles
## 261 7 43 60 40 24 0.128 17.5 0.99589 0.01183 streambioticsum_suff_redback heptageniidae
## 263 7 45 60 53 36 0.169 23.2 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_redback leptophlebiidae
## 264 7 46 60 19 13 0.061 8.3 0.99515 0.01878 streambioticsum_suff_redback chloroperlidae
## 265 7 47 60 68 40 0.217 29.8 0.99990 0.00038 streambioticsum_suff_redback leuctridae
## 266 7 48 60 46 31 0.147 20.1 0.99998 0.00008 streambioticsum_suff_redback nemouridae
## 267 7 49 60 44 29 0.141 19.3 0.99992 0.00032 streambioticsum_suff_redback perlidae
## 271 7 54 60 30 23 0.096 13.1 0.99999 0.00004 streambioticsum_suff_redback lepidostomatidae
## 272 7 55 60 45 30 0.144 19.7 0.99996 0.00016 streambioticsum_suff_redback limnephilidae
## 273 7 56 60 4 4 0.013 1.8 1.00000 0.03472 streambioticsum_suff_redback molannidae
## 274 7 57 60 5 5 0.016 2.2 1.00000 0.01462 streambioticsum_suff_redback odontoceridae
## 278 7 61 60 24 16 0.077 10.5 0.99669 0.01200 streambioticsum_suff_redback rhyacophilidae
## 279 7 62 60 46 30 0.147 20.1 0.99992 0.00032 streambioticsum_suff_redback uenoidae
## 280 8 9 8 19 4 0.008 1.1 0.99868 0.01322 streambioticsum_suff_slimy blacknose_dace
## 285 8 25 8 52 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 streambioticsum_suff_slimy water_mites
## 295 8 35 8 52 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 streambioticsum_suff_slimy fishfly_larvae
## 296 8 36 8 39 5 0.017 2.3 0.99317 0.04187 streambioticsum_suff_slimy water_penny_beetles
## 301 8 45 8 53 7 0.023 3.1 0.99965 0.00554 streambioticsum_suff_slimy leptophlebiidae
## 303 8 47 8 68 7 0.029 4.0 0.99704 0.02972 streambioticsum_suff_slimy leuctridae
## 304 8 48 8 46 6 0.020 2.7 0.99795 0.01740 streambioticsum_suff_slimy nemouridae
## 310 8 58 8 62 7 0.026 3.6 0.99865 0.01611 streambioticsum_suff_slimy philopotamidae
## 311 8 60 8 56 7 0.024 3.3 0.99943 0.00808 streambioticsum_suff_slimy polycentropodidae
## 312 8 61 8 24 4 0.010 1.4 0.99566 0.03171 streambioticsum_suff_slimy rhyacophilidae
## 313 8 62 8 46 6 0.020 2.7 0.99795 0.01740 streambioticsum_suff_slimy uenoidae
## 314 9 13 19 36 12 0.036 5.0 0.99996 0.00028 blacknose_dace creek_chub
## 324 9 31 19 79 18 0.080 11.0 0.99999 0.00019 blacknose_dace riffle_beetles
## 329 9 36 19 39 9 0.039 5.4 0.98490 0.04884 blacknose_dace water_penny_beetles
## 331 9 38 19 56 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 blacknose_dace ameletidae
## 332 9 39 19 117 19 0.118 16.2 1.00000 0.03935 blacknose_dace baetidae
## 334 9 43 19 40 11 0.040 5.5 0.99903 0.00477 blacknose_dace heptageniidae
## 335 9 44 19 11 5 0.011 1.5 0.99903 0.00821 blacknose_dace leptohyphidae
## 336 9 45 19 53 12 0.054 7.4 0.99511 0.01862 blacknose_dace leptophlebiidae
## 337 9 46 19 19 8 0.019 2.6 0.99989 0.00093 blacknose_dace chloroperlidae
## 338 9 47 19 68 15 0.069 9.4 0.99899 0.00537 blacknose_dace leuctridae
## 339 9 48 19 46 12 0.047 6.4 0.99909 0.00450 blacknose_dace nemouridae
## 340 9 49 19 44 12 0.045 6.1 0.99947 0.00280 blacknose_dace perlidae
## 341 9 50 19 18 6 0.018 2.5 0.99598 0.02050 blacknose_dace perlodidae
## 342 9 52 19 107 18 0.108 14.8 0.99382 0.04576 blacknose_dace hydropsychidae
## 344 9 54 19 30 0 0.030 4.2 0.00618 1.00000 blacknose_dace lepidostomatidae
## 384 13 15 36 4 4 0.008 1.1 1.00000 0.00419 creek_chub johnny_darter
## 392 13 26 36 78 26 0.150 20.5 0.99158 0.02372 creek_chub damselfly_nymphs
## 396 13 30 36 100 32 0.192 26.3 0.99810 0.00851 creek_chub dragonfly_nymphs
## 397 13 31 36 79 34 0.152 20.8 1.00000 0.00000 creek_chub riffle_beetles
## 399 13 33 36 99 33 0.190 26.0 0.99979 0.00137 creek_chub snails
## 403 13 37 36 125 36 0.240 32.8 1.00000 0.02144 creek_chub cranefly_larvae
## 404 13 38 36 56 25 0.107 14.7 0.99999 0.00006 creek_chub ameletidae
## 408 13 43 36 40 16 0.077 10.5 0.99389 0.01808 creek_chub heptageniidae
## 412 13 47 36 68 23 0.130 17.9 0.98597 0.03571 creek_chub leuctridae
## 414 13 49 36 44 18 0.084 11.6 0.99770 0.00755 creek_chub perlidae
## 418 13 54 36 30 2 0.058 7.9 0.00326 0.99957 creek_chub lepidostomatidae
## 423 13 59 36 8 5 0.015 2.1 0.99571 0.02942 creek_chub phryganeidae
## 454 15 38 4 56 4 0.012 1.6 1.00000 0.02615 johnny_darter ameletidae
## 491 16 58 4 62 4 0.013 1.8 1.00000 0.03972 rainbow_darter philopotamidae
## 521 19 38 4 56 4 0.012 1.6 1.00000 0.02615 white_sucker ameletidae
## 565 22 27 122 59 49 0.384 52.5 0.04699 0.98718 aquatic_worms alderfly_larvae
## 568 22 30 122 100 86 0.650 89.1 0.04864 0.99347 aquatic_worms dragonfly_nymphs
## 585 22 47 122 68 56 0.442 60.6 0.01195 0.99787 aquatic_worms leuctridae
## 587 22 49 122 44 35 0.286 39.2 0.01790 0.99602 aquatic_worms perlidae
## 601 23 24 42 51 29 0.114 15.6 1.00000 0.00000 sow_bugs scuds
## 602 23 25 42 52 24 0.116 15.9 0.99942 0.00207 sow_bugs water_mites
## 603 23 26 42 78 31 0.175 23.9 0.99807 0.00625 sow_bugs damselfly_nymphs
## 604 23 27 42 59 13 0.132 18.1 0.04207 0.98261 sow_bugs alderfly_larvae
## 610 23 33 42 99 35 0.222 30.4 0.98585 0.04016 sow_bugs snails
## 612 23 35 42 52 7 0.116 15.9 0.00043 0.99991 sow_bugs fishfly_larvae
## 621 23 45 42 53 5 0.119 16.2 0.00001 1.00000 sow_bugs leptophlebiidae
## 623 23 47 42 68 15 0.152 20.8 0.02340 0.99097 sow_bugs leuctridae
## 624 23 48 42 46 6 0.103 14.1 0.00098 0.99980 sow_bugs nemouridae
## 625 23 49 42 44 6 0.098 13.5 0.00202 0.99955 sow_bugs perlidae
## 626 23 50 42 18 2 0.040 5.5 0.04229 0.99154 sow_bugs perlodidae
## 629 23 54 42 30 2 0.067 9.2 0.00058 0.99994 sow_bugs lepidostomatidae
## 630 23 55 42 45 6 0.101 13.8 0.00141 0.99970 sow_bugs limnephilidae
## 636 23 61 42 24 2 0.054 7.4 0.00570 0.99919 sow_bugs rhyacophilidae
## 637 23 62 42 46 9 0.103 14.1 0.03350 0.98763 sow_bugs uenoidae
## 638 24 25 51 52 27 0.141 19.4 0.99845 0.00476 scuds water_mites
## 640 24 27 51 59 15 0.160 22.0 0.01004 0.99644 scuds alderfly_larvae
## 648 24 35 51 52 12 0.141 19.4 0.00568 0.99820 scuds fishfly_larvae
## 656 24 43 51 40 7 0.109 14.9 0.00153 0.99965 scuds heptageniidae
## 657 24 44 51 11 0 0.030 4.1 0.00462 1.00000 scuds leptohyphidae
## 658 24 45 51 53 10 0.144 19.7 0.00031 0.99993 scuds leptophlebiidae
## 660 24 47 51 68 20 0.185 25.3 0.04416 0.98033 scuds leuctridae
## 661 24 48 51 46 10 0.125 17.1 0.00582 0.99825 scuds nemouridae
## 662 24 49 51 44 5 0.120 16.4 0.00001 1.00000 scuds perlidae
## 674 24 62 51 46 11 0.125 17.1 0.01650 0.99418 scuds uenoidae
## 678 25 29 52 104 44 0.288 39.5 0.98267 0.04663 water_mites crayfish
## 680 25 31 52 79 39 0.219 30.0 0.99972 0.00105 water_mites riffle_beetles
## 706 25 58 52 62 31 0.172 23.5 0.99763 0.00681 water_mites philopotamidae
## 714 26 30 78 100 65 0.416 56.9 0.99957 0.00166 damselfly_nymphs dragonfly_nymphs
## 715 26 31 78 79 57 0.328 45.0 0.99999 0.00003 damselfly_nymphs riffle_beetles
## 717 26 33 78 99 63 0.411 56.4 0.99698 0.00915 damselfly_nymphs snails
## 718 26 34 78 45 33 0.187 25.6 0.99836 0.00526 damselfly_nymphs clams
## 721 26 37 78 125 76 0.519 71.2 0.99959 0.00381 damselfly_nymphs cranefly_larvae
## 722 26 38 78 56 41 0.233 31.9 0.99969 0.00112 damselfly_nymphs ameletidae
## 723 26 39 78 117 72 0.486 66.6 0.99803 0.00855 damselfly_nymphs baetidae
## 724 26 40 78 13 12 0.054 7.4 0.99959 0.00521 damselfly_nymphs caenidae
## 729 26 45 78 53 25 0.220 30.2 0.04894 0.97776 damselfly_nymphs leptophlebiidae
## 736 26 52 78 107 67 0.445 60.9 0.99694 0.01012 damselfly_nymphs hydropsychidae
## 738 26 54 78 30 10 0.125 17.1 0.00306 0.99922 damselfly_nymphs lepidostomatidae
## 745 26 61 78 24 9 0.100 13.7 0.02977 0.99032 damselfly_nymphs rhyacophilidae
## 748 27 29 59 104 52 0.327 44.8 0.99933 0.00279 alderfly_larvae crayfish
## 749 27 30 59 100 53 0.314 43.1 0.99999 0.00007 alderfly_larvae dragonfly_nymphs
## 750 27 31 59 79 41 0.248 34.0 0.99573 0.01148 alderfly_larvae riffle_beetles
## 754 27 35 59 52 38 0.163 22.4 1.00000 0.00000 alderfly_larvae fishfly_larvae
## 755 27 36 59 39 28 0.123 16.8 1.00000 0.00002 alderfly_larvae water_penny_beetles
## 756 27 37 59 125 57 0.393 53.8 0.99096 0.04777 alderfly_larvae cranefly_larvae
## 757 27 38 59 56 30 0.176 24.1 0.98748 0.02944 alderfly_larvae ameletidae
## 758 27 39 59 117 55 0.368 50.4 0.99529 0.01979 alderfly_larvae baetidae
## 762 27 43 59 40 26 0.126 17.2 0.99979 0.00085 alderfly_larvae heptageniidae
## 763 27 44 59 11 10 0.035 4.7 0.99995 0.00098 alderfly_larvae leptohyphidae
## 764 27 45 59 53 34 0.167 22.8 0.99998 0.00007 alderfly_larvae leptophlebiidae
## 765 27 46 59 19 14 0.060 8.2 0.99925 0.00394 alderfly_larvae chloroperlidae
## 766 27 47 59 68 45 0.214 29.3 1.00000 0.00000 alderfly_larvae leuctridae
## 767 27 48 59 46 29 0.145 19.8 0.99980 0.00075 alderfly_larvae nemouridae
## 768 27 49 59 44 35 0.138 18.9 1.00000 0.00000 alderfly_larvae perlidae
## 770 27 52 59 107 54 0.336 46.1 0.99988 0.00067 alderfly_larvae hydropsychidae
## 773 27 55 59 45 27 0.141 19.4 0.99857 0.00448 alderfly_larvae limnephilidae
## 776 27 58 59 62 37 0.195 26.7 0.99992 0.00032 alderfly_larvae philopotamidae
## 777 27 59 59 8 7 0.025 3.4 0.99911 0.01153 alderfly_larvae phryganeidae
## 778 27 60 59 56 31 0.176 24.1 0.99525 0.01252 alderfly_larvae polycentropodidae
## 779 27 61 59 24 16 0.075 10.3 0.99742 0.00968 alderfly_larvae rhyacophilidae
## 780 27 62 59 46 35 0.145 19.8 1.00000 0.00000 alderfly_larvae uenoidae
## 781 28 29 105 104 85 0.582 79.7 0.99589 0.01389 other_beetles crayfish
## 782 28 30 105 100 82 0.559 76.6 0.99520 0.01543 other_beetles dragonfly_nymphs
## 786 28 34 105 45 39 0.252 34.5 0.98701 0.03918 other_beetles clams
## 801 28 49 105 44 38 0.246 33.7 0.98352 0.04799 other_beetles perlidae
## 807 28 55 105 45 41 0.252 34.5 0.99934 0.00338 other_beetles limnephilidae
## 815 29 30 104 100 83 0.554 75.9 0.99952 0.00201 crayfish dragonfly_nymphs
## 816 29 31 104 79 69 0.438 60.0 0.99994 0.00028 crayfish riffle_beetles
## 820 29 35 104 52 48 0.288 39.5 0.99996 0.00025 crayfish fishfly_larvae
## 821 29 36 104 39 37 0.216 29.6 0.99995 0.00046 crayfish water_penny_beetles
## 822 29 37 104 125 101 0.693 94.9 0.99999 0.00014 crayfish cranefly_larvae
## 823 29 38 104 56 49 0.310 42.5 0.99830 0.00638 crayfish ameletidae
## 824 29 39 104 117 94 0.648 88.8 0.99877 0.00588 crayfish baetidae
## 828 29 43 104 40 37 0.222 30.4 0.99967 0.00208 crayfish heptageniidae
## 829 29 44 104 11 11 0.061 8.4 1.00000 0.04213 crayfish leptohyphidae
## 830 29 45 104 53 51 0.294 40.2 1.00000 0.00000 crayfish leptophlebiidae
## 831 29 46 104 19 19 0.105 14.4 1.00000 0.00342 crayfish chloroperlidae
## 832 29 47 104 68 63 0.377 51.6 1.00000 0.00000 crayfish leuctridae
## 833 29 48 104 46 45 0.255 34.9 1.00000 0.00000 crayfish nemouridae
## 834 29 49 104 44 43 0.244 33.4 1.00000 0.00001 crayfish perlidae
## 835 29 50 104 18 17 0.100 13.7 0.99527 0.03700 crayfish perlodidae
## 837 29 52 104 107 91 0.593 81.2 1.00000 0.00001 crayfish hydropsychidae
## 839 29 54 104 30 29 0.166 22.8 0.99992 0.00108 crayfish lepidostomatidae
## 840 29 55 104 45 43 0.249 34.2 1.00000 0.00006 crayfish limnephilidae
## 843 29 58 104 62 56 0.344 47.1 0.99996 0.00024 crayfish philopotamidae
## 846 29 61 104 24 23 0.133 18.2 0.99936 0.00690 crayfish rhyacophilidae
## 847 29 62 104 46 43 0.255 34.9 0.99996 0.00031 crayfish uenoidae
## 848 30 31 100 79 65 0.421 57.7 0.99884 0.00396 dragonfly_nymphs riffle_beetles
## 851 30 34 100 45 38 0.240 32.8 0.99153 0.02579 dragonfly_nymphs clams
## 852 30 35 100 52 44 0.277 38.0 0.99616 0.01248 dragonfly_nymphs fishfly_larvae
## 853 30 36 100 39 37 0.208 28.5 0.99999 0.00010 dragonfly_nymphs water_penny_beetles
## 854 30 37 100 125 95 0.666 91.2 0.99688 0.01706 dragonfly_nymphs cranefly_larvae
## 855 30 38 100 56 48 0.298 40.9 0.99893 0.00403 dragonfly_nymphs ameletidae
## 856 30 39 100 117 92 0.623 85.4 0.99987 0.00079 dragonfly_nymphs baetidae
## 860 30 43 100 40 36 0.213 29.2 0.99952 0.00253 dragonfly_nymphs heptageniidae
## 862 30 45 100 53 47 0.282 38.7 0.99986 0.00069 dragonfly_nymphs leptophlebiidae
## 863 30 46 100 19 18 0.101 13.9 0.99850 0.01440 dragonfly_nymphs chloroperlidae
## 864 30 47 100 68 62 0.362 49.6 1.00000 0.00000 dragonfly_nymphs leuctridae
## 865 30 48 100 46 43 0.245 33.6 0.99999 0.00005 dragonfly_nymphs nemouridae
## 866 30 49 100 44 40 0.234 32.1 0.99989 0.00067 dragonfly_nymphs perlidae
## 867 30 50 100 18 18 0.096 13.1 1.00000 0.00218 dragonfly_nymphs perlodidae
## 869 30 52 100 107 88 0.570 78.1 1.00000 0.00001 dragonfly_nymphs hydropsychidae
## 871 30 54 100 30 28 0.160 21.9 0.99968 0.00248 dragonfly_nymphs lepidostomatidae
## 872 30 55 100 45 39 0.240 32.8 0.99775 0.00847 dragonfly_nymphs limnephilidae
## 875 30 58 100 62 54 0.330 45.3 0.99988 0.00056 dragonfly_nymphs philopotamidae
## 878 30 61 100 24 23 0.128 17.5 0.99978 0.00276 dragonfly_nymphs rhyacophilidae
## 879 30 62 100 46 44 0.245 33.6 1.00000 0.00001 dragonfly_nymphs uenoidae
## 881 31 33 79 99 65 0.417 57.1 0.99941 0.00214 riffle_beetles snails
## 882 31 34 79 45 32 0.189 25.9 0.99267 0.01964 riffle_beetles clams
## 884 31 36 79 39 28 0.164 22.5 0.99025 0.02628 riffle_beetles water_penny_beetles
## 885 31 37 79 125 76 0.526 72.1 0.99677 0.01838 riffle_beetles cranefly_larvae
## 886 31 38 79 56 47 0.236 32.3 1.00000 0.00000 riffle_beetles ameletidae
## 887 31 39 79 117 74 0.492 67.5 0.99974 0.00156 riffle_beetles baetidae
## 888 31 40 79 13 11 0.055 7.5 0.99395 0.03400 riffle_beetles caenidae
## 891 31 43 79 40 29 0.168 23.1 0.99351 0.01835 riffle_beetles heptageniidae
## 892 31 44 79 11 10 0.046 6.3 0.99829 0.01749 riffle_beetles leptohyphidae
## 894 31 46 79 19 15 0.080 11.0 0.99074 0.03526 riffle_beetles chloroperlidae
## 895 31 47 79 68 47 0.286 39.2 0.99802 0.00570 riffle_beetles leuctridae
## 897 31 49 79 44 34 0.185 25.4 0.99973 0.00108 riffle_beetles perlidae
## 900 31 52 79 107 73 0.450 61.7 1.00000 0.00000 riffle_beetles hydropsychidae
## 902 31 54 79 30 12 0.126 17.3 0.02280 0.99216 riffle_beetles lepidostomatidae
## 906 31 58 79 62 48 0.261 35.8 1.00000 0.00002 riffle_beetles philopotamidae
## 908 31 60 79 56 39 0.236 32.3 0.99470 0.01403 riffle_beetles polycentropodidae
## 910 31 62 79 46 32 0.194 26.5 0.98638 0.03341 riffle_beetles uenoidae
## 915 32 37 135 125 125 0.899 123.2 1.00000 0.00708 other_flies cranefly_larvae
## 917 32 39 135 117 117 0.842 115.3 1.00000 0.02040 other_flies baetidae
## 930 32 52 135 107 107 0.770 105.4 1.00000 0.04669 other_flies hydropsychidae
## 952 33 45 99 53 27 0.280 38.3 0.00001 1.00000 snails leptophlebiidae
## 954 33 47 99 68 43 0.359 49.1 0.01535 0.99461 snails leuctridae
## 955 33 48 99 46 25 0.243 33.2 0.00103 0.99975 snails nemouridae
## 961 33 54 99 30 10 0.158 21.7 0.00000 1.00000 snails lepidostomatidae
## 962 33 55 99 45 27 0.237 32.5 0.02187 0.99208 snails limnephilidae
## 964 33 57 99 5 0 0.026 3.6 0.00134 1.00000 snails odontoceridae
## 995 34 62 45 46 20 0.110 15.1 0.98034 0.04631 clams uenoidae
## 996 35 36 52 39 29 0.108 14.8 1.00000 0.00000 fishfly_larvae water_penny_beetles
## 1003 35 43 52 40 22 0.111 15.2 0.99754 0.00757 fishfly_larvae heptageniidae
## 1004 35 44 52 11 8 0.030 4.2 0.99725 0.01679 fishfly_larvae leptohyphidae
## 1005 35 45 52 53 35 0.147 20.1 1.00000 0.00000 fishfly_larvae leptophlebiidae
## 1006 35 46 52 19 12 0.053 7.2 0.99607 0.01551 fishfly_larvae chloroperlidae
## 1007 35 47 52 68 47 0.188 25.8 1.00000 0.00000 fishfly_larvae leuctridae
## 1008 35 48 52 46 32 0.127 17.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae nemouridae
## 1009 35 49 52 44 29 0.122 16.7 1.00000 0.00000 fishfly_larvae perlidae
## 1011 35 52 52 107 51 0.296 40.6 1.00000 0.00000 fishfly_larvae hydropsychidae
## 1013 35 54 52 30 21 0.083 11.4 0.99999 0.00006 fishfly_larvae lepidostomatidae
## 1014 35 55 52 45 27 0.125 17.1 0.99995 0.00022 fishfly_larvae limnephilidae
## 1016 35 57 52 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00696 fishfly_larvae odontoceridae
## 1017 35 58 52 62 38 0.172 23.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae philopotamidae
## 1018 35 59 52 8 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 fishfly_larvae phryganeidae
## 1019 35 60 52 56 31 0.155 21.3 0.99988 0.00046 fishfly_larvae polycentropodidae
## 1020 35 61 52 24 19 0.066 9.1 1.00000 0.00001 fishfly_larvae rhyacophilidae
## 1021 35 62 52 46 30 0.127 17.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae uenoidae
## 1023 36 38 39 56 25 0.116 15.9 0.99988 0.00051 water_penny_beetles ameletidae
## 1024 36 39 39 117 39 0.243 33.3 1.00000 0.00066 water_penny_beetles baetidae
## 1027 36 43 39 40 18 0.083 11.4 0.99816 0.00619 water_penny_beetles heptageniidae
## 1028 36 44 39 11 8 0.023 3.1 0.99980 0.00197 water_penny_beetles leptohyphidae
## 1029 36 45 39 53 25 0.110 15.1 0.99997 0.00014 water_penny_beetles leptophlebiidae
## 1030 36 46 39 19 11 0.039 5.4 0.99928 0.00372 water_penny_beetles chloroperlidae
## 1031 36 47 39 68 36 0.141 19.4 1.00000 0.00000 water_penny_beetles leuctridae
## 1032 36 48 39 46 25 0.096 13.1 1.00000 0.00000 water_penny_beetles nemouridae
## 1033 36 49 39 44 21 0.091 12.5 0.99983 0.00074 water_penny_beetles perlidae
## 1034 36 50 39 18 9 0.037 5.1 0.99089 0.03285 water_penny_beetles perlodidae
## 1035 36 52 39 107 37 0.222 30.5 0.99983 0.00141 water_penny_beetles hydropsychidae
## 1036 36 53 39 16 8 0.033 4.6 0.98740 0.04531 water_penny_beetles hydroptilidae
## 1037 36 54 39 30 14 0.062 8.5 0.99600 0.01328 water_penny_beetles lepidostomatidae
## 1038 36 55 39 45 18 0.094 12.8 0.98828 0.03057 water_penny_beetles limnephilidae
## 1041 36 58 39 62 30 0.129 17.6 1.00000 0.00000 water_penny_beetles philopotamidae
## 1043 36 60 39 56 25 0.116 15.9 0.99988 0.00051 water_penny_beetles polycentropodidae
## 1044 36 61 39 24 16 0.050 6.8 1.00000 0.00002 water_penny_beetles rhyacophilidae
## 1045 36 62 39 46 28 0.096 13.1 1.00000 0.00000 water_penny_beetles uenoidae
## 1046 37 38 125 56 55 0.373 51.1 0.99873 0.01349 cranefly_larvae ameletidae
## 1047 37 39 125 117 111 0.779 106.8 0.99975 0.00243 cranefly_larvae baetidae
## 1053 37 45 125 53 53 0.353 48.4 1.00000 0.00203 cranefly_larvae leptophlebiidae
## 1055 37 47 125 68 67 0.453 62.0 0.99984 0.00239 cranefly_larvae leuctridae
## 1056 37 48 125 46 45 0.306 42.0 0.99432 0.04484 cranefly_larvae nemouridae
## 1057 37 49 125 44 44 0.293 40.1 1.00000 0.00749 cranefly_larvae perlidae
## 1060 37 52 125 107 104 0.713 97.6 1.00000 0.00005 cranefly_larvae hydropsychidae
## 1066 37 58 125 62 61 0.413 56.6 0.99953 0.00593 cranefly_larvae philopotamidae
## 1068 37 60 125 56 55 0.373 51.1 0.99873 0.01349 cranefly_larvae polycentropodidae
## 1071 38 39 56 117 55 0.349 47.8 0.99999 0.00017 ameletidae baetidae
## 1072 38 40 56 13 9 0.039 5.3 0.99333 0.03026 ameletidae caenidae
## 1073 38 41 56 5 5 0.015 2.0 1.00000 0.01023 ameletidae ephemerellidae
## 1075 38 43 56 40 27 0.119 16.4 0.99999 0.00005 ameletidae heptageniidae
## 1076 38 44 56 11 9 0.033 4.5 0.99943 0.00521 ameletidae leptohyphidae
## 1077 38 45 56 53 28 0.158 21.7 0.99259 0.01877 ameletidae leptophlebiidae
## 1078 38 46 56 19 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 ameletidae chloroperlidae
## 1079 38 47 56 68 36 0.203 27.8 0.99883 0.00358 ameletidae leuctridae
## 1080 38 48 56 46 25 0.137 18.8 0.99301 0.01827 ameletidae nemouridae
## 1081 38 49 56 44 24 0.131 18.0 0.99217 0.02037 ameletidae perlidae
## 1082 38 50 56 18 14 0.054 7.4 0.99989 0.00080 ameletidae perlodidae
## 1083 38 52 56 107 51 0.319 43.7 0.99968 0.00162 ameletidae hydropsychidae
## 1089 38 58 56 62 32 0.185 25.3 0.99384 0.01572 ameletidae philopotamidae
## 1091 38 60 56 56 30 0.167 22.9 0.99643 0.00975 ameletidae polycentropodidae
## 1093 38 62 56 46 28 0.137 18.8 0.99982 0.00070 ameletidae uenoidae
## 1097 39 43 117 40 39 0.249 34.2 0.99948 0.00591 baetidae heptageniidae
## 1099 39 45 117 53 51 0.330 45.3 0.99964 0.00288 baetidae leptophlebiidae
## 1100 39 46 117 19 19 0.118 16.2 1.00000 0.03935 baetidae chloroperlidae
## 1101 39 47 117 68 65 0.424 58.1 0.99992 0.00066 baetidae leuctridae
## 1102 39 48 117 46 44 0.287 39.3 0.99827 0.01116 baetidae nemouridae
## 1103 39 49 117 44 42 0.274 37.6 0.99736 0.01592 baetidae perlidae
## 1104 39 50 117 18 18 0.112 15.4 1.00000 0.04730 baetidae perlodidae
## 1106 39 52 117 107 98 0.667 91.4 0.99994 0.00044 baetidae hydropsychidae
## 1112 39 58 117 62 58 0.386 52.9 0.99745 0.01174 baetidae philopotamidae
## 1114 39 60 117 56 54 0.349 47.8 0.99983 0.00153 baetidae polycentropodidae
## 1115 39 61 117 24 24 0.150 20.5 1.00000 0.01528 baetidae rhyacophilidae
## 1116 39 62 117 46 46 0.287 39.3 1.00000 0.00013 baetidae uenoidae
## 1118 40 44 13 11 4 0.008 1.0 0.99884 0.01133 caenidae leptohyphidae
## 1123 40 49 13 44 8 0.030 4.2 0.99546 0.02177 caenidae perlidae
## 1124 40 50 13 18 5 0.012 1.7 0.99783 0.01474 caenidae perlodidae
## 1132 40 62 13 46 8 0.032 4.4 0.99346 0.02925 caenidae uenoidae
## 1150 42 62 3 46 3 0.007 1.0 1.00000 0.03621 ephemeridae uenoidae
## 1151 43 44 40 11 8 0.023 3.2 0.99974 0.00240 heptageniidae leptohyphidae
## 1152 43 45 40 53 30 0.113 15.5 1.00000 0.00000 heptageniidae leptophlebiidae
## 1153 43 46 40 19 13 0.040 5.5 0.99998 0.00015 heptageniidae chloroperlidae
## 1154 43 47 40 68 32 0.145 19.9 1.00000 0.00000 heptageniidae leuctridae
## 1155 43 48 40 46 29 0.098 13.4 1.00000 0.00000 heptageniidae nemouridae
## 1156 43 49 40 44 30 0.094 12.8 1.00000 0.00000 heptageniidae perlidae
## 1157 43 50 40 18 14 0.038 5.3 1.00000 0.00001 heptageniidae perlodidae
## 1158 43 52 40 107 36 0.228 31.2 0.99422 0.02242 heptageniidae hydropsychidae
## 1160 43 54 40 30 13 0.064 8.8 0.98254 0.04697 heptageniidae lepidostomatidae
## 1161 43 55 40 45 23 0.096 13.1 0.99998 0.00011 heptageniidae limnephilidae
## 1165 43 59 40 8 6 0.017 2.3 0.99925 0.00790 heptageniidae phryganeidae
## 1167 43 61 40 24 13 0.051 7.0 0.99901 0.00430 heptageniidae rhyacophilidae
## 1168 43 62 40 46 27 0.098 13.4 1.00000 0.00000 heptageniidae uenoidae
## 1169 44 45 11 53 10 0.031 4.3 0.99999 0.00032 leptohyphidae leptophlebiidae
## 1170 44 46 11 19 7 0.011 1.5 1.00000 0.00008 leptohyphidae chloroperlidae
## 1171 44 47 11 68 11 0.040 5.5 1.00000 0.00029 leptohyphidae leuctridae
## 1172 44 48 11 46 11 0.027 3.7 1.00000 0.00000 leptohyphidae nemouridae
## 1173 44 49 11 44 11 0.026 3.5 1.00000 0.00000 leptohyphidae perlidae
## 1174 44 50 11 18 4 0.011 1.4 0.99369 0.03869 leptohyphidae perlodidae
## 1176 44 53 11 16 4 0.009 1.3 0.99651 0.02520 leptohyphidae hydroptilidae
## 1182 44 62 11 46 10 0.027 3.7 1.00000 0.00007 leptohyphidae uenoidae
## 1183 45 46 53 19 16 0.054 7.4 1.00000 0.00002 leptophlebiidae chloroperlidae
## 1184 45 47 53 68 47 0.192 26.3 1.00000 0.00000 leptophlebiidae leuctridae
## 1185 45 48 53 46 37 0.130 17.8 1.00000 0.00000 leptophlebiidae nemouridae
## 1186 45 49 53 44 36 0.124 17.0 1.00000 0.00000 leptophlebiidae perlidae
## 1187 45 50 53 18 14 0.051 7.0 0.99995 0.00038 leptophlebiidae perlodidae
## 1188 45 52 53 107 50 0.302 41.4 0.99999 0.00013 leptophlebiidae hydropsychidae
## 1190 45 54 53 30 26 0.085 11.6 1.00000 0.00000 leptophlebiidae lepidostomatidae
## 1191 45 55 53 45 31 0.127 17.4 1.00000 0.00000 leptophlebiidae limnephilidae
## 1192 45 56 53 4 4 0.011 1.5 1.00000 0.02085 leptophlebiidae molannidae
## 1193 45 57 53 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00768 leptophlebiidae odontoceridae
## 1196 45 60 53 56 29 0.158 21.7 0.99740 0.00741 leptophlebiidae polycentropodidae
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## 1199 46 47 19 68 18 0.069 9.4 1.00000 0.00001 chloroperlidae leuctridae
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## 1202 46 50 19 18 10 0.018 2.5 1.00000 0.00001 chloroperlidae perlodidae
## 1203 46 52 19 107 18 0.108 14.8 0.99382 0.04576 chloroperlidae hydropsychidae
## 1205 46 54 19 30 8 0.030 4.2 0.99283 0.02779 chloroperlidae lepidostomatidae
## 1207 46 58 19 62 15 0.063 8.6 0.99977 0.00152 chloroperlidae philopotamidae
## 1209 46 60 19 56 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 chloroperlidae polycentropodidae
## 1210 46 61 19 24 9 0.024 3.3 0.99985 0.00107 chloroperlidae rhyacophilidae
## 1211 46 62 19 46 15 0.047 6.4 1.00000 0.00002 chloroperlidae uenoidae
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## 1215 47 52 68 107 65 0.388 53.1 1.00000 0.00000 leuctridae hydropsychidae
## 1217 47 54 68 30 26 0.109 14.9 1.00000 0.00000 leuctridae lepidostomatidae
## 1218 47 55 68 45 34 0.163 22.3 1.00000 0.00002 leuctridae limnephilidae
## 1220 47 57 68 5 5 0.018 2.5 1.00000 0.02790 leuctridae odontoceridae
## 1221 47 58 68 62 46 0.225 30.8 1.00000 0.00000 leuctridae philopotamidae
## 1223 47 60 68 56 40 0.203 27.8 1.00000 0.00002 leuctridae polycentropodidae
## 1224 47 61 68 24 22 0.087 11.9 1.00000 0.00000 leuctridae rhyacophilidae
## 1225 47 62 68 46 38 0.167 22.8 1.00000 0.00000 leuctridae uenoidae
## 1226 48 49 46 44 31 0.108 14.8 1.00000 0.00000 nemouridae perlidae
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## 1228 48 52 46 107 44 0.262 35.9 0.99998 0.00017 nemouridae hydropsychidae
## 1230 48 54 46 30 23 0.074 10.1 1.00000 0.00000 nemouridae lepidostomatidae
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## 1234 48 58 46 62 31 0.152 20.8 0.99995 0.00020 nemouridae philopotamidae
## 1237 48 61 46 24 21 0.059 8.1 1.00000 0.00000 nemouridae rhyacophilidae
## 1238 48 62 46 46 31 0.113 15.4 1.00000 0.00000 nemouridae uenoidae
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## 1240 49 52 44 107 41 0.251 34.4 0.99969 0.00199 perlidae hydropsychidae
## 1242 49 54 44 30 16 0.070 9.6 0.99850 0.00551 perlidae lepidostomatidae
## 1243 49 55 44 45 26 0.105 14.5 1.00000 0.00001 perlidae limnephilidae
## 1246 49 58 44 62 28 0.145 19.9 0.99923 0.00261 perlidae philopotamidae
## 1247 49 59 44 8 6 0.019 2.6 0.99850 0.01358 perlidae phryganeidae
## 1249 49 61 44 24 12 0.056 7.7 0.98795 0.03632 perlidae rhyacophilidae
## 1250 49 62 44 46 29 0.108 14.8 1.00000 0.00000 perlidae uenoidae
## 1253 50 54 18 30 9 0.029 3.9 0.99919 0.00446 perlodidae lepidostomatidae
## 1259 50 62 18 46 14 0.044 6.0 1.00000 0.00005 perlodidae uenoidae
## 1262 52 54 107 30 28 0.171 23.4 0.99741 0.01529 hydropsychidae lepidostomatidae
## 1263 52 55 107 45 40 0.257 35.1 0.99302 0.02442 hydropsychidae limnephilidae
## 1266 52 58 107 62 59 0.353 48.4 1.00000 0.00000 hydropsychidae philopotamidae
## 1268 52 60 107 56 51 0.319 43.7 0.99968 0.00162 hydropsychidae polycentropodidae
## 1269 52 61 107 24 24 0.137 18.7 1.00000 0.00138 hydropsychidae rhyacophilidae
## 1270 52 62 107 46 43 0.262 35.9 0.99983 0.00113 hydropsychidae uenoidae
## 1274 53 60 16 56 11 0.048 6.5 0.99625 0.01664 hydroptilidae polycentropodidae
## 1277 54 55 30 45 23 0.072 9.9 1.00000 0.00000 lepidostomatidae limnephilidae
## 1278 54 57 30 5 5 0.008 1.1 1.00000 0.00038 lepidostomatidae odontoceridae
## 1282 54 61 30 24 16 0.038 5.3 1.00000 0.00000 lepidostomatidae rhyacophilidae
## 1283 54 62 30 46 17 0.074 10.1 0.99927 0.00291 lepidostomatidae uenoidae
## 1284 55 56 45 4 4 0.010 1.3 1.00000 0.01061 limnephilidae molannidae
## 1285 55 57 45 5 5 0.012 1.6 1.00000 0.00327 limnephilidae odontoceridae
## 1286 55 58 45 62 26 0.149 20.4 0.98754 0.03032 limnephilidae philopotamidae
## 1289 55 61 45 24 16 0.058 7.9 0.99997 0.00020 limnephilidae rhyacophilidae
## 1290 55 62 45 46 22 0.110 15.1 0.99759 0.00735 limnephilidae uenoidae
## 1294 57 58 5 62 5 0.017 2.3 1.00000 0.01732 odontoceridae philopotamidae
## 1298 58 60 62 56 36 0.185 25.3 0.99996 0.00018 philopotamidae polycentropodidae
## 1299 58 61 62 24 18 0.079 10.9 0.99976 0.00127 philopotamidae rhyacophilidae
## 1300 58 62 62 46 28 0.152 20.8 0.99742 0.00754 philopotamidae uenoidae
## 1303 59 62 8 46 7 0.020 2.7 0.99990 0.00205 phryganeidae uenoidae
## 1304 60 61 56 24 17 0.072 9.8 0.99978 0.00117 polycentropodidae rhyacophilidae
## 1305 60 62 56 46 26 0.137 18.8 0.99764 0.00699 polycentropodidae uenoidae
## 1306 61 62 24 46 18 0.059 8.1 1.00000 0.00001 rhyacophilidae uenoidaeco[, "sp1_name"] == rownames(streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3)[co$sp1]## [1] TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE TRUE
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visIgraphLayout(layout = "layout_with_kk")plot(cooc)
pair.attributes(cooc)## pos neg rand num_pos num_neg num_rand sppname
## 1 9.30 9.30 81.40 4 4 35 streambioticsum_suff_mtdusky
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## 20 46.55 0.00 53.45 27 0 31 streambioticsum_suff_twolined
## 31 30.30 3.03 66.67 10 1 22 streambioticsum_suff_longtail
## 42 36.59 14.63 48.78 15 6 20 streambioticsum_suff_red
## 53 0.00 0.00 100.00 0 0 12 streambioticsum_suff_mole
## 57 35.85 5.66 58.49 19 3 31 streambioticsum_suff_redback
## 58 34.21 0.00 65.79 13 0 25 streambioticsum_suff_slimy
## 59 37.21 2.33 60.47 16 1 26 blacknose_dace
## 2 0.00 0.00 100.00 0 0 12 bluegill_sunfish
## 3 0.00 0.00 100.00 0 0 25 central_stoneroller_minnow
## 4 25.49 3.92 70.59 13 2 36 creek_chub
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## 6 6.25 0.00 93.75 2 0 30 johnny_darter
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## 12 0.00 6.90 93.10 0 4 54 aquatic_worms
## 13 7.84 25.49 66.67 4 13 34 sow_bugs
## 14 3.77 16.98 79.25 2 9 42 scuds
## 15 11.32 0.00 88.68 6 0 47 water_mites
## 16 18.97 8.62 72.41 11 5 42 damselfly_nymphs
## 17 49.06 5.66 45.28 26 3 24 alderfly_larvae
## 18 8.62 0.00 91.38 5 0 53 other_beetles
## 19 46.55 0.00 53.45 27 0 31 crayfish
## 21 48.28 1.72 50.00 28 1 29 dragonfly_nymphs
## 22 41.38 3.45 55.17 24 2 32 riffle_beetles
## 23 5.17 0.00 94.83 3 0 55 other_flies
## 24 6.90 15.52 77.59 4 9 45 snails
## 25 9.80 0.00 90.20 5 0 46 clams
## 26 49.06 3.77 47.17 26 2 25 fishfly_larvae
## 27 56.86 0.00 43.14 29 0 22 water_penny_beetles
## 28 29.31 0.00 70.69 17 0 41 cranefly_larvae
## 29 50.94 1.89 47.17 27 1 25 ameletidae
## 30 41.38 0.00 58.62 24 0 34 baetidae
## 32 17.07 0.00 82.93 7 0 34 caenidae
## 33 3.03 0.00 96.97 1 0 32 ephemerellidae
## 34 4.00 0.00 96.00 1 0 24 ephemeridae
## 35 49.02 3.92 47.06 25 2 24 heptageniidae
## 36 41.46 2.44 56.10 17 1 23 leptohyphidae
## 37 56.60 7.55 35.85 30 4 19 leptophlebiidae
## 38 55.81 0.00 44.19 24 0 19 chloroperlidae
## 39 62.26 7.55 30.19 33 4 16 leuctridae
## 40 54.72 7.55 37.74 29 4 20 nemouridae
## 41 56.86 7.84 35.29 29 4 18 perlidae
## 43 37.21 2.33 60.47 16 1 26 perlodidae
## 44 0.00 0.00 100.00 0 0 12 glossosomatidae
## 45 46.55 0.00 53.45 27 0 31 hydropsychidae
## 46 7.32 0.00 92.68 3 0 38 hydroptilidae
## 47 45.65 13.04 41.30 21 6 19 lepidostomatidae
## 48 43.14 5.88 50.98 22 3 26 limnephilidae
## 49 9.38 0.00 90.62 3 0 29 molannidae
## 50 27.27 3.03 69.70 9 1 23 odontoceridae
## 51 47.17 0.00 52.83 25 0 28 philopotamidae
## 52 15.79 0.00 84.21 6 0 32 phryganeidae
## 54 35.85 0.00 64.15 19 0 34 polycentropodidae
## 55 53.49 4.65 41.86 23 2 18 rhyacophilidae
## 56 60.38 3.77 35.85 32 2 19 uenoidaepair.profile(cooc)
prob.table(cooc)## sp1 sp2 sp1_inc sp2_inc obs_cooccur prob_cooccur exp_cooccur p_lt p_gt sp1_name sp2_name
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## 2 1 3 24 102 22 0.130 17.9 0.99560 0.02403 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_twolined
## 3 1 5 24 17 1 0.022 3.0 0.15631 0.96998 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_red
## 4 1 7 24 60 7 0.077 10.5 0.08500 0.96732 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_redback
## 5 1 8 24 8 0 0.010 1.4 0.20475 1.00000 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_slimy
## 6 1 9 24 19 3 0.024 3.3 0.56475 0.69032 streambioticsum_suff_mtdusky blacknose_dace
## 7 1 13 24 36 3 0.046 6.3 0.07063 0.98020 streambioticsum_suff_mtdusky creek_chub
## 8 1 22 24 122 21 0.156 21.4 0.51086 0.74679 streambioticsum_suff_mtdusky aquatic_worms
## 9 1 23 24 42 10 0.054 7.4 0.93469 0.14836 streambioticsum_suff_mtdusky sow_bugs
## 10 1 24 24 51 11 0.065 8.9 0.88279 0.23168 streambioticsum_suff_mtdusky scuds
## 11 1 25 24 52 9 0.066 9.1 0.57625 0.60647 streambioticsum_suff_mtdusky water_mites
## 12 1 26 24 78 16 0.100 13.7 0.90212 0.20319 streambioticsum_suff_mtdusky damselfly_nymphs
## 13 1 27 24 59 12 0.075 10.3 0.83707 0.29720 streambioticsum_suff_mtdusky alderfly_larvae
## 14 1 28 24 105 18 0.134 18.4 0.50977 0.69077 streambioticsum_suff_mtdusky other_beetles
## 15 1 29 24 104 21 0.133 18.2 0.96499 0.11199 streambioticsum_suff_mtdusky crayfish
## 16 1 30 24 100 18 0.128 17.5 0.68288 0.51399 streambioticsum_suff_mtdusky dragonfly_nymphs
## 17 1 31 24 79 10 0.101 13.8 0.06502 0.97533 streambioticsum_suff_mtdusky riffle_beetles
## 18 1 32 24 135 24 0.173 23.6 1.00000 0.67926 streambioticsum_suff_mtdusky other_flies
## 19 1 33 24 99 20 0.127 17.3 0.94914 0.13826 streambioticsum_suff_mtdusky snails
## 20 1 34 24 45 7 0.058 7.9 0.43440 0.74225 streambioticsum_suff_mtdusky clams
## 21 1 35 24 52 12 0.066 9.1 0.94047 0.13452 streambioticsum_suff_mtdusky fishfly_larvae
## 22 1 36 24 39 10 0.050 6.8 0.96313 0.09415 streambioticsum_suff_mtdusky water_penny_beetles
## 23 1 37 24 125 23 0.160 21.9 0.91110 0.33991 streambioticsum_suff_mtdusky cranefly_larvae
## 24 1 38 24 56 13 0.072 9.8 0.95331 0.10996 streambioticsum_suff_mtdusky ameletidae
## 25 1 39 24 117 22 0.150 20.5 0.90672 0.27268 streambioticsum_suff_mtdusky baetidae
## 26 1 40 24 13 2 0.017 2.3 0.59393 0.70628 streambioticsum_suff_mtdusky caenidae
## 27 1 43 24 40 1 0.051 7.0 0.00134 0.99990 streambioticsum_suff_mtdusky heptageniidae
## 28 1 44 24 11 0 0.014 1.9 0.10982 1.00000 streambioticsum_suff_mtdusky leptohyphidae
## 29 1 45 24 53 6 0.068 9.3 0.09766 0.96263 streambioticsum_suff_mtdusky leptophlebiidae
## 30 1 46 24 19 3 0.024 3.3 0.56475 0.69032 streambioticsum_suff_mtdusky chloroperlidae
## 31 1 47 24 68 18 0.087 11.9 0.99873 0.00548 streambioticsum_suff_mtdusky leuctridae
## 32 1 48 24 46 4 0.059 8.1 0.04100 0.98845 streambioticsum_suff_mtdusky nemouridae
## 33 1 49 24 44 3 0.056 7.7 0.01717 0.99635 streambioticsum_suff_mtdusky perlidae
## 34 1 50 24 18 1 0.023 3.2 0.13211 0.97598 streambioticsum_suff_mtdusky perlodidae
## 35 1 52 24 107 21 0.137 18.7 0.94022 0.17087 streambioticsum_suff_mtdusky hydropsychidae
## 36 1 53 24 16 3 0.020 2.8 0.70244 0.56008 streambioticsum_suff_mtdusky hydroptilidae
## 37 1 54 24 30 4 0.038 5.3 0.35189 0.82913 streambioticsum_suff_mtdusky lepidostomatidae
## 38 1 55 24 45 1 0.058 7.9 0.00037 0.99998 streambioticsum_suff_mtdusky limnephilidae
## 39 1 58 24 62 13 0.079 10.9 0.88310 0.22928 streambioticsum_suff_mtdusky philopotamidae
## 40 1 59 24 8 0 0.010 1.4 0.20475 1.00000 streambioticsum_suff_mtdusky phryganeidae
## 41 1 60 24 56 15 0.072 9.8 0.99514 0.01657 streambioticsum_suff_mtdusky polycentropodidae
## 42 1 61 24 24 4 0.031 4.2 0.58531 0.64733 streambioticsum_suff_mtdusky rhyacophilidae
## 43 1 62 24 46 8 0.059 8.1 0.58944 0.59824 streambioticsum_suff_mtdusky uenoidae
## 44 2 3 51 102 48 0.277 38.0 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_twolined
## 45 2 4 51 5 2 0.014 1.9 0.73243 0.61686 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_longtail
## 46 2 5 51 17 12 0.046 6.3 0.99945 0.00317 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_red
## 47 2 7 51 60 28 0.163 22.3 0.98593 0.03299 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_redback
## 48 2 8 51 8 7 0.022 3.0 0.99975 0.00424 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_slimy
## 49 2 9 51 19 8 0.052 7.1 0.76918 0.40791 streambioticsum_suff_nodusky blacknose_dace
## 50 2 11 51 3 1 0.008 1.1 0.68877 0.75588 streambioticsum_suff_nodusky central_stoneroller_minnow
## 51 2 13 51 36 10 0.098 13.4 0.12128 0.94325 streambioticsum_suff_nodusky creek_chub
## 52 2 15 51 4 1 0.011 1.5 0.52285 0.84879 streambioticsum_suff_nodusky johnny_darter
## 53 2 16 51 4 0 0.011 1.5 0.15121 1.00000 streambioticsum_suff_nodusky rainbow_darter
## 54 2 19 51 4 1 0.011 1.5 0.52285 0.84879 streambioticsum_suff_nodusky white_sucker
## 55 2 21 51 4 4 0.011 1.5 1.00000 0.01779 streambioticsum_suff_nodusky sessile_animals
## 56 2 22 51 122 46 0.332 45.4 0.72538 0.48889 streambioticsum_suff_nodusky aquatic_worms
## 57 2 23 51 42 15 0.114 15.6 0.48193 0.66618 streambioticsum_suff_nodusky sow_bugs
## 58 2 24 51 51 19 0.139 19.0 0.57607 0.56882 streambioticsum_suff_nodusky scuds
## 59 2 25 51 52 24 0.141 19.4 0.96910 0.06608 streambioticsum_suff_nodusky water_mites
## 60 2 26 51 78 27 0.212 29.0 0.29131 0.81742 streambioticsum_suff_nodusky damselfly_nymphs
## 61 2 27 51 59 29 0.160 22.0 0.99643 0.00985 streambioticsum_suff_nodusky alderfly_larvae
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## 65 2 31 51 79 26 0.215 29.4 0.14909 0.91879 streambioticsum_suff_nodusky riffle_beetles
## 66 2 32 51 135 51 0.367 50.3 1.00000 0.39234 streambioticsum_suff_nodusky other_flies
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## 75 2 41 51 5 1 0.014 1.9 0.38314 0.90677 streambioticsum_suff_nodusky ephemerellidae
## 76 2 42 51 3 1 0.008 1.1 0.68877 0.75588 streambioticsum_suff_nodusky ephemeridae
## 77 2 43 51 40 16 0.109 14.9 0.73546 0.40392 streambioticsum_suff_nodusky heptageniidae
## 78 2 44 51 11 5 0.030 4.1 0.82046 0.38816 streambioticsum_suff_nodusky leptohyphidae
## 79 2 45 51 53 27 0.144 19.7 0.99754 0.00714 streambioticsum_suff_nodusky leptophlebiidae
## 80 2 46 51 19 9 0.052 7.1 0.89164 0.23082 streambioticsum_suff_nodusky chloroperlidae
## 81 2 47 51 68 36 0.185 25.3 0.99997 0.00014 streambioticsum_suff_nodusky leuctridae
## 82 2 48 51 46 23 0.125 17.1 0.99118 0.02262 streambioticsum_suff_nodusky nemouridae
## 83 2 49 51 44 17 0.120 16.4 0.66585 0.47952 streambioticsum_suff_nodusky perlidae
## 84 2 50 51 18 7 0.049 6.7 0.66666 0.53500 streambioticsum_suff_nodusky perlodidae
## 85 2 52 51 107 48 0.291 39.8 0.99997 0.00025 streambioticsum_suff_nodusky hydropsychidae
## 86 2 53 51 16 7 0.043 6.0 0.80341 0.37646 streambioticsum_suff_nodusky hydroptilidae
## 87 2 54 51 30 17 0.082 11.2 0.99624 0.01210 streambioticsum_suff_nodusky lepidostomatidae
## 88 2 55 51 45 17 0.122 16.8 0.61271 0.53551 streambioticsum_suff_nodusky limnephilidae
## 89 2 56 51 4 2 0.011 1.5 0.85468 0.47715 streambioticsum_suff_nodusky molannidae
## 90 2 57 51 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00629 streambioticsum_suff_nodusky odontoceridae
## 91 2 58 51 62 30 0.168 23.1 0.99583 0.01128 streambioticsum_suff_nodusky philopotamidae
## 92 2 59 51 8 4 0.022 3.0 0.87324 0.33909 streambioticsum_suff_nodusky phryganeidae
## 93 2 60 51 56 28 0.152 20.8 0.99700 0.00847 streambioticsum_suff_nodusky polycentropodidae
## 94 2 61 51 24 18 0.065 8.9 0.99999 0.00004 streambioticsum_suff_nodusky rhyacophilidae
## 95 2 62 51 46 27 0.125 17.1 0.99994 0.00024 streambioticsum_suff_nodusky uenoidae
## 96 3 4 102 5 5 0.027 3.7 1.00000 0.22296 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_longtail
## 97 3 5 102 17 16 0.092 12.7 0.99545 0.03606 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_red
## 98 3 6 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_mole
## 99 3 7 102 60 49 0.326 44.7 0.97288 0.06430 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_redback
## 100 3 8 102 8 8 0.043 6.0 1.00000 0.08774 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_slimy
## 101 3 9 102 19 19 0.103 14.1 1.00000 0.00228 streambioticsum_suff_twolined blacknose_dace
## 102 3 10 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined bluegill_sunfish
## 103 3 11 102 3 2 0.016 2.2 0.59043 0.83962 streambioticsum_suff_twolined central_stoneroller_minnow
## 104 3 13 102 36 32 0.196 26.8 0.99643 0.01475 streambioticsum_suff_twolined creek_chub
## 105 3 14 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined green_sunfish
## 106 3 15 102 4 3 0.022 3.0 0.69741 0.73050 streambioticsum_suff_twolined johnny_darter
## 107 3 16 102 4 4 0.022 3.0 1.00000 0.30259 streambioticsum_suff_twolined rainbow_darter
## 108 3 17 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined redbelly_dace
## 109 3 19 102 4 3 0.022 3.0 0.69741 0.73050 streambioticsum_suff_twolined white_sucker
## 110 3 21 102 4 4 0.022 3.0 1.00000 0.30259 streambioticsum_suff_twolined sessile_animals
## 111 3 22 102 122 90 0.663 90.8 0.43373 0.79405 streambioticsum_suff_twolined aquatic_worms
## 112 3 23 102 42 27 0.228 31.3 0.05636 0.97710 streambioticsum_suff_twolined sow_bugs
## 113 3 24 102 51 35 0.277 38.0 0.15833 0.91932 streambioticsum_suff_twolined scuds
## 114 3 25 102 52 42 0.283 38.7 0.93848 0.12995 streambioticsum_suff_twolined water_mites
## 115 3 26 102 78 61 0.424 58.1 0.91207 0.16843 streambioticsum_suff_twolined damselfly_nymphs
## 116 3 27 102 59 52 0.321 43.9 0.99977 0.00105 streambioticsum_suff_twolined alderfly_larvae
## 117 3 28 102 105 82 0.571 78.2 0.97493 0.06445 streambioticsum_suff_twolined other_beetles
## 118 3 29 102 104 90 0.565 77.4 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined crayfish
## 119 3 30 102 100 82 0.543 74.5 0.99971 0.00126 streambioticsum_suff_twolined dragonfly_nymphs
## 120 3 31 102 79 69 0.429 58.8 0.99999 0.00006 streambioticsum_suff_twolined riffle_beetles
## 121 3 32 102 135 102 0.734 100.5 1.00000 0.06387 streambioticsum_suff_twolined other_flies
## 122 3 33 102 99 73 0.538 73.7 0.47021 0.69704 streambioticsum_suff_twolined snails
## 123 3 34 102 45 34 0.245 33.5 0.65727 0.50534 streambioticsum_suff_twolined clams
## 124 3 35 102 52 48 0.283 38.7 0.99999 0.00009 streambioticsum_suff_twolined fishfly_larvae
## 125 3 36 102 39 39 0.212 29.0 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined water_penny_beetles
## 126 3 37 102 125 100 0.679 93.1 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_twolined cranefly_larvae
## 127 3 38 102 56 52 0.304 41.7 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_twolined ameletidae
## 128 3 39 102 117 95 0.636 87.1 0.99999 0.00006 streambioticsum_suff_twolined baetidae
## 129 3 40 102 13 11 0.071 9.7 0.89403 0.30429 streambioticsum_suff_twolined caenidae
## 130 3 41 102 5 5 0.027 3.7 1.00000 0.22296 streambioticsum_suff_twolined ephemerellidae
## 131 3 42 102 3 2 0.016 2.2 0.59043 0.83962 streambioticsum_suff_twolined ephemeridae
## 132 3 43 102 40 35 0.217 29.8 0.99509 0.01788 streambioticsum_suff_twolined heptageniidae
## 133 3 44 102 11 10 0.060 8.2 0.96635 0.17448 streambioticsum_suff_twolined leptohyphidae
## 134 3 45 102 53 52 0.288 39.5 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined leptophlebiidae
## 135 3 46 102 19 18 0.103 14.1 0.99772 0.02030 streambioticsum_suff_twolined chloroperlidae
## 136 3 47 102 68 64 0.370 50.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined leuctridae
## 137 3 48 102 46 43 0.250 34.2 0.99999 0.00013 streambioticsum_suff_twolined nemouridae
## 138 3 49 102 44 42 0.239 32.8 1.00000 0.00003 streambioticsum_suff_twolined perlidae
## 139 3 50 102 18 16 0.098 13.4 0.97286 0.10749 streambioticsum_suff_twolined perlodidae
## 140 3 51 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined glossosomatidae
## 141 3 52 102 107 93 0.581 79.7 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined hydropsychidae
## 142 3 53 102 16 12 0.087 11.9 0.62602 0.61297 streambioticsum_suff_twolined hydroptilidae
## 143 3 54 102 30 28 0.163 22.3 0.99941 0.00427 streambioticsum_suff_twolined lepidostomatidae
## 144 3 55 102 45 38 0.245 33.5 0.98388 0.04504 streambioticsum_suff_twolined limnephilidae
## 145 3 56 102 4 4 0.022 3.0 1.00000 0.30259 streambioticsum_suff_twolined molannidae
## 146 3 57 102 5 5 0.027 3.7 1.00000 0.22296 streambioticsum_suff_twolined odontoceridae
## 147 3 58 102 62 57 0.337 46.2 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_twolined philopotamidae
## 148 3 59 102 8 7 0.043 6.0 0.91226 0.34635 streambioticsum_suff_twolined phryganeidae
## 149 3 60 102 56 51 0.304 41.7 0.99998 0.00013 streambioticsum_suff_twolined polycentropodidae
## 150 3 61 102 24 23 0.130 17.9 0.99962 0.00440 streambioticsum_suff_twolined rhyacophilidae
## 151 3 62 102 46 42 0.250 34.2 0.99987 0.00077 streambioticsum_suff_twolined uenoidae
## 152 4 7 5 60 5 0.016 2.2 1.00000 0.01462 streambioticsum_suff_longtail streambioticsum_suff_redback
## 153 4 13 5 36 1 0.010 1.3 0.60550 0.78797 streambioticsum_suff_longtail creek_chub
## 154 4 22 5 122 5 0.033 4.5 1.00000 0.55489 streambioticsum_suff_longtail aquatic_worms
## 155 4 23 5 42 0 0.011 1.5 0.15510 1.00000 streambioticsum_suff_longtail sow_bugs
## 156 4 24 5 51 0 0.014 1.9 0.09323 1.00000 streambioticsum_suff_longtail scuds
## 157 4 25 5 52 1 0.014 1.9 0.36965 0.91219 streambioticsum_suff_longtail water_mites
## 158 4 26 5 78 3 0.021 2.8 0.71820 0.63024 streambioticsum_suff_longtail damselfly_nymphs
## 159 4 27 5 59 5 0.016 2.2 1.00000 0.01340 streambioticsum_suff_longtail alderfly_larvae
## 160 4 28 5 105 5 0.028 3.8 1.00000 0.25848 streambioticsum_suff_longtail other_beetles
## 161 4 29 5 104 5 0.028 3.8 1.00000 0.24617 streambioticsum_suff_longtail crayfish
## 162 4 30 5 100 4 0.027 3.6 0.79846 0.58992 streambioticsum_suff_longtail dragonfly_nymphs
## 163 4 31 5 79 3 0.021 2.9 0.70639 0.64353 streambioticsum_suff_longtail riffle_beetles
## 164 4 32 5 135 5 0.036 4.9 1.00000 0.92808 streambioticsum_suff_longtail other_flies
## 165 4 33 5 99 1 0.026 3.6 0.02091 0.99866 streambioticsum_suff_longtail snails
## 166 4 34 5 45 2 0.012 1.6 0.80103 0.53177 streambioticsum_suff_longtail clams
## 167 4 35 5 52 5 0.014 1.9 1.00000 0.00696 streambioticsum_suff_longtail fishfly_larvae
## 168 4 36 5 39 4 0.010 1.4 0.99846 0.02312 streambioticsum_suff_longtail water_penny_beetles
## 169 4 37 5 125 5 0.033 4.6 1.00000 0.62782 streambioticsum_suff_longtail cranefly_larvae
## 170 4 38 5 56 2 0.015 2.0 0.66972 0.68201 streambioticsum_suff_longtail ameletidae
## 171 4 39 5 117 4 0.031 4.3 0.55149 0.84543 streambioticsum_suff_longtail baetidae
## 172 4 43 5 40 3 0.011 1.5 0.97451 0.14863 streambioticsum_suff_longtail heptageniidae
## 173 4 45 5 53 5 0.014 1.9 1.00000 0.00768 streambioticsum_suff_longtail leptophlebiidae
## 174 4 47 5 68 5 0.018 2.5 1.00000 0.02790 streambioticsum_suff_longtail leuctridae
## 175 4 48 5 46 5 0.012 1.7 1.00000 0.00367 streambioticsum_suff_longtail nemouridae
## 176 4 49 5 44 3 0.012 1.6 0.96330 0.18837 streambioticsum_suff_longtail perlidae
## 177 4 52 5 107 5 0.029 3.9 1.00000 0.28458 streambioticsum_suff_longtail hydropsychidae
## 178 4 54 5 30 4 0.008 1.1 0.99962 0.00823 streambioticsum_suff_longtail lepidostomatidae
## 179 4 55 5 45 5 0.012 1.6 1.00000 0.00327 streambioticsum_suff_longtail limnephilidae
## 180 4 58 5 62 2 0.017 2.3 0.58974 0.75207 streambioticsum_suff_longtail philopotamidae
## 181 4 60 5 56 2 0.015 2.0 0.66972 0.68201 streambioticsum_suff_longtail polycentropodidae
## 182 4 62 5 46 4 0.012 1.7 0.99633 0.04342 streambioticsum_suff_longtail uenoidae
## 183 5 7 17 60 16 0.054 7.4 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_red streambioticsum_suff_redback
## 184 5 9 17 19 0 0.017 2.4 0.06632 1.00000 streambioticsum_suff_red blacknose_dace
## 185 5 13 17 36 0 0.033 4.5 0.00380 1.00000 streambioticsum_suff_red creek_chub
## 186 5 22 17 122 16 0.111 15.1 0.87814 0.41501 streambioticsum_suff_red aquatic_worms
## 187 5 23 17 42 1 0.038 5.2 0.01222 0.99878 streambioticsum_suff_red sow_bugs
## 188 5 24 17 51 8 0.046 6.3 0.87699 0.26200 streambioticsum_suff_red scuds
## 189 5 25 17 52 8 0.047 6.5 0.86244 0.28462 streambioticsum_suff_red water_mites
## 190 5 26 17 78 4 0.071 9.7 0.00328 0.99946 streambioticsum_suff_red damselfly_nymphs
## 191 5 27 17 59 8 0.053 7.3 0.73275 0.45919 streambioticsum_suff_red alderfly_larvae
## 192 5 28 17 105 14 0.095 13.0 0.81362 0.40238 streambioticsum_suff_red other_beetles
## 193 5 29 17 104 16 0.094 12.9 0.99348 0.04809 streambioticsum_suff_red crayfish
## 194 5 30 17 100 16 0.091 12.4 0.99684 0.02679 streambioticsum_suff_red dragonfly_nymphs
## 195 5 31 17 79 6 0.072 9.8 0.04226 0.98778 streambioticsum_suff_red riffle_beetles
## 196 5 32 17 135 17 0.122 16.8 1.00000 0.76642 streambioticsum_suff_red other_flies
## 197 5 33 17 99 4 0.090 12.3 0.00001 1.00000 streambioticsum_suff_red snails
## 198 5 34 17 45 7 0.041 5.6 0.85448 0.30083 streambioticsum_suff_red clams
## 199 5 35 17 52 13 0.047 6.5 0.99991 0.00070 streambioticsum_suff_red fishfly_larvae
## 200 5 36 17 39 7 0.035 4.8 0.93306 0.16919 streambioticsum_suff_red water_penny_beetles
## 201 5 37 17 125 17 0.113 15.5 1.00000 0.18966 streambioticsum_suff_red cranefly_larvae
## 202 5 38 17 56 1 0.051 6.9 0.00095 0.99994 streambioticsum_suff_red ameletidae
## 203 5 39 17 117 16 0.106 14.5 0.94323 0.24786 streambioticsum_suff_red baetidae
## 204 5 40 17 13 0 0.012 1.6 0.16387 1.00000 streambioticsum_suff_red caenidae
## 205 5 43 17 40 7 0.036 5.0 0.92263 0.18866 streambioticsum_suff_red heptageniidae
## 206 5 44 17 11 1 0.010 1.4 0.59196 0.78076 streambioticsum_suff_red leptohyphidae
## 207 5 45 17 53 16 0.048 6.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red leptophlebiidae
## 208 5 46 17 19 4 0.017 2.4 0.93790 0.19008 streambioticsum_suff_red chloroperlidae
## 209 5 47 17 68 16 0.062 8.4 1.00000 0.00005 streambioticsum_suff_red leuctridae
## 210 5 48 17 46 14 0.042 5.7 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_red nemouridae
## 211 5 49 17 44 8 0.040 5.5 0.95120 0.12971 streambioticsum_suff_red perlidae
## 212 5 50 17 18 3 0.016 2.2 0.83686 0.39216 streambioticsum_suff_red perlodidae
## 213 5 52 17 107 17 0.097 13.3 1.00000 0.01102 streambioticsum_suff_red hydropsychidae
## 214 5 53 17 16 2 0.014 2.0 0.68414 0.62343 streambioticsum_suff_red hydroptilidae
## 215 5 54 17 30 16 0.027 3.7 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red lepidostomatidae
## 216 5 55 17 45 15 0.041 5.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red limnephilidae
## 217 5 58 17 62 13 0.056 7.7 0.99894 0.00586 streambioticsum_suff_red philopotamidae
## 218 5 60 17 56 9 0.051 6.9 0.90975 0.20591 streambioticsum_suff_red polycentropodidae
## 219 5 61 17 24 11 0.022 3.0 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red rhyacophilidae
## 220 5 62 17 46 10 0.042 5.7 0.99478 0.02088 streambioticsum_suff_red uenoidae
## 221 6 22 2 122 2 0.013 1.8 1.00000 0.79229 streambioticsum_suff_mole aquatic_worms
## 222 6 26 2 78 0 0.008 1.1 0.18366 1.00000 streambioticsum_suff_mole damselfly_nymphs
## 223 6 28 2 105 2 0.011 1.5 1.00000 0.58609 streambioticsum_suff_mole other_beetles
## 224 6 29 2 104 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 streambioticsum_suff_mole crayfish
## 225 6 30 2 100 1 0.011 1.5 0.46866 0.92851 streambioticsum_suff_mole dragonfly_nymphs
## 226 6 31 2 79 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 streambioticsum_suff_mole riffle_beetles
## 227 6 32 2 135 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 streambioticsum_suff_mole other_flies
## 228 6 33 2 99 0 0.011 1.4 0.07546 1.00000 streambioticsum_suff_mole snails
## 229 6 37 2 125 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 streambioticsum_suff_mole cranefly_larvae
## 230 6 39 2 117 1 0.012 1.7 0.27158 0.97960 streambioticsum_suff_mole baetidae
## 231 6 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 streambioticsum_suff_mole hydropsychidae
## 232 7 8 60 8 7 0.026 3.5 0.99898 0.01292 streambioticsum_suff_redback streambioticsum_suff_slimy
## 233 7 9 60 19 12 0.061 8.3 0.98122 0.05703 streambioticsum_suff_redback blacknose_dace
## 234 7 11 60 3 2 0.010 1.3 0.91837 0.40673 streambioticsum_suff_redback central_stoneroller_minnow
## 235 7 13 60 36 13 0.115 15.8 0.18794 0.89999 streambioticsum_suff_redback creek_chub
## 236 7 15 60 4 1 0.013 1.8 0.40888 0.90364 streambioticsum_suff_redback johnny_darter
## 237 7 16 60 4 2 0.013 1.8 0.77766 0.59112 streambioticsum_suff_redback rainbow_darter
## 238 7 19 60 4 0 0.013 1.8 0.09636 1.00000 streambioticsum_suff_redback white_sucker
## 239 7 21 60 4 0 0.013 1.8 0.09636 1.00000 streambioticsum_suff_redback sessile_animals
## 240 7 22 60 122 55 0.390 53.4 0.87390 0.28043 streambioticsum_suff_redback aquatic_worms
## 241 7 23 60 42 12 0.134 18.4 0.01311 0.99547 streambioticsum_suff_redback sow_bugs
## 242 7 24 60 51 23 0.163 22.3 0.66130 0.47594 streambioticsum_suff_redback scuds
## 243 7 25 60 52 23 0.166 22.8 0.60226 0.53795 streambioticsum_suff_redback water_mites
## 244 7 26 60 78 27 0.249 34.2 0.01020 0.99620 streambioticsum_suff_redback damselfly_nymphs
## 245 7 27 60 59 33 0.189 25.8 0.99620 0.01020 streambioticsum_suff_redback alderfly_larvae
## 246 7 28 60 105 50 0.336 46.0 0.96827 0.07527 streambioticsum_suff_redback other_beetles
## 247 7 29 60 104 50 0.332 45.5 0.97819 0.05453 streambioticsum_suff_redback crayfish
## 248 7 30 60 100 43 0.320 43.8 0.45296 0.69315 streambioticsum_suff_redback dragonfly_nymphs
## 249 7 31 60 79 32 0.253 34.6 0.23219 0.85989 streambioticsum_suff_redback riffle_beetles
## 250 7 32 60 135 58 0.432 59.1 0.19000 1.00000 streambioticsum_suff_redback other_flies
## 251 7 33 60 99 32 0.316 43.4 0.00001 1.00000 streambioticsum_suff_redback snails
## 252 7 34 60 45 19 0.144 19.7 0.47067 0.67019 streambioticsum_suff_redback clams
## 253 7 35 60 52 34 0.166 22.8 0.99999 0.00007 streambioticsum_suff_redback fishfly_larvae
## 254 7 36 60 39 24 0.125 17.1 0.99768 0.00720 streambioticsum_suff_redback water_penny_beetles
## 255 7 37 60 125 55 0.400 54.7 0.67329 0.56298 streambioticsum_suff_redback cranefly_larvae
## 256 7 38 60 56 23 0.179 24.5 0.36024 0.76070 streambioticsum_suff_redback ameletidae
## 257 7 39 60 117 50 0.374 51.2 0.35695 0.80241 streambioticsum_suff_redback baetidae
## 258 7 40 60 13 4 0.042 5.7 0.24401 0.90317 streambioticsum_suff_redback caenidae
## 259 7 41 60 5 1 0.016 2.2 0.27024 0.94711 streambioticsum_suff_redback ephemerellidae
## 260 7 42 60 3 3 0.010 1.3 1.00000 0.08163 streambioticsum_suff_redback ephemeridae
## 261 7 43 60 40 24 0.128 17.5 0.99589 0.01183 streambioticsum_suff_redback heptageniidae
## 262 7 44 60 11 7 0.035 4.8 0.95531 0.14341 streambioticsum_suff_redback leptohyphidae
## 263 7 45 60 53 36 0.169 23.2 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_redback leptophlebiidae
## 264 7 46 60 19 13 0.061 8.3 0.99515 0.01878 streambioticsum_suff_redback chloroperlidae
## 265 7 47 60 68 40 0.217 29.8 0.99990 0.00038 streambioticsum_suff_redback leuctridae
## 266 7 48 60 46 31 0.147 20.1 0.99998 0.00008 streambioticsum_suff_redback nemouridae
## 267 7 49 60 44 29 0.141 19.3 0.99992 0.00032 streambioticsum_suff_redback perlidae
## 268 7 50 60 18 11 0.058 7.9 0.96713 0.09155 streambioticsum_suff_redback perlodidae
## 269 7 52 60 107 49 0.342 46.9 0.86434 0.24859 streambioticsum_suff_redback hydropsychidae
## 270 7 53 60 16 7 0.051 7.0 0.60688 0.60361 streambioticsum_suff_redback hydroptilidae
## 271 7 54 60 30 23 0.096 13.1 0.99999 0.00004 streambioticsum_suff_redback lepidostomatidae
## 272 7 55 60 45 30 0.144 19.7 0.99996 0.00016 streambioticsum_suff_redback limnephilidae
## 273 7 56 60 4 4 0.013 1.8 1.00000 0.03472 streambioticsum_suff_redback molannidae
## 274 7 57 60 5 5 0.016 2.2 1.00000 0.01462 streambioticsum_suff_redback odontoceridae
## 275 7 58 60 62 30 0.198 27.2 0.87654 0.20842 streambioticsum_suff_redback philopotamidae
## 276 7 59 60 8 6 0.026 3.5 0.98708 0.07153 streambioticsum_suff_redback phryganeidae
## 277 7 60 60 56 27 0.179 24.5 0.85126 0.24446 streambioticsum_suff_redback polycentropodidae
## 278 7 61 60 24 16 0.077 10.5 0.99669 0.01200 streambioticsum_suff_redback rhyacophilidae
## 279 7 62 60 46 30 0.147 20.1 0.99992 0.00032 streambioticsum_suff_redback uenoidae
## 280 8 9 8 19 4 0.008 1.1 0.99868 0.01322 streambioticsum_suff_slimy blacknose_dace
## 281 8 13 8 36 2 0.015 2.1 0.64806 0.67139 streambioticsum_suff_slimy creek_chub
## 282 8 22 8 122 7 0.052 7.1 0.61474 0.78728 streambioticsum_suff_slimy aquatic_worms
## 283 8 23 8 42 1 0.018 2.5 0.23433 0.95137 streambioticsum_suff_slimy sow_bugs
## 284 8 24 8 51 4 0.022 3.0 0.87324 0.33909 streambioticsum_suff_slimy scuds
## 285 8 25 8 52 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 streambioticsum_suff_slimy water_mites
## 286 8 26 8 78 2 0.033 4.6 0.06567 0.98847 streambioticsum_suff_slimy damselfly_nymphs
## 287 8 27 8 59 4 0.025 3.4 0.78194 0.47782 streambioticsum_suff_slimy alderfly_larvae
## 288 8 28 8 105 7 0.045 6.1 0.88844 0.40298 streambioticsum_suff_slimy other_beetles
## 289 8 29 8 104 8 0.044 6.1 1.00000 0.10306 streambioticsum_suff_slimy crayfish
## 290 8 30 8 100 7 0.043 5.8 0.92554 0.31143 streambioticsum_suff_slimy dragonfly_nymphs
## 291 8 31 8 79 7 0.034 4.6 0.98956 0.07771 streambioticsum_suff_slimy riffle_beetles
## 292 8 32 8 135 8 0.058 7.9 1.00000 0.88622 streambioticsum_suff_slimy other_flies
## 293 8 33 8 99 5 0.042 5.8 0.38997 0.85144 streambioticsum_suff_slimy snails
## 294 8 34 8 45 3 0.019 2.6 0.75664 0.52257 streambioticsum_suff_slimy clams
## 295 8 35 8 52 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 streambioticsum_suff_slimy fishfly_larvae
## 296 8 36 8 39 5 0.017 2.3 0.99317 0.04187 streambioticsum_suff_slimy water_penny_beetles
## 297 8 37 8 125 8 0.053 7.3 1.00000 0.47060 streambioticsum_suff_slimy cranefly_larvae
## 298 8 38 8 56 4 0.024 3.3 0.81943 0.42507 streambioticsum_suff_slimy ameletidae
## 299 8 39 8 117 8 0.050 6.8 1.00000 0.27285 streambioticsum_suff_slimy baetidae
## 300 8 43 8 40 4 0.017 2.3 0.95328 0.17342 streambioticsum_suff_slimy heptageniidae
## 301 8 45 8 53 7 0.023 3.1 0.99965 0.00554 streambioticsum_suff_slimy leptophlebiidae
## 302 8 46 8 19 3 0.008 1.1 0.98678 0.08105 streambioticsum_suff_slimy chloroperlidae
## 303 8 47 8 68 7 0.029 4.0 0.99704 0.02972 streambioticsum_suff_slimy leuctridae
## 304 8 48 8 46 6 0.020 2.7 0.99795 0.01740 streambioticsum_suff_slimy nemouridae
## 305 8 49 8 44 4 0.019 2.6 0.93003 0.22855 streambioticsum_suff_slimy perlidae
## 306 8 50 8 18 1 0.008 1.1 0.71723 0.68621 streambioticsum_suff_slimy perlodidae
## 307 8 52 8 107 8 0.046 6.2 1.00000 0.13042 streambioticsum_suff_slimy hydropsychidae
## 308 8 54 8 30 3 0.013 1.8 0.93066 0.24203 streambioticsum_suff_slimy lepidostomatidae
## 309 8 55 8 45 4 0.019 2.6 0.92321 0.24336 streambioticsum_suff_slimy limnephilidae
## 310 8 58 8 62 7 0.026 3.6 0.99865 0.01611 streambioticsum_suff_slimy philopotamidae
## 311 8 60 8 56 7 0.024 3.3 0.99943 0.00808 streambioticsum_suff_slimy polycentropodidae
## 312 8 61 8 24 4 0.010 1.4 0.99566 0.03171 streambioticsum_suff_slimy rhyacophilidae
## 313 8 62 8 46 6 0.020 2.7 0.99795 0.01740 streambioticsum_suff_slimy uenoidae
## 314 9 13 19 36 12 0.036 5.0 0.99996 0.00028 blacknose_dace creek_chub
## 315 9 22 19 122 18 0.124 16.9 0.90681 0.34855 blacknose_dace aquatic_worms
## 316 9 23 19 42 8 0.043 5.8 0.92153 0.18324 blacknose_dace sow_bugs
## 317 9 24 19 51 7 0.052 7.1 0.59209 0.60914 blacknose_dace scuds
## 318 9 25 19 52 10 0.053 7.2 0.95144 0.12260 blacknose_dace water_mites
## 319 9 26 19 78 14 0.079 10.8 0.96968 0.08859 blacknose_dace damselfly_nymphs
## 320 9 27 19 59 11 0.060 8.2 0.95062 0.12398 blacknose_dace alderfly_larvae
## 321 9 28 19 105 15 0.106 14.6 0.69773 0.52981 blacknose_dace other_beetles
## 322 9 29 19 104 17 0.105 14.4 0.97168 0.11078 blacknose_dace crayfish
## 323 9 30 19 100 15 0.101 13.9 0.81637 0.37383 blacknose_dace dragonfly_nymphs
## 324 9 31 19 79 18 0.080 11.0 0.99999 0.00019 blacknose_dace riffle_beetles
## 325 9 32 19 135 19 0.137 18.7 1.00000 0.74098 blacknose_dace other_flies
## 326 9 33 19 99 14 0.100 13.7 0.65470 0.56213 blacknose_dace snails
## 327 9 34 19 45 4 0.046 6.2 0.18095 0.93001 blacknose_dace clams
## 328 9 35 19 52 10 0.053 7.2 0.95144 0.12260 blacknose_dace fishfly_larvae
## 329 9 36 19 39 9 0.039 5.4 0.98490 0.04884 blacknose_dace water_penny_beetles
## 330 9 37 19 125 19 0.127 17.3 1.00000 0.15348 blacknose_dace cranefly_larvae
## 331 9 38 19 56 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 blacknose_dace ameletidae
## 332 9 39 19 117 19 0.118 16.2 1.00000 0.03935 blacknose_dace baetidae
## 333 9 40 19 13 3 0.013 1.8 0.91624 0.26044 blacknose_dace caenidae
## 334 9 43 19 40 11 0.040 5.5 0.99903 0.00477 blacknose_dace heptageniidae
## 335 9 44 19 11 5 0.011 1.5 0.99903 0.00821 blacknose_dace leptohyphidae
## 336 9 45 19 53 12 0.054 7.4 0.99511 0.01862 blacknose_dace leptophlebiidae
## 337 9 46 19 19 8 0.019 2.6 0.99989 0.00093 blacknose_dace chloroperlidae
## 338 9 47 19 68 15 0.069 9.4 0.99899 0.00537 blacknose_dace leuctridae
## 339 9 48 19 46 12 0.047 6.4 0.99909 0.00450 blacknose_dace nemouridae
## 340 9 49 19 44 12 0.045 6.1 0.99947 0.00280 blacknose_dace perlidae
## 341 9 50 19 18 6 0.018 2.5 0.99598 0.02050 blacknose_dace perlodidae
## 342 9 52 19 107 18 0.108 14.8 0.99382 0.04576 blacknose_dace hydropsychidae
## 343 9 53 19 16 2 0.016 2.2 0.61229 0.68912 blacknose_dace hydroptilidae
## 344 9 54 19 30 0 0.030 4.2 0.00618 1.00000 blacknose_dace lepidostomatidae
## 345 9 55 19 45 5 0.046 6.2 0.35594 0.81905 blacknose_dace limnephilidae
## 346 9 58 19 62 12 0.063 8.6 0.97376 0.07498 blacknose_dace philopotamidae
## 347 9 59 19 8 1 0.008 1.1 0.69349 0.70731 blacknose_dace phryganeidae
## 348 9 60 19 56 10 0.057 7.8 0.91447 0.19113 blacknose_dace polycentropodidae
## 349 9 61 19 24 3 0.024 3.3 0.56475 0.69032 blacknose_dace rhyacophilidae
## 350 9 62 19 46 9 0.047 6.4 0.94630 0.13419 blacknose_dace uenoidae
## 351 10 22 2 122 1 0.013 1.8 0.20771 0.98873 bluegill_sunfish aquatic_worms
## 352 10 26 2 78 2 0.008 1.1 1.00000 0.32235 bluegill_sunfish damselfly_nymphs
## 353 10 28 2 105 2 0.011 1.5 1.00000 0.58609 bluegill_sunfish other_beetles
## 354 10 29 2 104 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 bluegill_sunfish crayfish
## 355 10 30 2 100 2 0.011 1.5 1.00000 0.53134 bluegill_sunfish dragonfly_nymphs
## 356 10 31 2 79 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 bluegill_sunfish riffle_beetles
## 357 10 32 2 135 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 bluegill_sunfish other_flies
## 358 10 33 2 99 2 0.011 1.4 1.00000 0.52072 bluegill_sunfish snails
## 359 10 37 2 125 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 bluegill_sunfish cranefly_larvae
## 360 10 39 2 117 1 0.012 1.7 0.27158 0.97960 bluegill_sunfish baetidae
## 361 10 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 bluegill_sunfish hydropsychidae
## 362 11 22 3 122 3 0.020 2.7 1.00000 0.70426 central_stoneroller_minnow aquatic_worms
## 363 11 24 3 51 2 0.008 1.1 0.95032 0.31123 central_stoneroller_minnow scuds
## 364 11 25 3 52 2 0.008 1.1 0.94728 0.32157 central_stoneroller_minnow water_mites
## 365 11 26 3 78 2 0.012 1.7 0.81853 0.60411 central_stoneroller_minnow damselfly_nymphs
## 366 11 27 3 59 2 0.009 1.3 0.92245 0.39589 central_stoneroller_minnow alderfly_larvae
## 367 11 28 3 105 3 0.017 2.3 1.00000 0.44716 central_stoneroller_minnow other_beetles
## 368 11 29 3 104 3 0.017 2.3 1.00000 0.43439 central_stoneroller_minnow crayfish
## 369 11 30 3 100 2 0.016 2.2 0.61428 0.82260 central_stoneroller_minnow dragonfly_nymphs
## 370 11 31 3 79 3 0.013 1.7 1.00000 0.18863 central_stoneroller_minnow riffle_beetles
## 371 11 32 3 135 3 0.022 3.0 1.00000 0.95653 central_stoneroller_minnow other_flies
## 372 11 33 3 99 3 0.016 2.2 1.00000 0.37414 central_stoneroller_minnow snails
## 373 11 35 3 52 1 0.008 1.1 0.67843 0.76440 central_stoneroller_minnow fishfly_larvae
## 374 11 37 3 125 3 0.020 2.7 1.00000 0.75796 central_stoneroller_minnow cranefly_larvae
## 375 11 38 3 56 2 0.009 1.2 0.93388 0.36368 central_stoneroller_minnow ameletidae
## 376 11 39 3 117 1 0.019 2.6 0.05575 0.99728 central_stoneroller_minnow baetidae
## 377 11 45 3 53 0 0.008 1.2 0.22729 1.00000 central_stoneroller_minnow leptophlebiidae
## 378 11 47 3 68 0 0.011 1.5 0.12498 1.00000 central_stoneroller_minnow leuctridae
## 379 11 48 3 46 0 0.007 1.0 0.28979 1.00000 central_stoneroller_minnow nemouridae
## 380 11 52 3 107 2 0.017 2.3 0.52654 0.87929 central_stoneroller_minnow hydropsychidae
## 381 11 58 3 62 1 0.010 1.4 0.57148 0.83893 central_stoneroller_minnow philopotamidae
## 382 11 60 3 56 0 0.009 1.2 0.20352 1.00000 central_stoneroller_minnow polycentropodidae
## 383 11 62 3 46 1 0.007 1.0 0.73912 0.71021 central_stoneroller_minnow uenoidae
## 384 13 15 36 4 4 0.008 1.1 1.00000 0.00419 creek_chub johnny_darter
## 385 13 16 36 4 3 0.008 1.1 0.99581 0.05554 creek_chub rainbow_darter
## 386 13 19 36 4 3 0.008 1.1 0.99581 0.05554 creek_chub white_sucker
## 387 13 21 36 4 3 0.008 1.1 0.99581 0.05554 creek_chub sessile_animals
## 388 13 22 36 122 30 0.234 32.1 0.16531 0.93947 creek_chub aquatic_worms
## 389 13 23 36 42 12 0.081 11.0 0.73356 0.41786 creek_chub sow_bugs
## 390 13 24 36 51 11 0.098 13.4 0.22379 0.87872 creek_chub scuds
## 391 13 25 36 52 14 0.100 13.7 0.63334 0.52308 creek_chub water_mites
## 392 13 26 36 78 26 0.150 20.5 0.99158 0.02372 creek_chub damselfly_nymphs
## 393 13 27 36 59 20 0.113 15.5 0.97464 0.05898 creek_chub alderfly_larvae
## 394 13 28 36 105 28 0.201 27.6 0.65524 0.52450 creek_chub other_beetles
## 395 13 29 36 104 31 0.199 27.3 0.97516 0.07135 creek_chub crayfish
## 396 13 30 36 100 32 0.192 26.3 0.99810 0.00851 creek_chub dragonfly_nymphs
## 397 13 31 36 79 34 0.152 20.8 1.00000 0.00000 creek_chub riffle_beetles
## 398 13 32 36 135 36 0.259 35.5 1.00000 0.54208 creek_chub other_flies
## 399 13 33 36 99 33 0.190 26.0 0.99979 0.00137 creek_chub snails
## 400 13 34 36 45 15 0.086 11.8 0.93422 0.13483 creek_chub clams
## 401 13 35 36 52 16 0.100 13.7 0.87133 0.23044 creek_chub fishfly_larvae
## 402 13 36 36 39 12 0.075 10.2 0.83392 0.29172 creek_chub water_penny_beetles
## 403 13 37 36 125 36 0.240 32.8 1.00000 0.02144 creek_chub cranefly_larvae
## 404 13 38 36 56 25 0.107 14.7 0.99999 0.00006 creek_chub ameletidae
## 405 13 39 36 117 34 0.224 30.7 0.98741 0.05789 creek_chub baetidae
## 406 13 40 36 13 6 0.025 3.4 0.97492 0.08776 creek_chub caenidae
## 407 13 41 36 5 3 0.010 1.3 0.98306 0.11346 creek_chub ephemerellidae
## 408 13 43 36 40 16 0.077 10.5 0.99389 0.01808 creek_chub heptageniidae
## 409 13 44 36 11 5 0.021 2.9 0.96337 0.12688 creek_chub leptohyphidae
## 410 13 45 36 53 18 0.102 13.9 0.96502 0.07796 creek_chub leptophlebiidae
## 411 13 46 36 19 6 0.036 5.0 0.80395 0.37675 creek_chub chloroperlidae
## 412 13 47 36 68 23 0.130 17.9 0.98597 0.03571 creek_chub leuctridae
## 413 13 48 36 46 13 0.088 12.1 0.72144 0.42867 creek_chub nemouridae
## 414 13 49 36 44 18 0.084 11.6 0.99770 0.00755 creek_chub perlidae
## 415 13 50 36 18 5 0.035 4.7 0.68031 0.53873 creek_chub perlodidae
## 416 13 52 36 107 32 0.205 28.1 0.98461 0.05140 creek_chub hydropsychidae
## 417 13 53 36 16 3 0.031 4.2 0.34763 0.84923 creek_chub hydroptilidae
## 418 13 54 36 30 2 0.058 7.9 0.00326 0.99957 creek_chub lepidostomatidae
## 419 13 55 36 45 16 0.086 11.8 0.97198 0.06578 creek_chub limnephilidae
## 420 13 56 36 4 0 0.008 1.1 0.29073 1.00000 creek_chub molannidae
## 421 13 57 36 5 0 0.010 1.3 0.21203 1.00000 creek_chub odontoceridae
## 422 13 58 36 62 20 0.119 16.3 0.94946 0.10559 creek_chub philopotamidae
## 423 13 59 36 8 5 0.015 2.1 0.99571 0.02942 creek_chub phryganeidae
## 424 13 60 36 56 14 0.107 14.7 0.46846 0.68254 creek_chub polycentropodidae
## 425 13 61 36 24 6 0.046 6.3 0.54976 0.65095 creek_chub rhyacophilidae
## 426 13 62 36 46 14 0.088 12.1 0.83938 0.27856 creek_chub uenoidae
## 427 14 22 2 122 2 0.013 1.8 1.00000 0.79229 green_sunfish aquatic_worms
## 428 14 26 2 78 2 0.008 1.1 1.00000 0.32235 green_sunfish damselfly_nymphs
## 429 14 28 2 105 2 0.011 1.5 1.00000 0.58609 green_sunfish other_beetles
## 430 14 29 2 104 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 green_sunfish crayfish
## 431 14 30 2 100 2 0.011 1.5 1.00000 0.53134 green_sunfish dragonfly_nymphs
## 432 14 31 2 79 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 green_sunfish riffle_beetles
## 433 14 32 2 135 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 green_sunfish other_flies
## 434 14 33 2 99 2 0.011 1.4 1.00000 0.52072 green_sunfish snails
## 435 14 37 2 125 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 green_sunfish cranefly_larvae
## 436 14 39 2 117 1 0.012 1.7 0.27158 0.97960 green_sunfish baetidae
## 437 14 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 green_sunfish hydropsychidae
## 438 15 22 4 122 3 0.026 3.6 0.37457 0.94077 johnny_darter aquatic_worms
## 439 15 23 4 42 1 0.009 1.2 0.64063 0.77331 johnny_darter sow_bugs
## 440 15 24 4 51 1 0.011 1.5 0.52285 0.84879 johnny_darter scuds
## 441 15 25 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 johnny_darter water_mites
## 442 15 26 4 78 3 0.017 2.3 0.89843 0.42117 johnny_darter damselfly_nymphs
## 443 15 27 4 59 2 0.013 1.7 0.78704 0.57883 johnny_darter alderfly_larvae
## 444 15 28 4 105 3 0.022 3.1 0.65962 0.76752 johnny_darter other_beetles
## 445 15 29 4 104 4 0.022 3.0 1.00000 0.32741 johnny_darter crayfish
## 446 15 30 4 100 4 0.021 2.9 1.00000 0.27921 johnny_darter dragonfly_nymphs
## 447 15 31 4 79 4 0.017 2.3 1.00000 0.10699 johnny_darter riffle_beetles
## 448 15 32 4 135 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 johnny_darter other_flies
## 449 15 33 4 99 4 0.021 2.9 1.00000 0.26804 johnny_darter snails
## 450 15 34 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 johnny_darter clams
## 451 15 35 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 johnny_darter fishfly_larvae
## 452 15 36 4 39 1 0.008 1.1 0.67959 0.74279 johnny_darter water_penny_beetles
## 453 15 37 4 125 4 0.027 3.6 1.00000 0.69008 johnny_darter cranefly_larvae
## 454 15 38 4 56 4 0.012 1.6 1.00000 0.02615 johnny_darter ameletidae
## 455 15 39 4 117 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 johnny_darter baetidae
## 456 15 43 4 40 3 0.009 1.2 0.99349 0.07475 johnny_darter heptageniidae
## 457 15 45 4 53 2 0.011 1.5 0.83903 0.50302 johnny_darter leptophlebiidae
## 458 15 47 4 68 4 0.014 2.0 1.00000 0.05799 johnny_darter leuctridae
## 459 15 48 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 johnny_darter nemouridae
## 460 15 49 4 44 2 0.009 1.3 0.90263 0.38554 johnny_darter perlidae
## 461 15 52 4 107 4 0.023 3.1 1.00000 0.36746 johnny_darter hydropsychidae
## 462 15 55 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 johnny_darter limnephilidae
## 463 15 58 4 62 3 0.013 1.8 0.96028 0.24170 johnny_darter philopotamidae
## 464 15 60 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 johnny_darter polycentropodidae
## 465 15 62 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 johnny_darter uenoidae
## 466 16 22 4 122 4 0.026 3.6 1.00000 0.62543 rainbow_darter aquatic_worms
## 467 16 23 4 42 0 0.009 1.2 0.22669 1.00000 rainbow_darter sow_bugs
## 468 16 24 4 51 2 0.011 1.5 0.85468 0.47715 rainbow_darter scuds
## 469 16 25 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 rainbow_darter water_mites
## 470 16 26 4 78 2 0.017 2.3 0.57883 0.78704 rainbow_darter damselfly_nymphs
## 471 16 27 4 59 3 0.013 1.7 0.96759 0.21296 rainbow_darter alderfly_larvae
## 472 16 28 4 105 3 0.022 3.1 0.65962 0.76752 rainbow_darter other_beetles
## 473 16 29 4 104 4 0.022 3.0 1.00000 0.32741 rainbow_darter crayfish
## 474 16 30 4 100 4 0.021 2.9 1.00000 0.27921 rainbow_darter dragonfly_nymphs
## 475 16 31 4 79 4 0.017 2.3 1.00000 0.10699 rainbow_darter riffle_beetles
## 476 16 32 4 135 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 rainbow_darter other_flies
## 477 16 33 4 99 3 0.021 2.9 0.73196 0.69245 rainbow_darter snails
## 478 16 34 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 rainbow_darter clams
## 479 16 35 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 rainbow_darter fishfly_larvae
## 480 16 36 4 39 2 0.008 1.1 0.93037 0.32041 rainbow_darter water_penny_beetles
## 481 16 37 4 125 4 0.027 3.6 1.00000 0.69008 rainbow_darter cranefly_larvae
## 482 16 38 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 rainbow_darter ameletidae
## 483 16 39 4 117 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 rainbow_darter baetidae
## 484 16 43 4 40 3 0.009 1.2 0.99349 0.07475 rainbow_darter heptageniidae
## 485 16 45 4 53 3 0.011 1.5 0.97915 0.16097 rainbow_darter leptophlebiidae
## 486 16 47 4 68 3 0.014 2.0 0.94201 0.30422 rainbow_darter leuctridae
## 487 16 48 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 rainbow_darter nemouridae
## 488 16 49 4 44 2 0.009 1.3 0.90263 0.38554 rainbow_darter perlidae
## 489 16 52 4 107 4 0.023 3.1 1.00000 0.36746 rainbow_darter hydropsychidae
## 490 16 55 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 rainbow_darter limnephilidae
## 491 16 58 4 62 4 0.013 1.8 1.00000 0.03972 rainbow_darter philopotamidae
## 492 16 60 4 56 3 0.012 1.6 0.97385 0.18603 rainbow_darter polycentropodidae
## 493 16 62 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 rainbow_darter uenoidae
## 494 17 22 2 122 1 0.013 1.8 0.20771 0.98873 redbelly_dace aquatic_worms
## 495 17 26 2 78 1 0.008 1.1 0.67765 0.81634 redbelly_dace damselfly_nymphs
## 496 17 28 2 105 0 0.011 1.5 0.05324 1.00000 redbelly_dace other_beetles
## 497 17 29 2 104 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 redbelly_dace crayfish
## 498 17 30 2 100 2 0.011 1.5 1.00000 0.53134 redbelly_dace dragonfly_nymphs
## 499 17 31 2 79 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 redbelly_dace riffle_beetles
## 500 17 32 2 135 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 redbelly_dace other_flies
## 501 17 33 2 99 2 0.011 1.4 1.00000 0.52072 redbelly_dace snails
## 502 17 37 2 125 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 redbelly_dace cranefly_larvae
## 503 17 39 2 117 2 0.012 1.7 1.00000 0.72842 redbelly_dace baetidae
## 504 17 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 redbelly_dace hydropsychidae
## 505 19 22 4 122 4 0.026 3.6 1.00000 0.62543 white_sucker aquatic_worms
## 506 19 23 4 42 1 0.009 1.2 0.64063 0.77331 white_sucker sow_bugs
## 507 19 24 4 51 2 0.011 1.5 0.85468 0.47715 white_sucker scuds
## 508 19 25 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 white_sucker water_mites
## 509 19 26 4 78 2 0.017 2.3 0.57883 0.78704 white_sucker damselfly_nymphs
## 510 19 27 4 59 0 0.013 1.7 0.10157 1.00000 white_sucker alderfly_larvae
## 511 19 28 4 105 2 0.022 3.1 0.23248 0.96036 white_sucker other_beetles
## 512 19 29 4 104 3 0.022 3.0 0.67259 0.75532 white_sucker crayfish
## 513 19 30 4 100 4 0.021 2.9 1.00000 0.27921 white_sucker dragonfly_nymphs
## 514 19 31 4 79 3 0.017 2.3 0.89301 0.43358 white_sucker riffle_beetles
## 515 19 32 4 135 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 white_sucker other_flies
## 516 19 33 4 99 4 0.021 2.9 1.00000 0.26804 white_sucker snails
## 517 19 34 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 white_sucker clams
## 518 19 35 4 52 0 0.011 1.5 0.14418 1.00000 white_sucker fishfly_larvae
## 519 19 36 4 39 1 0.008 1.1 0.67959 0.74279 white_sucker water_penny_beetles
## 520 19 37 4 125 3 0.027 3.6 0.30992 0.96159 white_sucker cranefly_larvae
## 521 19 38 4 56 4 0.012 1.6 1.00000 0.02615 white_sucker ameletidae
## 522 19 39 4 117 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 white_sucker baetidae
## 523 19 43 4 40 2 0.009 1.2 0.92525 0.33334 white_sucker heptageniidae
## 524 19 45 4 53 1 0.011 1.5 0.49698 0.86261 white_sucker leptophlebiidae
## 525 19 47 4 68 2 0.014 2.0 0.69578 0.68475 white_sucker leuctridae
## 526 19 48 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 white_sucker nemouridae
## 527 19 49 4 44 0 0.009 1.3 0.20790 1.00000 white_sucker perlidae
## 528 19 52 4 107 3 0.023 3.1 0.63254 0.79146 white_sucker hydropsychidae
## 529 19 55 4 45 1 0.010 1.3 0.60135 0.80104 white_sucker limnephilidae
## 530 19 58 4 62 3 0.013 1.8 0.96028 0.24170 white_sucker philopotamidae
## 531 19 60 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 white_sucker polycentropodidae
## 532 19 62 4 46 1 0.010 1.3 0.58823 0.80969 white_sucker uenoidae
## 533 21 22 4 122 4 0.026 3.6 1.00000 0.62543 sessile_animals aquatic_worms
## 534 21 23 4 42 2 0.009 1.2 0.91437 0.35937 sessile_animals sow_bugs
## 535 21 24 4 51 2 0.011 1.5 0.85468 0.47715 sessile_animals scuds
## 536 21 25 4 52 0 0.011 1.5 0.14418 1.00000 sessile_animals water_mites
## 537 21 26 4 78 3 0.017 2.3 0.89843 0.42117 sessile_animals damselfly_nymphs
## 538 21 27 4 59 1 0.013 1.7 0.42117 0.89843 sessile_animals alderfly_larvae
## 539 21 28 4 105 3 0.022 3.1 0.65962 0.76752 sessile_animals other_beetles
## 540 21 29 4 104 3 0.022 3.0 0.67259 0.75532 sessile_animals crayfish
## 541 21 30 4 100 3 0.021 2.9 0.72079 0.70523 sessile_animals dragonfly_nymphs
## 542 21 31 4 79 2 0.017 2.3 0.56642 0.79622 sessile_animals riffle_beetles
## 543 21 32 4 135 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 sessile_animals other_flies
## 544 21 33 4 99 4 0.021 2.9 1.00000 0.26804 sessile_animals snails
## 545 21 34 4 45 3 0.010 1.3 0.98939 0.10357 sessile_animals clams
## 546 21 35 4 52 1 0.011 1.5 0.50989 0.85582 sessile_animals fishfly_larvae
## 547 21 36 4 39 1 0.008 1.1 0.67959 0.74279 sessile_animals water_penny_beetles
## 548 21 37 4 125 4 0.027 3.6 1.00000 0.69008 sessile_animals cranefly_larvae
## 549 21 38 4 56 3 0.012 1.6 0.97385 0.18603 sessile_animals ameletidae
## 550 21 39 4 117 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 sessile_animals baetidae
## 551 21 43 4 40 0 0.009 1.2 0.24672 1.00000 sessile_animals heptageniidae
## 552 21 45 4 53 1 0.011 1.5 0.49698 0.86261 sessile_animals leptophlebiidae
## 553 21 47 4 68 2 0.014 2.0 0.69578 0.68475 sessile_animals leuctridae
## 554 21 48 4 46 0 0.010 1.3 0.19031 1.00000 sessile_animals nemouridae
## 555 21 49 4 44 0 0.009 1.3 0.20790 1.00000 sessile_animals perlidae
## 556 21 52 4 107 4 0.023 3.1 1.00000 0.36746 sessile_animals hydropsychidae
## 557 21 55 4 45 0 0.010 1.3 0.19896 1.00000 sessile_animals limnephilidae
## 558 21 58 4 62 3 0.013 1.8 0.96028 0.24170 sessile_animals philopotamidae
## 559 21 60 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 sessile_animals polycentropodidae
## 560 21 62 4 46 0 0.010 1.3 0.19031 1.00000 sessile_animals uenoidae
## 561 22 23 122 42 40 0.273 37.4 0.97504 0.10236 aquatic_worms sow_bugs
## 562 22 24 122 51 47 0.332 45.4 0.88286 0.27462 aquatic_worms scuds
## 563 22 25 122 52 47 0.338 46.3 0.74552 0.46398 aquatic_worms water_mites
## 564 22 26 122 78 71 0.507 69.5 0.86987 0.28104 aquatic_worms damselfly_nymphs
## 565 22 27 122 59 49 0.384 52.5 0.04699 0.98718 aquatic_worms alderfly_larvae
## 566 22 28 122 105 91 0.683 93.5 0.08997 0.98566 aquatic_worms other_beetles
## 567 22 29 122 104 90 0.676 92.6 0.07989 0.98771 aquatic_worms crayfish
## 568 22 30 122 100 86 0.650 89.1 0.04864 0.99347 aquatic_worms dragonfly_nymphs
## 569 22 31 122 79 71 0.514 70.4 0.73942 0.46265 aquatic_worms riffle_beetles
## 570 22 32 122 135 120 0.878 120.2 0.79229 1.00000 aquatic_worms other_flies
## 571 22 33 122 99 90 0.644 88.2 0.91988 0.20322 aquatic_worms snails
## 572 22 34 122 45 41 0.293 40.1 0.79414 0.41217 aquatic_worms clams
## 573 22 35 122 52 44 0.338 46.3 0.15424 0.94144 aquatic_worms fishfly_larvae
## 574 22 36 122 39 37 0.254 34.7 0.96251 0.14006 aquatic_worms water_penny_beetles
## 575 22 37 122 125 111 0.813 111.3 0.61218 0.76649 aquatic_worms cranefly_larvae
## 576 22 38 122 56 52 0.364 49.9 0.93177 0.18295 aquatic_worms ameletidae
## 577 22 39 122 117 104 0.761 104.2 0.62123 0.68174 aquatic_worms baetidae
## 578 22 40 122 13 11 0.085 11.6 0.43023 0.84544 aquatic_worms caenidae
## 579 22 41 122 5 4 0.033 4.5 0.44511 0.90757 aquatic_worms ephemerellidae
## 580 22 42 122 3 2 0.020 2.7 0.29574 0.96836 aquatic_worms ephemeridae
## 581 22 43 122 40 35 0.260 35.6 0.45794 0.75524 aquatic_worms heptageniidae
## 582 22 44 122 11 8 0.072 9.8 0.10253 0.98023 aquatic_worms leptohyphidae
## 583 22 45 122 53 45 0.345 47.2 0.16985 0.93356 aquatic_worms leptophlebiidae
## 584 22 46 122 19 17 0.124 16.9 0.65145 0.65500 aquatic_worms chloroperlidae
## 585 22 47 122 68 56 0.442 60.6 0.01195 0.99787 aquatic_worms leuctridae
## 586 22 48 122 46 40 0.299 41.0 0.38556 0.80356 aquatic_worms nemouridae
## 587 22 49 122 44 35 0.286 39.2 0.01790 0.99602 aquatic_worms perlidae
## 588 22 50 122 18 17 0.117 16.0 0.89337 0.38081 aquatic_worms perlodidae
## 589 22 51 122 2 2 0.013 1.8 1.00000 0.79229 aquatic_worms glossosomatidae
## 590 22 52 122 107 95 0.696 95.3 0.57565 0.68360 aquatic_worms hydropsychidae
## 591 22 53 122 16 15 0.104 14.2 0.86090 0.45111 aquatic_worms hydroptilidae
## 592 22 54 122 30 25 0.195 26.7 0.20561 0.92338 aquatic_worms lepidostomatidae
## 593 22 55 122 45 38 0.293 40.1 0.17861 0.93020 aquatic_worms limnephilidae
## 594 22 56 122 4 3 0.026 3.6 0.37457 0.94077 aquatic_worms molannidae
## 595 22 57 122 5 5 0.033 4.5 1.00000 0.55489 aquatic_worms odontoceridae
## 596 22 58 122 62 55 0.403 55.2 0.55997 0.65377 aquatic_worms philopotamidae
## 597 22 59 122 8 7 0.052 7.1 0.61474 0.78728 aquatic_worms phryganeidae
## 598 22 60 122 56 53 0.364 49.9 0.98227 0.06823 aquatic_worms polycentropodidae
## 599 22 61 122 24 22 0.156 21.4 0.78383 0.48914 aquatic_worms rhyacophilidae
## 600 22 62 122 46 41 0.299 41.0 0.61250 0.61444 aquatic_worms uenoidae
## 601 23 24 42 51 29 0.114 15.6 1.00000 0.00000 sow_bugs scuds
## 602 23 25 42 52 24 0.116 15.9 0.99942 0.00207 sow_bugs water_mites
## 603 23 26 42 78 31 0.175 23.9 0.99807 0.00625 sow_bugs damselfly_nymphs
## 604 23 27 42 59 13 0.132 18.1 0.04207 0.98261 sow_bugs alderfly_larvae
## 605 23 28 42 105 36 0.235 32.2 0.97397 0.07060 sow_bugs other_beetles
## 606 23 29 42 104 30 0.233 31.9 0.27155 0.84903 sow_bugs crayfish
## 607 23 30 42 100 30 0.224 30.7 0.46895 0.68859 sow_bugs dragonfly_nymphs
## 608 23 31 42 79 27 0.177 24.2 0.89122 0.19652 sow_bugs riffle_beetles
## 609 23 32 42 135 42 0.302 41.4 1.00000 0.47928 sow_bugs other_flies
## 610 23 33 42 99 35 0.222 30.4 0.98585 0.04016 sow_bugs snails
## 611 23 34 42 45 18 0.101 13.8 0.96720 0.07296 sow_bugs clams
## 612 23 35 42 52 7 0.116 15.9 0.00043 0.99991 sow_bugs fishfly_larvae
## 613 23 36 42 39 8 0.087 12.0 0.07579 0.96904 sow_bugs water_penny_beetles
## 614 23 37 42 125 37 0.280 38.3 0.28724 0.88187 sow_bugs cranefly_larvae
## 615 23 38 42 56 20 0.125 17.2 0.89512 0.18947 sow_bugs ameletidae
## 616 23 39 42 117 33 0.262 35.9 0.10866 0.95843 sow_bugs baetidae
## 617 23 40 42 13 3 0.029 4.0 0.39230 0.82474 sow_bugs caenidae
## 618 23 41 42 5 3 0.011 1.5 0.96926 0.16795 sow_bugs ephemerellidae
## 619 23 43 42 40 8 0.090 12.3 0.06024 0.97636 sow_bugs heptageniidae
## 620 23 44 42 11 2 0.025 3.4 0.28601 0.90508 sow_bugs leptohyphidae
## 621 23 45 42 53 5 0.119 16.2 0.00001 1.00000 sow_bugs leptophlebiidae
## 622 23 46 42 19 5 0.043 5.8 0.44104 0.75662 sow_bugs chloroperlidae
## 623 23 47 42 68 15 0.152 20.8 0.02340 0.99097 sow_bugs leuctridae
## 624 23 48 42 46 6 0.103 14.1 0.00098 0.99980 sow_bugs nemouridae
## 625 23 49 42 44 6 0.098 13.5 0.00202 0.99955 sow_bugs perlidae
## 626 23 50 42 18 2 0.040 5.5 0.04229 0.99154 sow_bugs perlodidae
## 627 23 52 42 107 33 0.239 32.8 0.61661 0.56027 sow_bugs hydropsychidae
## 628 23 53 42 16 8 0.036 4.9 0.97806 0.07040 sow_bugs hydroptilidae
## 629 23 54 42 30 2 0.067 9.2 0.00058 0.99994 sow_bugs lepidostomatidae
## 630 23 55 42 45 6 0.101 13.8 0.00141 0.99970 sow_bugs limnephilidae
## 631 23 56 42 4 0 0.009 1.2 0.22669 1.00000 sow_bugs molannidae
## 632 23 57 42 5 0 0.011 1.5 0.15510 1.00000 sow_bugs odontoceridae
## 633 23 58 42 62 18 0.139 19.0 0.42606 0.71195 sow_bugs philopotamidae
## 634 23 59 42 8 2 0.018 2.5 0.53373 0.76567 sow_bugs phryganeidae
## 635 23 60 42 56 19 0.125 17.2 0.81053 0.30677 sow_bugs polycentropodidae
## 636 23 61 42 24 2 0.054 7.4 0.00570 0.99919 sow_bugs rhyacophilidae
## 637 23 62 42 46 9 0.103 14.1 0.03350 0.98763 sow_bugs uenoidae
## 638 24 25 51 52 27 0.141 19.4 0.99845 0.00476 scuds water_mites
## 639 24 26 51 78 31 0.212 29.0 0.81018 0.30137 scuds damselfly_nymphs
## 640 24 27 51 59 15 0.160 22.0 0.01004 0.99644 scuds alderfly_larvae
## 641 24 28 51 105 42 0.285 39.1 0.92484 0.15679 scuds other_beetles
## 642 24 29 51 104 36 0.283 38.7 0.17958 0.90722 scuds crayfish
## 643 24 30 51 100 37 0.272 37.2 0.54021 0.61637 scuds dragonfly_nymphs
## 644 24 31 51 79 29 0.215 29.4 0.51206 0.62814 scuds riffle_beetles
## 645 24 32 51 135 51 0.367 50.3 1.00000 0.39234 scuds other_flies
## 646 24 33 51 99 39 0.269 36.9 0.85205 0.25955 scuds snails
## 647 24 34 51 45 21 0.122 16.8 0.96238 0.07977 scuds clams
## 648 24 35 51 52 12 0.141 19.4 0.00568 0.99820 scuds fishfly_larvae
## 649 24 36 51 39 10 0.106 14.5 0.05613 0.97701 scuds water_penny_beetles
## 650 24 37 51 125 46 0.340 46.5 0.48277 0.74430 scuds cranefly_larvae
## 651 24 38 51 56 18 0.152 20.8 0.19973 0.88587 scuds ameletidae
## 652 24 39 51 117 40 0.318 43.6 0.06478 0.97742 scuds baetidae
## 653 24 40 51 13 4 0.035 4.8 0.42754 0.78746 scuds caenidae
## 654 24 41 51 5 1 0.014 1.9 0.38314 0.90677 scuds ephemerellidae
## 655 24 42 51 3 0 0.008 1.1 0.24412 1.00000 scuds ephemeridae
## 656 24 43 51 40 7 0.109 14.9 0.00153 0.99965 scuds heptageniidae
## 657 24 44 51 11 0 0.030 4.1 0.00462 1.00000 scuds leptohyphidae
## 658 24 45 51 53 10 0.144 19.7 0.00031 0.99993 scuds leptophlebiidae
## 659 24 46 51 19 4 0.052 7.1 0.09148 0.97040 scuds chloroperlidae
## 660 24 47 51 68 20 0.185 25.3 0.04416 0.98033 scuds leuctridae
## 661 24 48 51 46 10 0.125 17.1 0.00582 0.99825 scuds nemouridae
## 662 24 49 51 44 5 0.120 16.4 0.00001 1.00000 scuds perlidae
## 663 24 50 51 18 5 0.049 6.7 0.26894 0.87662 scuds perlodidae
## 664 24 52 51 107 36 0.291 39.8 0.07831 0.96677 scuds hydropsychidae
## 665 24 53 51 16 7 0.043 6.0 0.80341 0.37646 scuds hydroptilidae
## 666 24 54 51 30 10 0.082 11.2 0.39156 0.76015 scuds lepidostomatidae
## 667 24 55 51 45 13 0.122 16.8 0.10989 0.94649 scuds limnephilidae
## 668 24 56 51 4 1 0.011 1.5 0.52285 0.84879 scuds molannidae
## 669 24 57 51 5 0 0.014 1.9 0.09323 1.00000 scuds odontoceridae
## 670 24 58 51 62 24 0.168 23.1 0.69317 0.44025 scuds philopotamidae
## 671 24 59 51 8 2 0.022 3.0 0.37072 0.86913 scuds phryganeidae
## 672 24 60 51 56 21 0.152 20.8 0.59380 0.54845 scuds polycentropodidae
## 673 24 61 51 24 7 0.065 8.9 0.25517 0.87209 scuds rhyacophilidae
## 674 24 62 51 46 11 0.125 17.1 0.01650 0.99418 scuds uenoidae
## 675 25 26 52 78 33 0.216 29.6 0.91734 0.15171 water_mites damselfly_nymphs
## 676 25 27 52 59 23 0.163 22.4 0.65343 0.48421 water_mites alderfly_larvae
## 677 25 28 52 105 41 0.291 39.9 0.75152 0.39747 water_mites other_beetles
## 678 25 29 52 104 44 0.288 39.5 0.98267 0.04663 water_mites crayfish
## 679 25 30 52 100 41 0.277 38.0 0.92141 0.15655 water_mites dragonfly_nymphs
## 680 25 31 52 79 39 0.219 30.0 0.99972 0.00105 water_mites riffle_beetles
## 681 25 32 52 135 52 0.374 51.2 1.00000 0.38321 water_mites other_flies
## 682 25 33 52 99 40 0.274 37.6 0.87541 0.22581 water_mites snails
## 683 25 34 52 45 18 0.125 17.1 0.70386 0.43555 water_mites clams
## 684 25 35 52 52 18 0.144 19.7 0.32792 0.79106 water_mites fishfly_larvae
## 685 25 36 52 39 16 0.108 14.8 0.74712 0.39052 water_mites water_penny_beetles
## 686 25 37 52 125 50 0.346 47.4 0.97767 0.09697 water_mites cranefly_larvae
## 687 25 38 52 56 25 0.155 21.3 0.93552 0.12275 water_mites ameletidae
## 688 25 39 52 117 47 0.324 44.4 0.94182 0.14823 water_mites baetidae
## 689 25 40 52 13 4 0.036 4.9 0.40504 0.80350 water_mites caenidae
## 690 25 41 52 5 2 0.014 1.9 0.72024 0.63035 water_mites ephemerellidae
## 691 25 42 52 3 1 0.008 1.1 0.67843 0.76440 water_mites ephemeridae
## 692 25 43 52 40 16 0.111 15.2 0.69656 0.44858 water_mites heptageniidae
## 693 25 44 52 11 5 0.030 4.2 0.80591 0.40880 water_mites leptohyphidae
## 694 25 45 52 53 22 0.147 20.1 0.80570 0.30778 water_mites leptophlebiidae
## 695 25 46 52 19 8 0.053 7.2 0.74653 0.43599 water_mites chloroperlidae
## 696 25 47 52 68 29 0.188 25.8 0.90317 0.17181 water_mites leuctridae
## 697 25 48 52 46 18 0.127 17.5 0.65234 0.49205 water_mites nemouridae
## 698 25 49 52 44 16 0.122 16.7 0.47204 0.67289 water_mites perlidae
## 699 25 50 52 18 5 0.050 6.8 0.24694 0.88977 water_mites perlodidae
## 700 25 52 52 107 44 0.296 40.6 0.95337 0.10837 water_mites hydropsychidae
## 701 25 53 52 16 8 0.044 6.1 0.90694 0.21541 water_mites hydroptilidae
## 702 25 54 52 30 12 0.083 11.4 0.68465 0.47694 water_mites lepidostomatidae
## 703 25 55 52 45 17 0.125 17.1 0.56445 0.58406 water_mites limnephilidae
## 704 25 56 52 4 1 0.011 1.5 0.50989 0.85582 water_mites molannidae
## 705 25 57 52 5 3 0.014 1.9 0.93144 0.27976 water_mites odontoceridae
## 706 25 58 52 62 31 0.172 23.5 0.99763 0.00681 water_mites philopotamidae
## 707 25 59 52 8 1 0.022 3.0 0.12195 0.98074 water_mites phryganeidae
## 708 25 60 52 56 24 0.155 21.3 0.87725 0.21055 water_mites polycentropodidae
## 709 25 61 52 24 12 0.066 9.1 0.94047 0.13452 water_mites rhyacophilidae
## 710 25 62 52 46 17 0.127 17.5 0.50795 0.63800 water_mites uenoidae
## 711 26 27 78 59 38 0.245 33.6 0.95682 0.08633 damselfly_nymphs alderfly_larvae
## 712 26 28 78 105 61 0.436 59.8 0.75897 0.38308 damselfly_nymphs other_beetles
## 713 26 29 78 104 60 0.432 59.2 0.69944 0.45185 damselfly_nymphs crayfish
## 714 26 30 78 100 65 0.416 56.9 0.99957 0.00166 damselfly_nymphs dragonfly_nymphs
## 715 26 31 78 79 57 0.328 45.0 0.99999 0.00003 damselfly_nymphs riffle_beetles
## 716 26 32 78 135 78 0.561 76.9 1.00000 0.18366 damselfly_nymphs other_flies
## 717 26 33 78 99 63 0.411 56.4 0.99698 0.00915 damselfly_nymphs snails
## 718 26 34 78 45 33 0.187 25.6 0.99836 0.00526 damselfly_nymphs clams
## 719 26 35 78 52 31 0.216 29.6 0.74922 0.37605 damselfly_nymphs fishfly_larvae
## 720 26 36 78 39 25 0.162 22.2 0.89674 0.19038 damselfly_nymphs water_penny_beetles
## 721 26 37 78 125 76 0.519 71.2 0.99959 0.00381 damselfly_nymphs cranefly_larvae
## 722 26 38 78 56 41 0.233 31.9 0.99969 0.00112 damselfly_nymphs ameletidae
## 723 26 39 78 117 72 0.486 66.6 0.99803 0.00855 damselfly_nymphs baetidae
## 724 26 40 78 13 12 0.054 7.4 0.99959 0.00521 damselfly_nymphs caenidae
## 725 26 41 78 5 4 0.021 2.8 0.94349 0.28180 damselfly_nymphs ephemerellidae
## 726 26 42 78 3 2 0.012 1.7 0.81853 0.60411 damselfly_nymphs ephemeridae
## 727 26 43 78 40 26 0.166 22.8 0.92211 0.15037 damselfly_nymphs heptageniidae
## 728 26 44 78 11 8 0.046 6.3 0.92557 0.21841 damselfly_nymphs leptohyphidae
## 729 26 45 78 53 25 0.220 30.2 0.04894 0.97776 damselfly_nymphs leptophlebiidae
## 730 26 46 78 19 11 0.079 10.8 0.63005 0.56603 damselfly_nymphs chloroperlidae
## 731 26 47 78 68 38 0.283 38.7 0.47038 0.66247 damselfly_nymphs leuctridae
## 732 26 48 78 46 22 0.191 26.2 0.08902 0.95647 damselfly_nymphs nemouridae
## 733 26 49 78 44 28 0.183 25.1 0.89922 0.18297 damselfly_nymphs perlidae
## 734 26 50 78 18 12 0.075 10.2 0.87575 0.26358 damselfly_nymphs perlodidae
## 735 26 51 78 2 1 0.008 1.1 0.67765 0.81634 damselfly_nymphs glossosomatidae
## 736 26 52 78 107 67 0.445 60.9 0.99694 0.01012 damselfly_nymphs hydropsychidae
## 737 26 53 78 16 11 0.066 9.1 0.90216 0.22941 damselfly_nymphs hydroptilidae
## 738 26 54 78 30 10 0.125 17.1 0.00306 0.99922 damselfly_nymphs lepidostomatidae
## 739 26 55 78 45 23 0.187 25.6 0.21774 0.87406 damselfly_nymphs limnephilidae
## 740 26 56 78 4 1 0.017 2.3 0.21296 0.96759 damselfly_nymphs molannidae
## 741 26 57 78 5 1 0.021 2.8 0.10843 0.98660 damselfly_nymphs odontoceridae
## 742 26 58 78 62 39 0.258 35.3 0.92759 0.13354 damselfly_nymphs philopotamidae
## 743 26 59 78 8 7 0.033 4.6 0.99062 0.07175 damselfly_nymphs phryganeidae
## 744 26 60 78 56 36 0.233 31.9 0.94789 0.10190 damselfly_nymphs polycentropodidae
## 745 26 61 78 24 9 0.100 13.7 0.02977 0.99032 damselfly_nymphs rhyacophilidae
## 746 26 62 78 46 28 0.191 26.2 0.80037 0.31699 damselfly_nymphs uenoidae
## 747 27 28 59 105 48 0.330 45.2 0.91048 0.17641 alderfly_larvae other_beetles
## 748 27 29 59 104 52 0.327 44.8 0.99933 0.00279 alderfly_larvae crayfish
## 749 27 30 59 100 53 0.314 43.1 0.99999 0.00007 alderfly_larvae dragonfly_nymphs
## 750 27 31 59 79 41 0.248 34.0 0.99573 0.01148 alderfly_larvae riffle_beetles
## 751 27 32 59 135 59 0.424 58.1 1.00000 0.32235 alderfly_larvae other_flies
## 752 27 33 59 99 43 0.311 42.6 0.62906 0.52232 alderfly_larvae snails
## 753 27 34 59 45 22 0.141 19.4 0.87406 0.21774 alderfly_larvae clams
## 754 27 35 59 52 38 0.163 22.4 1.00000 0.00000 alderfly_larvae fishfly_larvae
## 755 27 36 59 39 28 0.123 16.8 1.00000 0.00002 alderfly_larvae water_penny_beetles
## 756 27 37 59 125 57 0.393 53.8 0.99096 0.04777 alderfly_larvae cranefly_larvae
## 757 27 38 59 56 30 0.176 24.1 0.98748 0.02944 alderfly_larvae ameletidae
## 758 27 39 59 117 55 0.368 50.4 0.99529 0.01979 alderfly_larvae baetidae
## 759 27 40 59 13 8 0.041 5.6 0.95578 0.13180 alderfly_larvae caenidae
## 760 27 41 59 5 2 0.016 2.2 0.63024 0.71820 alderfly_larvae ephemerellidae
## 761 27 42 59 3 3 0.009 1.3 1.00000 0.07755 alderfly_larvae ephemeridae
## 762 27 43 59 40 26 0.126 17.2 0.99979 0.00085 alderfly_larvae heptageniidae
## 763 27 44 59 11 10 0.035 4.7 0.99995 0.00098 alderfly_larvae leptohyphidae
## 764 27 45 59 53 34 0.167 22.8 0.99998 0.00007 alderfly_larvae leptophlebiidae
## 765 27 46 59 19 14 0.060 8.2 0.99925 0.00394 alderfly_larvae chloroperlidae
## 766 27 47 59 68 45 0.214 29.3 1.00000 0.00000 alderfly_larvae leuctridae
## 767 27 48 59 46 29 0.145 19.8 0.99980 0.00075 alderfly_larvae nemouridae
## 768 27 49 59 44 35 0.138 18.9 1.00000 0.00000 alderfly_larvae perlidae
## 769 27 50 59 18 11 0.057 7.8 0.97185 0.08079 alderfly_larvae perlodidae
## 770 27 52 59 107 54 0.336 46.1 0.99988 0.00067 alderfly_larvae hydropsychidae
## 771 27 53 59 16 8 0.050 6.9 0.80679 0.36887 alderfly_larvae hydroptilidae
## 772 27 54 59 30 17 0.094 12.9 0.97163 0.06808 alderfly_larvae lepidostomatidae
## 773 27 55 59 45 27 0.141 19.4 0.99857 0.00448 alderfly_larvae limnephilidae
## 774 27 56 59 4 2 0.013 1.7 0.78704 0.57883 alderfly_larvae molannidae
## 775 27 57 59 5 2 0.016 2.2 0.63024 0.71820 alderfly_larvae odontoceridae
## 776 27 58 59 62 37 0.195 26.7 0.99992 0.00032 alderfly_larvae philopotamidae
## 777 27 59 59 8 7 0.025 3.4 0.99911 0.01153 alderfly_larvae phryganeidae
## 778 27 60 59 56 31 0.176 24.1 0.99525 0.01252 alderfly_larvae polycentropodidae
## 779 27 61 59 24 16 0.075 10.3 0.99742 0.00968 alderfly_larvae rhyacophilidae
## 780 27 62 59 46 35 0.145 19.8 1.00000 0.00000 alderfly_larvae uenoidae
## 781 28 29 105 104 85 0.582 79.7 0.99589 0.01389 other_beetles crayfish
## 782 28 30 105 100 82 0.559 76.6 0.99520 0.01543 other_beetles dragonfly_nymphs
## 783 28 31 105 79 63 0.442 60.5 0.88590 0.21199 other_beetles riffle_beetles
## 784 28 32 105 135 104 0.755 103.5 0.94676 0.41391 other_beetles other_flies
## 785 28 33 105 99 75 0.554 75.9 0.43983 0.72847 other_beetles snails
## 786 28 34 105 45 39 0.252 34.5 0.98701 0.03918 other_beetles clams
## 787 28 35 105 52 40 0.291 39.9 0.60253 0.56194 other_beetles fishfly_larvae
## 788 28 36 105 39 27 0.218 29.9 0.14273 0.93322 other_beetles water_penny_beetles
## 789 28 37 105 125 97 0.699 95.8 0.88446 0.29591 other_beetles cranefly_larvae
## 790 28 38 105 56 42 0.313 42.9 0.42910 0.72138 other_beetles ameletidae
## 791 28 39 105 117 90 0.655 89.7 0.69178 0.52418 other_beetles baetidae
## 792 28 40 105 13 11 0.073 10.0 0.85703 0.37417 other_beetles caenidae
## 793 28 41 105 5 4 0.028 3.8 0.74152 0.66796 other_beetles ephemerellidae
## 794 28 42 105 3 3 0.017 2.3 1.00000 0.44716 other_beetles ephemeridae
## 795 28 43 105 40 30 0.224 30.7 0.46566 0.70032 other_beetles heptageniidae
## 796 28 44 105 11 9 0.062 8.4 0.77856 0.50298 other_beetles leptohyphidae
## 797 28 45 105 53 44 0.296 40.6 0.94814 0.11539 other_beetles leptophlebiidae
## 798 28 46 105 19 14 0.106 14.6 0.47019 0.73984 other_beetles chloroperlidae
## 799 28 47 105 68 53 0.380 52.1 0.71150 0.43871 other_beetles leuctridae
## 800 28 48 105 46 36 0.257 35.3 0.69920 0.46345 other_beetles nemouridae
## 801 28 49 105 44 38 0.246 33.7 0.98352 0.04799 other_beetles perlidae
## 802 28 50 105 18 16 0.101 13.8 0.95695 0.15362 other_beetles perlodidae
## 803 28 51 105 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.58609 other_beetles glossosomatidae
## 804 28 52 105 107 85 0.599 82.0 0.95263 0.11343 other_beetles hydropsychidae
## 805 28 53 105 16 14 0.090 12.3 0.92925 0.22449 other_beetles hydroptilidae
## 806 28 54 105 30 26 0.168 23.0 0.96245 0.10750 other_beetles lepidostomatidae
## 807 28 55 105 45 41 0.252 34.5 0.99934 0.00338 other_beetles limnephilidae
## 808 28 56 105 4 3 0.022 3.1 0.65962 0.76752 other_beetles molannidae
## 809 28 57 105 5 4 0.028 3.8 0.74152 0.66796 other_beetles odontoceridae
## 810 28 58 105 62 44 0.347 47.5 0.11054 0.94830 other_beetles philopotamidae
## 811 28 59 105 8 7 0.045 6.1 0.88844 0.40298 other_beetles phryganeidae
## 812 28 60 105 56 44 0.313 42.9 0.74035 0.40845 other_beetles polycentropodidae
## 813 28 61 105 24 15 0.134 18.4 0.06593 0.97718 other_beetles rhyacophilidae
## 814 28 62 105 46 38 0.257 35.3 0.91957 0.16893 other_beetles uenoidae
## 815 29 30 104 100 83 0.554 75.9 0.99952 0.00201 crayfish dragonfly_nymphs
## 816 29 31 104 79 69 0.438 60.0 0.99994 0.00028 crayfish riffle_beetles
## 817 29 32 104 135 104 0.748 102.5 1.00000 0.05668 crayfish other_flies
## 818 29 33 104 99 73 0.549 75.2 0.23306 0.88350 crayfish snails
## 819 29 34 104 45 35 0.249 34.2 0.71233 0.44769 crayfish clams
## 820 29 35 104 52 48 0.288 39.5 0.99996 0.00025 crayfish fishfly_larvae
## 821 29 36 104 39 37 0.216 29.6 0.99995 0.00046 crayfish water_penny_beetles
## 822 29 37 104 125 101 0.693 94.9 0.99999 0.00014 crayfish cranefly_larvae
## 823 29 38 104 56 49 0.310 42.5 0.99830 0.00638 crayfish ameletidae
## 824 29 39 104 117 94 0.648 88.8 0.99877 0.00588 crayfish baetidae
## 825 29 40 104 13 10 0.072 9.9 0.65005 0.61638 crayfish caenidae
## 826 29 41 104 5 5 0.028 3.8 1.00000 0.24617 crayfish ephemerellidae
## 827 29 42 104 3 3 0.017 2.3 1.00000 0.43439 crayfish ephemeridae
## 828 29 43 104 40 37 0.222 30.4 0.99967 0.00208 crayfish heptageniidae
## 829 29 44 104 11 11 0.061 8.4 1.00000 0.04213 crayfish leptohyphidae
## 830 29 45 104 53 51 0.294 40.2 1.00000 0.00000 crayfish leptophlebiidae
## 831 29 46 104 19 19 0.105 14.4 1.00000 0.00342 crayfish chloroperlidae
## 832 29 47 104 68 63 0.377 51.6 1.00000 0.00000 crayfish leuctridae
## 833 29 48 104 46 45 0.255 34.9 1.00000 0.00000 crayfish nemouridae
## 834 29 49 104 44 43 0.244 33.4 1.00000 0.00001 crayfish perlidae
## 835 29 50 104 18 17 0.100 13.7 0.99527 0.03700 crayfish perlodidae
## 836 29 51 104 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 crayfish glossosomatidae
## 837 29 52 104 107 91 0.593 81.2 1.00000 0.00001 crayfish hydropsychidae
## 838 29 53 104 16 10 0.089 12.1 0.15271 0.94496 crayfish hydroptilidae
## 839 29 54 104 30 29 0.166 22.8 0.99992 0.00108 crayfish lepidostomatidae
## 840 29 55 104 45 43 0.249 34.2 1.00000 0.00006 crayfish limnephilidae
## 841 29 56 104 4 3 0.022 3.0 0.67259 0.75532 crayfish molannidae
## 842 29 57 104 5 5 0.028 3.8 1.00000 0.24617 crayfish odontoceridae
## 843 29 58 104 62 56 0.344 47.1 0.99996 0.00024 crayfish philopotamidae
## 844 29 59 104 8 7 0.044 6.1 0.89694 0.38355 crayfish phryganeidae
## 845 29 60 104 56 45 0.310 42.5 0.88853 0.21026 crayfish polycentropodidae
## 846 29 61 104 24 23 0.133 18.2 0.99936 0.00690 crayfish rhyacophilidae
## 847 29 62 104 46 43 0.255 34.9 0.99996 0.00031 crayfish uenoidae
## 848 30 31 100 79 65 0.421 57.7 0.99884 0.00396 dragonfly_nymphs riffle_beetles
## 849 30 32 100 135 100 0.719 98.5 1.00000 0.07149 dragonfly_nymphs other_flies
## 850 30 33 100 99 72 0.527 72.3 0.54638 0.62316 dragonfly_nymphs snails
## 851 30 34 100 45 38 0.240 32.8 0.99153 0.02579 dragonfly_nymphs clams
## 852 30 35 100 52 44 0.277 38.0 0.99616 0.01248 dragonfly_nymphs fishfly_larvae
## 853 30 36 100 39 37 0.208 28.5 0.99999 0.00010 dragonfly_nymphs water_penny_beetles
## 854 30 37 100 125 95 0.666 91.2 0.99688 0.01706 dragonfly_nymphs cranefly_larvae
## 855 30 38 100 56 48 0.298 40.9 0.99893 0.00403 dragonfly_nymphs ameletidae
## 856 30 39 100 117 92 0.623 85.4 0.99987 0.00079 dragonfly_nymphs baetidae
## 857 30 40 100 13 12 0.069 9.5 0.98670 0.08602 dragonfly_nymphs caenidae
## 858 30 41 100 5 5 0.027 3.6 1.00000 0.20154 dragonfly_nymphs ephemerellidae
## 859 30 42 100 3 3 0.016 2.2 1.00000 0.38572 dragonfly_nymphs ephemeridae
## 860 30 43 100 40 36 0.213 29.2 0.99952 0.00253 dragonfly_nymphs heptageniidae
## 861 30 44 100 11 10 0.059 8.0 0.97325 0.14773 dragonfly_nymphs leptohyphidae
## 862 30 45 100 53 47 0.282 38.7 0.99986 0.00069 dragonfly_nymphs leptophlebiidae
## 863 30 46 100 19 18 0.101 13.9 0.99850 0.01440 dragonfly_nymphs chloroperlidae
## 864 30 47 100 68 62 0.362 49.6 1.00000 0.00000 dragonfly_nymphs leuctridae
## 865 30 48 100 46 43 0.245 33.6 0.99999 0.00005 dragonfly_nymphs nemouridae
## 866 30 49 100 44 40 0.234 32.1 0.99989 0.00067 dragonfly_nymphs perlidae
## 867 30 50 100 18 18 0.096 13.1 1.00000 0.00218 dragonfly_nymphs perlodidae
## 868 30 51 100 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.53134 dragonfly_nymphs glossosomatidae
## 869 30 52 100 107 88 0.570 78.1 1.00000 0.00001 dragonfly_nymphs hydropsychidae
## 870 30 53 100 16 12 0.085 11.7 0.67771 0.55666 dragonfly_nymphs hydroptilidae
## 871 30 54 100 30 28 0.160 21.9 0.99968 0.00248 dragonfly_nymphs lepidostomatidae
## 872 30 55 100 45 39 0.240 32.8 0.99775 0.00847 dragonfly_nymphs limnephilidae
## 873 30 56 100 4 3 0.021 2.9 0.72079 0.70523 dragonfly_nymphs molannidae
## 874 30 57 100 5 5 0.027 3.6 1.00000 0.20154 dragonfly_nymphs odontoceridae
## 875 30 58 100 62 54 0.330 45.3 0.99988 0.00056 dragonfly_nymphs philopotamidae
## 876 30 59 100 8 8 0.043 5.8 1.00000 0.07446 dragonfly_nymphs phryganeidae
## 877 30 60 100 56 44 0.298 40.9 0.92309 0.15212 dragonfly_nymphs polycentropodidae
## 878 30 61 100 24 23 0.128 17.5 0.99978 0.00276 dragonfly_nymphs rhyacophilidae
## 879 30 62 100 46 44 0.245 33.6 1.00000 0.00001 dragonfly_nymphs uenoidae
## 880 31 32 79 135 79 0.568 77.8 1.00000 0.17744 riffle_beetles other_flies
## 881 31 33 79 99 65 0.417 57.1 0.99941 0.00214 riffle_beetles snails
## 882 31 34 79 45 32 0.189 25.9 0.99267 0.01964 riffle_beetles clams
## 883 31 35 79 52 35 0.219 30.0 0.97593 0.05323 riffle_beetles fishfly_larvae
## 884 31 36 79 39 28 0.164 22.5 0.99025 0.02628 riffle_beetles water_penny_beetles
## 885 31 37 79 125 76 0.526 72.1 0.99677 0.01838 riffle_beetles cranefly_larvae
## 886 31 38 79 56 47 0.236 32.3 1.00000 0.00000 riffle_beetles ameletidae
## 887 31 39 79 117 74 0.492 67.5 0.99974 0.00156 riffle_beetles baetidae
## 888 31 40 79 13 11 0.055 7.5 0.99395 0.03400 riffle_beetles caenidae
## 889 31 41 79 5 4 0.021 2.9 0.93967 0.29361 riffle_beetles ephemerellidae
## 890 31 42 79 3 3 0.013 1.7 1.00000 0.18863 riffle_beetles ephemeridae
## 891 31 43 79 40 29 0.168 23.1 0.99351 0.01835 riffle_beetles heptageniidae
## 892 31 44 79 11 10 0.046 6.3 0.99829 0.01749 riffle_beetles leptohyphidae
## 893 31 45 79 53 34 0.223 30.6 0.91941 0.14841 riffle_beetles leptophlebiidae
## 894 31 46 79 19 15 0.080 11.0 0.99074 0.03526 riffle_beetles chloroperlidae
## 895 31 47 79 68 47 0.286 39.2 0.99802 0.00570 riffle_beetles leuctridae
## 896 31 48 79 46 30 0.194 26.5 0.92789 0.13790 riffle_beetles nemouridae
## 897 31 49 79 44 34 0.185 25.4 0.99973 0.00108 riffle_beetles perlidae
## 898 31 50 79 18 12 0.076 10.4 0.86158 0.28599 riffle_beetles perlodidae
## 899 31 51 79 2 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 riffle_beetles glossosomatidae
## 900 31 52 79 107 73 0.450 61.7 1.00000 0.00000 riffle_beetles hydropsychidae
## 901 31 53 79 16 11 0.067 9.2 0.89101 0.24889 riffle_beetles hydroptilidae
## 902 31 54 79 30 12 0.126 17.3 0.02280 0.99216 riffle_beetles lepidostomatidae
## 903 31 55 79 45 29 0.189 25.9 0.90501 0.17395 riffle_beetles limnephilidae
## 904 31 56 79 4 2 0.017 2.3 0.56642 0.79622 riffle_beetles molannidae
## 905 31 57 79 5 2 0.021 2.9 0.35647 0.89801 riffle_beetles odontoceridae
## 906 31 58 79 62 48 0.261 35.8 1.00000 0.00002 riffle_beetles philopotamidae
## 907 31 59 79 8 7 0.034 4.6 0.98956 0.07771 riffle_beetles phryganeidae
## 908 31 60 79 56 39 0.236 32.3 0.99470 0.01403 riffle_beetles polycentropodidae
## 909 31 61 79 24 15 0.101 13.8 0.77368 0.38487 riffle_beetles rhyacophilidae
## 910 31 62 79 46 32 0.194 26.5 0.98638 0.03341 riffle_beetles uenoidae
## 911 32 33 135 99 98 0.712 97.6 0.92454 0.47928 other_flies snails
## 912 32 34 135 45 45 0.324 44.3 1.00000 0.44933 other_flies clams
## 913 32 35 135 52 52 0.374 51.2 1.00000 0.38321 other_flies fishfly_larvae
## 914 32 36 135 39 39 0.281 38.4 1.00000 0.51020 other_flies water_penny_beetles
## 915 32 37 135 125 125 0.899 123.2 1.00000 0.00708 other_flies cranefly_larvae
## 916 32 38 135 56 56 0.403 55.2 1.00000 0.34779 other_flies ameletidae
## 917 32 39 135 117 117 0.842 115.3 1.00000 0.02040 other_flies baetidae
## 918 32 40 135 13 13 0.094 12.8 1.00000 0.81859 other_flies caenidae
## 919 32 41 135 5 5 0.036 4.9 1.00000 0.92808 other_flies ephemerellidae
## 920 32 42 135 3 3 0.022 3.0 1.00000 0.95653 other_flies ephemeridae
## 921 32 43 135 40 40 0.288 39.4 1.00000 0.49979 other_flies heptageniidae
## 922 32 44 135 11 11 0.079 10.8 1.00000 0.84532 other_flies leptohyphidae
## 923 32 45 135 53 53 0.381 52.2 1.00000 0.37419 other_flies leptophlebiidae
## 924 32 46 135 19 19 0.137 18.7 1.00000 0.74098 other_flies chloroperlidae
## 925 32 47 135 68 68 0.489 67.0 1.00000 0.25182 other_flies leuctridae
## 926 32 48 135 46 46 0.331 45.3 1.00000 0.43957 other_flies nemouridae
## 927 32 49 135 44 44 0.316 43.4 1.00000 0.45921 other_flies perlidae
## 928 32 50 135 18 18 0.129 17.7 1.00000 0.75365 other_flies perlodidae
## 929 32 51 135 2 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 other_flies glossosomatidae
## 930 32 52 135 107 107 0.770 105.4 1.00000 0.04669 other_flies hydropsychidae
## 931 32 53 135 16 16 0.115 15.8 1.00000 0.77930 other_flies hydroptilidae
## 932 32 54 135 30 30 0.216 29.6 1.00000 0.60874 other_flies lepidostomatidae
## 933 32 55 135 45 45 0.324 44.3 1.00000 0.44933 other_flies limnephilidae
## 934 32 56 135 4 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 other_flies molannidae
## 935 32 57 135 5 5 0.036 4.9 1.00000 0.92808 other_flies odontoceridae
## 936 32 58 135 62 62 0.446 61.1 1.00000 0.29787 other_flies philopotamidae
## 937 32 59 135 8 8 0.058 7.9 1.00000 0.88622 other_flies phryganeidae
## 938 32 60 135 56 56 0.403 55.2 1.00000 0.34779 other_flies polycentropodidae
## 939 32 61 135 24 24 0.173 23.6 1.00000 0.67926 other_flies rhyacophilidae
## 940 32 62 135 46 46 0.331 45.3 1.00000 0.43957 other_flies uenoidae
## 941 33 34 99 45 37 0.237 32.5 0.98079 0.05048 snails clams
## 942 33 35 99 52 33 0.274 37.6 0.05529 0.97634 snails fishfly_larvae
## 943 33 36 99 39 29 0.206 28.2 0.70773 0.45205 snails water_penny_beetles
## 944 33 37 99 125 91 0.659 90.3 0.78987 0.43747 snails cranefly_larvae
## 945 33 38 99 56 45 0.295 40.5 0.97597 0.05747 snails ameletidae
## 946 33 39 99 117 85 0.617 84.5 0.70362 0.49851 snails baetidae
## 947 33 40 99 13 10 0.069 9.4 0.75692 0.48897 snails caenidae
## 948 33 41 99 5 5 0.026 3.6 1.00000 0.19146 snails ephemerellidae
## 949 33 42 99 3 3 0.016 2.2 1.00000 0.37414 snails ephemeridae
## 950 33 43 99 40 27 0.211 28.9 0.27502 0.84364 snails heptageniidae
## 951 33 44 99 11 6 0.058 7.9 0.15412 0.95212 snails leptohyphidae
## 952 33 45 99 53 27 0.280 38.3 0.00001 1.00000 snails leptophlebiidae
## 953 33 46 99 19 13 0.100 13.7 0.43787 0.75626 snails chloroperlidae
## 954 33 47 99 68 43 0.359 49.1 0.01535 0.99461 snails leuctridae
## 955 33 48 99 46 25 0.243 33.2 0.00103 0.99975 snails nemouridae
## 956 33 49 99 44 28 0.232 31.8 0.09010 0.95900 snails perlidae
## 957 33 50 99 18 11 0.095 13.0 0.19488 0.91838 snails perlodidae
## 958 33 51 99 2 1 0.011 1.4 0.47928 0.92454 snails glossosomatidae
## 959 33 52 99 107 79 0.564 77.3 0.84276 0.28880 snails hydropsychidae
## 960 33 53 99 16 14 0.084 11.6 0.96854 0.12172 snails hydroptilidae
## 961 33 54 99 30 10 0.158 21.7 0.00000 1.00000 snails lepidostomatidae
## 962 33 55 99 45 27 0.237 32.5 0.02187 0.99208 snails limnephilidae
## 963 33 56 99 4 1 0.021 2.9 0.06472 0.99474 snails molannidae
## 964 33 57 99 5 0 0.026 3.6 0.00134 1.00000 snails odontoceridae
## 965 33 58 99 62 45 0.327 44.8 0.60426 0.54724 snails philopotamidae
## 966 33 59 99 8 8 0.042 5.8 1.00000 0.06850 snails phryganeidae
## 967 33 60 99 56 37 0.295 40.5 0.12495 0.93767 snails polycentropodidae
## 968 33 61 99 24 14 0.127 17.3 0.07946 0.97014 snails rhyacophilidae
## 969 33 62 99 46 33 0.243 33.2 0.53769 0.62098 snails uenoidae
## 970 34 35 45 52 19 0.125 17.1 0.81802 0.29614 clams fishfly_larvae
## 971 34 36 45 39 16 0.094 12.8 0.93034 0.13940 clams water_penny_beetles
## 972 34 37 45 125 42 0.300 41.1 0.82154 0.40023 clams cranefly_larvae
## 973 34 38 45 56 22 0.134 18.4 0.93527 0.12540 clams ameletidae
## 974 34 39 45 117 42 0.281 38.4 0.98665 0.05188 clams baetidae
## 975 34 40 45 13 6 0.031 4.3 0.91416 0.21934 clams caenidae
## 976 34 41 45 5 2 0.012 1.6 0.80103 0.53177 clams ephemerellidae
## 977 34 43 45 40 15 0.096 13.1 0.82787 0.29085 clams heptageniidae
## 978 34 44 45 11 4 0.026 3.6 0.72995 0.51660 clams leptohyphidae
## 979 34 45 45 53 14 0.127 17.4 0.13841 0.92886 clams leptophlebiidae
## 980 34 46 45 19 4 0.046 6.2 0.18095 0.93001 clams chloroperlidae
## 981 34 47 45 68 24 0.163 22.3 0.78441 0.33601 clams leuctridae
## 982 34 48 45 46 12 0.110 15.1 0.15741 0.91909 clams nemouridae
## 983 34 49 45 44 15 0.105 14.5 0.66070 0.48941 clams perlidae
## 984 34 50 45 18 5 0.043 5.9 0.42123 0.77300 clams perlodidae
## 985 34 52 45 107 39 0.257 35.1 0.97558 0.06715 clams hydropsychidae
## 986 34 53 45 16 7 0.038 5.3 0.89631 0.23688 clams hydroptilidae
## 987 34 54 45 30 10 0.072 9.9 0.61669 0.55617 clams lepidostomatidae
## 988 34 55 45 45 17 0.108 14.8 0.85373 0.25154 clams limnephilidae
## 989 34 56 45 4 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 clams molannidae
## 990 34 57 45 5 1 0.012 1.6 0.46823 0.86836 clams odontoceridae
## 991 34 58 45 62 24 0.149 20.4 0.93454 0.12601 clams philopotamidae
## 992 34 59 45 8 5 0.019 2.6 0.98460 0.07679 clams phryganeidae
## 993 34 60 45 56 18 0.134 18.4 0.51716 0.62819 clams polycentropodidae
## 994 34 61 45 24 7 0.058 7.9 0.43440 0.74225 clams rhyacophilidae
## 995 34 62 45 46 20 0.110 15.1 0.98034 0.04631 clams uenoidae
## 996 35 36 52 39 29 0.108 14.8 1.00000 0.00000 fishfly_larvae water_penny_beetles
## 997 35 37 52 125 50 0.346 47.4 0.97767 0.09697 fishfly_larvae cranefly_larvae
## 998 35 38 52 56 26 0.155 21.3 0.96963 0.06448 fishfly_larvae ameletidae
## 999 35 39 52 117 48 0.324 44.4 0.98287 0.05818 fishfly_larvae baetidae
## 1000 35 40 52 13 5 0.036 4.9 0.63905 0.59496 fishfly_larvae caenidae
## 1001 35 41 52 5 2 0.014 1.9 0.72024 0.63035 fishfly_larvae ephemerellidae
## 1002 35 42 52 3 3 0.008 1.1 1.00000 0.05272 fishfly_larvae ephemeridae
## 1003 35 43 52 40 22 0.111 15.2 0.99754 0.00757 fishfly_larvae heptageniidae
## 1004 35 44 52 11 8 0.030 4.2 0.99725 0.01679 fishfly_larvae leptohyphidae
## 1005 35 45 52 53 35 0.147 20.1 1.00000 0.00000 fishfly_larvae leptophlebiidae
## 1006 35 46 52 19 12 0.053 7.2 0.99607 0.01551 fishfly_larvae chloroperlidae
## 1007 35 47 52 68 47 0.188 25.8 1.00000 0.00000 fishfly_larvae leuctridae
## 1008 35 48 52 46 32 0.127 17.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae nemouridae
## 1009 35 49 52 44 29 0.122 16.7 1.00000 0.00000 fishfly_larvae perlidae
## 1010 35 50 52 18 10 0.050 6.8 0.97057 0.08363 fishfly_larvae perlodidae
## 1011 35 52 52 107 51 0.296 40.6 1.00000 0.00000 fishfly_larvae hydropsychidae
## 1012 35 53 52 16 9 0.044 6.1 0.96829 0.09306 fishfly_larvae hydroptilidae
## 1013 35 54 52 30 21 0.083 11.4 0.99999 0.00006 fishfly_larvae lepidostomatidae
## 1014 35 55 52 45 27 0.125 17.1 0.99995 0.00022 fishfly_larvae limnephilidae
## 1015 35 56 52 4 3 0.011 1.5 0.98072 0.15304 fishfly_larvae molannidae
## 1016 35 57 52 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00696 fishfly_larvae odontoceridae
## 1017 35 58 52 62 38 0.172 23.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae philopotamidae
## 1018 35 59 52 8 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 fishfly_larvae phryganeidae
## 1019 35 60 52 56 31 0.155 21.3 0.99988 0.00046 fishfly_larvae polycentropodidae
## 1020 35 61 52 24 19 0.066 9.1 1.00000 0.00001 fishfly_larvae rhyacophilidae
## 1021 35 62 52 46 30 0.127 17.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae uenoidae
## 1022 36 37 39 125 38 0.260 35.6 0.98539 0.09322 water_penny_beetles cranefly_larvae
## 1023 36 38 39 56 25 0.116 15.9 0.99988 0.00051 water_penny_beetles ameletidae
## 1024 36 39 39 117 39 0.243 33.3 1.00000 0.00066 water_penny_beetles baetidae
## 1025 36 40 39 13 6 0.027 3.7 0.96026 0.12418 water_penny_beetles caenidae
## 1026 36 41 39 5 3 0.010 1.4 0.97688 0.13940 water_penny_beetles ephemerellidae
## 1027 36 43 39 40 18 0.083 11.4 0.99816 0.00619 water_penny_beetles heptageniidae
## 1028 36 44 39 11 8 0.023 3.1 0.99980 0.00197 water_penny_beetles leptohyphidae
## 1029 36 45 39 53 25 0.110 15.1 0.99997 0.00014 water_penny_beetles leptophlebiidae
## 1030 36 46 39 19 11 0.039 5.4 0.99928 0.00372 water_penny_beetles chloroperlidae
## 1031 36 47 39 68 36 0.141 19.4 1.00000 0.00000 water_penny_beetles leuctridae
## 1032 36 48 39 46 25 0.096 13.1 1.00000 0.00000 water_penny_beetles nemouridae
## 1033 36 49 39 44 21 0.091 12.5 0.99983 0.00074 water_penny_beetles perlidae
## 1034 36 50 39 18 9 0.037 5.1 0.99089 0.03285 water_penny_beetles perlodidae
## 1035 36 52 39 107 37 0.222 30.5 0.99983 0.00141 water_penny_beetles hydropsychidae
## 1036 36 53 39 16 8 0.033 4.6 0.98740 0.04531 water_penny_beetles hydroptilidae
## 1037 36 54 39 30 14 0.062 8.5 0.99600 0.01328 water_penny_beetles lepidostomatidae
## 1038 36 55 39 45 18 0.094 12.8 0.98828 0.03057 water_penny_beetles limnephilidae
## 1039 36 56 39 4 2 0.008 1.1 0.93037 0.32041 water_penny_beetles molannidae
## 1040 36 57 39 5 2 0.010 1.4 0.86060 0.44109 water_penny_beetles odontoceridae
## 1041 36 58 39 62 30 0.129 17.6 1.00000 0.00000 water_penny_beetles philopotamidae
## 1042 36 59 39 8 4 0.017 2.3 0.95813 0.16075 water_penny_beetles phryganeidae
## 1043 36 60 39 56 25 0.116 15.9 0.99988 0.00051 water_penny_beetles polycentropodidae
## 1044 36 61 39 24 16 0.050 6.8 1.00000 0.00002 water_penny_beetles rhyacophilidae
## 1045 36 62 39 46 28 0.096 13.1 1.00000 0.00000 water_penny_beetles uenoidae
## 1046 37 38 125 56 55 0.373 51.1 0.99873 0.01349 cranefly_larvae ameletidae
## 1047 37 39 125 117 111 0.779 106.8 0.99975 0.00243 cranefly_larvae baetidae
## 1048 37 40 125 13 13 0.087 11.9 1.00000 0.28648 cranefly_larvae caenidae
## 1049 37 41 125 5 5 0.033 4.6 1.00000 0.62782 cranefly_larvae ephemerellidae
## 1050 37 42 125 3 3 0.020 2.7 1.00000 0.75796 cranefly_larvae ephemeridae
## 1051 37 43 125 40 39 0.266 36.5 0.98718 0.08440 cranefly_larvae heptageniidae
## 1052 37 44 125 11 11 0.073 10.0 1.00000 0.35026 cranefly_larvae leptohyphidae
## 1053 37 45 125 53 53 0.353 48.4 1.00000 0.00203 cranefly_larvae leptophlebiidae
## 1054 37 46 125 19 19 0.127 17.3 1.00000 0.15348 cranefly_larvae chloroperlidae
## 1055 37 47 125 68 67 0.453 62.0 0.99984 0.00239 cranefly_larvae leuctridae
## 1056 37 48 125 46 45 0.306 42.0 0.99432 0.04484 cranefly_larvae nemouridae
## 1057 37 49 125 44 44 0.293 40.1 1.00000 0.00749 cranefly_larvae perlidae
## 1058 37 50 125 18 17 0.120 16.4 0.82930 0.51209 cranefly_larvae perlodidae
## 1059 37 51 125 2 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 cranefly_larvae glossosomatidae
## 1060 37 52 125 107 104 0.713 97.6 1.00000 0.00005 cranefly_larvae hydropsychidae
## 1061 37 53 125 16 14 0.107 14.6 0.42196 0.85118 cranefly_larvae hydroptilidae
## 1062 37 54 125 30 29 0.200 27.4 0.95541 0.21181 cranefly_larvae lepidostomatidae
## 1063 37 55 125 45 44 0.300 41.1 0.99347 0.05004 cranefly_larvae limnephilidae
## 1064 37 56 125 4 4 0.027 3.6 1.00000 0.69008 cranefly_larvae molannidae
## 1065 37 57 125 5 5 0.033 4.6 1.00000 0.62782 cranefly_larvae odontoceridae
## 1066 37 58 125 62 61 0.413 56.6 0.99953 0.00593 cranefly_larvae philopotamidae
## 1067 37 59 125 8 7 0.053 7.3 0.52940 0.85347 cranefly_larvae phryganeidae
## 1068 37 60 125 56 55 0.373 51.1 0.99873 0.01349 cranefly_larvae polycentropodidae
## 1069 37 61 125 24 24 0.160 21.9 1.00000 0.08890 cranefly_larvae rhyacophilidae
## 1070 37 62 125 46 44 0.306 42.0 0.95516 0.16450 cranefly_larvae uenoidae
## 1071 38 39 56 117 55 0.349 47.8 0.99999 0.00017 ameletidae baetidae
## 1072 38 40 56 13 9 0.039 5.3 0.99333 0.03026 ameletidae caenidae
## 1073 38 41 56 5 5 0.015 2.0 1.00000 0.01023 ameletidae ephemerellidae
## 1074 38 42 56 3 2 0.009 1.2 0.93388 0.36368 ameletidae ephemeridae
## 1075 38 43 56 40 27 0.119 16.4 0.99999 0.00005 ameletidae heptageniidae
## 1076 38 44 56 11 9 0.033 4.5 0.99943 0.00521 ameletidae leptohyphidae
## 1077 38 45 56 53 28 0.158 21.7 0.99259 0.01877 ameletidae leptophlebiidae
## 1078 38 46 56 19 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 ameletidae chloroperlidae
## 1079 38 47 56 68 36 0.203 27.8 0.99883 0.00358 ameletidae leuctridae
## 1080 38 48 56 46 25 0.137 18.8 0.99301 0.01827 ameletidae nemouridae
## 1081 38 49 56 44 24 0.131 18.0 0.99217 0.02037 ameletidae perlidae
## 1082 38 50 56 18 14 0.054 7.4 0.99989 0.00080 ameletidae perlodidae
## 1083 38 52 56 107 51 0.319 43.7 0.99968 0.00162 ameletidae hydropsychidae
## 1084 38 53 56 16 9 0.048 6.5 0.94432 0.14468 ameletidae hydroptilidae
## 1085 38 54 56 30 8 0.090 12.3 0.05512 0.97916 ameletidae lepidostomatidae
## 1086 38 55 56 45 16 0.134 18.4 0.24244 0.85805 ameletidae limnephilidae
## 1087 38 56 56 4 0 0.012 1.6 0.11847 1.00000 ameletidae molannidae
## 1088 38 57 56 5 0 0.015 2.0 0.06859 1.00000 ameletidae odontoceridae
## 1089 38 58 56 62 32 0.185 25.3 0.99384 0.01572 ameletidae philopotamidae
## 1090 38 59 56 8 5 0.024 3.3 0.94982 0.18057 ameletidae phryganeidae
## 1091 38 60 56 56 30 0.167 22.9 0.99643 0.00975 ameletidae polycentropodidae
## 1092 38 61 56 24 11 0.072 9.8 0.78098 0.37338 ameletidae rhyacophilidae
## 1093 38 62 56 46 28 0.137 18.8 0.99982 0.00070 ameletidae uenoidae
## 1094 39 40 117 13 12 0.081 11.1 0.88418 0.40260 baetidae caenidae
## 1095 39 41 117 5 5 0.031 4.3 1.00000 0.44851 baetidae ephemerellidae
## 1096 39 42 117 3 3 0.019 2.6 1.00000 0.62051 baetidae ephemeridae
## 1097 39 43 117 40 39 0.249 34.2 0.99948 0.00591 baetidae heptageniidae
## 1098 39 44 117 11 11 0.069 9.4 1.00000 0.16389 baetidae leptohyphidae
## 1099 39 45 117 53 51 0.330 45.3 0.99964 0.00288 baetidae leptophlebiidae
## 1100 39 46 117 19 19 0.118 16.2 1.00000 0.03935 baetidae chloroperlidae
## 1101 39 47 117 68 65 0.424 58.1 0.99992 0.00066 baetidae leuctridae
## 1102 39 48 117 46 44 0.287 39.3 0.99827 0.01116 baetidae nemouridae
## 1103 39 49 117 44 42 0.274 37.6 0.99736 0.01592 baetidae perlidae
## 1104 39 50 117 18 18 0.112 15.4 1.00000 0.04730 baetidae perlodidae
## 1105 39 51 117 2 2 0.012 1.7 1.00000 0.72842 baetidae glossosomatidae
## 1106 39 52 117 107 98 0.667 91.4 0.99994 0.00044 baetidae hydropsychidae
## 1107 39 53 117 16 15 0.100 13.7 0.93199 0.28136 baetidae hydroptilidae
## 1108 39 54 117 30 28 0.187 25.6 0.96397 0.13329 baetidae lepidostomatidae
## 1109 39 55 117 45 40 0.281 38.4 0.85760 0.29662 baetidae limnephilidae
## 1110 39 56 117 4 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 baetidae molannidae
## 1111 39 57 117 5 5 0.031 4.3 1.00000 0.44851 baetidae odontoceridae
## 1112 39 58 117 62 58 0.386 52.9 0.99745 0.01174 baetidae philopotamidae
## 1113 39 59 117 8 8 0.050 6.8 1.00000 0.27285 baetidae phryganeidae
## 1114 39 60 117 56 54 0.349 47.8 0.99983 0.00153 baetidae polycentropodidae
## 1115 39 61 117 24 24 0.150 20.5 1.00000 0.01528 baetidae rhyacophilidae
## 1116 39 62 117 46 46 0.287 39.3 1.00000 0.00013 baetidae uenoidae
## 1117 40 43 13 40 5 0.028 3.8 0.86198 0.31594 caenidae heptageniidae
## 1118 40 44 13 11 4 0.008 1.0 0.99884 0.01133 caenidae leptohyphidae
## 1119 40 45 13 53 6 0.037 5.0 0.81157 0.38298 caenidae leptophlebiidae
## 1120 40 46 13 19 4 0.013 1.8 0.98107 0.08376 caenidae chloroperlidae
## 1121 40 47 13 68 8 0.047 6.5 0.88406 0.27136 caenidae leuctridae
## 1122 40 48 13 46 6 0.032 4.4 0.90400 0.23784 caenidae nemouridae
## 1123 40 49 13 44 8 0.030 4.2 0.99546 0.02177 caenidae perlidae
## 1124 40 50 13 18 5 0.012 1.7 0.99783 0.01474 caenidae perlodidae
## 1125 40 52 13 107 11 0.074 10.2 0.82698 0.42519 caenidae hydropsychidae
## 1126 40 53 13 16 1 0.011 1.5 0.53394 0.81641 caenidae hydroptilidae
## 1127 40 54 13 30 3 0.021 2.8 0.69209 0.57481 caenidae lepidostomatidae
## 1128 40 55 13 45 2 0.031 4.3 0.13429 0.96528 caenidae limnephilidae
## 1129 40 58 13 62 7 0.043 5.9 0.82815 0.35713 caenidae philopotamidae
## 1130 40 60 13 56 6 0.039 5.3 0.76083 0.45040 caenidae polycentropodidae
## 1131 40 61 13 24 1 0.017 2.3 0.29372 0.92817 caenidae rhyacophilidae
## 1132 40 62 13 46 8 0.032 4.4 0.99346 0.02925 caenidae uenoidae
## 1133 41 43 5 40 3 0.011 1.5 0.97451 0.14863 ephemerellidae heptageniidae
## 1134 41 45 5 53 3 0.014 1.9 0.92647 0.29213 ephemerellidae leptophlebiidae
## 1135 41 47 5 68 4 0.018 2.5 0.97210 0.17833 ephemerellidae leuctridae
## 1136 41 48 5 46 3 0.012 1.7 0.95658 0.20982 ephemerellidae nemouridae
## 1137 41 49 5 44 3 0.012 1.6 0.96330 0.18837 ephemerellidae perlidae
## 1138 41 52 5 107 4 0.029 3.9 0.71542 0.69901 ephemerellidae hydropsychidae
## 1139 41 54 5 30 0 0.008 1.1 0.28458 1.00000 ephemerellidae lepidostomatidae
## 1140 41 55 5 45 2 0.012 1.6 0.80103 0.53177 ephemerellidae limnephilidae
## 1141 41 58 5 62 3 0.017 2.3 0.87068 0.41026 ephemerellidae philopotamidae
## 1142 41 60 5 56 2 0.015 2.0 0.66972 0.68201 ephemerellidae polycentropodidae
## 1143 41 62 5 46 2 0.012 1.7 0.79018 0.54641 ephemerellidae uenoidae
## 1144 42 45 3 53 2 0.008 1.2 0.94412 0.33199 ephemeridae leptophlebiidae
## 1145 42 47 3 68 3 0.011 1.5 1.00000 0.11955 ephemeridae leuctridae
## 1146 42 48 3 46 1 0.007 1.0 0.73912 0.71021 ephemeridae nemouridae
## 1147 42 52 3 107 3 0.017 2.3 1.00000 0.47346 ephemeridae hydropsychidae
## 1148 42 58 3 62 3 0.010 1.4 1.00000 0.09022 ephemeridae philopotamidae
## 1149 42 60 3 56 2 0.009 1.2 0.93388 0.36368 ephemeridae polycentropodidae
## 1150 42 62 3 46 3 0.007 1.0 1.00000 0.03621 ephemeridae uenoidae
## 1151 43 44 40 11 8 0.023 3.2 0.99974 0.00240 heptageniidae leptohyphidae
## 1152 43 45 40 53 30 0.113 15.5 1.00000 0.00000 heptageniidae leptophlebiidae
## 1153 43 46 40 19 13 0.040 5.5 0.99998 0.00015 heptageniidae chloroperlidae
## 1154 43 47 40 68 32 0.145 19.9 1.00000 0.00000 heptageniidae leuctridae
## 1155 43 48 40 46 29 0.098 13.4 1.00000 0.00000 heptageniidae nemouridae
## 1156 43 49 40 44 30 0.094 12.8 1.00000 0.00000 heptageniidae perlidae
## 1157 43 50 40 18 14 0.038 5.3 1.00000 0.00001 heptageniidae perlodidae
## 1158 43 52 40 107 36 0.228 31.2 0.99422 0.02242 heptageniidae hydropsychidae
## 1159 43 53 40 16 4 0.034 4.7 0.47296 0.74714 heptageniidae hydroptilidae
## 1160 43 54 40 30 13 0.064 8.8 0.98254 0.04697 heptageniidae lepidostomatidae
## 1161 43 55 40 45 23 0.096 13.1 0.99998 0.00011 heptageniidae limnephilidae
## 1162 43 56 40 4 3 0.009 1.2 0.99349 0.07475 heptageniidae molannidae
## 1163 43 57 40 5 2 0.011 1.5 0.85137 0.45648 heptageniidae odontoceridae
## 1164 43 58 40 62 22 0.132 18.1 0.95145 0.09992 heptageniidae philopotamidae
## 1165 43 59 40 8 6 0.017 2.3 0.99925 0.00790 heptageniidae phryganeidae
## 1166 43 60 40 56 17 0.119 16.4 0.67110 0.47528 heptageniidae polycentropodidae
## 1167 43 61 40 24 13 0.051 7.0 0.99901 0.00430 heptageniidae rhyacophilidae
## 1168 43 62 40 46 27 0.098 13.4 1.00000 0.00000 heptageniidae uenoidae
## 1169 44 45 11 53 10 0.031 4.3 0.99999 0.00032 leptohyphidae leptophlebiidae
## 1170 44 46 11 19 7 0.011 1.5 1.00000 0.00008 leptohyphidae chloroperlidae
## 1171 44 47 11 68 11 0.040 5.5 1.00000 0.00029 leptohyphidae leuctridae
## 1172 44 48 11 46 11 0.027 3.7 1.00000 0.00000 leptohyphidae nemouridae
## 1173 44 49 11 44 11 0.026 3.5 1.00000 0.00000 leptohyphidae perlidae
## 1174 44 50 11 18 4 0.011 1.4 0.99369 0.03869 leptohyphidae perlodidae
## 1175 44 52 11 107 10 0.063 8.6 0.94147 0.25764 leptohyphidae hydropsychidae
## 1176 44 53 11 16 4 0.009 1.3 0.99651 0.02520 leptohyphidae hydroptilidae
## 1177 44 54 11 30 5 0.018 2.4 0.98586 0.06279 leptohyphidae lepidostomatidae
## 1178 44 55 11 45 5 0.026 3.6 0.89452 0.27005 leptohyphidae limnephilidae
## 1179 44 58 11 62 7 0.036 5.0 0.94462 0.16829 leptohyphidae philopotamidae
## 1180 44 60 11 56 5 0.033 4.5 0.74188 0.49229 leptohyphidae polycentropodidae
## 1181 44 61 11 24 3 0.014 1.9 0.89817 0.29747 leptohyphidae rhyacophilidae
## 1182 44 62 11 46 10 0.027 3.7 1.00000 0.00007 leptohyphidae uenoidae
## 1183 45 46 53 19 16 0.054 7.4 1.00000 0.00002 leptophlebiidae chloroperlidae
## 1184 45 47 53 68 47 0.192 26.3 1.00000 0.00000 leptophlebiidae leuctridae
## 1185 45 48 53 46 37 0.130 17.8 1.00000 0.00000 leptophlebiidae nemouridae
## 1186 45 49 53 44 36 0.124 17.0 1.00000 0.00000 leptophlebiidae perlidae
## 1187 45 50 53 18 14 0.051 7.0 0.99995 0.00038 leptophlebiidae perlodidae
## 1188 45 52 53 107 50 0.302 41.4 0.99999 0.00013 leptophlebiidae hydropsychidae
## 1189 45 53 53 16 5 0.045 6.2 0.35903 0.82105 leptophlebiidae hydroptilidae
## 1190 45 54 53 30 26 0.085 11.6 1.00000 0.00000 leptophlebiidae lepidostomatidae
## 1191 45 55 53 45 31 0.127 17.4 1.00000 0.00000 leptophlebiidae limnephilidae
## 1192 45 56 53 4 4 0.011 1.5 1.00000 0.02085 leptophlebiidae molannidae
## 1193 45 57 53 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00768 leptophlebiidae odontoceridae
## 1194 45 58 53 62 29 0.175 24.0 0.97405 0.05581 leptophlebiidae philopotamidae
## 1195 45 59 53 8 3 0.023 3.1 0.62697 0.66239 leptophlebiidae phryganeidae
## 1196 45 60 53 56 29 0.158 21.7 0.99740 0.00741 leptophlebiidae polycentropodidae
## 1197 45 61 53 24 19 0.068 9.3 1.00000 0.00001 leptophlebiidae rhyacophilidae
## 1198 45 62 53 46 28 0.130 17.8 0.99996 0.00016 leptophlebiidae uenoidae
## 1199 46 47 19 68 18 0.069 9.4 1.00000 0.00001 chloroperlidae leuctridae
## 1200 46 48 19 46 19 0.047 6.4 1.00000 0.00000 chloroperlidae nemouridae
## 1201 46 49 19 44 16 0.045 6.1 1.00000 0.00000 chloroperlidae perlidae
## 1202 46 50 19 18 10 0.018 2.5 1.00000 0.00001 chloroperlidae perlodidae
## 1203 46 52 19 107 18 0.108 14.8 0.99382 0.04576 chloroperlidae hydropsychidae
## 1204 46 53 19 16 3 0.016 2.2 0.84003 0.38771 chloroperlidae hydroptilidae
## 1205 46 54 19 30 8 0.030 4.2 0.99283 0.02779 chloroperlidae lepidostomatidae
## 1206 46 55 19 45 9 0.046 6.2 0.95419 0.11844 chloroperlidae limnephilidae
## 1207 46 58 19 62 15 0.063 8.6 0.99977 0.00152 chloroperlidae philopotamidae
## 1208 46 59 19 8 1 0.008 1.1 0.69349 0.70731 chloroperlidae phryganeidae
## 1209 46 60 19 56 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 chloroperlidae polycentropodidae
## 1210 46 61 19 24 9 0.024 3.3 0.99985 0.00107 chloroperlidae rhyacophilidae
## 1211 46 62 19 46 15 0.047 6.4 1.00000 0.00002 chloroperlidae uenoidae
## 1212 47 48 68 46 41 0.167 22.8 1.00000 0.00000 leuctridae nemouridae
## 1213 47 49 68 44 38 0.159 21.8 1.00000 0.00000 leuctridae perlidae
## 1214 47 50 68 18 13 0.065 8.9 0.99049 0.03461 leuctridae perlodidae
## 1215 47 52 68 107 65 0.388 53.1 1.00000 0.00000 leuctridae hydropsychidae
## 1216 47 53 68 16 9 0.058 7.9 0.79613 0.38349 leuctridae hydroptilidae
## 1217 47 54 68 30 26 0.109 14.9 1.00000 0.00000 leuctridae lepidostomatidae
## 1218 47 55 68 45 34 0.163 22.3 1.00000 0.00002 leuctridae limnephilidae
## 1219 47 56 68 4 4 0.014 2.0 1.00000 0.05799 leuctridae molannidae
## 1220 47 57 68 5 5 0.018 2.5 1.00000 0.02790 leuctridae odontoceridae
## 1221 47 58 68 62 46 0.225 30.8 1.00000 0.00000 leuctridae philopotamidae
## 1222 47 59 68 8 6 0.029 4.0 0.97028 0.13246 leuctridae phryganeidae
## 1223 47 60 68 56 40 0.203 27.8 1.00000 0.00002 leuctridae polycentropodidae
## 1224 47 61 68 24 22 0.087 11.9 1.00000 0.00000 leuctridae rhyacophilidae
## 1225 47 62 68 46 38 0.167 22.8 1.00000 0.00000 leuctridae uenoidae
## 1226 48 49 46 44 31 0.108 14.8 1.00000 0.00000 nemouridae perlidae
## 1227 48 50 46 18 17 0.044 6.0 1.00000 0.00000 nemouridae perlodidae
## 1228 48 52 46 107 44 0.262 35.9 0.99998 0.00017 nemouridae hydropsychidae
## 1229 48 53 46 16 6 0.039 5.4 0.74156 0.46182 nemouridae hydroptilidae
## 1230 48 54 46 30 23 0.074 10.1 1.00000 0.00000 nemouridae lepidostomatidae
## 1231 48 55 46 45 29 0.110 15.1 1.00000 0.00000 nemouridae limnephilidae
## 1232 48 56 46 4 3 0.010 1.3 0.98838 0.10998 nemouridae molannidae
## 1233 48 57 46 5 5 0.012 1.7 1.00000 0.00367 nemouridae odontoceridae
## 1234 48 58 46 62 31 0.152 20.8 0.99995 0.00020 nemouridae philopotamidae
## 1235 48 59 46 8 4 0.020 2.7 0.91597 0.25853 nemouridae phryganeidae
## 1236 48 60 46 56 23 0.137 18.8 0.95769 0.08715 nemouridae polycentropodidae
## 1237 48 61 46 24 21 0.059 8.1 1.00000 0.00000 nemouridae rhyacophilidae
## 1238 48 62 46 46 31 0.113 15.4 1.00000 0.00000 nemouridae uenoidae
## 1239 49 50 44 18 13 0.042 5.8 0.99997 0.00022 perlidae perlodidae
## 1240 49 52 44 107 41 0.251 34.4 0.99969 0.00199 perlidae hydropsychidae
## 1241 49 53 44 16 5 0.038 5.1 0.59116 0.63251 perlidae hydroptilidae
## 1242 49 54 44 30 16 0.070 9.6 0.99850 0.00551 perlidae lepidostomatidae
## 1243 49 55 44 45 26 0.105 14.5 1.00000 0.00001 perlidae limnephilidae
## 1244 49 56 44 4 2 0.009 1.3 0.90263 0.38554 perlidae molannidae
## 1245 49 57 44 5 3 0.012 1.6 0.96330 0.18837 perlidae odontoceridae
## 1246 49 58 44 62 28 0.145 19.9 0.99923 0.00261 perlidae philopotamidae
## 1247 49 59 44 8 6 0.019 2.6 0.99850 0.01358 perlidae phryganeidae
## 1248 49 60 44 56 20 0.131 18.0 0.82545 0.28566 perlidae polycentropodidae
## 1249 49 61 44 24 12 0.056 7.7 0.98795 0.03632 perlidae rhyacophilidae
## 1250 49 62 44 46 29 0.108 14.8 1.00000 0.00000 perlidae uenoidae
## 1251 50 52 18 107 16 0.103 14.1 0.94216 0.19212 perlodidae hydropsychidae
## 1252 50 53 18 16 3 0.015 2.1 0.86355 0.35175 perlodidae hydroptilidae
## 1253 50 54 18 30 9 0.029 3.9 0.99919 0.00446 perlodidae lepidostomatidae
## 1254 50 55 18 45 9 0.043 5.9 0.97077 0.08404 perlodidae limnephilidae
## 1255 50 58 18 62 10 0.059 8.1 0.88397 0.24518 perlodidae philopotamidae
## 1256 50 59 18 8 3 0.008 1.1 0.98929 0.07034 perlodidae phryganeidae
## 1257 50 60 18 56 8 0.054 7.4 0.72373 0.46624 perlodidae polycentropodidae
## 1258 50 61 18 24 6 0.023 3.2 0.98179 0.06557 perlodidae rhyacophilidae
## 1259 50 62 18 46 14 0.044 6.0 1.00000 0.00005 perlodidae uenoidae
## 1260 51 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 glossosomatidae hydropsychidae
## 1261 52 53 107 16 15 0.091 12.5 0.98535 0.09107 hydropsychidae hydroptilidae
## 1262 52 54 107 30 28 0.171 23.4 0.99741 0.01529 hydropsychidae lepidostomatidae
## 1263 52 55 107 45 40 0.257 35.1 0.99302 0.02442 hydropsychidae limnephilidae
## 1264 52 56 107 4 4 0.023 3.1 1.00000 0.36746 hydropsychidae molannidae
## 1265 52 57 107 5 5 0.029 3.9 1.00000 0.28458 hydropsychidae odontoceridae
## 1266 52 58 107 62 59 0.353 48.4 1.00000 0.00000 hydropsychidae philopotamidae
## 1267 52 59 107 8 8 0.046 6.2 1.00000 0.13042 hydropsychidae phryganeidae
## 1268 52 60 107 56 51 0.319 43.7 0.99968 0.00162 hydropsychidae polycentropodidae
## 1269 52 61 107 24 24 0.137 18.7 1.00000 0.00138 hydropsychidae rhyacophilidae
## 1270 52 62 107 46 43 0.262 35.9 0.99983 0.00113 hydropsychidae uenoidae
## 1271 53 54 16 30 4 0.026 3.5 0.74777 0.48173 hydroptilidae lepidostomatidae
## 1272 53 55 16 45 3 0.038 5.3 0.16020 0.94683 hydroptilidae limnephilidae
## 1273 53 58 16 62 10 0.053 7.2 0.95930 0.11384 hydroptilidae philopotamidae
## 1274 53 60 16 56 11 0.048 6.5 0.99625 0.01664 hydroptilidae polycentropodidae
## 1275 53 61 16 24 4 0.020 2.8 0.87984 0.29756 hydroptilidae rhyacophilidae
## 1276 53 62 16 46 7 0.039 5.4 0.88328 0.25844 hydroptilidae uenoidae
## 1277 54 55 30 45 23 0.072 9.9 1.00000 0.00000 lepidostomatidae limnephilidae
## 1278 54 57 30 5 5 0.008 1.1 1.00000 0.00038 lepidostomatidae odontoceridae
## 1279 54 58 30 62 17 0.099 13.6 0.94812 0.11265 lepidostomatidae philopotamidae
## 1280 54 59 30 8 1 0.013 1.8 0.44342 0.86958 lepidostomatidae phryganeidae
## 1281 54 60 30 56 14 0.090 12.3 0.82661 0.29995 lepidostomatidae polycentropodidae
## 1282 54 61 30 24 16 0.038 5.3 1.00000 0.00000 lepidostomatidae rhyacophilidae
## 1283 54 62 30 46 17 0.074 10.1 0.99927 0.00291 lepidostomatidae uenoidae
## 1284 55 56 45 4 4 0.010 1.3 1.00000 0.01061 limnephilidae molannidae
## 1285 55 57 45 5 5 0.012 1.6 1.00000 0.00327 limnephilidae odontoceridae
## 1286 55 58 45 62 26 0.149 20.4 0.98754 0.03032 limnephilidae philopotamidae
## 1287 55 59 45 8 3 0.019 2.6 0.75664 0.52257 limnephilidae phryganeidae
## 1288 55 60 45 56 15 0.134 18.4 0.14195 0.92602 limnephilidae polycentropodidae
## 1289 55 61 45 24 16 0.058 7.9 0.99997 0.00020 limnephilidae rhyacophilidae
## 1290 55 62 45 46 22 0.110 15.1 0.99759 0.00735 limnephilidae uenoidae
## 1291 56 58 4 62 3 0.013 1.8 0.96028 0.24170 molannidae philopotamidae
## 1292 56 60 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 molannidae polycentropodidae
## 1293 56 62 4 46 3 0.010 1.3 0.98838 0.10998 molannidae uenoidae
## 1294 57 58 5 62 5 0.017 2.3 1.00000 0.01732 odontoceridae philopotamidae
## 1295 57 60 5 56 3 0.015 2.0 0.91014 0.33028 odontoceridae polycentropodidae
## 1296 57 62 5 46 2 0.012 1.7 0.79018 0.54641 odontoceridae uenoidae
## 1297 58 59 62 8 6 0.026 3.6 0.98389 0.08437 philopotamidae phryganeidae
## 1298 58 60 62 56 36 0.185 25.3 0.99996 0.00018 philopotamidae polycentropodidae
## 1299 58 61 62 24 18 0.079 10.9 0.99976 0.00127 philopotamidae rhyacophilidae
## 1300 58 62 62 46 28 0.152 20.8 0.99742 0.00754 philopotamidae uenoidae
## 1301 59 60 8 56 4 0.024 3.3 0.81943 0.42507 phryganeidae polycentropodidae
## 1302 59 61 8 24 1 0.010 1.4 0.57560 0.79525 phryganeidae rhyacophilidae
## 1303 59 62 8 46 7 0.020 2.7 0.99990 0.00205 phryganeidae uenoidae
## 1304 60 61 56 24 17 0.072 9.8 0.99978 0.00117 polycentropodidae rhyacophilidae
## 1305 60 62 56 46 26 0.137 18.8 0.99764 0.00699 polycentropodidae uenoidae
## 1306 61 62 24 46 18 0.059 8.1 1.00000 0.00001 rhyacophilidae uenoidae# network stuff
library(asnipe)
library(igraph)
assoc=streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3 #transpose the data into group-by-individual
mat=get_network(t(assoc), association_index="SRI") #create adjacency matrix with "simple ratio index"## Generating 62 x 62 matrixg.streams=graph_from_adjacency_matrix(mat, "undirected", weighted=T) #make into igraph object
plot(g.streams, edge.width=E(g.streams)$weight*5, vertex.label="")
com=cluster_louvain(g.streams)
com## IGRAPH clustering multi level, groups: 3, mod: 0.1
## + groups:
## $`1`
## [1] "streambioticsum_suff_mtdusky" "streambioticsum_suff_nodusky" "streambioticsum_suff_twolined" "common_shiner" "aquatic_worms" "sow_bugs" "scuds" "water_mites" "damselfly_nymphs" "other_beetles" "crayfish" "dragonfly_nymphs" "riffle_beetles" "other_flies" "snails" "clams" "cranefly_larvae" "ameletidae"
## [19] "baetidae" "hydropsychidae" "philopotamidae" "polycentropodidae"
##
## $`2`
## [1] "streambioticsum_suff_longtail" "streambioticsum_suff_red" "streambioticsum_suff_mole" "streambioticsum_suff_redback" "streambioticsum_suff_slimy" "blacknose_dace" "alderfly_larvae" "fishfly_larvae" "water_penny_beetles" "heptageniidae" "leptohyphidae" "leptophlebiidae" "chloroperlidae" "leuctridae" "nemouridae" "perlidae" "perlodidae" "glossosomatidae"
## [19] "hydroptilidae" "lepidostomatidae" "limnephilidae" "molannidae" "odontoceridae" "rhyacophilidae" "uenoidae"
##
## $`3`
## [1] "bluegill_sunfish" "central_stoneroller_minnow" "creek_chub" "green_sunfish" "johnny_darter" "rainbow_darter" "redbelly_dace" "redside_dace" "white_sucker" "yellow_bullhead_catfish" "sessile_animals" "caenidae" "ephemerellidae" "ephemeridae" "phryganeidae"
## + ... omitted several groups/verticescom$memberships## [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10] [,11] [,12] [,13] [,14] [,15] [,16] [,17] [,18] [,19] [,20] [,21] [,22] [,23] [,24] [,25] [,26] [,27] [,28] [,29] [,30] [,31] [,32] [,33] [,34] [,35] [,36] [,37] [,38] [,39] [,40] [,41] [,42] [,43] [,44] [,45] [,46] [,47] [,48] [,49] [,50] [,51] [,52] [,53] [,54] [,55] [,56] [,57] [,58] [,59] [,60] [,61] [,62]
## [1,] 1 1 1 2 2 2 2 2 2 3 3 1 4 3 4 4 5 5 4 3 4 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 4 5 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 4 1 2 2
## [2,] 1 1 1 2 2 2 2 2 2 3 3 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 3 1 2 2set.seed(2)
plot(com, g.streams, edge.width=E(g.streams)$weight*5)
library(RColorBrewer)
colors=brewer.pal(length(com),'Accent') #make a color palette
V(g.streams)$color=colors[membership(com)] #assign each vertex a color based on the community assignment
set.seed(2)
plot(g.streams, edge.width=E(g.streams)$weight*5)
# number of species
S <- vcount(g.streams)
# number of interactions
L <- ecount(g.streams)
# average number of interactions species
L.S <- L/S
# network connectance
C <- L/S^2
# Calculate connectance
connectance <- ecount(g.streams) / vcount(g.streams)^2
# Print connectance va
print(paste0('Connectance of stream network =', round(connectance,2)))## [1] "Connectance of stream network =0.39"links.per.species <- ecount(g.streams) / vcount(g.streams)
## Mean generality of species in the network
Generality <- function(M){
return(sum(colSums(M))/sum((colSums(M)!=0)));
}
Generality(mat)## [1] 9.137971 ## Mean vulnerability of the species in the network
Vulnerability <- function(M){
return(sum(rowSums(M))/sum((rowSums(M)!=0)));
}
Vulnerability(mat)## [1] 9.137971 ## In-degree or number of prey of all species in the network
InDegree <- function(M){
return(colSums(M));
}
InDegree(mat)## streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_longtail streambioticsum_suff_red streambioticsum_suff_mole streambioticsum_suff_redback streambioticsum_suff_slimy blacknose_dace bluegill_sunfish central_stoneroller_minnow common_shiner creek_chub green_sunfish johnny_darter rainbow_darter redbelly_dace redside_dace white_sucker yellow_bullhead_catfish
## 5.7684429 12.6091201 18.1148539 2.6036502 6.9880317 0.8314151 13.2562505 4.3712446 6.8745118 1.2921030 1.6087976 0.2536703 9.7791805 1.7606198 1.9689797 2.0458670 1.0543417 0.7658198 1.8081731 0.6520434
## sessile_animals aquatic_worms sow_bugs scuds water_mites damselfly_nymphs alderfly_larvae other_beetles crayfish dragonfly_nymphs riffle_beetles other_flies snails clams fishfly_larvae water_penny_beetles cranefly_larvae ameletidae baetidae caenidae
## 1.5287731 16.3934254 7.9742613 9.0931701 11.3492770 14.0937051 14.6841860 16.0219490 17.8581053 17.6184242 15.9132396 17.7178975 14.4724936 10.3423900 14.5769653 12.7719430 17.9686099 13.6687473 17.8530641 4.7198128
## ephemerellidae ephemeridae heptageniidae leptohyphidae leptophlebiidae chloroperlidae leuctridae nemouridae perlidae perlodidae glossosomatidae hydropsychidae hydroptilidae lepidostomatidae limnephilidae molannidae odontoceridae philopotamidae phryganeidae polycentropodidae
## 2.5257326 1.7673071 12.4332667 5.6486398 14.9095868 8.4589938 17.2533323 14.5551439 13.6439999 7.3296146 1.3508963 18.2477425 5.0222787 9.9118894 12.1626754 2.1686248 2.6417555 15.0208323 3.8684341 13.0957294
## rhyacophilidae uenoidae
## 9.3303700 14.1798088 ## Out-degree or number of predators of all species in the network
OutDegree <- function(M){
return(rowSums(M));
}
OutDegree(mat)## streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_longtail streambioticsum_suff_red streambioticsum_suff_mole streambioticsum_suff_redback streambioticsum_suff_slimy blacknose_dace bluegill_sunfish central_stoneroller_minnow common_shiner creek_chub green_sunfish johnny_darter rainbow_darter redbelly_dace redside_dace white_sucker yellow_bullhead_catfish
## 5.7684429 12.6091201 18.1148539 2.6036502 6.9880317 0.8314151 13.2562505 4.3712446 6.8745118 1.2921030 1.6087976 0.2536703 9.7791805 1.7606198 1.9689797 2.0458670 1.0543417 0.7658198 1.8081731 0.6520434
## sessile_animals aquatic_worms sow_bugs scuds water_mites damselfly_nymphs alderfly_larvae other_beetles crayfish dragonfly_nymphs riffle_beetles other_flies snails clams fishfly_larvae water_penny_beetles cranefly_larvae ameletidae baetidae caenidae
## 1.5287731 16.3934254 7.9742613 9.0931701 11.3492770 14.0937051 14.6841860 16.0219490 17.8581053 17.6184242 15.9132396 17.7178975 14.4724936 10.3423900 14.5769653 12.7719430 17.9686099 13.6687473 17.8530641 4.7198128
## ephemerellidae ephemeridae heptageniidae leptohyphidae leptophlebiidae chloroperlidae leuctridae nemouridae perlidae perlodidae glossosomatidae hydropsychidae hydroptilidae lepidostomatidae limnephilidae molannidae odontoceridae philopotamidae phryganeidae polycentropodidae
## 2.5257326 1.7673071 12.4332667 5.6486398 14.9095868 8.4589938 17.2533323 14.5551439 13.6439999 7.3296146 1.3508963 18.2477425 5.0222787 9.9118894 12.1626754 2.1686248 2.6417555 15.0208323 3.8684341 13.0957294
## rhyacophilidae uenoidae
## 9.3303700 14.1798088#occupancy - all taxa
phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula <- ~scale(pool_depth_.cm.) + scale(per_sand) + scale(per_cobble) + scale(substrate_metric_total) +
scale(pool_metric_total)
phwhall_occobject_season.det.formula <- ~ scale(seasons)
# Number of species
N <- dim(phwhall_occobject$y)[1]
# Distances between sites
dist.phwh <- dist(phwhall_occobject$coords)
# Exponential covariance model
cov.model <- "exponential"
ms.inits <- list(alpha.comm = 0,
beta.comm = 0,
beta = 0,
alpha = 0,
tau.sq.beta = 1,
tau.sq.alpha = 1,
z = apply(phwhall_occobject$y, c(1, 2), max, na.rm = TRUE))
ms.priors <- list(beta.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
alpha.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
tau.sq.beta.ig = list(a = 0.1, b = 0.1),
tau.sq.alpha.ig = list(a = 0.1, b = 0.1))
out.alltax.allsigcor.ms <- msPGOcc(occ.formula = phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula,
det.formula = phwhsal_occobject_season.det.formula,
data = phwhall_occobject,
inits = ms.inits,
n.samples = 30000,
priors = ms.priors,
n.omp.threads = 4,
verbose = TRUE,
n.report = 60000,
n.burn = 10000,
n.thin = 50,
n.chains = 3)
summary(out.alltax.allsigcor.ms, level = 'both')
ppc.alltax.allsigcor.ms.out <- ppcOcc(out.alltax.allsigcor.ms, 'chi-squared', group = 1)
summary(ppc.alltax.allsigcor.ms.out, level = 'both')
waicOcc(out.alltax.allsigcor.ms)improved detection model
phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula <- ~scale(pool_depth_.cm.) + scale(per_sand) + scale(per_cobble) + scale(substrate_metric_total) +
scale(pool_metric_total)
phwhall_occobject_dayyearseason.det.formula <- ~scale(seasons)+scale(dayyear)
# Number of species
N <- dim(phwhall_occobject$y)[1]
# Distances between sites
dist.phwh <- dist(phwhall_occobject$coords)
# Exponential covariance model
cov.model <- "exponential"
ms.inits <- list(alpha.comm = 0,
beta.comm = 0,
beta = 0,
alpha = 0,
tau.sq.beta = 1,
tau.sq.alpha = 1,
z = apply(phwhall_occobject$y, c(1, 2), max, na.rm = TRUE))
ms.priors <- list(beta.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
alpha.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
tau.sq.beta.ig = list(a = 0.1, b = 0.1),
tau.sq.alpha.ig = list(a = 0.1, b = 0.1))
out.alltax.allsigcor.impdet.ms <- msPGOcc(occ.formula = phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula,
det.formula = phwhall_occobject_dayyearseason.det.formula,
data = phwhall_occobject,
inits = ms.inits,
n.samples = 30000,
priors = ms.priors,
n.omp.threads = 4,
verbose = TRUE,
n.report = 60000,
n.burn = 10000,
n.thin = 50,
n.chains = 3)
summary(out.alltax.allsigcor.impdet.ms, level = 'both')
ppc.alltax.allsigcor.impdet.ms.out <- ppcOcc(out.alltax.allsigcor.impdet.ms, 'chi-squared', group = 1)
summary(ppc.alltax.allsigcor.impdet.ms.out, level = 'both')
waicOcc(out.alltax.allsigcor.impdet.ms)
write_rds(out.alltax.allsigcor.impdet.ms,"alltaxmodel_phwh.rds")full null
null <- ~1
# Number of species
N <- dim(phwhall_occobject$y)[1]
# Distances between sites
dist.phwh <- dist(phwhall_occobject$coords)
# Exponential covariance model
cov.model <- "exponential"
ms.inits <- list(alpha.comm = 0,
beta.comm = 0,
beta = 0,
alpha = 0,
tau.sq.beta = 1,
tau.sq.alpha = 1,
z = apply(phwhall_occobject$y, c(1, 2), max, na.rm = TRUE))
ms.priors <- list(beta.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
alpha.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
tau.sq.beta.ig = list(a = 0.1, b = 0.1),
tau.sq.alpha.ig = list(a = 0.1, b = 0.1))
out.null <- msPGOcc(occ.formula = null,
det.formula = null,
data = phwhall_occobject,
inits = ms.inits,
n.samples = 30000,
priors = ms.priors,
n.omp.threads = 4,
verbose = TRUE,
n.report = 60000,
n.burn = 10000,
n.thin = 50,
n.chains = 3)
summary(out.null, level = 'both')
ppc.out.null <- ppcOcc(out.null, 'chi-squared', group = 1)
summary(ppc.out.null, level = 'both')
waicOcc(out.null)Will want to exclude species that did not fit as well.
out.alltax.allsigcor.impdet.ms<-readRDS("alltaxmodel_phwh.rds")
summary(out.alltax.allsigcor.impdet.ms,max.print=100000)##
## Call:
## msPGOcc(occ.formula = phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula, det.formula = phwhall_occobject_dayyearseason.det.formula, data = phwhall_occobject, inits = ms.inits, priors = ms.priors, n.samples = 30000, n.omp.threads = 4, verbose = TRUE, n.report = 60000, n.burn = 10000, n.thin = 50, n.chains = 3)
##
## Samples per Chain: 30000
## Burn-in: 10000
## Thinning Rate: 50
## Number of Chains: 3
## Total Posterior Samples: 1200
## Run Time (min): 52.2222
##
## ----------------------------------------
## Community Level
## ----------------------------------------
## Occurrence Means (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept) -2.8897 0.8106 -4.1358 -3.0216 -0.8177 1.3829 19
## scale(pool_depth_.cm.) -0.0189 0.1261 -0.2612 -0.0202 0.2446 1.0128 996
## scale(per_sand) 0.4350 0.0947 0.2540 0.4328 0.6232 1.0005 1264
## scale(per_cobble) 0.2455 0.0708 0.1068 0.2441 0.3797 1.0046 1200
## scale(substrate_metric_total) 0.3483 0.0759 0.1939 0.3484 0.4971 1.0016 1076
## scale(pool_metric_total) -0.0111 0.0659 -0.1415 -0.0112 0.1189 1.0040 1121
##
## Occurrence Variances (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept) 20.1277 6.2804 6.2490 19.9050 33.7245 1.2347 39
## scale(pool_depth_.cm.) 0.6635 0.1997 0.3567 0.6368 1.1398 1.0009 846
## scale(per_sand) 0.2564 0.0786 0.1299 0.2473 0.4325 1.0016 1200
## scale(per_cobble) 0.0880 0.0414 0.0304 0.0807 0.1884 1.0074 874
## scale(substrate_metric_total) 0.0931 0.0465 0.0323 0.0825 0.2054 1.0020 1088
## scale(pool_metric_total) 0.0986 0.0432 0.0357 0.0911 0.2026 1.0064 1261
##
## Detection Means (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept) -1.6660 0.6560 -3.5379 -1.5174 -0.8506 1.5221 15
## scale(seasons) -0.2099 0.0849 -0.3768 -0.2093 -0.0468 1.0000 1200
## scale(dayyear) 0.0430 0.0670 -0.0857 0.0408 0.1796 0.9997 1329
##
## Detection Variances (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept) 4.2489 2.8532 1.6422 3.4169 13.0521 1.8461 11
## scale(seasons) 0.3257 0.0801 0.1999 0.3122 0.5103 1.0039 1377
## scale(dayyear) 0.1949 0.0557 0.1075 0.1867 0.3228 1.0066 1200
##
## ----------------------------------------
## Species Level
## ----------------------------------------
## Occurrence (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept)-streambiotic_suff_mtdusky -1.6714 0.3158 -2.2931 -1.6676 -1.0738 1.0069 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_nodusky -0.2926 0.2490 -0.7606 -0.2946 0.2157 1.0019 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_twolined 1.3494 0.2331 0.9142 1.3450 1.8238 1.0085 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_longtail -2.7872 0.9864 -4.3067 -2.8829 -0.7278 1.0416 344
## (Intercept)-streambiotic_suff_red -2.1236 0.3988 -2.9360 -2.1125 -1.3427 1.0015 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_mole -2.8320 2.1500 -6.1460 -3.2241 2.8850 1.0121 87
## (Intercept)-streambiotic_suff_fourtoed -7.0579 3.5622 -14.7157 -6.9632 0.7699 1.1068 80
## (Intercept)-streambiotic_suff_redback 0.2688 0.2868 -0.2481 0.2551 0.8896 1.0116 1059
## (Intercept)-streambiotic_suff_slimy -2.6199 0.6411 -3.8349 -2.6258 -1.3496 1.0093 1200
## (Intercept)-blacknose_dace -1.2054 0.4735 -2.0231 -1.2426 -0.1994 1.0119 1200
## (Intercept)-bluegill_sunfish -3.7258 2.3377 -7.3622 -4.1296 2.0549 1.1298 79
## (Intercept)-bluntnose_minnow -6.8915 3.7733 -14.1115 -6.9540 2.4590 1.2352 70
## (Intercept)-brindled_madtom -7.0534 3.2793 -13.9572 -6.9878 0.3016 1.0210 111
## (Intercept)-brook_stickleback -7.1122 3.2834 -13.7670 -7.0479 0.1516 1.1848 123
## (Intercept)-brook_trout -7.1785 3.3522 -14.0238 -7.1069 -0.3317 1.1173 106
## (Intercept)-central_mudminnow -7.4677 3.1885 -14.4570 -7.2760 -1.3172 1.0883 88
## (Intercept)-central_stoneroller_minnow 0.2610 2.6950 -3.6953 -0.0168 6.3101 1.0429 153
## (Intercept)-common_shiner -3.7405 2.3847 -7.5003 -4.0724 2.3740 1.0714 145
## (Intercept)-creek_chub 0.2249 0.4715 -0.5601 0.1843 1.2506 1.0145 1200
## (Intercept)-eastern_sand_darter -7.1371 3.3839 -14.2057 -6.8568 -0.4857 1.1854 113
## (Intercept)-fantail_darter -7.3309 3.4109 -13.6478 -7.3197 0.2814 1.0633 74
## (Intercept)-fathead_minnow -7.0752 3.7493 -14.4893 -7.0690 1.8171 1.0938 78
## (Intercept)-golden_shiner -7.0745 3.4416 -14.1829 -7.0144 0.0641 1.1160 145
## (Intercept)-goldfish -6.7943 3.3873 -13.6019 -6.7761 0.4492 1.1215 93
## (Intercept)-grass_pickerel -7.0637 3.4071 -14.2590 -6.9380 -0.0003 1.0807 82
## (Intercept)-greenside_darter -7.0977 3.4632 -14.1352 -6.9934 0.4010 1.1293 112
## (Intercept)-green_sunfish -0.8145 2.8525 -5.0552 -1.3766 6.3994 1.0220 107
## (Intercept)-johnny_darter -1.1372 2.5547 -4.2377 -1.8215 5.8808 1.1016 89
## (Intercept)-largemouth_bass -7.0980 3.2337 -13.4376 -6.8887 -0.2490 1.0630 110
## (Intercept)-longear_sunfish -7.4140 3.2980 -14.9066 -7.0032 -1.7382 1.1130 144
## (Intercept)-longnose_dace -6.8785 3.2587 -13.3308 -6.8346 -0.2809 1.0859 127
## (Intercept)-mottled_sculpin -7.2003 3.2037 -14.1498 -6.9098 -0.5250 1.1300 111
## (Intercept)-northern_hog_sucker -6.8674 3.3454 -14.1051 -6.5850 -0.0535 1.0572 178
## (Intercept)-pumpkinseed_sunfish -7.1124 3.4247 -14.5798 -6.8443 -0.5439 1.1252 141
## (Intercept)-rainbow_darter -2.8952 1.3061 -4.8557 -3.1010 0.1429 1.0408 150
## (Intercept)-rainbow_trout -6.9916 3.3899 -14.2202 -6.8555 0.2404 1.0369 104
## (Intercept)-redbelly_dace -2.4819 2.2035 -5.7180 -2.9002 3.0511 1.0440 182
## (Intercept)-redside_dace -3.3292 2.4776 -7.2167 -3.7049 2.7117 1.0906 83
## (Intercept)-river_chub -6.8888 3.4570 -13.7146 -7.0238 1.8403 1.2002 85
## (Intercept)-silverjaw_minnow -7.4363 3.4387 -15.0933 -7.0283 -1.3192 1.1063 254
## (Intercept)-smallmouth_bass -7.1866 3.0710 -13.7327 -7.0961 -1.0083 1.1085 193
## (Intercept)-spotfin_shiner -7.0542 3.2570 -14.2424 -6.8545 -0.4446 1.1031 178
## (Intercept)-stonecat_madtom -7.2054 3.1927 -13.8734 -7.1343 -0.8378 1.1105 117
## (Intercept)-striped_shiner -7.1079 3.3263 -13.8537 -7.1191 0.0730 1.0957 77
## (Intercept)-trout_perch -7.0610 3.1221 -14.3304 -6.7461 -1.2735 1.0290 122
## (Intercept)-warmouth_sunfish -6.8193 3.3254 -13.0212 -6.8420 0.2631 1.0828 67
## (Intercept)-white_sucker -1.6229 2.0338 -4.3526 -2.0695 3.8386 1.0967 144
## (Intercept)-yellow_bullhead_catfish -3.4573 2.7157 -7.4249 -4.0641 3.5879 1.0420 82
## (Intercept)-sessile_animals -1.6096 2.0533 -4.3211 -2.1043 3.5089 1.0108 167
## (Intercept)-aquatic_worms 3.1021 0.6406 2.1854 3.0119 4.5790 1.0284 1003
## (Intercept)-sow_bugs -0.8697 0.2401 -1.3433 -0.8673 -0.4078 1.0136 1115
## (Intercept)-scuds -0.2922 0.2437 -0.7547 -0.3094 0.2216 1.0026 1200
## (Intercept)-water_mites 0.8918 0.6268 -0.0568 0.7870 2.3533 1.0032 1456
## (Intercept)-damselfly_nymphs 1.2825 0.4296 0.5423 1.2496 2.1956 1.0138 1200
## (Intercept)-alderfly_larvae 0.9982 0.5220 0.2616 0.9258 2.1611 1.0072 1200
## (Intercept)-other_beetles 2.3960 0.5824 1.5310 2.3072 3.7063 1.0123 1200
## (Intercept)-crayfish 1.7067 0.3134 1.1683 1.6755 2.3998 0.9998 1200
## (Intercept)-dragonfly_nymphs 2.1909 0.5235 1.3590 2.1165 3.3958 1.0131 1090
## (Intercept)-riffle_beetles 0.8138 0.3060 0.2840 0.7827 1.5518 1.0094 983
## (Intercept)-other_flies 5.3742 1.3067 3.5999 5.1581 8.4109 1.0189 335
## (Intercept)-midges 7.0682 1.8530 4.4088 6.7589 11.5066 1.0097 532
## (Intercept)-snails 2.2443 0.5670 1.3429 2.1747 3.4480 1.0238 884
## (Intercept)-clams 1.0285 1.2947 -0.2492 0.6834 4.8916 1.0049 387
## (Intercept)-fishfly_larvae 0.2736 0.3555 -0.3510 0.2447 1.0270 1.0014 1200
## (Intercept)-water_penny_beetles -0.3778 0.3146 -0.9740 -0.3852 0.2687 1.0134 1200
## (Intercept)-cranefly_larvae 3.5094 0.6563 2.4088 3.4274 4.9850 1.0090 1200
## (Intercept)-ameletidae 2.2774 1.2939 0.8079 1.9868 5.7393 1.0365 269
## (Intercept)-arthropleidae -6.9640 3.5273 -13.8095 -7.1280 1.2260 1.0377 79
## (Intercept)-baetidae 2.4801 0.4639 1.7742 2.4257 3.4994 1.0016 1200
## (Intercept)-baetiscidae -7.3073 3.3593 -14.5140 -7.0662 -0.9920 1.0949 197
## (Intercept)-caenidae -1.9179 0.4897 -2.8016 -1.9432 -0.9140 1.0055 1083
## (Intercept)-ephemerellidae 0.3600 2.6123 -3.2720 -0.0905 6.7463 1.0277 125
## (Intercept)-ephemeridae -0.9252 3.0957 -4.4288 -1.6916 7.7726 1.1372 96
## (Intercept)-heptageniidae -0.4805 0.3024 -1.0301 -0.4907 0.1644 1.0041 1200
## (Intercept)-isonychiidae -6.8291 3.4875 -13.2607 -6.9023 1.7498 1.0942 91
## (Intercept)-leptohyphidae 0.7116 2.4152 -2.1556 0.0602 6.7710 1.0148 175
## (Intercept)-leptophlebiidae -0.4340 0.2062 -0.8396 -0.4433 -0.0128 1.0010 1200
## (Intercept)-polymitarcyidae -7.0008 3.4940 -14.2122 -6.9362 1.1252 1.0595 135
## (Intercept)-potamanthidae -6.7182 3.5802 -14.0777 -6.6941 1.2172 1.0667 105
## (Intercept)-pseudironidae -7.2023 3.4675 -14.7931 -6.9349 -0.3905 1.2009 121
## (Intercept)-siphlonuridae -7.3228 3.2561 -13.7737 -7.0589 -0.8043 1.0723 81
## (Intercept)-capniidae -7.1588 3.3482 -14.1327 -7.2355 -0.5028 1.0430 111
## (Intercept)-chloroperlidae -0.8242 0.7049 -1.8431 -0.9236 0.8767 1.0383 784
## (Intercept)-leuctridae 0.0479 0.1864 -0.2760 0.0407 0.4252 1.0040 1200
## (Intercept)-nemouridae 0.2620 0.4565 -0.4265 0.2004 1.2542 1.0170 1281
## (Intercept)-peltoperlidae -6.8993 3.6425 -14.4221 -6.7738 0.4331 1.0945 155
## (Intercept)-perlidae -0.5157 0.2394 -0.9731 -0.5195 -0.0517 1.0021 1489
## (Intercept)-perlodidae 2.6890 2.3437 -0.3275 2.1992 8.1902 1.1052 259
## (Intercept)-pteronarcyidae -7.4993 3.2902 -15.0314 -7.1267 -1.1286 1.0375 232
## (Intercept)-taeniopterygidae -7.4550 3.0921 -13.7788 -7.3171 -1.5923 1.0829 163
## (Intercept)-brachycentridae -7.1579 3.0476 -13.6339 -7.0785 -0.9852 1.1407 102
## (Intercept)-dipseuodopsidae -7.0052 3.2048 -13.8019 -6.8476 -0.6929 1.0892 75
## (Intercept)-glossosomatidae -4.5174 0.9038 -6.4746 -4.4723 -2.9239 1.0120 1067
## (Intercept)-goeridae -7.1288 3.1598 -14.4513 -6.8562 -0.8039 1.1530 130
## (Intercept)-helicopsychidae -7.0960 3.3249 -14.0048 -6.9356 0.0352 1.0802 64
## (Intercept)-hydropsychidae 1.6188 0.2750 1.1073 1.6129 2.2024 1.0114 1200
## (Intercept)-hydroptilidae -1.1451 0.6431 -2.1779 -1.2053 0.3192 0.9996 888
## (Intercept)-lepidostomatidae -1.5017 0.2951 -2.1085 -1.4880 -0.9440 1.0006 1200
## (Intercept)-leptoceridae -7.3243 3.5354 -15.4596 -7.0670 -1.1162 1.1471 114
## (Intercept)-limnephilidae -0.4135 0.2696 -0.9207 -0.4217 0.1196 1.0106 1094
## (Intercept)-molannidae -3.7488 0.9263 -5.5739 -3.7192 -1.8769 1.0167 878
## (Intercept)-odontoceridae -3.0429 1.0115 -4.8007 -3.1240 -0.8342 1.0059 739
## (Intercept)-philopotamidae 0.6268 0.3545 0.0010 0.6167 1.3451 1.0047 1319
## (Intercept)-phryganeidae -1.2262 1.4137 -2.9907 -1.5792 2.7230 1.1993 217
## (Intercept)-polycentropodidae 0.1839 0.3187 -0.3635 0.1608 0.8722 1.0005 1345
## (Intercept)-psychomiidae -7.0248 3.5038 -13.3155 -7.0853 1.5167 1.1337 76
## (Intercept)-rhyacophilidae -1.1545 0.3760 -1.8427 -1.1751 -0.3484 1.0020 1257
## (Intercept)-uenoidae 0.3959 0.5554 -0.4218 0.3158 1.7402 1.0068 936
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## scale(pool_depth_.cm.)-green_sunfish 0.2618 0.7810 -1.2521 0.2475 1.7928 1.0068 936
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## scale(pool_depth_.cm.)-longear_sunfish -0.0159 0.7591 -1.4462 -0.0303 1.4447 1.0018 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-longnose_dace 0.0036 0.7646 -1.4051 0.0036 1.5188 1.0004 1587
## scale(pool_depth_.cm.)-mottled_sculpin -0.0119 0.7899 -1.5727 -0.0110 1.4861 1.0066 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-northern_hog_sucker -0.0127 0.7867 -1.6250 0.0253 1.4802 1.0018 1008
## scale(pool_depth_.cm.)-pumpkinseed_sunfish -0.0756 0.7903 -1.6087 -0.0839 1.5422 1.0034 1081
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## scale(pool_depth_.cm.)-rainbow_trout -0.0684 0.7989 -1.7436 -0.0315 1.3929 1.0024 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-redbelly_dace 0.7809 0.7196 -0.7193 0.7756 2.2018 1.0162 686
## scale(pool_depth_.cm.)-redside_dace -0.2126 0.7060 -1.6647 -0.2060 1.1618 1.0062 1099
## scale(pool_depth_.cm.)-river_chub -0.0533 0.7839 -1.5771 -0.0474 1.3524 1.0155 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-silverjaw_minnow -0.0356 0.8094 -1.6096 -0.0248 1.5726 1.0039 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-smallmouth_bass 0.0119 0.7873 -1.5953 0.0186 1.5768 1.0031 1414
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## scale(pool_depth_.cm.)-white_sucker 0.6162 0.6370 -0.6688 0.5890 1.8982 1.0058 1059
## scale(pool_depth_.cm.)-yellow_bullhead_catfish 0.0253 0.7096 -1.4565 0.0496 1.3573 1.0042 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-sessile_animals -0.2776 0.6718 -1.6544 -0.2773 1.0764 1.0024 1010
## scale(pool_depth_.cm.)-aquatic_worms 0.3812 0.4817 -0.4233 0.3384 1.4015 1.0017 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-sow_bugs 0.7583 0.2480 0.2959 0.7456 1.2735 1.0006 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-scuds 0.1082 0.2236 -0.3420 0.0993 0.5576 1.0075 1327
## scale(pool_depth_.cm.)-water_mites 0.3881 0.3893 -0.3068 0.3471 1.2303 1.0022 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-damselfly_nymphs 1.8763 0.5027 1.0259 1.8276 2.9761 1.0142 1089
## scale(pool_depth_.cm.)-alderfly_larvae 0.0138 0.3669 -0.6618 -0.0023 0.8137 1.0031 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-other_beetles -0.4390 0.4387 -1.2307 -0.4436 0.4510 1.0049 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-crayfish -0.7319 0.2800 -1.3096 -0.7266 -0.2157 1.0027 1260
## scale(pool_depth_.cm.)-dragonfly_nymphs 0.5327 0.4620 -0.2877 0.4973 1.5345 1.0090 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-riffle_beetles 0.6434 0.3300 0.1102 0.6021 1.3725 1.0012 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-other_flies 0.6445 0.6702 -0.5878 0.6266 2.0818 1.0067 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-midges 0.0055 0.7013 -1.3490 -0.0034 1.4121 1.0017 1155
## scale(pool_depth_.cm.)-snails 1.3655 0.5142 0.5131 1.3260 2.5663 1.0111 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-clams 0.2600 0.5150 -0.7002 0.2306 1.4267 1.0055 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-fishfly_larvae -0.8439 0.2902 -1.4699 -0.8277 -0.3167 1.0035 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-water_penny_beetles -0.4621 0.2786 -1.0124 -0.4561 0.0523 1.0020 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-cranefly_larvae 0.5872 0.5421 -0.3626 0.5409 1.7337 0.9994 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-ameletidae 1.0107 0.6725 -0.3677 0.9859 2.3581 1.0013 862
## scale(pool_depth_.cm.)-arthropleidae -0.0337 0.7990 -1.6697 -0.0473 1.4618 1.0025 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-baetidae 0.3418 0.4131 -0.3347 0.2815 1.3211 1.0016 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-baetiscidae -0.0522 0.7918 -1.5842 -0.0761 1.5067 0.9999 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-caenidae 0.5639 0.3012 -0.0242 0.5677 1.1699 1.0028 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-ephemerellidae 0.0922 0.7083 -1.2929 0.0837 1.5920 1.0257 896
## scale(pool_depth_.cm.)-ephemeridae 0.3737 0.7191 -1.0703 0.3908 1.7517 1.0599 437
## scale(pool_depth_.cm.)-heptageniidae 0.1435 0.2627 -0.3434 0.1349 0.7013 1.0072 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-isonychiidae -0.0171 0.7990 -1.4913 -0.0128 1.5263 1.0148 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-leptohyphidae 0.2254 0.6375 -1.0456 0.2255 1.5010 1.0010 961
## scale(pool_depth_.cm.)-leptophlebiidae -0.6252 0.2246 -1.0706 -0.6316 -0.1991 1.0000 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-polymitarcyidae -0.0425 0.7530 -1.6391 -0.0277 1.3684 0.9996 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-potamanthidae -0.0035 0.7371 -1.4756 0.0067 1.3912 1.0077 1019
## scale(pool_depth_.cm.)-pseudironidae -0.0533 0.7666 -1.5151 -0.0846 1.4163 1.0036 1588
## scale(pool_depth_.cm.)-siphlonuridae -0.0267 0.7894 -1.6992 -0.0062 1.5015 1.0188 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-capniidae -0.0111 0.8059 -1.6136 -0.0286 1.6281 1.0008 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-chloroperlidae 0.0537 0.3691 -0.6651 0.0521 0.7682 1.0088 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-leuctridae -0.4966 0.1975 -0.8866 -0.4872 -0.1428 1.0049 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-nemouridae -0.3199 0.2910 -0.8798 -0.3130 0.2642 1.0083 1413
## scale(pool_depth_.cm.)-peltoperlidae -0.0431 0.7812 -1.5270 -0.0546 1.4684 1.0019 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-perlidae -0.1929 0.2341 -0.6473 -0.1832 0.2510 1.0052 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-perlodidae -0.0858 0.7054 -1.4198 -0.1060 1.3162 1.0073 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-pteronarcyidae 0.0240 0.8037 -1.6344 0.0330 1.5746 1.0000 1141
## scale(pool_depth_.cm.)-taeniopterygidae -0.0250 0.7846 -1.5473 -0.0326 1.5411 1.0029 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-brachycentridae -0.0164 0.7713 -1.4592 -0.0315 1.5209 1.0018 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-dipseuodopsidae -0.0214 0.7743 -1.5572 -0.0097 1.4623 1.0083 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-glossosomatidae -0.6362 0.6297 -1.8978 -0.6173 0.5193 1.0033 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-goeridae -0.0209 0.7837 -1.5303 -0.0215 1.5492 1.0031 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-helicopsychidae -0.0834 0.7991 -1.6098 -0.0707 1.4864 0.9991 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-hydropsychidae -0.1457 0.2545 -0.6179 -0.1557 0.3428 1.0010 1330
## scale(pool_depth_.cm.)-hydroptilidae 0.5170 0.4096 -0.2662 0.4934 1.3736 0.9999 1048
## scale(pool_depth_.cm.)-lepidostomatidae -1.2124 0.3276 -1.8826 -1.2014 -0.6162 1.0022 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-leptoceridae -0.0574 0.7597 -1.5809 -0.0336 1.4168 1.0045 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-limnephilidae -0.3823 0.2455 -0.8713 -0.3832 0.1195 1.0007 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-molannidae -0.8066 0.5620 -1.9310 -0.7845 0.2203 1.0068 1200
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## scale(pool_depth_.cm.)-philopotamidae -0.2216 0.2847 -0.7565 -0.2316 0.3767 1.0077 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-phryganeidae 0.5172 0.5112 -0.5364 0.5075 1.5256 1.0056 1206
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## scale(per_cobble)-central_stoneroller_minnow 0.1895 0.3071 -0.4393 0.1957 0.8073 1.0191 1200
## scale(per_cobble)-common_shiner 0.2403 0.3052 -0.3550 0.2474 0.8368 1.0040 1200
## scale(per_cobble)-creek_chub 0.1453 0.2286 -0.3235 0.1420 0.5688 1.0007 1200
## scale(per_cobble)-eastern_sand_darter 0.2360 0.3060 -0.3821 0.2480 0.8214 1.0081 1118
## scale(per_cobble)-fantail_darter 0.2482 0.2963 -0.3202 0.2511 0.8432 1.0029 1200
## scale(per_cobble)-fathead_minnow 0.2468 0.2954 -0.3387 0.2486 0.8532 1.0105 1200
## scale(per_cobble)-golden_shiner 0.2425 0.3010 -0.3579 0.2424 0.8288 0.9993 1200
## scale(per_cobble)-goldfish 0.2400 0.3036 -0.3910 0.2461 0.8446 1.0025 1200
## scale(per_cobble)-grass_pickerel 0.2462 0.2981 -0.3397 0.2458 0.8531 1.0041 1461
## scale(per_cobble)-greenside_darter 0.2454 0.2955 -0.3229 0.2449 0.8210 1.0109 1200
## scale(per_cobble)-green_sunfish 0.2223 0.2927 -0.3589 0.2216 0.8064 1.0013 1200
## scale(per_cobble)-johnny_darter 0.2600 0.2796 -0.3064 0.2643 0.8059 0.9999 1380
## scale(per_cobble)-largemouth_bass 0.2518 0.3057 -0.3530 0.2563 0.8448 1.0021 1050
## scale(per_cobble)-longear_sunfish 0.2464 0.2930 -0.3206 0.2473 0.8288 1.0069 1200
## scale(per_cobble)-longnose_dace 0.2380 0.2978 -0.3553 0.2252 0.8367 1.0038 1409
## scale(per_cobble)-mottled_sculpin 0.2407 0.2979 -0.3862 0.2444 0.8245 1.0123 1200
## scale(per_cobble)-northern_hog_sucker 0.2519 0.2940 -0.3489 0.2554 0.8149 1.0113 1200
## scale(per_cobble)-pumpkinseed_sunfish 0.2425 0.3074 -0.3742 0.2473 0.8135 0.9997 773
## scale(per_cobble)-rainbow_darter 0.3798 0.2697 -0.1299 0.3749 0.9059 1.0026 1200
## scale(per_cobble)-rainbow_trout 0.2469 0.3012 -0.3654 0.2474 0.8462 1.0013 1200
## scale(per_cobble)-redbelly_dace 0.2422 0.2784 -0.2978 0.2404 0.8065 1.0100 1037
## scale(per_cobble)-redside_dace 0.3638 0.3082 -0.1716 0.3554 0.9912 1.0013 839
## scale(per_cobble)-river_chub 0.2558 0.2950 -0.3058 0.2578 0.8440 1.0052 1200
## scale(per_cobble)-silverjaw_minnow 0.2367 0.3040 -0.3931 0.2421 0.8100 1.0033 1200
## scale(per_cobble)-smallmouth_bass 0.2488 0.3062 -0.3325 0.2466 0.8879 1.0120 1200
## scale(per_cobble)-spotfin_shiner 0.2491 0.2947 -0.3586 0.2578 0.8247 0.9998 1200
## scale(per_cobble)-stonecat_madtom 0.2500 0.2930 -0.3655 0.2457 0.8602 1.0028 1469
## scale(per_cobble)-striped_shiner 0.2480 0.2993 -0.3642 0.2443 0.8392 1.0093 1200
## scale(per_cobble)-trout_perch 0.2548 0.2905 -0.3178 0.2554 0.8109 1.0013 1591
## scale(per_cobble)-warmouth_sunfish 0.2443 0.2990 -0.3714 0.2579 0.8188 1.0232 1200
## scale(per_cobble)-white_sucker 0.3275 0.2696 -0.1769 0.3265 0.8786 1.0138 978
## scale(per_cobble)-yellow_bullhead_catfish 0.2454 0.2900 -0.3329 0.2454 0.8132 1.0115 1200
## scale(per_cobble)-sessile_animals 0.1688 0.2827 -0.4041 0.1605 0.7450 1.0101 1018
## scale(per_cobble)-aquatic_worms 0.2881 0.2606 -0.2093 0.2851 0.8444 1.0063 1200
## scale(per_cobble)-sow_bugs 0.2594 0.1902 -0.1028 0.2552 0.6481 1.0025 1200
## scale(per_cobble)-scuds 0.1169 0.1977 -0.2762 0.1167 0.4976 1.0020 1104
## scale(per_cobble)-water_mites 0.4795 0.2792 -0.0461 0.4722 1.0804 1.0004 1002
## scale(per_cobble)-damselfly_nymphs 0.3048 0.2302 -0.1535 0.3049 0.8031 1.0083 1322
## scale(per_cobble)-alderfly_larvae -0.1114 0.2526 -0.6186 -0.1017 0.3788 1.0106 1200
## scale(per_cobble)-other_beetles 0.1131 0.2426 -0.3766 0.1162 0.5751 1.0189 1200
## scale(per_cobble)-crayfish 0.4140 0.2280 -0.0100 0.4055 0.8887 1.0007 1200
## scale(per_cobble)-dragonfly_nymphs 0.1238 0.2552 -0.4338 0.1369 0.6048 1.0148 1200
## scale(per_cobble)-riffle_beetles 0.4058 0.2028 0.0218 0.3999 0.8379 1.0019 1061
## scale(per_cobble)-other_flies 0.2100 0.3031 -0.3640 0.2071 0.8107 0.9994 1200
## scale(per_cobble)-midges 0.2327 0.2894 -0.3331 0.2473 0.8020 1.0032 1791
## scale(per_cobble)-snails 0.0348 0.2600 -0.5080 0.0320 0.5303 1.0088 1030
## scale(per_cobble)-clams 0.0062 0.2689 -0.5431 0.0083 0.5179 1.0001 1064
## scale(per_cobble)-fishfly_larvae 0.3352 0.2207 -0.0943 0.3286 0.7635 1.0076 1200
## scale(per_cobble)-water_penny_beetles 0.4437 0.2230 0.0203 0.4407 0.8794 1.0006 1200
## scale(per_cobble)-cranefly_larvae 0.2391 0.2652 -0.2770 0.2361 0.7559 1.0038 1105
## scale(per_cobble)-ameletidae 0.2205 0.2739 -0.3339 0.2158 0.7868 1.0022 1529
## scale(per_cobble)-arthropleidae 0.2308 0.2950 -0.3884 0.2448 0.7853 1.0006 1200
## scale(per_cobble)-baetidae 0.3143 0.2531 -0.1722 0.3055 0.8202 1.0177 1200
## scale(per_cobble)-baetiscidae 0.2425 0.3109 -0.3665 0.2424 0.8998 1.0008 1200
## scale(per_cobble)-caenidae -0.2005 0.2628 -0.7624 -0.1883 0.2830 1.0001 1200
## scale(per_cobble)-ephemerellidae 0.2703 0.2817 -0.2961 0.2591 0.8270 0.9995 1200
## scale(per_cobble)-ephemeridae 0.2030 0.2931 -0.3968 0.2093 0.7869 1.0026 1200
## scale(per_cobble)-heptageniidae 0.2604 0.2014 -0.1290 0.2561 0.6796 1.0020 1200
## scale(per_cobble)-isonychiidae 0.2325 0.2964 -0.3742 0.2330 0.8224 1.0094 993
## scale(per_cobble)-leptohyphidae 0.0869 0.3095 -0.5382 0.0941 0.6954 1.0046 756
## scale(per_cobble)-leptophlebiidae 0.3437 0.1823 -0.0024 0.3431 0.6971 1.0006 1395
## scale(per_cobble)-polymitarcyidae 0.2328 0.3110 -0.4154 0.2351 0.8321 1.0092 1200
## scale(per_cobble)-potamanthidae 0.2441 0.3117 -0.3533 0.2341 0.9064 1.0055 1200
## scale(per_cobble)-pseudironidae 0.2359 0.3030 -0.3832 0.2373 0.8542 1.0015 1200
## scale(per_cobble)-siphlonuridae 0.2486 0.2946 -0.3144 0.2443 0.8350 1.0043 1200
## scale(per_cobble)-capniidae 0.2631 0.3085 -0.3054 0.2598 0.8957 1.0018 1200
## scale(per_cobble)-chloroperlidae 0.2849 0.2421 -0.1855 0.2837 0.7577 1.0061 1200
## scale(per_cobble)-leuctridae 0.4108 0.1820 0.0555 0.4154 0.7750 1.0002 1412
## scale(per_cobble)-nemouridae 0.3604 0.2203 -0.0659 0.3556 0.7974 1.0038 1084
## scale(per_cobble)-peltoperlidae 0.2430 0.3065 -0.3608 0.2416 0.8624 1.0013 1071
## scale(per_cobble)-perlidae 0.1059 0.1936 -0.2975 0.1117 0.4706 1.0033 1200
## scale(per_cobble)-perlodidae 0.2115 0.2921 -0.3658 0.2140 0.7979 1.0023 1200
## scale(per_cobble)-pteronarcyidae 0.2373 0.3086 -0.3763 0.2355 0.8325 1.0111 1101
## scale(per_cobble)-taeniopterygidae 0.2499 0.3048 -0.3598 0.2485 0.8408 1.0001 1200
## scale(per_cobble)-brachycentridae 0.2349 0.3175 -0.4371 0.2423 0.8978 1.0044 1200
## scale(per_cobble)-dipseuodopsidae 0.2385 0.3003 -0.3689 0.2396 0.8174 1.0038 1200
## scale(per_cobble)-glossosomatidae 0.3019 0.2783 -0.2534 0.3036 0.8513 1.0073 1200
## scale(per_cobble)-goeridae 0.2441 0.2986 -0.3808 0.2449 0.8378 1.0027 1200
## scale(per_cobble)-helicopsychidae 0.2395 0.2994 -0.3195 0.2334 0.8281 1.0026 1200
## scale(per_cobble)-hydropsychidae 0.2663 0.2092 -0.1489 0.2647 0.7038 1.0160 1200
## scale(per_cobble)-hydroptilidae 0.1683 0.2472 -0.3026 0.1712 0.6821 1.0018 1200
## scale(per_cobble)-lepidostomatidae 0.2161 0.2179 -0.2214 0.2211 0.6128 1.0032 1200
## scale(per_cobble)-leptoceridae 0.2442 0.3103 -0.4041 0.2524 0.8543 1.0004 1361
## scale(per_cobble)-limnephilidae 0.1752 0.2042 -0.2285 0.1797 0.5711 1.0031 1200
## scale(per_cobble)-molannidae 0.2071 0.2717 -0.3520 0.2126 0.7207 1.0094 1200
## scale(per_cobble)-odontoceridae 0.3321 0.2615 -0.1961 0.3236 0.8322 1.0074 1200
## scale(per_cobble)-philopotamidae 0.5303 0.2437 0.0946 0.5190 1.0736 1.0054 1101
## scale(per_cobble)-phryganeidae 0.0028 0.2927 -0.6084 0.0115 0.5469 1.0063 1014
## scale(per_cobble)-polycentropodidae 0.5448 0.2266 0.1332 0.5323 1.0323 1.0007 1200
## scale(per_cobble)-psychomiidae 0.2523 0.3092 -0.3375 0.2530 0.8308 1.0021 1200
## scale(per_cobble)-rhyacophilidae 0.4106 0.2243 -0.0025 0.3990 0.8768 1.0048 1200
## scale(per_cobble)-uenoidae 0.1198 0.2342 -0.3296 0.1184 0.5806 1.0048 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_mtdusky 0.4494 0.2298 0.0129 0.4366 0.9117 1.0054 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_nodusky 0.7050 0.2481 0.2531 0.6820 1.2354 1.0052 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_twolined 0.5463 0.2191 0.1407 0.5481 1.0151 1.0098 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_longtail 0.2580 0.2873 -0.3320 0.2695 0.8010 1.0002 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_red 0.3947 0.2507 -0.1000 0.3906 0.8853 1.0010 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_mole 0.1457 0.3033 -0.4961 0.1589 0.7081 1.0112 1048
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_fourtoed 0.3598 0.3014 -0.2210 0.3640 0.9677 1.0054 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_redback 0.3076 0.2276 -0.1660 0.3072 0.7396 1.0025 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_slimy 0.4793 0.2643 -0.0198 0.4706 1.0111 1.0099 1200
## scale(substrate_metric_total)-blacknose_dace 0.6599 0.2818 0.1637 0.6520 1.2390 0.9997 1200
## scale(substrate_metric_total)-bluegill_sunfish 0.2775 0.3167 -0.3750 0.2837 0.8861 1.0030 1200
## scale(substrate_metric_total)-bluntnose_minnow 0.3383 0.3252 -0.3220 0.3414 0.9337 1.0073 1313
## scale(substrate_metric_total)-brindled_madtom 0.3486 0.3042 -0.2685 0.3526 0.9240 0.9996 1200
## scale(substrate_metric_total)-brook_stickleback 0.3468 0.3036 -0.2790 0.3580 0.9229 1.0025 1308
## scale(substrate_metric_total)-brook_trout 0.3328 0.3312 -0.3664 0.3253 0.9706 1.0059 1200
## scale(substrate_metric_total)-central_mudminnow 0.3583 0.3005 -0.2448 0.3482 0.9613 1.0090 1574
## scale(substrate_metric_total)-central_stoneroller_minnow 0.2931 0.3054 -0.3622 0.2900 0.8962 1.0079 1200
## scale(substrate_metric_total)-common_shiner 0.2943 0.3081 -0.3222 0.3020 0.9081 1.0252 1099
## scale(substrate_metric_total)-creek_chub 0.2988 0.2511 -0.2136 0.2979 0.7763 1.0032 1238
## scale(substrate_metric_total)-eastern_sand_darter 0.3626 0.3144 -0.2527 0.3621 0.9963 1.0025 1338
## scale(substrate_metric_total)-fantail_darter 0.3380 0.3071 -0.2775 0.3444 0.9264 0.9999 1200
## scale(substrate_metric_total)-fathead_minnow 0.3465 0.3096 -0.2413 0.3411 0.9901 1.0023 1200
## scale(substrate_metric_total)-golden_shiner 0.3458 0.3090 -0.2963 0.3615 0.9416 1.0084 1200
## scale(substrate_metric_total)-goldfish 0.3549 0.3181 -0.2877 0.3520 1.0113 1.0075 1200
## scale(substrate_metric_total)-grass_pickerel 0.3371 0.3129 -0.2932 0.3398 0.9891 1.0026 925
## scale(substrate_metric_total)-greenside_darter 0.3474 0.3028 -0.2561 0.3508 0.9455 1.0022 1200
## scale(substrate_metric_total)-green_sunfish 0.3731 0.3038 -0.1908 0.3660 0.9881 1.0037 1022
## scale(substrate_metric_total)-johnny_darter 0.2636 0.3070 -0.3434 0.2783 0.8555 1.0124 1200
## scale(substrate_metric_total)-largemouth_bass 0.3420 0.3070 -0.2399 0.3403 0.9182 1.0100 1200
## scale(substrate_metric_total)-longear_sunfish 0.3365 0.2996 -0.2711 0.3380 0.9449 1.0059 1200
## scale(substrate_metric_total)-longnose_dace 0.3462 0.3108 -0.2665 0.3468 0.9402 1.0076 1200
## scale(substrate_metric_total)-mottled_sculpin 0.3317 0.3108 -0.2992 0.3360 0.9292 1.0067 1365
## scale(substrate_metric_total)-northern_hog_sucker 0.3431 0.3090 -0.2739 0.3486 0.9401 1.0004 1200
## scale(substrate_metric_total)-pumpkinseed_sunfish 0.3391 0.3237 -0.3518 0.3502 0.9872 1.0067 1029
## scale(substrate_metric_total)-rainbow_darter 0.2930 0.2922 -0.2959 0.2976 0.8556 1.0171 1200
## scale(substrate_metric_total)-rainbow_trout 0.3578 0.3109 -0.2389 0.3456 0.9912 1.0009 1200
## scale(substrate_metric_total)-redbelly_dace 0.2798 0.3058 -0.3365 0.2772 0.8454 1.0013 1200
## scale(substrate_metric_total)-redside_dace 0.4056 0.2974 -0.1704 0.4026 1.0304 1.0008 1200
## scale(substrate_metric_total)-river_chub 0.3518 0.3069 -0.2568 0.3502 0.9510 1.0025 1104
## scale(substrate_metric_total)-silverjaw_minnow 0.3521 0.3159 -0.2681 0.3540 0.9932 1.0064 1200
## scale(substrate_metric_total)-smallmouth_bass 0.3473 0.3097 -0.2290 0.3456 0.9813 1.0055 1200
## scale(substrate_metric_total)-spotfin_shiner 0.3404 0.3183 -0.2865 0.3326 0.9620 0.9994 1098
## scale(substrate_metric_total)-stonecat_madtom 0.3511 0.3091 -0.2679 0.3462 0.9425 1.0009 1200
## scale(substrate_metric_total)-striped_shiner 0.3474 0.3107 -0.3041 0.3572 0.9811 1.0004 1303
## scale(substrate_metric_total)-trout_perch 0.3573 0.3160 -0.2967 0.3577 0.9755 1.0108 1200
## scale(substrate_metric_total)-warmouth_sunfish 0.3410 0.3202 -0.2953 0.3409 1.0134 1.0035 1499
## scale(substrate_metric_total)-white_sucker 0.2575 0.2941 -0.3218 0.2560 0.8383 1.0053 1200
## scale(substrate_metric_total)-yellow_bullhead_catfish 0.3175 0.3083 -0.3105 0.3257 0.8952 1.0159 1200
## scale(substrate_metric_total)-sessile_animals 0.5067 0.2892 -0.0368 0.4871 1.1131 1.0067 1200
## scale(substrate_metric_total)-aquatic_worms 0.3661 0.2749 -0.1712 0.3605 0.9462 1.0060 1200
## scale(substrate_metric_total)-sow_bugs 0.1399 0.2163 -0.3099 0.1419 0.5652 1.0003 1285
## scale(substrate_metric_total)-scuds 0.3148 0.2053 -0.0799 0.3122 0.7045 1.0048 1200
## scale(substrate_metric_total)-water_mites 0.6143 0.2694 0.1125 0.6117 1.1693 0.9995 1200
## scale(substrate_metric_total)-damselfly_nymphs 0.2162 0.2285 -0.2665 0.2177 0.6526 0.9995 1200
## scale(substrate_metric_total)-alderfly_larvae 0.3402 0.2499 -0.1661 0.3477 0.8347 1.0076 1200
## scale(substrate_metric_total)-other_beetles 0.0118 0.2631 -0.4874 0.0232 0.5160 1.0009 1200
## scale(substrate_metric_total)-crayfish 0.2709 0.2238 -0.1774 0.2741 0.7190 1.0193 1294
## scale(substrate_metric_total)-dragonfly_nymphs 0.2976 0.2421 -0.1906 0.2949 0.7450 1.0178 1200
## scale(substrate_metric_total)-riffle_beetles 0.2316 0.2018 -0.1656 0.2321 0.6095 1.0012 1200
## scale(substrate_metric_total)-other_flies 0.3677 0.2774 -0.1946 0.3702 0.9137 1.0008 1200
## scale(substrate_metric_total)-midges 0.3239 0.3049 -0.2888 0.3138 0.9076 1.0111 1200
## scale(substrate_metric_total)-snails 0.3499 0.2224 -0.0746 0.3418 0.7905 1.0116 1200
## scale(substrate_metric_total)-clams 0.1908 0.2533 -0.2899 0.1817 0.7169 1.0023 1185
## scale(substrate_metric_total)-fishfly_larvae 0.3544 0.2425 -0.1222 0.3491 0.8300 1.0039 1100
## scale(substrate_metric_total)-water_penny_beetles 0.7010 0.2681 0.2251 0.6847 1.2850 1.0013 1200
## scale(substrate_metric_total)-cranefly_larvae 0.4434 0.2588 -0.0515 0.4305 0.9842 1.0391 1200
## scale(substrate_metric_total)-ameletidae 0.3212 0.2689 -0.1942 0.3275 0.8144 1.0283 1200
## scale(substrate_metric_total)-arthropleidae 0.3456 0.3141 -0.2928 0.3373 0.9580 1.0002 1729
## scale(substrate_metric_total)-baetidae 0.4640 0.2296 0.0307 0.4556 0.9279 1.0055 1200
## scale(substrate_metric_total)-baetiscidae 0.3492 0.3157 -0.2575 0.3397 1.0392 1.0002 1091
## scale(substrate_metric_total)-caenidae 0.1573 0.2578 -0.3706 0.1647 0.6429 1.0124 1200
## scale(substrate_metric_total)-ephemerellidae 0.3075 0.2949 -0.3076 0.3232 0.8742 1.0014 1200
## scale(substrate_metric_total)-ephemeridae 0.3523 0.3050 -0.2534 0.3644 0.9293 0.9996 1200
## scale(substrate_metric_total)-heptageniidae 0.1549 0.2428 -0.3373 0.1609 0.6120 0.9989 1200
## scale(substrate_metric_total)-isonychiidae 0.3492 0.3141 -0.3120 0.3408 1.0081 1.0018 1200
## scale(substrate_metric_total)-leptohyphidae 0.2992 0.2923 -0.3186 0.2941 0.8511 1.0109 1027
## scale(substrate_metric_total)-leptophlebiidae 0.1838 0.2012 -0.2059 0.1804 0.6021 1.0042 976
## scale(substrate_metric_total)-polymitarcyidae 0.3534 0.3118 -0.2871 0.3554 0.9771 1.0024 1200
## scale(substrate_metric_total)-potamanthidae 0.3489 0.3139 -0.2827 0.3440 0.9704 1.0161 1200
## scale(substrate_metric_total)-pseudironidae 0.3584 0.3151 -0.2649 0.3446 0.9925 1.0003 1200
## scale(substrate_metric_total)-siphlonuridae 0.3419 0.3129 -0.2980 0.3517 1.0101 1.0014 1200
## scale(substrate_metric_total)-capniidae 0.3492 0.3120 -0.2571 0.3528 0.9736 1.0093 1200
## scale(substrate_metric_total)-chloroperlidae 0.3372 0.2502 -0.1388 0.3283 0.8305 1.0103 1200
## scale(substrate_metric_total)-leuctridae 0.3978 0.2036 -0.0091 0.3974 0.7847 0.9993 1200
## scale(substrate_metric_total)-nemouridae 0.3457 0.2416 -0.1345 0.3516 0.8026 1.0005 1200
## scale(substrate_metric_total)-peltoperlidae 0.3530 0.3127 -0.2623 0.3557 0.9904 1.0051 1200
## scale(substrate_metric_total)-perlidae 0.0733 0.2266 -0.3832 0.0757 0.4898 1.0020 1200
## scale(substrate_metric_total)-perlodidae 0.3253 0.3029 -0.3155 0.3227 0.8988 1.0110 1200
## scale(substrate_metric_total)-pteronarcyidae 0.3402 0.3224 -0.3022 0.3417 0.9944 1.0239 1200
## scale(substrate_metric_total)-taeniopterygidae 0.3540 0.3098 -0.2746 0.3565 0.9461 1.0005 1200
## scale(substrate_metric_total)-brachycentridae 0.3407 0.3140 -0.2546 0.3385 0.9818 1.0225 1200
## scale(substrate_metric_total)-dipseuodopsidae 0.3433 0.2993 -0.2446 0.3428 0.9390 1.0013 1030
## scale(substrate_metric_total)-glossosomatidae 0.3316 0.2914 -0.2992 0.3308 0.8878 0.9994 1200
## scale(substrate_metric_total)-goeridae 0.3430 0.3114 -0.2942 0.3507 0.9579 1.0101 1200
## scale(substrate_metric_total)-helicopsychidae 0.3524 0.3015 -0.2559 0.3523 0.9320 1.0034 1200
## scale(substrate_metric_total)-hydropsychidae 0.6472 0.2276 0.2268 0.6325 1.0976 1.0037 1200
## scale(substrate_metric_total)-hydroptilidae 0.5885 0.2677 0.1244 0.5717 1.1474 1.0207 1200
## scale(substrate_metric_total)-lepidostomatidae 0.2080 0.2292 -0.2474 0.2139 0.6379 1.0155 1200
## scale(substrate_metric_total)-leptoceridae 0.3487 0.3174 -0.2802 0.3562 0.9661 1.0020 1200
## scale(substrate_metric_total)-limnephilidae 0.3009 0.2272 -0.1327 0.2982 0.7497 0.9990 1200
## scale(substrate_metric_total)-molannidae 0.3407 0.2888 -0.2423 0.3365 0.9301 1.0044 1200
## scale(substrate_metric_total)-odontoceridae 0.3163 0.2862 -0.2372 0.3139 0.8986 1.0010 1200
## scale(substrate_metric_total)-philopotamidae 0.6389 0.2566 0.1821 0.6255 1.1879 1.0041 1200
## scale(substrate_metric_total)-phryganeidae 0.2474 0.2968 -0.3541 0.2660 0.8129 1.0058 1200
## scale(substrate_metric_total)-polycentropodidae 0.3778 0.2287 -0.0352 0.3700 0.8524 1.0093 1200
## scale(substrate_metric_total)-psychomiidae 0.3410 0.3106 -0.2603 0.3365 0.9603 1.0017 1039
## scale(substrate_metric_total)-rhyacophilidae 0.5598 0.2534 0.0905 0.5553 1.0876 1.0124 1200
## scale(substrate_metric_total)-uenoidae 0.4026 0.2517 -0.1034 0.3973 0.8989 1.0273 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_mtdusky 0.2485 0.2124 -0.1457 0.2433 0.6714 1.0003 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_nodusky -0.0817 0.1909 -0.4610 -0.0796 0.2856 1.0081 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_twolined 0.2682 0.1895 -0.0799 0.2649 0.6671 1.0008 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_longtail -0.0455 0.2843 -0.6355 -0.0330 0.4811 1.0038 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_red -0.5066 0.2511 -1.0515 -0.4938 -0.0594 1.0025 1087
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_mole -0.1470 0.3096 -0.8091 -0.1418 0.4219 1.0042 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_fourtoed -0.0012 0.3249 -0.6194 0.0012 0.6388 1.0085 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_redback -0.4147 0.2438 -0.9194 -0.4076 0.0691 0.9989 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_slimy -0.1293 0.2493 -0.5990 -0.1279 0.3531 1.0041 1200
## scale(pool_metric_total)-blacknose_dace 0.1040 0.2629 -0.3735 0.0921 0.6760 1.0052 1200
## scale(pool_metric_total)-bluegill_sunfish 0.0055 0.3075 -0.5871 0.0061 0.6292 1.0008 1200
## scale(pool_metric_total)-bluntnose_minnow -0.0037 0.3188 -0.6373 0.0044 0.6693 1.0038 1200
## scale(pool_metric_total)-brindled_madtom -0.0112 0.3210 -0.6640 0.0010 0.6055 1.0209 1392
## scale(pool_metric_total)-brook_stickleback -0.0149 0.3212 -0.6242 -0.0220 0.6157 1.0001 1037
## scale(pool_metric_total)-brook_trout -0.0275 0.3038 -0.6481 -0.0120 0.5531 1.0312 1200
## scale(pool_metric_total)-central_mudminnow -0.0152 0.3156 -0.6537 -0.0054 0.6013 1.0037 1327
## scale(pool_metric_total)-central_stoneroller_minnow 0.0108 0.3207 -0.6469 0.0144 0.6674 1.0056 1200
## scale(pool_metric_total)-common_shiner -0.0248 0.3278 -0.6875 -0.0133 0.6073 1.0058 1026
## scale(pool_metric_total)-creek_chub 0.1583 0.2584 -0.3372 0.1458 0.7010 1.0112 1247
## scale(pool_metric_total)-eastern_sand_darter 0.0003 0.3239 -0.6604 0.0105 0.6516 1.0004 1200
## scale(pool_metric_total)-fantail_darter -0.0111 0.3136 -0.6041 -0.0012 0.6081 1.0136 1081
## scale(pool_metric_total)-fathead_minnow -0.0128 0.3150 -0.6457 -0.0125 0.6364 1.0073 1200
## scale(pool_metric_total)-golden_shiner -0.0265 0.3078 -0.6155 -0.0353 0.5800 1.0002 1200
## scale(pool_metric_total)-goldfish -0.0048 0.3187 -0.6140 -0.0216 0.6492 1.0065 1200
## scale(pool_metric_total)-grass_pickerel -0.0071 0.3116 -0.6190 -0.0105 0.6440 1.0040 1200
## scale(pool_metric_total)-greenside_darter -0.0071 0.3307 -0.6773 -0.0082 0.6423 1.0029 1200
## scale(pool_metric_total)-green_sunfish 0.0302 0.3144 -0.5781 0.0347 0.6676 1.0004 1304
## scale(pool_metric_total)-johnny_darter -0.0904 0.3054 -0.7062 -0.0904 0.4804 1.0069 1200
## scale(pool_metric_total)-largemouth_bass -0.0098 0.3238 -0.6992 -0.0144 0.6026 1.0033 1200
## scale(pool_metric_total)-longear_sunfish -0.0178 0.3141 -0.6484 -0.0170 0.5922 1.0083 1200
## scale(pool_metric_total)-longnose_dace -0.0244 0.3187 -0.6554 -0.0278 0.6189 1.0054 1200
## scale(pool_metric_total)-mottled_sculpin -0.0224 0.3047 -0.5996 -0.0317 0.6125 1.0024 1200
## scale(pool_metric_total)-northern_hog_sucker -0.0141 0.3298 -0.6320 -0.0196 0.6661 1.0095 1066
## scale(pool_metric_total)-pumpkinseed_sunfish -0.0176 0.3163 -0.6883 -0.0066 0.6099 1.0026 1164
## scale(pool_metric_total)-rainbow_darter -0.1066 0.2958 -0.7434 -0.0955 0.4603 1.0006 1200
## scale(pool_metric_total)-rainbow_trout -0.0049 0.3216 -0.6252 -0.0005 0.6331 1.0080 1200
## scale(pool_metric_total)-redbelly_dace -0.0339 0.3199 -0.7037 -0.0272 0.5710 1.0008 1200
## scale(pool_metric_total)-redside_dace 0.0124 0.3109 -0.5890 0.0128 0.6411 1.0062 1011
## scale(pool_metric_total)-river_chub 0.0046 0.3273 -0.6588 -0.0064 0.6722 1.0019 1200
## scale(pool_metric_total)-silverjaw_minnow 0.0016 0.3090 -0.6242 -0.0039 0.6188 1.0142 1200
## scale(pool_metric_total)-smallmouth_bass -0.0230 0.3278 -0.6588 -0.0242 0.6340 0.9992 1084
## scale(pool_metric_total)-spotfin_shiner 0.0003 0.3226 -0.6463 0.0034 0.6321 1.0127 1440
## scale(pool_metric_total)-stonecat_madtom -0.0191 0.3127 -0.6433 -0.0054 0.5992 1.0061 1200
## scale(pool_metric_total)-striped_shiner -0.0011 0.2986 -0.6305 -0.0057 0.5946 1.0008 1200
## scale(pool_metric_total)-trout_perch 0.0048 0.3181 -0.6287 -0.0029 0.6363 1.0011 1331
## scale(pool_metric_total)-warmouth_sunfish -0.0106 0.3226 -0.6442 -0.0146 0.6095 1.0018 1200
## scale(pool_metric_total)-white_sucker -0.1158 0.3090 -0.7454 -0.1145 0.4673 1.0125 1200
## scale(pool_metric_total)-yellow_bullhead_catfish 0.0079 0.2981 -0.5610 0.0124 0.6076 1.0187 1200
## scale(pool_metric_total)-sessile_animals 0.0603 0.3054 -0.4856 0.0450 0.6666 1.0030 1200
## scale(pool_metric_total)-aquatic_worms -0.3389 0.2756 -0.9258 -0.3208 0.1778 1.0190 1200
## scale(pool_metric_total)-sow_bugs 0.0167 0.2048 -0.3861 0.0047 0.4193 1.0042 1310
## scale(pool_metric_total)-scuds -0.3650 0.1996 -0.7797 -0.3568 0.0048 1.0013 1098
## scale(pool_metric_total)-water_mites 0.1875 0.2541 -0.2929 0.1824 0.6937 1.0046 1274
## scale(pool_metric_total)-damselfly_nymphs 0.1646 0.2298 -0.2686 0.1532 0.6287 1.0032 1200
## scale(pool_metric_total)-alderfly_larvae 0.2169 0.2340 -0.2728 0.2243 0.6625 1.0065 1200
## scale(pool_metric_total)-other_beetles -0.0137 0.2608 -0.5352 -0.0156 0.5057 1.0006 1200
## scale(pool_metric_total)-crayfish 0.1031 0.2298 -0.3733 0.1032 0.5549 1.0085 1200
## scale(pool_metric_total)-dragonfly_nymphs -0.1952 0.2361 -0.6907 -0.1806 0.2425 1.0023 1200
## scale(pool_metric_total)-riffle_beetles 0.0835 0.1868 -0.2722 0.0853 0.4435 1.0185 1200
## scale(pool_metric_total)-other_flies 0.1752 0.2944 -0.3654 0.1667 0.7710 1.0017 1200
## scale(pool_metric_total)-midges -0.0289 0.3137 -0.6403 -0.0265 0.5447 1.0023 1200
## scale(pool_metric_total)-snails 0.2252 0.2292 -0.1993 0.2202 0.7228 1.0053 1200
## scale(pool_metric_total)-clams -0.0208 0.2666 -0.5694 -0.0065 0.4457 1.0011 1200
## scale(pool_metric_total)-fishfly_larvae -0.0295 0.2242 -0.4668 -0.0226 0.4098 1.0061 1200
## scale(pool_metric_total)-water_penny_beetles 0.0830 0.2086 -0.3040 0.0804 0.4905 1.0091 1200
## scale(pool_metric_total)-cranefly_larvae 0.2186 0.2600 -0.2919 0.2133 0.7333 1.0019 1200
## scale(pool_metric_total)-ameletidae 0.2320 0.2924 -0.3240 0.2191 0.8350 0.9995 1200
## scale(pool_metric_total)-arthropleidae -0.0159 0.3305 -0.6552 -0.0188 0.6579 1.0108 918
## scale(pool_metric_total)-baetidae 0.1930 0.2292 -0.2432 0.1914 0.6470 1.0136 1200
## scale(pool_metric_total)-baetiscidae -0.0047 0.3054 -0.6233 -0.0071 0.5846 1.0011 1085
## scale(pool_metric_total)-caenidae 0.1408 0.2638 -0.3401 0.1317 0.6788 1.0213 1200
## scale(pool_metric_total)-ephemerellidae 0.1058 0.3139 -0.5099 0.0908 0.7465 1.0072 806
## scale(pool_metric_total)-ephemeridae -0.0133 0.3014 -0.5670 -0.0170 0.5933 1.0020 1200
## scale(pool_metric_total)-heptageniidae -0.0218 0.2178 -0.4274 -0.0217 0.4231 1.0075 1054
## scale(pool_metric_total)-isonychiidae -0.0244 0.3164 -0.6559 -0.0227 0.6161 1.0142 1200
## scale(pool_metric_total)-leptohyphidae 0.1318 0.3099 -0.5004 0.1244 0.7414 1.0018 1200
## scale(pool_metric_total)-leptophlebiidae -0.1210 0.1768 -0.4688 -0.1200 0.2157 1.0117 1200
## scale(pool_metric_total)-polymitarcyidae -0.0215 0.3129 -0.6436 -0.0205 0.6129 1.0020 1467
## scale(pool_metric_total)-potamanthidae -0.0035 0.3157 -0.6166 -0.0101 0.6041 1.0029 1200
## scale(pool_metric_total)-pseudironidae -0.0133 0.3231 -0.6589 -0.0129 0.6034 1.0015 1200
## scale(pool_metric_total)-siphlonuridae -0.0161 0.3079 -0.5946 -0.0269 0.6423 1.0100 1200
## scale(pool_metric_total)-capniidae 0.0000 0.3119 -0.6008 0.0008 0.6320 1.0170 1200
## scale(pool_metric_total)-chloroperlidae 0.0760 0.2545 -0.4291 0.0826 0.5872 1.0045 1200
## scale(pool_metric_total)-leuctridae -0.1160 0.1751 -0.4640 -0.1150 0.2074 1.0023 1200
## scale(pool_metric_total)-nemouridae -0.0831 0.2286 -0.5295 -0.0832 0.3665 1.0218 1200
## scale(pool_metric_total)-peltoperlidae -0.0056 0.3035 -0.6336 -0.0144 0.5869 1.0055 1026
## scale(pool_metric_total)-perlidae 0.3449 0.2133 -0.0314 0.3308 0.8007 1.0012 1096
## scale(pool_metric_total)-perlodidae -0.0179 0.2966 -0.6046 -0.0085 0.5373 1.0159 1200
## scale(pool_metric_total)-pteronarcyidae -0.0050 0.3167 -0.6255 -0.0099 0.6041 1.0017 1211
## scale(pool_metric_total)-taeniopterygidae -0.0083 0.3187 -0.6570 -0.0162 0.6717 1.0046 1232
## scale(pool_metric_total)-brachycentridae -0.0007 0.3072 -0.6120 -0.0002 0.6167 1.0068 1242
## scale(pool_metric_total)-dipseuodopsidae -0.0040 0.3253 -0.6508 -0.0072 0.6202 1.0084 1200
## scale(pool_metric_total)-glossosomatidae -0.0558 0.2743 -0.6064 -0.0606 0.4958 1.0222 1101
## scale(pool_metric_total)-goeridae -0.0080 0.3191 -0.6168 -0.0128 0.6533 1.0014 1200
## scale(pool_metric_total)-helicopsychidae -0.0056 0.3183 -0.6151 -0.0146 0.6430 1.0002 1306
## scale(pool_metric_total)-hydropsychidae -0.0245 0.1930 -0.4014 -0.0245 0.3638 1.0151 1200
## scale(pool_metric_total)-hydroptilidae -0.0445 0.2591 -0.5655 -0.0483 0.4875 1.0174 1200
## scale(pool_metric_total)-lepidostomatidae -0.1171 0.1943 -0.5186 -0.1071 0.2343 1.0004 1220
## scale(pool_metric_total)-leptoceridae -0.0206 0.3292 -0.6601 -0.0248 0.6271 1.0029 1200
## scale(pool_metric_total)-limnephilidae -0.2047 0.2108 -0.6398 -0.1900 0.1788 1.0003 1200
## scale(pool_metric_total)-molannidae -0.1774 0.2787 -0.7613 -0.1676 0.3659 1.0053 1200
## scale(pool_metric_total)-odontoceridae -0.3154 0.2879 -0.9252 -0.3057 0.2102 1.0084 1200
## scale(pool_metric_total)-philopotamidae -0.2221 0.2255 -0.7130 -0.2044 0.1962 1.0006 1200
## scale(pool_metric_total)-phryganeidae -0.1644 0.2733 -0.7329 -0.1542 0.3642 1.0034 1200
## scale(pool_metric_total)-polycentropodidae -0.0530 0.1933 -0.4746 -0.0516 0.2994 1.0294 1200
## scale(pool_metric_total)-psychomiidae -0.0145 0.3120 -0.6120 -0.0111 0.5716 1.0052 1200
## scale(pool_metric_total)-rhyacophilidae -0.1035 0.2247 -0.5480 -0.0913 0.3480 1.0048 1200
## scale(pool_metric_total)-uenoidae 0.0628 0.2272 -0.3937 0.0631 0.5086 1.0044 1200
##
## Detection (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept)-streambiotic_suff_mtdusky -0.2914 0.3078 -0.8823 -0.3007 0.3236 1.0100 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_nodusky -0.2558 0.1790 -0.6103 -0.2578 0.0880 1.0104 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_twolined 1.4451 0.1416 1.1720 1.4412 1.7236 1.0215 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_longtail -1.8625 0.8383 -3.6466 -1.7982 -0.3676 1.0052 772
## (Intercept)-streambiotic_suff_red -0.8582 0.3406 -1.5083 -0.8641 -0.1866 1.0020 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_mole -2.9449 1.4637 -5.9136 -2.8580 -0.4228 1.0349 114
## (Intercept)-streambiotic_suff_fourtoed -2.4440 2.5086 -8.3143 -2.1281 1.6399 1.1088 38
## (Intercept)-streambiotic_suff_redback -0.4285 0.1641 -0.7467 -0.4250 -0.1194 1.0035 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_slimy -1.6962 0.6748 -3.0118 -1.6839 -0.4629 0.9996 1200
## (Intercept)-blacknose_dace -1.9011 0.4428 -2.8552 -1.8904 -1.0864 1.0020 1200
## (Intercept)-bluegill_sunfish -2.6766 1.8041 -6.4054 -2.3838 0.2415 1.1059 59
## (Intercept)-bluntnose_minnow -2.4916 2.6427 -8.6599 -2.1462 1.9154 1.2410 41
## (Intercept)-brindled_madtom -2.3606 2.4936 -8.2588 -2.1136 1.8225 1.0778 76
## (Intercept)-brook_stickleback -2.4250 2.5262 -8.2330 -2.2046 1.8824 1.1898 73
## (Intercept)-brook_trout -2.4368 2.6132 -8.1440 -2.1353 1.6340 1.1910 73
## (Intercept)-central_mudminnow -2.1988 2.5748 -8.1423 -1.9547 2.2522 1.1559 44
## (Intercept)-central_stoneroller_minnow -4.1764 1.0953 -6.0463 -4.3117 -1.7766 1.0478 168
## (Intercept)-common_shiner -2.9831 1.6973 -6.5375 -2.8389 0.0159 1.0960 75
## (Intercept)-creek_chub -1.8477 0.2616 -2.3363 -1.8533 -1.3231 1.0165 1200
## (Intercept)-eastern_sand_darter -2.4486 2.4737 -8.0662 -2.3141 2.0632 1.1641 80
## (Intercept)-fantail_darter -2.4621 2.5101 -7.8373 -2.2349 1.7915 1.0989 78
## (Intercept)-fathead_minnow -2.4723 2.6290 -8.5944 -2.0776 1.9317 1.1516 36
## (Intercept)-golden_shiner -2.3984 2.5076 -8.2144 -2.1050 1.8264 1.0975 68
## (Intercept)-goldfish -2.5517 2.4666 -8.2571 -2.2695 1.6762 1.1073 68
## (Intercept)-grass_pickerel -2.3993 2.5378 -8.1277 -2.1712 1.9566 1.1506 68
## (Intercept)-greenside_darter -2.3624 2.5468 -7.9913 -2.1201 2.0741 1.1043 88
## (Intercept)-green_sunfish -4.1827 1.3169 -6.5877 -4.2588 -1.5651 1.0078 165
## (Intercept)-johnny_darter -3.2856 1.1297 -5.3953 -3.3127 -1.0551 1.0180 183
## (Intercept)-largemouth_bass -2.3234 2.4294 -7.9822 -2.0658 1.8450 1.0934 71
## (Intercept)-longear_sunfish -2.3466 2.4095 -7.6200 -2.1262 2.1507 1.1010 62
## (Intercept)-longnose_dace -2.5289 2.4990 -8.1012 -2.2800 1.9572 1.1219 70
## (Intercept)-mottled_sculpin -2.3371 2.5359 -8.1357 -2.0348 2.0491 1.1076 85
## (Intercept)-northern_hog_sucker -2.5142 2.4823 -8.0926 -2.3154 1.7104 1.0997 112
## (Intercept)-pumpkinseed_sunfish -2.3195 2.4301 -7.5600 -2.0708 1.9404 1.0819 83
## (Intercept)-rainbow_darter -2.0014 0.9941 -4.1952 -1.8907 -0.2793 1.0100 319
## (Intercept)-rainbow_trout -2.3874 2.5284 -8.1079 -2.1566 1.8102 1.1034 44
## (Intercept)-redbelly_dace -3.4341 1.4092 -6.1523 -3.3884 -0.9159 1.0426 254
## (Intercept)-redside_dace -3.2591 1.6892 -6.7621 -3.0568 -0.4367 1.0848 66
## (Intercept)-river_chub -2.4837 2.4681 -8.1890 -2.3056 1.5278 1.1575 47
## (Intercept)-silverjaw_minnow -2.3307 2.3479 -8.0135 -2.1353 1.8411 1.1308 57
## (Intercept)-smallmouth_bass -2.3410 2.4102 -7.8480 -2.1545 1.8437 1.0926 45
## (Intercept)-spotfin_shiner -2.3585 2.4561 -8.1076 -2.1394 1.9856 1.1190 69
## (Intercept)-stonecat_madtom -2.4520 2.5752 -8.4653 -2.2294 1.9326 1.2455 82
## (Intercept)-striped_shiner -2.3044 2.3965 -7.6039 -2.0895 1.9722 1.1216 76
## (Intercept)-trout_perch -2.2398 2.4065 -7.5753 -1.9360 1.8791 1.0707 61
## (Intercept)-warmouth_sunfish -2.4565 2.5343 -8.2805 -2.2178 1.6799 1.0936 43
## (Intercept)-white_sucker -2.9844 1.2165 -5.2154 -3.0055 -0.7442 1.0612 169
## (Intercept)-yellow_bullhead_catfish -2.8236 1.9484 -6.7769 -2.6077 0.4685 1.0604 102
## (Intercept)-sessile_animals -2.9783 1.2888 -5.2886 -3.0022 -0.5222 1.0012 288
## (Intercept)-aquatic_worms 0.6181 0.1108 0.4097 0.6180 0.8431 0.9994 1200
## (Intercept)-sow_bugs 0.0351 0.1962 -0.3493 0.0355 0.4155 0.9995 1200
## (Intercept)-scuds -0.2698 0.1817 -0.6343 -0.2687 0.0867 1.0102 1200
## (Intercept)-water_mites -1.2911 0.1975 -1.6772 -1.2924 -0.9024 1.0033 1200
## (Intercept)-damselfly_nymphs -0.2754 0.1382 -0.5615 -0.2697 0.0038 1.0106 1200
## (Intercept)-alderfly_larvae -1.0421 0.1891 -1.3984 -1.0401 -0.6844 1.0021 1307
## (Intercept)-other_beetles -0.0246 0.1201 -0.2547 -0.0261 0.2204 1.0067 1200
## (Intercept)-crayfish 0.6413 0.1214 0.4018 0.6441 0.8811 1.0041 1200
## (Intercept)-dragonfly_nymphs -0.1140 0.1236 -0.3584 -0.1156 0.1256 1.0067 1200
## (Intercept)-riffle_beetles 0.0677 0.1370 -0.1854 0.0698 0.3358 1.0135 1453
## (Intercept)-other_flies 1.6953 0.1330 1.4487 1.6916 1.9651 1.0147 1200
## (Intercept)-midges 1.7920 0.1379 1.5161 1.7889 2.0679 1.0039 1200
## (Intercept)-snails -0.0316 0.1190 -0.2517 -0.0299 0.1994 1.0041 1200
## (Intercept)-clams -1.3937 0.2908 -1.9730 -1.3854 -0.8416 1.0119 776
## (Intercept)-fishfly_larvae -0.7965 0.1914 -1.1995 -0.7970 -0.4230 1.0067 1200
## (Intercept)-water_penny_beetles -0.9121 0.2179 -1.3530 -0.9169 -0.4644 1.0317 1200
## (Intercept)-cranefly_larvae 0.9855 0.1174 0.7708 0.9810 1.2181 1.0029 1200
## (Intercept)-ameletidae -2.4044 0.2623 -2.9779 -2.3926 -1.9226 0.9997 1085
## (Intercept)-arthropleidae -2.4860 2.5392 -8.2959 -2.2300 1.6794 1.0810 59
## (Intercept)-baetidae 0.4092 0.1311 0.1476 0.4086 0.6593 1.0136 1200
## (Intercept)-baetiscidae -2.4159 2.4326 -7.8271 -2.1853 1.8803 1.1091 92
## (Intercept)-caenidae -1.0183 0.5029 -2.1489 -0.9827 -0.1586 1.0050 1200
## (Intercept)-ephemerellidae -4.0193 1.0853 -5.7958 -4.2026 -1.7746 1.0530 169
## (Intercept)-ephemeridae -3.3444 1.3751 -5.7248 -3.3904 -0.6845 1.1421 116
## (Intercept)-heptageniidae -0.6951 0.2260 -1.1541 -0.6875 -0.2616 1.0006 1200
## (Intercept)-isonychiidae -2.4865 2.4374 -7.9426 -2.1930 1.6888 1.1219 39
## (Intercept)-leptohyphidae -3.1989 0.8090 -4.5762 -3.2970 -1.5032 1.0190 262
## (Intercept)-leptophlebiidae 0.5817 0.1684 0.2675 0.5793 0.9155 1.0017 1200
## (Intercept)-polymitarcyidae -2.4090 2.4607 -8.0205 -2.2101 1.7337 1.0833 51
## (Intercept)-potamanthidae -2.5168 2.5528 -8.3855 -2.2856 1.7607 1.1255 74
## (Intercept)-pseudironidae -2.4157 2.5236 -7.7872 -2.1981 1.6838 1.1253 87
## (Intercept)-siphlonuridae -2.2606 2.4535 -7.4841 -2.0885 1.9264 1.0558 56
## (Intercept)-capniidae -2.3979 2.4413 -7.6042 -2.1606 1.6089 1.1048 74
## (Intercept)-chloroperlidae -1.5697 0.4259 -2.4468 -1.5524 -0.7894 1.0234 848
## (Intercept)-leuctridae 0.7916 0.1564 0.4920 0.7918 1.1001 0.9998 1200
## (Intercept)-nemouridae -1.2491 0.2449 -1.7594 -1.2422 -0.8109 1.0111 1315
## (Intercept)-peltoperlidae -2.5557 2.5538 -8.0919 -2.3327 1.7069 1.1291 66
## (Intercept)-perlidae -0.2311 0.1894 -0.5944 -0.2259 0.1214 1.0019 1165
## (Intercept)-perlodidae -3.2312 0.3845 -3.9276 -3.2507 -2.4047 1.0147 656
## (Intercept)-pteronarcyidae -2.2416 2.3968 -7.7128 -2.0586 2.0355 1.0890 42
## (Intercept)-taeniopterygidae -2.3336 2.5536 -8.4495 -2.1545 1.9275 1.1497 69
## (Intercept)-brachycentridae -2.3151 2.3445 -7.5422 -2.1183 1.7410 1.1496 74
## (Intercept)-dipseuodopsidae -2.4638 2.5645 -8.4706 -2.2159 2.0027 1.1222 107
## (Intercept)-glossosomatidae -0.6958 0.7425 -2.2693 -0.6708 0.6758 1.0011 1544
## (Intercept)-goeridae -2.2967 2.3659 -7.6550 -2.2005 1.6332 1.0908 55
## (Intercept)-helicopsychidae -2.4151 2.4361 -7.9637 -2.2285 1.7999 1.1111 36
## (Intercept)-hydropsychidae 0.9845 0.1235 0.7411 0.9886 1.2173 1.0011 1478
## (Intercept)-hydroptilidae -1.7222 0.4446 -2.6088 -1.7124 -0.8926 0.9994 1058
## (Intercept)-lepidostomatidae -0.0396 0.2138 -0.4597 -0.0334 0.3630 1.0039 1022
## (Intercept)-leptoceridae -2.3503 2.4481 -8.1601 -2.1322 1.6888 1.1810 59
## (Intercept)-limnephilidae -0.4565 0.1964 -0.8381 -0.4581 -0.0904 1.0022 1200
## (Intercept)-molannidae -1.2748 0.9122 -3.1035 -1.2469 0.4831 1.0071 989
## (Intercept)-odontoceridae -2.0221 0.9209 -3.9958 -1.9658 -0.3853 1.0008 877
## (Intercept)-philopotamidae -0.7041 0.1650 -1.0292 -0.7095 -0.3739 1.0025 1200
## (Intercept)-phryganeidae -2.6549 0.8377 -4.3007 -2.6346 -1.1960 1.0630 390
## (Intercept)-polycentropodidae -0.4526 0.1794 -0.7968 -0.4538 -0.0988 0.9999 1200
## (Intercept)-psychomiidae -2.3476 2.4979 -8.0579 -2.0057 1.7895 1.1135 58
## (Intercept)-rhyacophilidae -1.1480 0.3097 -1.7541 -1.1455 -0.5633 1.0043 1200
## (Intercept)-uenoidae -1.2592 0.2428 -1.7636 -1.2601 -0.7993 0.9996 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_mtdusky -0.9483 0.2300 -1.4407 -0.9381 -0.5424 1.0059 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_nodusky -0.4391 0.1477 -0.7468 -0.4372 -0.1691 1.0070 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_twolined -0.2331 0.1373 -0.5065 -0.2320 0.0263 1.0046 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_longtail -0.3800 0.3842 -1.1835 -0.3779 0.3540 1.0016 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_red -0.7282 0.2958 -1.3331 -0.7254 -0.1434 1.0087 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_mole -0.0778 0.4543 -0.9638 -0.0739 0.8260 1.0003 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_fourtoed -0.2313 0.5608 -1.3591 -0.2188 0.8668 1.0045 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_redback -0.5561 0.1389 -0.8452 -0.5523 -0.2877 1.0015 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_slimy -0.7388 0.4130 -1.5970 -0.7236 -0.0033 1.0002 1318
## scale(seasons)-blacknose_dace -1.0679 0.2509 -1.5697 -1.0594 -0.5939 1.0015 1200
## scale(seasons)-bluegill_sunfish 0.0699 0.5126 -0.9251 0.0633 1.1312 1.0121 1200
## scale(seasons)-bluntnose_minnow -0.1938 0.5764 -1.3177 -0.1841 0.9488 1.0024 1296
## scale(seasons)-brindled_madtom -0.2307 0.5616 -1.3320 -0.1989 0.7906 1.0010 1572
## scale(seasons)-brook_stickleback -0.2055 0.5802 -1.3157 -0.2045 0.9245 1.0098 1200
## scale(seasons)-brook_trout -0.2024 0.5584 -1.2795 -0.2102 0.8934 1.0061 1200
## scale(seasons)-central_mudminnow -0.2184 0.5610 -1.3450 -0.2052 0.8461 1.0015 1200
## scale(seasons)-central_stoneroller_minnow -0.1696 0.4167 -0.9898 -0.1777 0.6639 1.0011 1200
## scale(seasons)-common_shiner -0.4334 0.4935 -1.4196 -0.4258 0.5259 1.0062 1308
## scale(seasons)-creek_chub -1.0593 0.2066 -1.4779 -1.0607 -0.6626 1.0005 1200
## scale(seasons)-eastern_sand_darter -0.1979 0.5650 -1.3591 -0.1885 0.8976 1.0002 1093
## scale(seasons)-fantail_darter -0.2186 0.5767 -1.3935 -0.2003 0.8707 1.0105 1200
## scale(seasons)-fathead_minnow -0.1851 0.5624 -1.2654 -0.1845 0.9097 1.0166 731
## scale(seasons)-golden_shiner -0.1866 0.5523 -1.2735 -0.1642 0.8850 1.0016 1200
## scale(seasons)-goldfish -0.2090 0.5747 -1.3509 -0.1947 0.8478 1.0005 1200
## scale(seasons)-grass_pickerel -0.2250 0.5627 -1.3558 -0.2285 0.9772 1.0049 1456
## scale(seasons)-greenside_darter -0.1770 0.5720 -1.2687 -0.1864 0.9002 1.0036 1200
## scale(seasons)-green_sunfish -0.4650 0.4276 -1.3411 -0.4635 0.3901 1.0090 1200
## scale(seasons)-johnny_darter 0.2365 0.3971 -0.5194 0.2240 1.0614 1.0030 1200
## scale(seasons)-largemouth_bass -0.2092 0.5748 -1.3042 -0.2179 0.9684 1.0012 1200
## scale(seasons)-longear_sunfish -0.1910 0.5681 -1.3383 -0.1999 0.8986 1.0004 1200
## scale(seasons)-longnose_dace -0.2145 0.5552 -1.3541 -0.1995 0.8626 1.0143 1200
## scale(seasons)-mottled_sculpin -0.1825 0.5679 -1.3525 -0.1805 0.9658 1.0015 1200
## scale(seasons)-northern_hog_sucker -0.1750 0.5581 -1.2779 -0.1885 0.9522 1.0024 1200
## scale(seasons)-pumpkinseed_sunfish -0.2287 0.5496 -1.3599 -0.2219 0.8735 1.0009 1301
## scale(seasons)-rainbow_darter -0.4499 0.4061 -1.2638 -0.4501 0.2832 0.9999 1200
## scale(seasons)-rainbow_trout -0.2272 0.5411 -1.2770 -0.2079 0.7987 1.0051 1200
## scale(seasons)-redbelly_dace -0.8027 0.4468 -1.7670 -0.7867 0.0406 1.0040 1197
## scale(seasons)-redside_dace -0.5211 0.4865 -1.5157 -0.5039 0.3817 1.0036 1200
## scale(seasons)-river_chub -0.2090 0.5561 -1.3016 -0.1899 0.7884 1.0006 1409
## scale(seasons)-silverjaw_minnow -0.1980 0.5581 -1.2958 -0.2097 0.8794 1.0305 1200
## scale(seasons)-smallmouth_bass -0.2192 0.5509 -1.3127 -0.2253 0.8644 1.0054 1200
## scale(seasons)-spotfin_shiner -0.1884 0.5550 -1.2859 -0.2006 0.8651 1.0091 1200
## scale(seasons)-stonecat_madtom -0.1828 0.5719 -1.2739 -0.1694 0.9372 1.0010 1200
## scale(seasons)-striped_shiner -0.1888 0.5716 -1.3014 -0.1868 0.9123 1.0042 1200
## scale(seasons)-trout_perch -0.2159 0.5727 -1.3134 -0.2150 0.9090 1.0041 1200
## scale(seasons)-warmouth_sunfish -0.2058 0.5612 -1.2884 -0.2043 0.9066 1.0035 1200
## scale(seasons)-white_sucker -0.3334 0.4030 -1.1594 -0.3305 0.4325 1.0419 1232
## scale(seasons)-yellow_bullhead_catfish -0.3894 0.5209 -1.4421 -0.3914 0.6377 1.0091 1200
## scale(seasons)-sessile_animals -0.2203 0.4234 -1.0867 -0.2137 0.5666 1.0046 1105
## scale(seasons)-aquatic_worms -0.0254 0.1032 -0.2166 -0.0270 0.1857 1.0004 1416
## scale(seasons)-sow_bugs 0.4887 0.1714 0.1753 0.4857 0.8304 1.0028 1200
## scale(seasons)-scuds 0.4519 0.1545 0.1566 0.4450 0.7785 1.0039 1200
## scale(seasons)-water_mites 0.3590 0.1514 0.0572 0.3582 0.6615 1.0081 964
## scale(seasons)-damselfly_nymphs -0.0906 0.1143 -0.3207 -0.0884 0.1280 1.0099 1200
## scale(seasons)-alderfly_larvae -0.1277 0.1398 -0.3931 -0.1263 0.1430 1.0072 1049
## scale(seasons)-other_beetles -0.4198 0.1113 -0.6419 -0.4167 -0.1981 1.0013 1200
## scale(seasons)-crayfish -0.4262 0.1184 -0.6579 -0.4290 -0.1926 1.0001 1200
## scale(seasons)-dragonfly_nymphs -0.1582 0.1028 -0.3585 -0.1558 0.0423 1.0044 1200
## scale(seasons)-riffle_beetles 0.0243 0.1128 -0.1960 0.0240 0.2419 1.0093 1200
## scale(seasons)-other_flies -0.1836 0.1355 -0.4516 -0.1817 0.0841 1.0125 822
## scale(seasons)-midges 0.3712 0.1343 0.1085 0.3654 0.6370 1.0015 974
## scale(seasons)-snails -0.1997 0.1134 -0.4207 -0.1976 0.0139 1.0044 1200
## scale(seasons)-clams -0.4151 0.1720 -0.7761 -0.4059 -0.1098 1.0050 1200
## scale(seasons)-fishfly_larvae -0.2194 0.1389 -0.4991 -0.2174 0.0586 1.0014 1100
## scale(seasons)-water_penny_beetles -0.0482 0.1617 -0.3495 -0.0532 0.2781 1.0032 1324
## scale(seasons)-cranefly_larvae 0.1343 0.1149 -0.1000 0.1345 0.3486 1.0045 1320
## scale(seasons)-ameletidae -1.8690 0.2363 -2.3641 -1.8555 -1.4522 1.0030 1056
## scale(seasons)-arthropleidae -0.1782 0.5551 -1.3165 -0.1598 0.8262 1.0004 1200
## scale(seasons)-baetidae 1.1663 0.1350 0.9063 1.1641 1.4353 1.0131 1200
## scale(seasons)-baetiscidae -0.2328 0.5699 -1.4133 -0.2439 0.9152 1.0008 1336
## scale(seasons)-caenidae 0.0762 0.2888 -0.5013 0.0732 0.6389 0.9998 1200
## scale(seasons)-ephemerellidae 0.8794 0.4324 0.0970 0.8606 1.7359 1.0327 1050
## scale(seasons)-ephemeridae 0.1353 0.4207 -0.6535 0.1192 1.0088 1.0082 1373
## scale(seasons)-heptageniidae 0.1134 0.1534 -0.1791 0.1145 0.4177 0.9998 1200
## scale(seasons)-isonychiidae -0.1834 0.5670 -1.2607 -0.1838 0.9895 1.0113 1200
## scale(seasons)-leptohyphidae -0.9456 0.3377 -1.7001 -0.9255 -0.3290 1.0037 1085
## scale(seasons)-leptophlebiidae -0.0300 0.1476 -0.3310 -0.0280 0.2508 1.0007 1253
## scale(seasons)-polymitarcyidae -0.1959 0.5548 -1.2278 -0.2084 0.9247 1.0168 1099
## scale(seasons)-potamanthidae -0.2074 0.5825 -1.3477 -0.2154 0.9372 1.0039 1200
## scale(seasons)-pseudironidae -0.2015 0.5770 -1.3225 -0.2226 0.9623 1.0122 1200
## scale(seasons)-siphlonuridae -0.2133 0.5811 -1.3364 -0.2185 1.0155 1.0030 1332
## scale(seasons)-capniidae -0.2050 0.5560 -1.3063 -0.2032 0.8588 1.0004 1051
## scale(seasons)-chloroperlidae -0.1170 0.1953 -0.4931 -0.1094 0.2842 1.0221 1037
## scale(seasons)-leuctridae 0.5099 0.1318 0.2532 0.5073 0.7619 1.0041 1200
## scale(seasons)-nemouridae -0.6125 0.1573 -0.9186 -0.6154 -0.3045 1.0109 1200
## scale(seasons)-peltoperlidae -0.2228 0.5684 -1.3217 -0.2198 0.8630 1.0165 1200
## scale(seasons)-perlidae -0.0860 0.1506 -0.3978 -0.0857 0.1949 1.0010 1200
## scale(seasons)-perlodidae -0.5449 0.2083 -0.9497 -0.5424 -0.1323 1.0080 1200
## scale(seasons)-pteronarcyidae -0.2161 0.5761 -1.3631 -0.2047 0.9229 1.0060 1200
## scale(seasons)-taeniopterygidae -0.1942 0.5933 -1.3449 -0.2018 0.9510 1.0031 1200
## scale(seasons)-brachycentridae -0.1882 0.5515 -1.3284 -0.1765 0.8874 1.0018 1200
## scale(seasons)-dipseuodopsidae -0.1888 0.5887 -1.3937 -0.1781 0.9565 1.0045 1200
## scale(seasons)-glossosomatidae 0.1690 0.4462 -0.6814 0.1673 1.0902 1.0041 1310
## scale(seasons)-goeridae -0.2325 0.5725 -1.3575 -0.2254 0.8548 1.0000 1362
## scale(seasons)-helicopsychidae -0.2187 0.5690 -1.3375 -0.1956 0.9149 1.0017 1200
## scale(seasons)-hydropsychidae 0.0524 0.1162 -0.1737 0.0535 0.2873 1.0009 1067
## scale(seasons)-hydroptilidae -0.1493 0.2418 -0.6221 -0.1514 0.3310 0.9992 979
## scale(seasons)-lepidostomatidae 0.0523 0.2054 -0.3378 0.0536 0.4569 1.0091 1325
## scale(seasons)-leptoceridae -0.1974 0.5887 -1.4024 -0.1935 0.9145 1.0016 1200
## scale(seasons)-limnephilidae -0.3237 0.1705 -0.6769 -0.3228 -0.0108 1.0012 1200
## scale(seasons)-molannidae 0.2643 0.4383 -0.5753 0.2704 1.1115 0.9993 1451
## scale(seasons)-odontoceridae -0.7630 0.4385 -1.6716 -0.7293 0.0072 1.0088 1200
## scale(seasons)-philopotamidae 0.2481 0.1293 -0.0111 0.2475 0.5075 1.0047 1348
## scale(seasons)-phryganeidae -0.6789 0.3720 -1.4360 -0.6616 -0.0108 1.0140 1086
## scale(seasons)-polycentropodidae 0.0126 0.1296 -0.2437 0.0132 0.2587 1.0084 1200
## scale(seasons)-psychomiidae -0.2188 0.5593 -1.3195 -0.2163 0.8131 1.0022 1391
## scale(seasons)-rhyacophilidae -0.3146 0.2048 -0.7099 -0.3173 0.1086 1.0037 1200
## scale(seasons)-uenoidae -0.7840 0.1723 -1.1208 -0.7851 -0.4561 1.0004 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_mtdusky -0.0321 0.2753 -0.5932 -0.0344 0.5000 1.0100 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_nodusky 0.0499 0.1602 -0.2626 0.0501 0.3702 1.0185 1042
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_twolined -0.1209 0.1386 -0.4038 -0.1210 0.1425 1.0070 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_longtail 0.1009 0.3712 -0.6348 0.0923 0.8278 1.0284 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_red -0.1272 0.2860 -0.6782 -0.1388 0.4478 0.9998 1384
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_mole 0.2099 0.4104 -0.6160 0.2130 1.0149 1.0094 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_fourtoed 0.0368 0.4507 -0.8928 0.0507 0.8822 1.0178 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_redback -0.0457 0.1276 -0.3051 -0.0465 0.2087 1.0036 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_slimy 0.7116 0.3430 0.0443 0.6925 1.4079 1.0024 1317
## scale(dayyear)-blacknose_dace 0.3673 0.2199 -0.0420 0.3643 0.8257 1.0147 1200
## scale(dayyear)-bluegill_sunfish -0.0125 0.4275 -0.8448 -0.0161 0.8175 1.0062 1200
## scale(dayyear)-bluntnose_minnow 0.0283 0.4585 -0.8361 0.0063 0.9576 1.0090 1200
## scale(dayyear)-brindled_madtom 0.0423 0.4414 -0.8365 0.0436 0.9358 1.0006 1200
## scale(dayyear)-brook_stickleback 0.0318 0.4475 -0.8470 0.0454 0.8753 1.0009 1344
## scale(dayyear)-brook_trout 0.0360 0.4451 -0.8447 0.0489 0.9078 0.9998 1200
## scale(dayyear)-central_mudminnow 0.0365 0.4321 -0.7992 0.0354 0.8907 1.0021 1200
## scale(dayyear)-central_stoneroller_minnow 0.3969 0.3139 -0.2193 0.4097 1.0365 0.9999 1200
## scale(dayyear)-common_shiner 0.0498 0.4022 -0.7111 0.0492 0.8339 1.0193 1200
## scale(dayyear)-creek_chub 0.3004 0.1766 -0.0263 0.2985 0.6645 1.0042 1200
## scale(dayyear)-eastern_sand_darter 0.0379 0.4428 -0.7841 0.0407 0.8883 1.0086 1352
## scale(dayyear)-fantail_darter 0.0441 0.4423 -0.8516 0.0500 0.9089 1.0039 1200
## scale(dayyear)-fathead_minnow 0.0458 0.4378 -0.8104 0.0662 0.9132 1.0035 1200
## scale(dayyear)-golden_shiner 0.0180 0.4378 -0.8596 0.0323 0.8989 1.0076 1200
## scale(dayyear)-goldfish 0.0278 0.4706 -0.8897 0.0287 0.9545 1.0070 1746
## scale(dayyear)-grass_pickerel 0.0446 0.4384 -0.8284 0.0453 0.8766 1.0073 1200
## scale(dayyear)-greenside_darter 0.0318 0.4379 -0.8098 0.0274 0.9043 1.0006 1365
## scale(dayyear)-green_sunfish 0.2658 0.3415 -0.4095 0.2690 0.9266 1.0173 1200
## scale(dayyear)-johnny_darter 0.5204 0.3403 -0.1183 0.5207 1.2014 0.9993 1123
## scale(dayyear)-largemouth_bass 0.0390 0.4504 -0.8575 0.0287 0.9314 1.0087 1200
## scale(dayyear)-longear_sunfish 0.0534 0.4282 -0.7677 0.0562 0.9121 1.0136 1200
## scale(dayyear)-longnose_dace 0.0401 0.4472 -0.8599 0.0243 0.9490 1.0161 1200
## scale(dayyear)-mottled_sculpin 0.0417 0.4381 -0.8350 0.0508 0.8701 1.0207 971
## scale(dayyear)-northern_hog_sucker 0.0297 0.4399 -0.8340 0.0236 0.8832 1.0006 1649
## scale(dayyear)-pumpkinseed_sunfish 0.0476 0.4354 -0.8374 0.0644 0.8511 1.0094 1200
## scale(dayyear)-rainbow_darter 0.0305 0.3735 -0.7582 0.0367 0.7180 1.0017 1200
## scale(dayyear)-rainbow_trout 0.0323 0.4279 -0.8064 0.0477 0.8870 1.0119 1200
## scale(dayyear)-redbelly_dace -0.1027 0.3875 -0.8651 -0.0969 0.7023 1.0051 1080
## scale(dayyear)-redside_dace 0.1096 0.4208 -0.6831 0.0921 0.9359 1.0107 1200
## scale(dayyear)-river_chub 0.0218 0.4279 -0.7867 0.0152 0.8805 1.0090 1200
## scale(dayyear)-silverjaw_minnow 0.0223 0.4480 -0.8527 0.0272 0.9186 1.0033 1200
## scale(dayyear)-smallmouth_bass 0.0725 0.4519 -0.8383 0.0758 0.9588 1.0014 1423
## scale(dayyear)-spotfin_shiner 0.0373 0.4566 -0.8989 0.0339 0.9087 1.0000 1200
## scale(dayyear)-stonecat_madtom 0.0437 0.4501 -0.8791 0.0456 0.9565 1.0223 1200
## scale(dayyear)-striped_shiner 0.0499 0.4411 -0.7971 0.0529 0.9139 1.0102 1211
## scale(dayyear)-trout_perch 0.0454 0.4335 -0.7786 0.0321 0.9228 1.0142 1200
## scale(dayyear)-warmouth_sunfish 0.0535 0.4341 -0.7892 0.0514 0.9213 1.0002 1200
## scale(dayyear)-white_sucker 0.2139 0.3605 -0.4607 0.2222 0.8887 1.0089 1200
## scale(dayyear)-yellow_bullhead_catfish 0.1972 0.4140 -0.6301 0.1911 0.9962 1.0022 1200
## scale(dayyear)-sessile_animals 0.4860 0.3716 -0.2202 0.4578 1.2716 1.0008 1200
## scale(dayyear)-aquatic_worms -0.1231 0.1024 -0.3165 -0.1299 0.0822 1.0004 1326
## scale(dayyear)-sow_bugs 0.1291 0.1679 -0.2126 0.1288 0.4521 1.0012 1009
## scale(dayyear)-scuds -0.0252 0.1510 -0.3190 -0.0184 0.2799 1.0078 1200
## scale(dayyear)-water_mites 0.0071 0.1444 -0.2845 0.0052 0.2999 1.0121 1200
## scale(dayyear)-damselfly_nymphs 0.1964 0.1140 -0.0175 0.1961 0.4195 1.0024 1200
## scale(dayyear)-alderfly_larvae 0.6684 0.1569 0.3802 0.6661 0.9709 1.0002 1200
## scale(dayyear)-other_beetles -0.0802 0.1063 -0.3009 -0.0781 0.1320 1.0009 1313
## scale(dayyear)-crayfish -0.0759 0.1169 -0.3018 -0.0755 0.1596 1.0037 1307
## scale(dayyear)-dragonfly_nymphs 0.0938 0.1085 -0.1119 0.0941 0.3064 1.0069 1200
## scale(dayyear)-riffle_beetles 0.1416 0.1251 -0.0959 0.1398 0.3945 1.0088 1200
## scale(dayyear)-other_flies -0.1825 0.1317 -0.4343 -0.1805 0.0770 0.9993 1200
## scale(dayyear)-midges -0.3404 0.1219 -0.5748 -0.3381 -0.1112 1.0011 1200
## scale(dayyear)-snails 0.1449 0.1088 -0.0625 0.1468 0.3529 1.0096 1200
## scale(dayyear)-clams 0.0302 0.1484 -0.2587 0.0395 0.3065 1.0017 1200
## scale(dayyear)-fishfly_larvae 0.4734 0.1533 0.1884 0.4689 0.7879 1.0075 1200
## scale(dayyear)-water_penny_beetles 0.8444 0.1955 0.4670 0.8439 1.2312 1.0024 1200
## scale(dayyear)-cranefly_larvae 0.4796 0.1270 0.2272 0.4777 0.7300 1.0013 1200
## scale(dayyear)-ameletidae -0.2326 0.1439 -0.5303 -0.2296 0.0423 1.0330 1200
## scale(dayyear)-arthropleidae 0.0460 0.4582 -0.9065 0.0437 0.9271 1.0185 1330
## scale(dayyear)-baetidae 0.0852 0.1294 -0.1592 0.0799 0.3447 1.0060 1200
## scale(dayyear)-baetiscidae 0.0434 0.4293 -0.8084 0.0446 0.8505 1.0001 1200
## scale(dayyear)-caenidae 0.0681 0.2899 -0.4970 0.0670 0.6226 1.0082 1200
## scale(dayyear)-ephemerellidae -0.5367 0.3675 -1.2828 -0.5315 0.1724 1.0045 1535
## scale(dayyear)-ephemeridae 0.1991 0.3584 -0.4911 0.1913 0.9245 1.0002 1200
## scale(dayyear)-heptageniidae -0.2386 0.1735 -0.5819 -0.2396 0.0986 1.0020 1200
## scale(dayyear)-isonychiidae 0.0383 0.4143 -0.7572 0.0357 0.8419 0.9996 1067
## scale(dayyear)-leptohyphidae 0.0671 0.2422 -0.4209 0.0655 0.5178 1.0006 1200
## scale(dayyear)-leptophlebiidae -0.4363 0.1666 -0.7666 -0.4321 -0.1046 1.0118 1200
## scale(dayyear)-polymitarcyidae 0.0530 0.4488 -0.8100 0.0466 0.9563 1.0035 1200
## scale(dayyear)-potamanthidae 0.0422 0.4532 -0.8594 0.0431 0.9825 1.0067 1200
## scale(dayyear)-pseudironidae 0.0367 0.4435 -0.8053 0.0282 0.9233 1.0045 1200
## scale(dayyear)-siphlonuridae 0.0341 0.4387 -0.8119 0.0203 0.9213 1.0020 1294
## scale(dayyear)-capniidae 0.0440 0.4413 -0.8476 0.0490 0.9335 1.0022 1200
## scale(dayyear)-chloroperlidae -0.3078 0.2210 -0.7341 -0.3149 0.1131 1.0011 1200
## scale(dayyear)-leuctridae -0.2411 0.1513 -0.5370 -0.2423 0.0524 1.0048 1012
## scale(dayyear)-nemouridae -0.8215 0.1863 -1.2043 -0.8107 -0.4872 0.9991 1200
## scale(dayyear)-peltoperlidae 0.0146 0.4226 -0.8292 0.0143 0.8263 1.0044 1200
## scale(dayyear)-perlidae -0.1291 0.1727 -0.4789 -0.1341 0.1915 1.0069 1200
## scale(dayyear)-perlodidae -1.1846 0.2726 -1.7471 -1.1712 -0.6809 1.0019 1200
## scale(dayyear)-pteronarcyidae 0.0501 0.4527 -0.8144 0.0373 0.9270 1.0048 1200
## scale(dayyear)-taeniopterygidae 0.0445 0.4493 -0.8697 0.0435 0.9719 1.0057 1200
## scale(dayyear)-brachycentridae 0.0303 0.4342 -0.8231 0.0377 0.8682 1.0088 1306
## scale(dayyear)-dipseuodopsidae 0.0372 0.4263 -0.8309 0.0280 0.8639 1.0052 1200
## scale(dayyear)-glossosomatidae -0.1751 0.4264 -1.0007 -0.1629 0.6160 1.0102 1183
## scale(dayyear)-goeridae 0.0395 0.4544 -0.8619 0.0224 0.9212 1.0086 1292
## scale(dayyear)-helicopsychidae 0.0421 0.4338 -0.8402 0.0453 0.8570 1.0004 1319
## scale(dayyear)-hydropsychidae 0.4611 0.1380 0.2039 0.4600 0.7477 1.0085 1560
## scale(dayyear)-hydroptilidae 0.1053 0.2141 -0.3163 0.0981 0.5156 1.0009 1200
## scale(dayyear)-lepidostomatidae -0.3813 0.2222 -0.8409 -0.3724 0.0459 1.0134 1071
## scale(dayyear)-leptoceridae 0.0282 0.4362 -0.8375 0.0301 0.8929 1.0047 1399
## scale(dayyear)-limnephilidae 0.1171 0.1642 -0.1886 0.1156 0.4375 1.0226 1350
## scale(dayyear)-molannidae 0.0216 0.3916 -0.7077 0.0236 0.7653 1.0017 1200
## scale(dayyear)-odontoceridae 0.1587 0.3948 -0.5830 0.1429 0.9929 1.0018 1093
## scale(dayyear)-philopotamidae 0.2924 0.1414 0.0039 0.2941 0.5570 1.0230 1062
## scale(dayyear)-phryganeidae 0.5464 0.3163 -0.0064 0.5315 1.1936 1.0041 1200
## scale(dayyear)-polycentropodidae 0.2357 0.1426 -0.0469 0.2387 0.5121 0.9989 1200
## scale(dayyear)-psychomiidae 0.0496 0.4368 -0.8491 0.0498 0.8901 0.9999 892
## scale(dayyear)-rhyacophilidae -0.4950 0.2213 -0.9482 -0.4893 -0.0839 1.0030 1200
## scale(dayyear)-uenoidae -0.3711 0.1622 -0.6941 -0.3665 -0.0588 1.0054 1200