phwh<-read.csv("PHWH_postgresexport.csv",header=T,na.strings=c("","NA"))
sitechecks<-data.frame(phwh$stream_name,phwh$date)
colnames(sitechecks)<-c("stream_names","date")
sitechecks$date<- as.Date(sitechecks$date , format = "%Y/%m/%d")
sitechecks$datecount<-as.numeric(sitechecks$date-min(sitechecks$date)+1)
sitechecks_surveyhistory<-sitechecks %>%
group_by(stream_names) %>%
mutate(check=as.character(dense_rank(date))) %>%
arrange(stream_names) %>%
distinct(stream_names, datecount, .keep_all = TRUE) %>%
spread(check,datecount) %>%
summarise(`1` = mean(`1`,na.rm=T),
`2`=mean(`2`,na.rm=T),
`3`=mean(`3`,na.rm=T),
`4`=mean(`4`,na.rm=T),
`5`=mean(`5`,na.rm=T),
`6`=mean(`6`,na.rm=T),
`7`=mean(`7`,na.rm=T),
`8`=mean(`8`,na.rm=T),
`9` = mean(`9`,na.rm=T),
`10`=mean(`10`,na.rm=T),
`11`=mean(`11`,na.rm=T),
`12`=mean(`12`,na.rm=T),
`13`=mean(`13`,na.rm=T),
`14`=mean(`14`,na.rm=T),
`15`=mean(`15`,na.rm=T),
`16`=mean(`16`,na.rm=T))
phwh_subset<-phwh %>%
dplyr::select(stream_name,reservation,river_basin,latitude,longitude,date,substrate_metric_total,percent_best_types,per_boulder_slabs,per_boulder_256mm,per_bedrock,per_cobble,per_gravel,per_sand,per_silt,per_leaf_woody,per_detritus,per_clay_hardpan,per_muck,per_artificial,pool_metric_total,pool_depth_.cm.,bankfull_metric_total,average_bankfull_.m.,sinuosity,base_flow,date_last_rain,amt_last_rain,X._canopy_open,temp,dissolved_oxygen_mgl,ph,conductivity,fish_observed,fish_time_collecting_minutes,frogs_tadpoles_observed,salamanders_observed,salamander_time_collecting_minutes,aquatic_macros_observed,macro_time_collecting_minutes,mountain_dusky_larvae,mountain_dusky_juveniles,mountain_dusky_adults,northern_dusky_larvae,northern_dusky_juveniles,northern_dusky_adults,two_lined_larvae,two_lined_juveniles,two_lined_adults,long_tailed_larvae,long_tailed_juveniles,long_tailed_adults,northern_red_larvae,northern_red_juveniles,northern_red_adults,mole_larvae,mole_juveniles,mole_adults,four_toed_larvae,four_toed_juveniles,four_toed_adults,red_backed_juveniles,red_backed_adults,slimy_juveniles,slimy_adults,blacknose_dace,bluegill_sunfish,bluntnose_minnow,brindled_madtom,brook_stickleback,brook_trout,central_mudminnow,central_stoneroller_minnow,common_shiner,creek_chub,eastern_sand_darter,fantail_darter,fathead_minnow,golden_shiner,goldfish,grass_pickerel,greenside_darter,green_sunfish,johnny_darter,largemouth_bass,longear_sunfish,longnose_dace,mottled_sculpin,northern_hog_sucker,pumpkinseed_sunfish,rainbow_darter,rainbow_trout,redbelly_dace,redside_dace,river_chub,silverjaw_minnow,smallmouth_bass,spotfin_shiner,stonecat_madtom,striped_shiner,trout_perch,warmouth_sunfish,white_sucker,yellow_bullhead_catfish,unidentified_fish_fry,sessile_animals,aquatic_worms,sow_bugs,scuds,water_mites,damselfly_nymphs,alderfly_larvae,other_beetles,crayfish,dragonfly_nymphs,riffle_beetles,other_flies,midges,snails,clams,fishfly_larvae,water_penny_beetles,cranefly_larvae,ameletidae,arthropleidae,baetidae,baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,pseudironidae,siphlonuridae,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae,brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae,total_mayfly,total_stonefly,total_caddisfly,total_ept,hhei_score,hmfei_score,hmfei_narrative) %>% distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_abiotic<- phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,substrate_metric_total,percent_best_types,per_boulder_slabs,per_boulder_256mm,per_bedrock,per_cobble,per_gravel,per_sand,per_silt,per_leaf_woody,per_detritus,per_clay_hardpan,per_muck,per_artificial,pool_metric_total,pool_depth_.cm.,bankfull_metric_total,average_bankfull_.m.,sinuosity,base_flow,date_last_rain,amt_last_rain,X._canopy_open,temp,dissolved_oxygen_mgl,ph,conductivity) %>% distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_salamander<- phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,mountain_dusky_larvae,mountain_dusky_juveniles,mountain_dusky_adults,northern_dusky_larvae,northern_dusky_juveniles,northern_dusky_adults,two_lined_larvae,two_lined_juveniles,two_lined_adults,long_tailed_larvae,long_tailed_juveniles,long_tailed_adults,northern_red_larvae,northern_red_juveniles,northern_red_adults,mole_larvae,mole_juveniles,mole_adults,four_toed_larvae,four_toed_juveniles,four_toed_adults,red_backed_juveniles,red_backed_adults,slimy_juveniles,slimy_adults) %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_fish<- phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,blacknose_dace,bluegill_sunfish,bluntnose_minnow,brindled_madtom,brook_stickleback,brook_trout,central_mudminnow,central_stoneroller_minnow,common_shiner,creek_chub,eastern_sand_darter,fantail_darter,fathead_minnow,golden_shiner,goldfish,grass_pickerel,greenside_darter,green_sunfish,johnny_darter,largemouth_bass,longear_sunfish,longnose_dace,mottled_sculpin,northern_hog_sucker,pumpkinseed_sunfish,rainbow_darter,rainbow_trout,redbelly_dace,redside_dace,river_chub,silverjaw_minnow,smallmouth_bass,spotfin_shiner,stonecat_madtom,striped_shiner,trout_perch,warmouth_sunfish,white_sucker,yellow_bullhead_catfish,unidentified_fish_fry) %>%
replace(is.na(.),0) %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE) %>% dplyr::select(-stream_name,-date)
phwh_fish<-sapply(phwh_fish,as.numeric)
phwh_macro<- phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,sessile_animals,aquatic_worms,sow_bugs,scuds,water_mites,damselfly_nymphs,alderfly_larvae,other_beetles,crayfish,dragonfly_nymphs,riffle_beetles,other_flies,midges,snails,clams,fishfly_larvae,water_penny_beetles,cranefly_larvae,total_mayfly,total_stonefly,total_caddisfly) %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
replace(.=="rare", 1) %>% distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE) %>% dplyr::select(-stream_name,-date)
phwh_macro<-sapply(phwh_macro,as.numeric)
phwh_ept<-phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,ameletidae,arthropleidae,baetidae,baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,pseudironidae,siphlonuridae,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae,brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae) %>%
replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_e<-phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,ameletidae,arthropleidae,baetidae,baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,pseudironidae,siphlonuridae) %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_p<-phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae) %>%
replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_t<-phwh_subset %>%
dplyr::select(stream_name,date,brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae) %>%
replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
fish_sum<-phwh_subset$fish_observed
sala_sum<-phwh_subset$salamanders_observed
macro_sum<-phwh_subset$aquatic_macros_observed
frog_sum<-phwh_subset$frogs_tadpoles_observed
total_ept<-phwh_subset$total_ept
hhei<-phwh_subset$hhei_score
hmfei<-phwh_subset$hmfei_score
score<-phwh_subset$hmfei_narrative
reservation<-phwh_subset$reservation
stream_name<-phwh$stream_name
watershed<-phwh$watershed
reservationsum<-phwh_subset %>%
distinct(stream_name, .keep_all = TRUE) %>%
dplyr::select(stream_name,reservation) %>%
arrange(., stream_name)
reservationsum<-na.omit(reservationsum)
reservationcol<-as.numeric(factor(reservationsum$reservation))
scoresum<-phwh_subset %>%
distinct(stream_name, .keep_all = TRUE) %>%
dplyr::select(stream_name,hmfei_narrative) %>%
arrange(., stream_name)
scoresum<-na.omit(scoresum)
scorecol<-as.numeric(factor(scoresum$hmfei_narrative))
streambiotic<-cbind(phwh_salamander,phwh_fish,phwh_macro)
streambioticsum<-streambiotic %>%
group_by(stream_name) %>%
dplyr::select(!date) %>%
summarise_all(list(sum))
streambiotic_nosite<-streambioticsum[-1,-1] %>%
select_if(colSums(.) != 0)
taxatype<-c(rep("salamander",19),rep("fish",20),rep("macro",21))
sitechecks_surveyhistory_rename<-sitechecks_surveyhistory %>% rename(stream_name=stream_names)
sitechecks_surveyhistory_res<-merge(sitechecks_surveyhistory_rename,reservationsum,by="stream_name")
sitechecks_surveyhistory_ressum<-sitechecks_surveyhistory_res %>%
group_by(reservation)
greenlightsites<-read.csv("PHWH_greenlightsites.csv")
sitechecks_surveyhistory_res_suff<-sitechecks_surveyhistory_res[sitechecks_surveyhistory_res$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam , ]
phwh_subset_suff<-phwh_subset[phwh_subset$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam ,]
class(phwh_subset_suff$stream_name)<-"character"
phwh_subset_suff_env_detecthistory<-phwh_subset_suff %>%
dplyr::select(stream_name,reservation,river_basin,latitude,longitude,date,substrate_metric_total,percent_best_types,per_boulder_slabs,per_boulder_256mm,
per_bedrock,per_cobble,per_gravel,per_sand,per_silt,per_leaf_woody,per_detritus,per_clay_hardpan,per_muck,per_artificial,pool_metric_total,
pool_depth_.cm.,bankfull_metric_total,average_bankfull_.m.,sinuosity,X._canopy_open,temp,
dissolved_oxygen_mgl,ph,conductivity,hmfei_narrative) %>%
group_by(stream_name, reservation,date)
phwh_salamander_suff<-phwh_salamander[phwh_salamander$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam ,]
phwh_salamander_suff_detecthistory<-phwh_salamander_suff %>%
group_by(stream_name, date)
mtdusky<-phwh_salamander_suff_detecthistory$mountain_dusky_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$mountain_dusky_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$mountain_dusky_adults
nodusky<-phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_dusky_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_dusky_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_dusky_adults
twolined<-phwh_salamander_suff_detecthistory$two_lined_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$two_lined_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$two_lined_adults
longtail<-phwh_salamander_suff_detecthistory$long_tailed_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$long_tailed_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$long_tailed_adults
red<-phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_red_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_red_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$northern_red_adults
mole<-phwh_salamander_suff_detecthistory$mole_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$mole_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$mole_adults
fourtoed<-phwh_salamander_suff_detecthistory$four_toed_larvae+
phwh_salamander_suff_detecthistory$four_toed_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$four_toed_adults
redback<-phwh_salamander_suff_detecthistory$red_backed_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$red_backed_adults
slimy<-phwh_salamander_suff_detecthistory$slimy_juveniles+
phwh_salamander_suff_detecthistory$slimy_adults
stream_name<-phwh_salamander_suff_detecthistory$stream_name
date<-phwh_salamander_suff_detecthistory$date
phwh_salamander_suff_sum<-data.frame(stream_name,date,
mtdusky,nodusky,twolined,longtail,red,
mole,fourtoed,redback,slimy)
sitechecks<-phwh_salamander_suff_sum[,c(1,2)]
sitechecks$date<- as.Date(sitechecks$date , format = "%Y/%m/%d")
sitechecks$dayofyear<-format(sitechecks$date, "%j")
sitechecks$datecount<-as.numeric(sitechecks$date-min(sitechecks$date)+1)
sitechecks_surveyhistory<-sitechecks %>%
group_by(stream_name) %>%
mutate(check=as.character(dense_rank(date))) %>%
arrange(stream_name) %>%
distinct(stream_name, datecount, .keep_all = TRUE) %>%
spread(check,datecount) %>%
summarise(`1` = mean(`1`,na.rm=T),
`2`=mean(`2`,na.rm=T),
`3`=mean(`3`,na.rm=T),
`4`=mean(`4`,na.rm=T),
`5`=mean(`5`,na.rm=T),
`6`=mean(`6`,na.rm=T),
`7`=mean(`7`,na.rm=T),
`8`=mean(`8`,na.rm=T),
`9` = mean(`9`,na.rm=T),
`10`=mean(`10`,na.rm=T),
`11`=mean(`11`,na.rm=T),
`12`=mean(`12`,na.rm=T),
`13`=mean(`13`,na.rm=T),
`14`=mean(`14`,na.rm=T),
`15`=mean(`15`,na.rm=T),
`16`=mean(`16`,na.rm=T))
phwh_subset_biotic<-phwh %>%
dplyr::select(stream_name,date,mountain_dusky_larvae,mountain_dusky_juveniles,
mountain_dusky_adults,northern_dusky_larvae,northern_dusky_juveniles,northern_dusky_adults,two_lined_larvae,two_lined_juveniles,
two_lined_adults,long_tailed_larvae,long_tailed_juveniles,long_tailed_adults,northern_red_larvae,northern_red_juveniles,northern_red_adults,
mole_larvae,mole_juveniles,mole_adults,four_toed_larvae,four_toed_juveniles,four_toed_adults,red_backed_juveniles,red_backed_adults,
slimy_juveniles,slimy_adults,blacknose_dace,bluegill_sunfish,bluntnose_minnow,brindled_madtom,brook_stickleback,brook_trout,
central_mudminnow,central_stoneroller_minnow,common_shiner,creek_chub,eastern_sand_darter,fantail_darter,fathead_minnow,golden_shiner,
goldfish,grass_pickerel,greenside_darter,green_sunfish,johnny_darter,largemouth_bass,longear_sunfish,longnose_dace,mottled_sculpin,
northern_hog_sucker,pumpkinseed_sunfish,rainbow_darter,rainbow_trout,redbelly_dace,redside_dace,river_chub,silverjaw_minnow,smallmouth_bass,
spotfin_shiner,stonecat_madtom,striped_shiner,trout_perch,warmouth_sunfish,white_sucker,yellow_bullhead_catfish,unidentified_fish_fry,
sessile_animals,aquatic_worms,sow_bugs,scuds,water_mites,damselfly_nymphs,alderfly_larvae,other_beetles,crayfish,dragonfly_nymphs,
riffle_beetles,other_flies,midges,snails,clams,fishfly_larvae,water_penny_beetles,cranefly_larvae,ameletidae,arthropleidae,baetidae,
baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,
pseudironidae,siphlonuridae,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae,
brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,
limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_subset_biotic_2<-phwh_subset_biotic %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE) %>% dplyr::select(-stream_name,-date)
phwh_subset_biotic_3<-data.frame(sapply(phwh_subset_biotic_2,as.numeric))
phwh_subset_biotic_3$stream_name<-phwh_subset_biotic$stream_name
phwh_subset_biotic_3$date<-phwh_subset_biotic$date
streambiotic<-phwh_subset_biotic_3
streambioticsum<-streambiotic %>%
group_by(stream_name) %>%
dplyr::select(!date) %>%
summarise_all(list(sum))
streambioticsum_suff <-streambioticsum[streambioticsum$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam , ]
streambioticsum_suff_mtdusky<-streambioticsum_suff$mountain_dusky_larvae+
streambioticsum_suff$mountain_dusky_juveniles+
streambioticsum_suff$mountain_dusky_adults
streambioticsum_suff_nodusky<-streambioticsum_suff$northern_dusky_larvae+
streambioticsum_suff$northern_dusky_juveniles+
streambioticsum_suff$northern_dusky_adults
streambioticsum_suff_twolined<-streambioticsum_suff$two_lined_larvae+
streambioticsum_suff$two_lined_juveniles+
streambioticsum_suff$two_lined_adults
streambioticsum_suff_longtail<-streambioticsum_suff$long_tailed_larvae+
streambioticsum_suff$long_tailed_juveniles+
streambioticsum_suff$long_tailed_adults
streambioticsum_suff_red<-streambioticsum_suff$northern_red_larvae+
streambioticsum_suff$northern_red_juveniles+
streambioticsum_suff$northern_red_adults
streambioticsum_suff_mole<-streambioticsum_suff$mole_larvae+
streambioticsum_suff$mole_juveniles+
streambioticsum_suff$mole_adults
streambioticsum_suff_fourtoed<-streambioticsum_suff$four_toed_larvae+
streambioticsum_suff$four_toed_juveniles+
streambioticsum_suff$four_toed_adults
streambioticsum_suff_redback<-streambioticsum_suff$red_backed_juveniles+
streambioticsum_suff$red_backed_adults
streambioticsum_suff_slimy<-streambioticsum_suff$slimy_juveniles+
streambioticsum_suff$slimy_adults
streambioticsum_suff_sal<-data.frame(streambioticsum_suff_mtdusky,streambioticsum_suff_nodusky,streambioticsum_suff_twolined,
streambioticsum_suff_longtail,streambioticsum_suff_red,streambioticsum_suff_mole,
streambioticsum_suff_fourtoed,streambioticsum_suff_redback,streambioticsum_suff_slimy)
streambioticsum_suff_fish<-streambioticsum_suff[,27:65]
streambioticsum_suff_macro<-streambioticsum_suff[,67:126]
streambioticsum_suff_biotic<-data.frame(streambioticsum_suff_sal,streambioticsum_suff_fish,streambioticsum_suff_macro)
streambioticsum_suff_biotic_bin<- streambioticsum_suff_biotic %>% mutate_if(is.numeric, ~1 * (. >= 1))
streambiotic_suff<-phwh_subset_biotic_3[phwh_subset_biotic_3$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam , ]
streambiotic_suff_mtdusky<-streambiotic_suff$mountain_dusky_larvae+
streambiotic_suff$mountain_dusky_juveniles+
streambiotic_suff$mountain_dusky_adults
streambiotic_suff_nodusky<-streambiotic_suff$northern_dusky_larvae+
streambiotic_suff$northern_dusky_juveniles+
streambiotic_suff$northern_dusky_adults
streambiotic_suff_twolined<-streambiotic_suff$two_lined_larvae+
streambiotic_suff$two_lined_juveniles+
streambiotic_suff$two_lined_adults
streambiotic_suff_longtail<-streambiotic_suff$long_tailed_larvae+
streambiotic_suff$long_tailed_juveniles+
streambiotic_suff$long_tailed_adults
streambiotic_suff_red<-streambiotic_suff$northern_red_larvae+
streambiotic_suff$northern_red_juveniles+
streambiotic_suff$northern_red_adults
streambiotic_suff_mole<-streambiotic_suff$mole_larvae+
streambiotic_suff$mole_juveniles+
streambiotic_suff$mole_adults
streambiotic_suff_fourtoed<-streambiotic_suff$four_toed_larvae+
streambiotic_suff$four_toed_juveniles+
streambiotic_suff$four_toed_adults
streambiotic_suff_redback<-streambiotic_suff$red_backed_juveniles+
streambiotic_suff$red_backed_adults
streambiotic_suff_slimy<-streambiotic_suff$slimy_juveniles+
streambiotic_suff$slimy_adults
streambiotic_suff_sal<-data.frame(streambiotic_suff_mtdusky,streambiotic_suff_nodusky,streambiotic_suff_twolined,
streambiotic_suff_longtail,streambiotic_suff_red,streambiotic_suff_mole,
streambiotic_suff_fourtoed,streambiotic_suff_redback,streambiotic_suff_slimy)
streambiotic_suff_fish<-streambiotic_suff[,26:64]
streambiotic_suff_macro<-streambiotic_suff[,66:125]
streambiotic_suff_biotic<-data.frame(streambiotic_suff_sal,streambiotic_suff_fish,streambiotic_suff_macro)
streambiotic_suff_biotic_bin<- streambiotic_suff_biotic %>% mutate_if(is.numeric, ~1 * (. >= 1))
phwh_alltax_suff_env_detecthistory<-cbind(phwh_subset_suff_env_detecthistory,streambiotic_suff_biotic_bin)
phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date<- as.Date(phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date , format = "%Y/%m/%d")
phwh_alltax_suff_env_detecthistory$datecount<-as.numeric(phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date-min(phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date)+1)
phwh_alltax_suff_env_detecthistory$dayofyear<-format(phwh_alltax_suff_env_detecthistory$date, "%j")
phwh_alltax_suff_env_detecthistory<-phwh_alltax_suff_env_detecthistory %>%
dplyr::select(!c(latitude,longitude))
phwh_alltax_suff_env_detecthistory_firstcheck<- phwh_alltax_suff_env_detecthistory %>% group_by(stream_name) %>%
arrange(datecount) %>%
summarise_all(funs(list(.[1]))) %>%
unnest(cols = c(reservation, river_basin, date, substrate_metric_total, percent_best_types,
per_boulder_slabs, per_boulder_256mm, per_bedrock, per_cobble,
per_gravel, per_sand, per_silt, per_leaf_woody, per_detritus,
per_clay_hardpan, per_muck, per_artificial, pool_metric_total,
pool_depth_.cm., bankfull_metric_total, average_bankfull_.m.,
sinuosity, X._canopy_open, temp, dissolved_oxygen_mgl, ph,
conductivity, hmfei_narrative, streambiotic_suff_mtdusky,
streambiotic_suff_nodusky, streambiotic_suff_twolined, streambiotic_suff_longtail,
streambiotic_suff_red, streambiotic_suff_mole, streambiotic_suff_fourtoed,
streambiotic_suff_redback, streambiotic_suff_slimy, blacknose_dace,
bluegill_sunfish, bluntnose_minnow, brindled_madtom, brook_stickleback,
brook_trout, central_mudminnow, central_stoneroller_minnow,
common_shiner, creek_chub, eastern_sand_darter, fantail_darter,
fathead_minnow, golden_shiner, goldfish, grass_pickerel,
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phwhall_occobject$occ.covs
## substrate_metric_total percent_best_types per_boulder_slabs per_boulder_256mm per_bedrock per_cobble per_gravel per_sand per_silt per_leaf_woody per_detritus per_clay_hardpan per_muck per_artificial pool_metric_total pool_depth_.cm. bankfull_metric_total average_bankfull_.m. X._canopy_open
## [1,] 22.33333 9.000000 0.0000000 1.6666667 0.0000000 7.3333333 45.000000 30.666667 0.6666667 5.0000000 0.6666667 7.3333333 0.0000000 1.6666667 20.000000 51.066667 30.000000 5.243333 33.00000
## [2,] 27.50000 42.000000 0.0000000 2.0000000 35.5000000 4.5000000 29.000000 20.000000 1.0000000 5.5000000 0.0000000 2.5000000 0.0000000 0.0000000 27.500000 18.100000 17.500000 1.480000 15.50000
## [3,] 25.00000 36.000000 0.3333333 7.0000000 19.6666667 9.0000000 33.333333 13.000000 10.3333333 5.0000000 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.6666667 23.333333 36.800000 26.666667 3.753333 21.66667
## [4,] 21.33333 19.333333 2.3333333 5.0000000 0.0000000 12.0000000 40.000000 20.000000 2.6666667 2.0000000 0.0000000 9.0000000 1.0000000 6.0000000 23.333333 46.200000 28.333333 5.043333 21.33333
## [5,] 32.33333 66.333333 0.0000000 14.0000000 47.6666667 4.6666667 17.333333 9.000000 2.6666667 3.0000000 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.0000000 25.000000 14.066667 20.000000 1.993333 14.33333
## [6,] 22.50000 10.500000 0.0000000 0.5000000 0.0000000 10.0000000 36.000000 22.500000 3.5000000 10.0000000 1.5000000 15.5000000 0.5000000 0.0000000 20.000000 40.850000 22.500000 2.850000 22.00000
## [7,] 18.00000 7.000000 0.0000000 3.6666667 0.6666667 2.6666667 15.333333 26.666667 23.3333333 2.0000000 0.3333333 17.6666667 7.0000000 0.0000000 20.000000 15.333333 25.000000 3.446667 17.00000
## [8,] 28.00000 24.666667 0.0000000 8.0000000 10.0000000 6.6666667 31.666667 20.000000 4.6666667 5.6666667 0.0000000 13.3333333 0.0000000 0.0000000 23.333333 17.000000 18.333333 1.566667 15.66667
## [9,] 23.53333 14.000000 0.0000000 1.6666667 3.2000000 9.8666667 44.266667 23.600000 1.7333333 6.6000000 0.4666667 5.9333333 0.6666667 0.0000000 23.666667 30.040000 27.666667 4.108000 18.73333
## [10,] 21.68750 11.312500 0.0312500 1.2187500 0.0000000 10.0625000 36.937500 27.187500 5.4062500 3.5312500 0.6875000 14.0625000 0.8750000 0.0000000 23.125000 32.393750 27.187500 4.171875 22.56250
## [11,] 21.50000 15.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 15.0000000 42.500000 26.000000 1.5000000 2.5000000 0.5000000 12.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 47.750000 22.500000 2.680000 18.00000
## [12,] 30.33333 47.000000 2.6666667 2.0000000 20.0000000 22.3333333 33.666667 13.000000 1.0000000 3.3333333 0.0000000 2.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 33.866667 26.666667 3.966667 26.00000
## [13,] 22.66667 29.666667 4.0000000 3.3333333 3.6666667 18.6666667 36.666667 10.000000 5.0000000 6.0000000 0.0000000 12.6666667 0.0000000 0.0000000 26.666667 18.166667 20.000000 1.743333 17.00000
## [14,] 36.00000 65.000000 14.2500000 3.2500000 23.0000000 24.5000000 16.750000 8.750000 2.5000000 5.5000000 0.0000000 1.5000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 25.200000 21.250000 2.575000 25.75000
## [15,] 23.33333 23.666667 1.0000000 3.3333333 0.0000000 19.3333333 27.333333 19.333333 6.3333333 8.6666667 0.0000000 14.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 37.833333 23.333333 2.866667 21.66667
## [16,] 15.00000 7.000000 0.3333333 0.6666667 0.0000000 6.0000000 14.666667 12.333333 9.6666667 4.6666667 0.0000000 51.6666667 0.0000000 0.0000000 16.666667 11.233333 20.000000 2.086667 21.33333
## [17,] 28.50000 45.750000 4.2500000 3.0000000 17.0000000 21.5000000 24.250000 10.750000 7.2500000 5.0000000 0.0000000 6.5000000 0.5000000 0.0000000 21.250000 27.825000 26.250000 4.090000 15.25000
## [18,] 32.33333 51.333333 10.3333333 3.3333333 17.3333333 20.3333333 31.000000 11.000000 3.3333333 2.6666667 0.0000000 0.6666667 0.0000000 0.0000000 23.333333 19.133333 25.000000 3.500000 14.50000
## [19,] 27.00000 33.500000 5.0000000 1.3333333 4.8333333 22.3333333 41.333333 15.333333 3.3333333 2.3333333 0.0000000 4.1666667 0.0000000 0.0000000 23.333333 28.433333 25.000000 3.293333 18.66667
## [20,] 27.00000 31.666667 6.3333333 1.0000000 6.6666667 17.6666667 41.666667 15.333333 2.3333333 3.3333333 0.3333333 5.3333333 0.0000000 0.0000000 23.333333 32.033333 20.000000 2.623333 16.00000
## [21,] 18.75000 0.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 30.000000 43.750000 11.0000000 4.2500000 0.2500000 10.7500000 0.0000000 0.0000000 22.500000 34.500000 18.750000 1.970000 41.25000
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## [23,] 20.66667 19.000000 1.0000000 3.0000000 7.6666667 7.3333333 38.666667 22.666667 4.6666667 2.0000000 0.0000000 12.6666667 0.3333333 0.0000000 28.333333 23.300000 23.333333 3.663333 17.33333
## [24,] 22.00000 14.500000 0.0000000 0.7500000 0.0000000 13.7500000 32.750000 23.750000 10.0000000 3.5000000 0.0000000 15.2500000 0.2500000 0.0000000 22.500000 50.275000 22.500000 3.212500 22.00000
## [25,] 24.00000 10.000000 0.0000000 1.3333333 0.0000000 8.6666667 41.666667 26.666667 2.6666667 6.0000000 0.0000000 13.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 69.766667 25.000000 3.453333 18.00000
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## [27,] 28.00000 37.666667 1.0000000 4.0000000 18.0000000 14.6666667 43.333333 14.000000 1.0000000 1.6666667 0.0000000 2.3333333 0.0000000 0.0000000 23.333333 59.133333 23.333333 3.243333 26.00000
## [28,] 21.33333 5.333333 0.0000000 0.3333333 0.0000000 5.0000000 45.000000 31.666667 6.6666667 3.6666667 0.0000000 7.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 38.966667 20.000000 2.370000 17.00000
## [29,] 15.00000 1.000000 0.0000000 0.3333333 0.0000000 0.6666667 20.000000 39.333333 8.3333333 3.0000000 0.6666667 26.6666667 1.0000000 0.0000000 18.333333 29.766667 18.333333 1.766667 18.00000
## [30,] 24.00000 24.000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 23.0000000 40.000000 22.000000 1.6666667 4.0000000 0.0000000 8.3333333 0.0000000 0.0000000 21.666667 28.100000 21.666667 2.670000 48.33333
## [31,] 19.00000 13.250000 0.0000000 1.2500000 0.0000000 12.0000000 45.000000 18.000000 1.2500000 1.5000000 0.0000000 21.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 35.700000 20.000000 2.350000 17.50000
## [32,] 27.33333 36.000000 1.3333333 3.6666667 16.6666667 14.3333333 36.333333 18.666667 2.3333333 5.0000000 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.0000000 21.666667 10.300000 18.333333 1.866667 23.00000
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## [37,] 21.50000 10.000000 0.0000000 3.7500000 0.0000000 6.2500000 32.000000 37.250000 5.7500000 4.5000000 0.0000000 10.5000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 27.875000 20.000000 2.305000 20.00000
## [38,] 20.00000 10.500000 0.0000000 1.5000000 0.0000000 9.0000000 40.666667 24.666667 2.0000000 4.0000000 0.1666667 18.0000000 0.0000000 0.0000000 23.333333 21.000000 20.000000 2.373333 18.66667
## [39,] 30.50000 60.625000 8.7500000 3.2500000 28.7500000 19.8750000 28.000000 7.000000 1.1250000 2.7500000 0.5000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 26.250000 23.925000 27.500000 3.920000 18.75000
## [40,] 31.25000 49.500000 4.7500000 6.2500000 23.5000000 15.0000000 33.250000 10.000000 2.8750000 2.8750000 0.1250000 1.3750000 0.0000000 0.0000000 26.250000 32.350000 28.750000 4.205000 17.75000
## [41,] 34.25000 75.750000 4.7500000 5.0000000 55.5000000 10.5000000 15.750000 4.750000 0.3750000 2.8750000 0.0000000 0.5000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 14.375000 22.500000 2.915000 17.75000
## [42,] 33.25000 56.000000 4.7500000 4.7500000 31.2500000 21.2500000 26.000000 6.250000 1.7500000 1.1250000 0.1250000 2.7500000 0.0000000 0.0000000 27.500000 22.975000 22.500000 2.872500 18.50000
## [43,] 25.40000 28.600000 0.0000000 4.0000000 0.0000000 24.6000000 40.600000 21.000000 1.6000000 3.4000000 0.2000000 4.6000000 0.0000000 0.0000000 22.000000 43.980000 27.000000 4.478000 34.80000
## [44,] 19.33333 18.333333 0.3333333 11.6666667 0.0000000 6.3333333 21.666667 35.000000 1.0000000 7.6666667 0.3333333 16.0000000 0.0000000 0.0000000 15.000000 8.300000 16.666667 1.390000 17.33333
## [45,] 19.00000 9.333333 0.0000000 5.0000000 0.0000000 4.3333333 21.000000 30.666667 3.3333333 5.3333333 0.0000000 30.3333333 0.0000000 0.0000000 26.666667 18.400000 8.333333 1.060000 19.66667
## [46,] 29.62500 45.875000 1.3750000 11.1250000 10.5000000 22.8750000 33.625000 14.000000 1.1875000 3.3125000 0.1250000 1.8125000 0.0625000 0.0000000 25.625000 22.300000 26.250000 4.570000 28.50000
## [47,] 38.14286 80.214286 0.0000000 9.0000000 66.2857143 4.9285714 5.571429 7.857143 2.2142857 3.0000000 0.4285714 0.1428571 0.5714286 0.0000000 25.000000 20.642857 24.285714 3.270000 20.00000
## [48,] 21.66667 18.666667 1.6666667 4.3333333 0.0000000 13.0000000 25.000000 36.666667 0.6666667 6.3333333 1.6666667 10.6666667 0.0000000 0.0000000 11.666667 4.526667 15.000000 1.273333 15.33333
## [49,] 19.33333 6.000000 0.0000000 2.5000000 0.0000000 3.5000000 29.000000 34.000000 1.3333333 3.6666667 1.0000000 25.0000000 0.0000000 0.0000000 18.333333 8.733333 15.000000 1.313333 24.66667
## [50,] 18.50000 9.250000 0.0000000 4.5000000 0.0000000 4.7500000 25.750000 27.500000 4.0000000 4.0000000 0.7500000 22.0000000 0.0000000 0.0000000 18.750000 24.975000 21.250000 2.467500 20.75000
## [51,] 19.66667 5.666667 0.0000000 1.3333333 0.0000000 4.3333333 25.666667 44.666667 3.3333333 3.3333333 2.3333333 15.0000000 0.0000000 0.0000000 21.666667 23.066667 20.000000 2.020000 17.66667
## [52,] 10.75000 4.000000 0.0000000 2.5000000 0.0000000 1.5250000 6.750000 23.875000 2.4750000 6.6250000 4.2500000 52.0000000 0.0000000 0.0000000 11.250000 6.300000 10.000000 1.107500 19.00000
## [53,] 15.00000 11.250000 0.7500000 3.7500000 0.0000000 6.7500000 10.500000 32.000000 1.7500000 6.2500000 2.7500000 35.5000000 0.0000000 0.0000000 8.750000 5.475000 12.500000 1.080000 17.75000
## [54,] 22.66667 28.000000 1.3333333 9.0000000 2.6666667 15.0000000 22.333333 42.333333 0.5000000 2.5000000 2.5000000 1.8333333 0.0000000 0.0000000 20.000000 13.233333 11.666667 1.226667 19.33333
## [55,] 22.33333 12.333333 0.1666667 0.5000000 0.0000000 11.6666667 41.000000 24.666667 2.0000000 4.3333333 0.6666667 14.6666667 0.3333333 0.0000000 20.000000 43.000000 28.333333 3.743333 21.00000
## [56,] 29.00000 47.666667 7.0000000 6.3333333 1.3333333 33.0000000 26.000000 16.000000 1.0000000 3.6666667 0.3333333 5.3333333 0.0000000 0.0000000 21.666667 30.900000 18.333333 1.420000 15.33333
## [57,] 26.33333 32.333333 1.3333333 4.0000000 13.6666667 13.3333333 19.000000 29.666667 3.3333333 6.3333333 2.6666667 6.6666667 0.0000000 0.0000000 11.666667 7.333333 13.333333 1.323333 20.33333
## [58,] 18.00000 8.666667 0.0000000 0.3333333 0.0000000 8.3333333 28.000000 21.666667 2.6666667 5.3333333 1.3333333 32.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 27.500000 18.333333 2.113333 43.33333
## [59,] 19.33333 2.666667 0.0000000 0.3333333 0.0000000 2.3333333 32.666667 32.666667 3.0000000 3.3333333 0.0000000 25.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 39.333333 21.666667 2.736667 19.33333
## [60,] 19.00000 6.300000 0.0000000 0.7000000 0.0000000 5.6000000 24.800000 44.800000 3.4000000 4.4000000 0.3000000 15.4000000 0.6000000 0.0000000 23.000000 20.840000 16.000000 1.740000 19.40000
## [61,] 22.66667 17.666667 0.6666667 4.3333333 0.0000000 12.6666667 30.000000 23.333333 5.0000000 5.0000000 1.6666667 17.3333333 0.0000000 0.0000000 15.000000 8.796667 18.333333 1.563333 17.66667
## [62,] 20.00000 2.666667 0.0000000 1.0000000 0.0000000 1.6666667 27.000000 27.666667 7.3333333 9.6666667 0.0000000 25.6666667 0.0000000 0.0000000 21.666667 10.800000 11.666667 1.026667 15.33333
## [63,] 20.33333 9.666667 0.0000000 0.6666667 0.0000000 9.0000000 29.666667 28.333333 5.0000000 2.0000000 0.3333333 22.6666667 2.3333333 0.0000000 23.333333 17.133333 16.666667 1.843333 16.33333
## [64,] 22.33333 4.666667 0.0000000 1.0000000 0.0000000 3.6666667 41.666667 28.333333 2.6666667 6.3333333 0.0000000 16.0000000 0.3333333 0.0000000 20.000000 34.166667 21.666667 3.076667 15.33333
## [65,] 20.66667 22.000000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 14.0000000 29.333333 30.000000 3.6666667 1.3333333 0.0000000 12.0000000 0.0000000 0.0000000 26.666667 18.233333 18.333333 1.690000 26.00000
## [66,] 19.50000 13.500000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 5.5000000 22.500000 25.000000 2.5000000 3.0000000 0.0000000 32.0000000 1.5000000 0.0000000 27.500000 23.150000 12.500000 1.240000 22.00000
## [67,] 22.33333 17.000000 0.0000000 7.6666667 0.0000000 9.3333333 30.333333 32.333333 5.3333333 4.0000000 1.0000000 10.0000000 0.0000000 0.0000000 18.333333 10.100000 18.333333 1.840000 16.00000
## [68,] 22.00000 17.333333 0.3333333 3.0000000 0.0000000 14.0000000 39.000000 31.000000 1.6666667 3.0000000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 42.733333 26.666667 3.540000 18.66667
## [69,] 22.33333 14.333333 0.6666667 2.3333333 0.0000000 11.3333333 43.333333 32.666667 1.3333333 2.6666667 0.0000000 5.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 17.733333 20.000000 2.300000 18.00000
## [70,] 23.00000 4.500000 0.0000000 1.5000000 0.0000000 3.0000000 38.000000 33.000000 4.0000000 9.0000000 2.5000000 8.5000000 0.5000000 0.0000000 20.000000 13.800000 15.000000 1.330000 17.00000
## [71,] 19.00000 2.500000 0.0000000 0.5000000 0.0000000 2.0000000 30.000000 32.500000 3.5000000 2.5000000 0.5000000 28.5000000 0.0000000 0.0000000 30.000000 28.450000 15.000000 1.335000 32.50000
## [72,] 17.50000 2.500000 0.0000000 0.5000000 0.0000000 2.0000000 24.500000 37.000000 2.0000000 4.0000000 0.5000000 29.5000000 0.0000000 0.0000000 27.500000 22.650000 17.500000 1.915000 36.50000
## [73,] 22.00000 12.000000 0.0000000 1.5000000 0.0000000 10.5000000 44.000000 28.000000 2.5000000 5.5000000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 52.800000 30.000000 5.950000 37.50000
## [74,] 21.33333 1.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 37.333333 33.000000 5.6666667 4.6666667 1.6666667 9.6666667 1.3333333 0.0000000 21.666667 31.666667 21.666667 2.933333 31.00000
## [75,] 31.66667 56.333333 0.0000000 1.6666667 43.0000000 11.6666667 28.333333 11.666667 0.6666667 3.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 13.800000 26.666667 4.233333 21.66667
## [76,] 22.66667 33.666667 0.0000000 4.0000000 15.6666667 14.0000000 28.333333 23.666667 2.6666667 8.3333333 0.0000000 3.3333333 0.0000000 0.0000000 20.000000 51.100000 28.333333 4.330000 19.00000
## [77,] 13.66667 1.000000 0.0000000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 20.666667 15.000000 7.3333333 12.0000000 1.0000000 41.6666667 1.3333333 0.0000000 23.333333 14.466667 16.666667 1.346667 20.33333
## [78,] 24.50000 21.500000 0.0000000 1.0000000 0.0000000 20.5000000 45.000000 22.500000 1.5000000 0.5000000 0.0000000 9.0000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 34.900000 15.000000 1.300000 56.50000
## [79,] 31.75000 67.750000 0.0000000 1.2500000 63.5000000 3.0000000 14.750000 11.250000 2.7500000 2.5000000 0.2500000 0.7500000 0.0000000 0.0000000 25.000000 18.175000 26.250000 3.812500 18.00000
## [80,] 23.00000 12.375000 0.0000000 1.1250000 3.2500000 8.0000000 41.250000 35.250000 1.2500000 4.3750000 0.5000000 5.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 31.225000 25.000000 3.317500 23.25000
## [81,] 21.66667 13.333333 0.3333333 0.3333333 0.0000000 12.6666667 46.333333 24.666667 1.6666667 3.0000000 0.0000000 11.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 17.700000 21.666667 2.933333 21.00000
## [82,] 31.66667 42.000000 1.3333333 3.0000000 22.6666667 15.0000000 35.333333 13.333333 1.3333333 5.3333333 0.3333333 2.3333333 0.0000000 0.0000000 30.000000 26.600000 25.000000 4.560000 22.00000
## [83,] 28.33333 52.666667 8.0000000 3.0000000 12.0000000 29.6666667 34.000000 11.333333 0.6666667 1.3333333 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 63.600000 30.000000 4.560000 34.00000
## [84,] 22.33333 14.666667 0.6666667 0.3333333 1.6666667 12.0000000 43.666667 25.000000 0.6666667 5.0000000 0.6666667 10.3333333 0.0000000 0.0000000 26.666667 21.033333 23.333333 3.053333 20.33333
## [85,] 34.66667 60.833333 0.0000000 0.8333333 56.6666667 3.3333333 19.000000 11.666667 1.1666667 2.8333333 0.1666667 4.3333333 0.0000000 0.0000000 11.666667 6.233333 18.333333 1.940000 16.66667
## [86,] 27.00000 44.875000 0.0000000 12.5000000 8.3750000 24.0000000 32.375000 13.625000 2.8750000 1.1250000 0.3750000 4.0000000 0.0000000 0.7500000 23.750000 31.437500 27.500000 4.882500 51.25000
## [87,] 23.00000 25.000000 0.6666667 3.0000000 13.0000000 8.3333333 45.000000 19.333333 1.3333333 4.0000000 1.0000000 4.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 14.800000 18.333333 2.013333 16.66667
## [88,] 21.66667 16.000000 0.0000000 1.3333333 0.0000000 14.6666667 37.333333 26.666667 3.6666667 2.6666667 0.0000000 13.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 50.200000 21.666667 2.653333 63.33333
## [89,] 21.66667 16.000000 0.0000000 2.0000000 0.0000000 14.0000000 40.000000 25.666667 3.3333333 1.3333333 0.6666667 13.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 44.533333 23.333333 2.983333 40.00000
## [90,] 26.33333 33.666667 4.0000000 3.6666667 0.0000000 26.0000000 40.333333 18.666667 3.6666667 1.0000000 0.3333333 2.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 17.733333 26.666667 3.853333 16.00000
## [91,] 28.50000 34.500000 2.5000000 5.5000000 0.7500000 25.7500000 41.250000 13.750000 2.5000000 2.0000000 0.2500000 5.5000000 0.2500000 0.0000000 20.000000 48.525000 27.500000 4.480000 36.25000
## [92,] 33.25000 71.500000 2.2500000 7.5000000 51.2500000 10.5000000 19.250000 5.500000 2.1250000 1.6250000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 26.250000 17.100000 26.250000 3.697500 20.75000
## [93,] 32.66667 61.000000 1.6666667 4.3333333 45.0000000 10.0000000 26.000000 6.666667 1.6666667 1.6666667 0.3333333 2.6666667 0.0000000 0.0000000 28.333333 19.566667 23.333333 3.073333 14.33333
## [94,] 24.33333 33.333333 2.3333333 9.0000000 0.0000000 22.0000000 37.000000 19.333333 1.3333333 2.5000000 0.1666667 6.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 24.466667 25.000000 3.220000 16.00000
## [95,] 32.25000 58.000000 6.2500000 2.5000000 37.2500000 9.7500000 26.000000 10.750000 2.5000000 4.2500000 0.7500000 0.0000000 0.0000000 0.2500000 28.750000 22.975000 26.250000 4.160000 21.25000
## [96,] 22.33333 5.000000 0.0000000 0.6666667 0.0000000 4.3333333 37.333333 30.000000 7.3333333 2.0000000 0.6666667 16.3333333 1.3333333 0.0000000 20.000000 54.233333 23.333333 3.600000 23.00000
## [97,] 18.00000 5.000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 5.0000000 43.500000 22.500000 6.5000000 4.0000000 2.5000000 17.5000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 23.250000 20.000000 1.865000 19.50000
## [98,] 35.00000 79.000000 0.6666667 2.6666667 70.6666667 5.0000000 11.666667 5.000000 0.8333333 0.8333333 0.1666667 0.1666667 0.0000000 2.3333333 23.333333 28.300000 28.333333 5.533333 31.00000
## [99,] 29.33333 45.666667 0.0000000 2.6666667 36.0000000 7.0000000 36.333333 14.000000 1.1666667 0.8333333 0.1666667 0.1666667 0.0000000 1.6666667 26.666667 15.633333 18.333333 1.833333 43.33333
## [100,] 25.33333 29.666667 1.6666667 2.3333333 16.6666667 9.0000000 41.666667 17.333333 2.0000000 2.6666667 0.0000000 6.6666667 0.0000000 0.0000000 11.666667 12.333333 21.666667 2.553333 16.00000
## [101,] 25.00000 14.000000 0.0000000 0.6666667 5.3333333 10.0000000 50.000000 17.000000 4.0000000 4.0000000 0.0000000 8.0000000 0.0000000 0.0000000 26.666667 20.666667 25.000000 3.520000 19.00000
## [102,] 20.66667 3.333333 0.0000000 1.6666667 0.0000000 1.6666667 36.000000 38.333333 3.3333333 2.6666667 1.3333333 15.0000000 0.0000000 0.0000000 23.333333 47.333333 25.000000 3.676667 53.33333
## [103,] 19.75000 3.250000 0.0000000 0.1250000 0.0000000 3.1250000 18.750000 63.250000 8.2500000 2.7500000 0.0000000 3.7500000 0.0000000 0.0000000 27.500000 20.000000 20.000000 2.047500 36.25000
## [104,] 27.00000 38.000000 3.3333333 5.0000000 1.3333333 26.6666667 35.000000 15.333333 4.0000000 2.0000000 2.0000000 7.6666667 0.0000000 0.0000000 20.000000 40.666667 23.333333 2.910000 23.33333
## [105,] 25.33333 60.000000 2.3333333 4.3333333 39.3333333 14.0000000 27.666667 8.666667 2.3333333 3.6666667 0.3333333 0.0000000 0.0000000 0.0000000 28.333333 24.700000 21.666667 2.756667 25.33333
## [106,] 23.75000 15.000000 0.7500000 0.7500000 0.0000000 13.5000000 44.500000 21.250000 5.7500000 4.7500000 0.7500000 8.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 46.375000 21.250000 2.735000 28.75000
## [107,] 28.25000 47.750000 3.2500000 6.5000000 0.0000000 38.0000000 33.250000 10.000000 2.3750000 2.6250000 0.0000000 4.0000000 0.0000000 0.0000000 22.500000 35.000000 30.000000 6.555000 28.75000
## [108,] 29.80000 50.800000 10.2000000 3.2000000 7.4000000 30.0000000 27.000000 13.200000 4.4000000 2.0000000 0.0000000 2.6000000 0.0000000 0.0000000 24.000000 21.920000 24.000000 3.198000 18.20000
## [109,] 20.66667 15.333333 0.0000000 0.0000000 0.0000000 15.3333333 41.666667 26.666667 3.6666667 3.3333333 0.0000000 9.3333333 0.0000000 0.0000000 23.000000 41.333333 21.666667 2.426667 21.66667
## [110,] 22.00000 11.666667 0.0000000 1.3333333 0.0000000 10.3333333 37.666667 37.666667 2.6666667 4.3333333 0.3333333 5.0000000 0.6666667 0.0000000 20.000000 47.266667 26.666667 3.636667 31.66667
## [111,] 23.33333 13.333333 0.0000000 0.3333333 0.0000000 13.0000000 41.000000 36.666667 1.0000000 2.6666667 0.0000000 4.6666667 0.6666667 0.0000000 28.333333 26.366667 23.333333 3.230000 21.66667
## [112,] 33.50000 73.250000 0.0000000 1.0000000 70.5000000 1.7500000 16.500000 8.500000 0.7500000 0.5000000 0.2500000 0.2500000 0.0000000 0.0000000 27.500000 21.000000 25.000000 3.530000 40.00000
## [113,] 15.33333 10.666667 0.0000000 3.3333333 0.3333333 7.0000000 23.333333 19.333333 4.0000000 10.6666667 0.6666667 31.3333333 0.0000000 0.0000000 6.666667 4.666667 16.666667 1.580000 20.00000
## [114,] 22.00000 13.666667 0.0000000 6.0000000 0.0000000 7.6666667 47.000000 20.333333 6.0000000 3.3333333 2.0000000 7.6666667 0.0000000 0.0000000 18.333333 13.100000 21.666667 2.226667 19.00000
## [115,] 22.00000 25.500000 0.0000000 12.0000000 0.0000000 13.5000000 29.000000 9.500000 1.0000000 7.0000000 0.5000000 27.5000000 0.0000000 0.0000000 15.000000 8.000000 25.000000 3.065000 18.00000
## [116,] 26.00000 37.500000 8.7500000 4.0000000 13.7500000 11.0000000 26.500000 14.000000 1.5000000 8.0000000 10.0000000 2.7500000 0.0000000 0.0000000 10.000000 6.250000 21.250000 2.437500 18.00000
## [117,] 35.75000 80.750000 9.0000000 4.5000000 60.0000000 7.2500000 11.250000 4.750000 2.7500000 5.7500000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 25.000000 23.000000 26.250000 3.922500 25.25000
## [118,] 24.80000 46.000000 4.0000000 4.6000000 26.0000000 11.4000000 17.000000 10.800000 11.2000000 3.0000000 0.2000000 12.0000000 0.0000000 0.0000000 20.000000 16.500000 22.000000 2.752000 14.20000
## [119,] 26.33333 57.000000 18.3333333 14.0000000 1.3333333 23.3333333 26.000000 9.666667 1.0000000 1.3333333 0.0000000 1.6666667 0.0000000 0.0000000 26.666667 22.000000 26.666667 3.746667 17.00000
## [120,] 22.00000 33.333333 3.0000000 9.0000000 2.3333333 19.0000000 33.333333 18.333333 1.0000000 3.0000000 0.0000000 12.6666667 0.0000000 0.0000000 26.666667 20.333333 21.666667 2.656667 16.33333
## [121,] 31.25000 64.000000 10.7500000 16.0000000 3.5000000 29.2500000 23.250000 10.750000 1.2500000 2.2500000 0.2500000 2.7500000 0.0000000 0.0000000 26.250000 20.250000 30.000000 4.695000 16.50000
## [122,] 31.33333 55.666667 10.6666667 4.3333333 14.0000000 26.6666667 33.666667 8.333333 1.3333333 3.3333333 0.0000000 0.3333333 0.0000000 0.0000000 26.666667 25.333333 26.666667 3.876667 16.00000
## [123,] 32.66667 64.000000 0.0000000 2.3333333 57.6666667 3.3333333 15.000000 6.666667 4.3333333 2.3333333 0.0000000 3.3333333 3.3333333 1.6666667 25.000000 26.333333 23.333333 3.820000 17.00000
## [124,] 28.00000 39.666667 3.6666667 6.6666667 14.6666667 14.6666667 37.000000 16.000000 3.3333333 2.6666667 0.0000000 1.3333333 0.0000000 0.0000000 21.666667 31.333333 23.333333 3.183333 20.33333
## [125,] 11.66667 1.666667 0.0000000 0.3333333 0.0000000 1.3333333 20.000000 8.666667 15.6666667 3.6666667 0.0000000 37.0000000 13.3333333 0.0000000 18.333333 17.100000 16.666667 1.950000 31.00000
## [126,] 23.00000 15.333333 0.0000000 2.0000000 0.0000000 13.3333333 36.666667 21.666667 7.6666667 2.6666667 1.0000000 13.3333333 0.0000000 1.6666667 23.333333 27.333333 18.333333 1.976667 38.66667
## [127,] 26.20000 29.750000 0.2000000 3.4000000 2.2000000 18.0000000 33.000000 16.000000 1.8000000 1.6000000 0.0000000 3.8000000 0.0000000 0.0000000 22.000000 45.200000 28.000000 4.720000 22.25000
## [128,] 29.42857 42.857143 4.0000000 10.5714286 3.8571429 24.4285714 30.142857 15.571429 3.4285714 1.8571429 0.1428571 6.1428571 0.0000000 0.0000000 23.571429 33.571429 26.428571 4.330000 19.71429
## [129,] 24.00000 34.000000 1.0000000 9.6666667 0.0000000 23.3333333 33.333333 23.666667 4.0000000 1.3333333 0.0000000 7.0000000 0.0000000 0.0000000 26.666667 31.000000 25.000000 3.486667 23.33333
## [130,] 24.50000 27.250000 0.0000000 5.5000000 0.0000000 21.7500000 35.500000 25.750000 3.2500000 4.7500000 0.0000000 3.5000000 0.0000000 0.0000000 23.750000 25.666667 27.500000 4.352500 18.33333
## [131,] 23.25000 37.500000 2.2500000 12.2500000 2.2500000 20.7500000 39.000000 14.750000 4.5000000 0.3750000 0.1250000 1.5000000 0.2500000 2.0000000 20.000000 51.500000 15.000000 1.545000 98.75000
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## [134,] 25.33333 22.666667 0.0000000 1.0000000 13.3333333 8.3333333 34.000000 26.000000 4.6666667 2.3333333 0.6666667 9.6666667 0.0000000 0.0000000 23.333333 34.500000 23.333333 3.053333 23.33333
## [135,] 24.40000 27.800000 0.4000000 8.0000000 2.2000000 17.2000000 46.000000 19.800000 0.6000000 1.4000000 0.0000000 2.0000000 0.0000000 2.4000000 25.000000 29.880000 23.000000 3.344000 18.00000
## [136,] 26.60000 25.200000 2.4000000 2.0000000 1.6000000 19.2000000 46.600000 17.200000 1.0000000 2.4000000 0.2000000 7.4000000 0.0000000 0.0000000 22.000000 33.520000 22.000000 2.748000 32.00000
## [137,] 29.00000 42.333333 4.3333333 5.0000000 9.6666667 23.3333333 34.333333 13.333333 0.6666667 6.0000000 0.0000000 3.3333333 0.0000000 0.0000000 25.000000 30.933333 26.666667 3.626667 30.66667
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##
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##
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## + per_cobble 1 565.86 2.5359 0.005 **
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## + per_bedrock 1 566.73 1.6741 0.030 *
## + per_silt 1 566.66 1.7438 0.040 *
## + per_artificial 1 566.65 1.7454 0.075 .
## + per_boulder_256mm 1 566.87 1.5294 0.075 .
## + per_boulder_slabs 1 566.92 1.4825 0.075 .
## + per_muck 1 567.22 1.1831 0.240
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm.
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - pool_depth_.cm. 1 566.41 4.1322 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
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## + percent_best_types 1 563.17 3.0763 0.005 **
## + bankfull_metric_total 1 563.54 2.7100 0.005 **
## + average_bankfull_.m. 1 563.75 2.5019 0.005 **
## + per_clay_hardpan 1 563.90 2.3513 0.005 **
## + per_leaf_woody 1 564.08 2.1727 0.005 **
## + per_cobble 1 563.74 2.5100 0.010 **
## + pool_metric_total 1 564.21 2.0439 0.010 **
## + per_bedrock 1 564.23 2.0277 0.010 **
## + per_silt 1 564.41 1.8427 0.030 *
## + per_detritus 1 564.22 2.0324 0.045 *
## + per_boulder_slabs 1 564.70 1.5532 0.075 .
## + per_artificial 1 564.64 1.6183 0.105
## + per_boulder_256mm 1 564.97 1.2931 0.125
## + X._canopy_open 1 564.97 1.2863 0.215
## + per_muck 1 564.94 1.3240 0.225
## + per_gravel 1 565.57 0.6971 0.890
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - per_sand 1 564.28 3.6289 0.005 **
## - pool_depth_.cm. 1 565.08 4.4344 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
## + per_cobble 1 561.91 2.6569 0.005 **
## + percent_best_types 1 562.07 2.4969 0.005 **
## + per_leaf_woody 1 562.65 1.9312 0.010 **
## + per_silt 1 562.65 1.9248 0.010 **
## + pool_metric_total 1 562.79 1.7932 0.010 **
## + per_clay_hardpan 1 562.73 1.8472 0.020 *
## + bankfull_metric_total 1 563.23 1.3598 0.075 .
## + average_bankfull_.m. 1 563.23 1.3592 0.075 .
## + per_detritus 1 562.87 1.7137 0.085 .
## + per_boulder_256mm 1 563.18 1.4046 0.090 .
## + per_artificial 1 563.10 1.4892 0.135
## + X._canopy_open 1 563.22 1.3697 0.135
## + per_muck 1 563.27 1.3181 0.195
## + per_boulder_slabs 1 563.52 1.0785 0.310
## + per_gravel 1 563.68 0.9192 0.540
## + per_bedrock 1 563.81 0.7918 0.790
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - per_cobble 1 562.62 2.6569 0.010 **
## - per_sand 1 563.74 3.7688 0.005 **
## - pool_depth_.cm. 1 564.77 4.8046 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
## + pool_metric_total 1 562.04 1.8145 0.010 **
## + percent_best_types 1 562.08 1.7802 0.010 **
## + per_bedrock 1 561.92 1.9380 0.015 *
## + per_leaf_woody 1 562.27 1.5962 0.050 *
## + per_detritus 1 562.06 1.7929 0.060 .
## + per_gravel 1 562.44 1.4297 0.060 .
## + per_silt 1 562.36 1.5061 0.075 .
## + X._canopy_open 1 562.47 1.3990 0.105
## + per_boulder_256mm 1 562.64 1.2278 0.135
## + bankfull_metric_total 1 562.64 1.2280 0.180
## + per_artificial 1 562.57 1.2961 0.235
## + per_clay_hardpan 1 562.70 1.1776 0.245
## + average_bankfull_.m. 1 562.75 1.1212 0.325
## + per_muck 1 562.94 0.9401 0.450
## + per_boulder_slabs 1 563.23 0.6611 0.940
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - pool_metric_total 1 561.91 1.8145 0.010 **
## - per_cobble 1 562.79 2.6719 0.010 **
## - per_sand 1 563.70 3.5715 0.005 **
## - pool_depth_.cm. 1 564.62 4.4818 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
## + per_bedrock 1 562.04 1.9289 0.005 **
## + percent_best_types 1 562.15 1.8243 0.010 **
## + per_gravel 1 562.60 1.3912 0.080 .
## + per_silt 1 562.42 1.5582 0.085 .
## + per_detritus 1 562.43 1.5542 0.090 .
## + X._canopy_open 1 562.58 1.4093 0.125
## + per_artificial 1 562.67 1.3194 0.195
## + bankfull_metric_total 1 562.84 1.1530 0.200
## + per_boulder_256mm 1 562.75 1.2398 0.225
## + per_leaf_woody 1 562.82 1.1779 0.230
## + average_bankfull_.m. 1 562.89 1.1057 0.245
## + per_clay_hardpan 1 562.84 1.1542 0.265
## + per_muck 1 563.06 0.9419 0.340
## + per_boulder_slabs 1 563.37 0.6471 0.945
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Step: streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total + per_bedrock
##
## Df AIC F Pr(>F)
## - pool_metric_total 1 561.92 1.8063 0.020 *
## - per_bedrock 1 562.04 1.9289 0.015 *
## - per_sand 1 563.70 3.5434 0.005 **
## - per_cobble 1 564.03 3.8716 0.005 **
## - pool_depth_.cm. 1 564.41 4.2421 0.005 **
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
##
## Df AIC F Pr(>F)
## + per_detritus 1 562.30 1.6618 0.065 .
## + bankfull_metric_total 1 562.69 1.2835 0.085 .
## + X._canopy_open 1 562.53 1.4434 0.095 .
## + per_artificial 1 562.62 1.3544 0.125
## + per_boulder_256mm 1 562.73 1.2494 0.175
## + per_silt 1 562.71 1.2648 0.200
## + average_bankfull_.m. 1 562.83 1.1512 0.250
## + per_clay_hardpan 1 562.94 1.0494 0.380
## + per_gravel 1 562.97 1.0200 0.410
## + per_muck 1 563.12 0.8754 0.425
## + percent_best_types 1 563.03 0.9610 0.430
## + per_leaf_woody 1 563.10 0.8918 0.645
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## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
p_alltax_step
## Call: rda(formula = streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total + per_bedrock, data = occcov_3[, -1], scale = T)
##
## Inertia Proportion Rank
## Total 62.0000 1.0000
## Constrained 6.1754 0.0996 5
## Unconstrained 55.8246 0.9004 62
## Inertia is correlations
##
## Eigenvalues for constrained axes:
## RDA1 RDA2 RDA3 RDA4 RDA5
## 2.7451 1.5905 1.0407 0.5293 0.2697
##
## Eigenvalues for unconstrained axes:
## PC1 PC2 PC3 PC4 PC5 PC6 PC7 PC8
## 7.962 3.141 2.795 2.343 2.035 1.878 1.758 1.663
## (Showing 8 of 62 unconstrained eigenvalues)
anova(p_alltax_step)
## Permutation test for rda under reduced model
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## Model: rda(formula = streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total + per_bedrock, data = occcov_3[, -1], scale = T)
## Df Variance F Pr(>F)
## Model 5 6.175 2.8983 0.001 ***
## Residual 131 55.825
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
anova(p_alltax_step,by="term")
## Permutation test for rda under reduced model
## Terms added sequentially (first to last)
## Permutation: free
## Number of permutations: 999
##
## Model: rda(formula = streambioticsum_suff_biotic_bin ~ pool_depth_.cm. + per_sand + per_cobble + pool_metric_total + per_bedrock, data = occcov_3[, -1], scale = T)
## Df Variance F Pr(>F)
## pool_depth_.cm. 1 1.841 4.3210 0.001 ***
## per_sand 1 1.586 3.7223 0.001 ***
## per_cobble 1 1.147 2.6920 0.002 **
## pool_metric_total 1 0.779 1.8272 0.012 *
## per_bedrock 1 0.822 1.9289 0.013 *
## Residual 131 55.825
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
library(ggord)
phwh_salamander_suff_sum_bin<-phwh_salamander_suff_sum %>% mutate_if(is.numeric, ~1 * (. >= 1))
phwh_salamander_suff_env_detecthistory<-cbind(phwh_subset_suff_env_detecthistory,phwh_salamander_suff_sum_bin[,-1:-2])
phwh_salamander_suff_env_detecthistory$datecount<-sitechecks$datecount
phwh_salamander_suff_env_detecthistory$dayofyear<-sitechecks$dayofyear
phwh_salamander_suff_env_detecthistory<-phwh_salamander_suff_env_detecthistory %>%
dplyr::select(!c(latitude,longitude))
phwh_subset_suff_env_detecthistory_first<- phwh_salamander_suff_env_detecthistory %>% group_by(stream_name) %>%
arrange(datecount) %>%
summarise_all(funs(list(.[1]))) %>%
unnest(cols = c(date, reservation, river_basin,hmfei_narrative, substrate_metric_total, percent_best_types, per_boulder_slabs,
per_boulder_256mm, per_bedrock, per_cobble, per_gravel, per_sand,
per_silt, per_leaf_woody, per_detritus, per_clay_hardpan,
per_muck, per_artificial, pool_metric_total, pool_depth_.cm.,
bankfull_metric_total, average_bankfull_.m., sinuosity, X._canopy_open,
temp, dissolved_oxygen_mgl, ph, conductivity, mtdusky, nodusky,
twolined, longtail, red, mole, fourtoed, redback, slimy,
datecount, dayofyear))
hmfei_narrative<-phwh_subset_suff_env_detecthistory_first$hmfei_narrative
ggord(p_alltax_step, xlim=c(-1,1.25),ylim = c(-1.25, 0.75),txt=4,arrow=TRUE,ptslab=TRUE,addsize=3, size =4,grp_in=hmfei_narrative)
This sets up a fairly clear contrast between substrate sandiness and most other substrate metrics.
## most differentiated taxa
plot_df <- scores(p_alltax_step, display = "sites") %>%
as.data.frame()
plot_df$stream_name<-streambioticsum_suff$stream_name
plot_df <- plot_df %>%
full_join(streambioticsum_suff, by = "stream_name")
# envfit() takes the output of metaMDS() and the species matrix you created
fitrdaall <- envfit(p_alltax_step, streambioticsum_suff_biotic_bin, perm = 999)
# extract p-values for each species
fitrdaall_pvals <- fitrdaall$vectors$pvals %>%
as.data.frame() %>%
rownames_to_column("species") %>%
dplyr::rename("pvals" = ".")
# extract coordinates for species, only keep species with p-val = 0.001
fit_spp <- fitrdaall %>%
scores(., display = "vectors") %>%
as.data.frame() %>%
rownames_to_column("species") %>%
full_join(., fitrdaall_pvals, by = "species") %>%
filter(pvals == 0.001)
rdaall_plot_new <- ggplot(plot_df, aes(x = RDA1, y = RDA2)) +
coord_fixed() +
geom_point(aes(color = hmfei_narrative), size = 3, alpha = 0.8) +
stat_ellipse(aes(color = hmfei_narrative)) +
geom_segment(data = fit_spp, aes(x = 0, xend = RDA1, y = 0, yend = RDA2),
col = "black") +
geom_text(data = fit_spp, aes(label = species))
rdaall_plot_new
fit_spp
## species RDA1 RDA2 pvals
## 1 streambioticsum_suff_mtdusky 0.17507595 -0.293644216 0.001
## 2 streambioticsum_suff_nodusky -0.27809375 -0.455284029 0.001
## 3 streambioticsum_suff_twolined -0.23822398 -0.638763319 0.001
## 4 streambioticsum_suff_longtail -0.39010575 0.062736629 0.001
## 5 streambioticsum_suff_red -0.75209043 0.031090809 0.001
## 6 streambioticsum_suff_redback -0.57734190 0.056641061 0.001
## 7 streambioticsum_suff_slimy -0.26432911 -0.250839261 0.001
## 8 blacknose_dace 0.15197211 -0.398865246 0.001
## 9 creek_chub 0.24147283 -0.269644637 0.001
## 10 sow_bugs 0.46853803 -0.130358924 0.001
## 11 water_mites 0.16203348 -0.342627989 0.001
## 12 damselfly_nymphs 0.42542871 -0.310468854 0.001
## 13 alderfly_larvae -0.23820548 -0.333107571 0.001
## 14 crayfish -0.31541526 -0.410797605 0.001
## 15 dragonfly_nymphs -0.14737034 -0.429481237 0.001
## 16 riffle_beetles 0.27450885 -0.486189992 0.001
## 17 snails 0.57051982 -0.210491614 0.001
## 18 fishfly_larvae -0.55491700 -0.373586567 0.001
## 19 water_penny_beetles -0.22680148 -0.608803917 0.001
## 20 cranefly_larvae -0.01779661 -0.436764317 0.001
## 21 ameletidae 0.30401485 -0.527521148 0.001
## 22 baetidae 0.01304353 -0.541866582 0.001
## 23 heptageniidae -0.31608809 -0.225105120 0.001
## 24 leptophlebiidae -0.71022889 -0.216865922 0.001
## 25 chloroperlidae -0.16974936 -0.383511797 0.001
## 26 leuctridae -0.56275788 -0.533921998 0.001
## 27 nemouridae -0.65902418 -0.278665497 0.001
## 28 perlidae -0.42901318 -0.196722395 0.001
## 29 hydropsychidae -0.14487030 -0.605885309 0.001
## 30 lepidostomatidae -0.77744388 0.056448603 0.001
## 31 limnephilidae -0.61638586 0.054267650 0.001
## 32 molannidae -0.43848282 0.042280512 0.001
## 33 odontoceridae -0.52357619 0.001948575 0.001
## 34 philopotamidae -0.12128870 -0.609498640 0.001
## 35 polycentropodidae -0.02254012 -0.553853773 0.001
## 36 rhyacophilidae -0.58742278 -0.315837496 0.001
## 37 uenoidae -0.36293897 -0.392353341 0.001
phwh_subset_biotic<-phwh %>%
dplyr::select(stream_name,date,mountain_dusky_larvae,mountain_dusky_juveniles,
mountain_dusky_adults,northern_dusky_larvae,northern_dusky_juveniles,northern_dusky_adults,two_lined_larvae,two_lined_juveniles,
two_lined_adults,long_tailed_larvae,long_tailed_juveniles,long_tailed_adults,northern_red_larvae,northern_red_juveniles,northern_red_adults,
mole_larvae,mole_juveniles,mole_adults,four_toed_larvae,four_toed_juveniles,four_toed_adults,red_backed_juveniles,red_backed_adults,
slimy_juveniles,slimy_adults,blacknose_dace,bluegill_sunfish,bluntnose_minnow,brindled_madtom,brook_stickleback,brook_trout,
central_mudminnow,central_stoneroller_minnow,common_shiner,creek_chub,eastern_sand_darter,fantail_darter,fathead_minnow,golden_shiner,
goldfish,grass_pickerel,greenside_darter,green_sunfish,johnny_darter,largemouth_bass,longear_sunfish,longnose_dace,mottled_sculpin,
northern_hog_sucker,pumpkinseed_sunfish,rainbow_darter,rainbow_trout,redbelly_dace,redside_dace,river_chub,silverjaw_minnow,smallmouth_bass,
spotfin_shiner,stonecat_madtom,striped_shiner,trout_perch,warmouth_sunfish,white_sucker,yellow_bullhead_catfish,unidentified_fish_fry,
sessile_animals,aquatic_worms,sow_bugs,scuds,water_mites,damselfly_nymphs,alderfly_larvae,other_beetles,crayfish,dragonfly_nymphs,
riffle_beetles,other_flies,midges,snails,clams,fishfly_larvae,water_penny_beetles,cranefly_larvae,ameletidae,arthropleidae,baetidae,
baetiscidae,caenidae,ephemerellidae,ephemeridae,heptageniidae,isonychiidae,leptohyphidae,leptophlebiidae,polymitarcyidae,potamanthidae,
pseudironidae,siphlonuridae,capniidae,chloroperlidae,leuctridae,nemouridae,peltoperlidae,perlidae,perlodidae,pteronarcyidae,taeniopterygidae,
brachycentridae,dipseuodopsidae,glossosomatidae,goeridae,helicopsychidae,hydropsychidae,hydroptilidae,lepidostomatidae,leptoceridae,
limnephilidae,molannidae,odontoceridae,philopotamidae,phryganeidae,polycentropodidae,psychomiidae,rhyacophilidae,uenoidae) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE)
phwh_subset_biotic_2<-phwh_subset_biotic %>% replace(is.na(.),0) %>% replace(.=="abundant",30) %>% replace(.=="common",6) %>% replace(.=="rare", 1) %>% replace(.=="very abundant",50) %>%
distinct(stream_name, date, .keep_all = TRUE) %>% dplyr::select(-stream_name,-date)
phwh_subset_biotic_3<-data.frame(sapply(phwh_subset_biotic_2,as.numeric))
phwh_subset_biotic_3$stream_name<-phwh_subset_biotic$stream_name
phwh_subset_biotic_3$date<-phwh_subset_biotic$date
streambiotic<-phwh_subset_biotic_3
streambioticsum<-streambiotic %>%
group_by(stream_name) %>%
dplyr::select(!date) %>%
summarise_all(list(sum))
streambioticsum_suff <-streambioticsum[streambioticsum$stream_name %in% greenlightsites$stream_nam , ]
streambioticsum_suff_mtdusky<-streambioticsum_suff$mountain_dusky_larvae+
streambioticsum_suff$mountain_dusky_juveniles+
streambioticsum_suff$mountain_dusky_adults
streambioticsum_suff_nodusky<-streambioticsum_suff$northern_dusky_larvae+
streambioticsum_suff$northern_dusky_juveniles+
streambioticsum_suff$northern_dusky_adults
streambioticsum_suff_twolined<-streambioticsum_suff$two_lined_larvae+
streambioticsum_suff$two_lined_juveniles+
streambioticsum_suff$two_lined_adults
streambioticsum_suff_longtail<-streambioticsum_suff$long_tailed_larvae+
streambioticsum_suff$long_tailed_juveniles+
streambioticsum_suff$long_tailed_adults
streambioticsum_suff_red<-streambioticsum_suff$northern_red_larvae+
streambioticsum_suff$northern_red_juveniles+
streambioticsum_suff$northern_red_adults
streambioticsum_suff_mole<-streambioticsum_suff$mole_larvae+
streambioticsum_suff$mole_juveniles+
streambioticsum_suff$mole_adults
streambioticsum_suff_fourtoed<-streambioticsum_suff$four_toed_larvae+
streambioticsum_suff$four_toed_juveniles+
streambioticsum_suff$four_toed_adults
streambioticsum_suff_redback<-streambioticsum_suff$red_backed_juveniles+
streambioticsum_suff$red_backed_adults
streambioticsum_suff_slimy<-streambioticsum_suff$slimy_juveniles+
streambioticsum_suff$slimy_adults
streambioticsum_suff_sal<-data.frame(streambioticsum_suff_mtdusky,streambioticsum_suff_nodusky,streambioticsum_suff_twolined,
streambioticsum_suff_longtail,streambioticsum_suff_red,streambioticsum_suff_mole,
streambioticsum_suff_fourtoed,streambioticsum_suff_redback,streambioticsum_suff_slimy)
streambioticsum_suff_fish<-streambioticsum_suff[,27:65]
streambioticsum_suff_macro<-streambioticsum_suff[,67:126]
streambioticsum_suff_biotic<-data.frame(streambioticsum_suff_sal,streambioticsum_suff_fish,streambioticsum_suff_macro)
streambioticsum_suff_biotic_bin<- streambioticsum_suff_biotic %>% mutate_if(is.numeric, ~1 * (. >= 1))
streambioticsum_suff_biotic_bin_t<-t(streambioticsum_suff_biotic_bin)
library(netassoc)
m_obs<-matrix(streambioticsum_suff_biotic_bin_t,ncol=137,nrow=108)
m_obs<-m_obs[rowSums(m_obs[])>0,]
m_obs<-m_obs[rowSums(m_obs[])<137,]
# Number of m species
nsp <- nrow(m_obs)
# Number of n sites
nsi <- ncol(m_obs)
m_nul <- floor(matrix(rbernoulli(nsp*nsi,p=0.5),ncol=nsi,nrow=nsp))
n <- make_netassoc_network(m_obs, m_nul,
method="partial_correlation",
args=list(method="shrinkage"), # for alternative estimators see ?partial_correlation
p.method='fdr',
numnulls=100,
plot=TRUE,
alpha=0.001)
## Calculating observed co-occurrence scores...
## Generating null replicate 1...
## Generating null replicate 2...
## Generating null replicate 3...
## Generating null replicate 4...
## Generating null replicate 5...
## Generating null replicate 6...
## Generating null replicate 7...
## Generating null replicate 8...
## Generating null replicate 9...
## Generating null replicate 10...
## Generating null replicate 11...
## Generating null replicate 12...
## Generating null replicate 13...
## Generating null replicate 14...
## Generating null replicate 15...
## Generating null replicate 16...
## Generating null replicate 17...
## Generating null replicate 18...
## Generating null replicate 19...
## Generating null replicate 20...
## Generating null replicate 21...
## Generating null replicate 22...
## Generating null replicate 23...
## Generating null replicate 24...
## Generating null replicate 25...
## Generating null replicate 26...
## Generating null replicate 27...
## Generating null replicate 28...
## Generating null replicate 29...
## Generating null replicate 30...
## Generating null replicate 31...
## Generating null replicate 32...
## Generating null replicate 33...
## Generating null replicate 34...
## Generating null replicate 35...
## Generating null replicate 36...
## Generating null replicate 37...
## Generating null replicate 38...
## Generating null replicate 39...
## Generating null replicate 40...
## Generating null replicate 41...
## Generating null replicate 42...
## Generating null replicate 43...
## Generating null replicate 44...
## Generating null replicate 45...
## Generating null replicate 46...
## Generating null replicate 47...
## Generating null replicate 48...
## Generating null replicate 49...
## Generating null replicate 50...
## Generating null replicate 51...
## Generating null replicate 52...
## Generating null replicate 53...
## Generating null replicate 54...
## Generating null replicate 55...
## Generating null replicate 56...
## Generating null replicate 57...
## Generating null replicate 58...
## Generating null replicate 59...
## Generating null replicate 60...
## Generating null replicate 61...
## Generating null replicate 62...
## Generating null replicate 63...
## Generating null replicate 64...
## Generating null replicate 65...
## Generating null replicate 66...
## Generating null replicate 67...
## Generating null replicate 68...
## Generating null replicate 69...
## Generating null replicate 70...
## Generating null replicate 71...
## Generating null replicate 72...
## Generating null replicate 73...
## Generating null replicate 74...
## Generating null replicate 75...
## Generating null replicate 76...
## Generating null replicate 77...
## Generating null replicate 78...
## Generating null replicate 79...
## Generating null replicate 80...
## Generating null replicate 81...
## Generating null replicate 82...
## Generating null replicate 83...
## Generating null replicate 84...
## Generating null replicate 85...
## Generating null replicate 86...
## Generating null replicate 87...
## Generating null replicate 88...
## Generating null replicate 89...
## Generating null replicate 90...
## Generating null replicate 91...
## Generating null replicate 92...
## Generating null replicate 93...
## Generating null replicate 94...
## Generating null replicate 95...
## Generating null replicate 96...
## Generating null replicate 97...
## Generating null replicate 98...
## Generating null replicate 99...
## Generating null replicate 100...
## Calculating standardized effect sizes...
## Adjusting p-values for multiple comparisons...
## Building network...
n$network_all
## IGRAPH bacd885 DNW- 62 2788 --
## + attr: name (v/c), weight (e/n)
## + edges from bacd885 (vertex names):
## [1] Species 1->Species 2 Species 1->Species 3 Species 1->Species 4 Species 1->Species 5 Species 1->Species 6 Species 1->Species 7 Species 1->Species 8 Species 1->Species 10 Species 1->Species 11 Species 1->Species 13 Species 1->Species 15 Species 1->Species 17 Species 1->Species 19 Species 1->Species 20 Species 1->Species 21 Species 1->Species 22 Species 1->Species 23 Species 1->Species 24 Species 1->Species 25 Species 1->Species 26 Species 1->Species 27 Species 1->Species 28 Species 1->Species 29 Species 1->Species 30 Species 1->Species 31 Species 1->Species 33 Species 1->Species 34
## [28] Species 1->Species 35 Species 1->Species 36 Species 1->Species 38 Species 1->Species 39 Species 1->Species 43 Species 1->Species 44 Species 1->Species 45 Species 1->Species 46 Species 1->Species 47 Species 1->Species 48 Species 1->Species 49 Species 1->Species 50 Species 1->Species 51 Species 1->Species 53 Species 1->Species 55 Species 1->Species 56 Species 1->Species 57 Species 1->Species 59 Species 1->Species 60 Species 1->Species 61 Species 2->Species 1 Species 2->Species 3 Species 2->Species 4 Species 2->Species 5 Species 2->Species 6 Species 2->Species 7 Species 2->Species 8
## [55] Species 2->Species 10 Species 2->Species 16 Species 2->Species 17 Species 2->Species 18 Species 2->Species 19 Species 2->Species 20 Species 2->Species 21 Species 2->Species 23 Species 2->Species 25 Species 2->Species 26 Species 2->Species 27 Species 2->Species 29 Species 2->Species 30 Species 2->Species 31 Species 2->Species 33 Species 2->Species 34 Species 2->Species 35 Species 2->Species 36 Species 2->Species 38 Species 2->Species 40 Species 2->Species 41 Species 2->Species 42 Species 2->Species 44 Species 2->Species 45 Species 2->Species 46 Species 2->Species 49 Species 2->Species 50
## [82] Species 2->Species 51 Species 2->Species 52 Species 2->Species 54 Species 2->Species 55 Species 2->Species 56 Species 2->Species 57 Species 2->Species 59 Species 2->Species 60 Species 2->Species 61 Species 2->Species 62 Species 3->Species 1 Species 3->Species 2 Species 3->Species 5 Species 3->Species 6 Species 3->Species 7 Species 3->Species 8 Species 3->Species 9 Species 3->Species 10 Species 3->Species 11 Species 3->Species 12 Species 3->Species 13 Species 3->Species 15 Species 3->Species 16 Species 3->Species 18 Species 3->Species 20 Species 3->Species 23 Species 3->Species 24
## [109] Species 3->Species 28 Species 3->Species 29 Species 3->Species 31 Species 3->Species 32 Species 3->Species 33 Species 3->Species 34 Species 3->Species 35 Species 3->Species 36 Species 3->Species 37 Species 3->Species 38 Species 3->Species 39 Species 3->Species 40 Species 3->Species 41 Species 3->Species 42 Species 3->Species 43 Species 3->Species 44 Species 3->Species 45 Species 3->Species 46 Species 3->Species 49 Species 3->Species 50 Species 3->Species 52 Species 3->Species 54 Species 3->Species 56 Species 3->Species 58 Species 3->Species 60 Species 3->Species 61 Species 4->Species 1
## [136] Species 4->Species 2 Species 4->Species 5 Species 4->Species 6 Species 4->Species 7 Species 4->Species 8 Species 4->Species 9 Species 4->Species 11 Species 4->Species 12 Species 4->Species 14 Species 4->Species 16 Species 4->Species 17 Species 4->Species 18 Species 4->Species 22 Species 4->Species 24 Species 4->Species 25 Species 4->Species 26 Species 4->Species 27 Species 4->Species 28 Species 4->Species 30 Species 4->Species 33 Species 4->Species 35 Species 4->Species 36 Species 4->Species 37 Species 4->Species 39 Species 4->Species 40 Species 4->Species 42 Species 4->Species 44
## [163] Species 4->Species 45 Species 4->Species 46 Species 4->Species 48 Species 4->Species 49 Species 4->Species 50 Species 4->Species 51 Species 4->Species 53 Species 4->Species 54 Species 4->Species 55 Species 4->Species 56 Species 4->Species 57 Species 4->Species 58 Species 4->Species 59 Species 4->Species 60 Species 4->Species 61 Species 4->Species 62 Species 5->Species 1 Species 5->Species 2 Species 5->Species 3 Species 5->Species 4 Species 5->Species 6 Species 5->Species 7 Species 5->Species 9 Species 5->Species 13 Species 5->Species 16 Species 5->Species 17 Species 5->Species 20
## [190] Species 5->Species 22 Species 5->Species 23 Species 5->Species 24 Species 5->Species 25 Species 5->Species 26 Species 5->Species 27 Species 5->Species 30 Species 5->Species 31 Species 5->Species 33 Species 5->Species 34 Species 5->Species 35 Species 5->Species 36 Species 5->Species 37 Species 5->Species 38 Species 5->Species 39 Species 5->Species 40 Species 5->Species 43 Species 5->Species 44 Species 5->Species 45 Species 5->Species 46 Species 5->Species 47 Species 5->Species 48 Species 5->Species 49 Species 5->Species 50 Species 5->Species 51 Species 5->Species 52 Species 5->Species 53
## + ... omitted several edges
plot(n$network_all)
# presence/absence across plots
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streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3<-streambioticsum_suff_biotic_bin_t_2[rowSums(streambioticsum_suff_biotic_bin_t_2[])<137,]
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co <- print(cooccur(streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3, spp_names = TRUE))
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## Call:
## cooccur(mat = streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3, spp_names = TRUE)
##
## Of 1891 species pair combinations, 585 pairs (30.94 %) were removed from the analysis because expected co-occurrence was < 1 and 1306 pairs were analyzed
##
## Cooccurrence Table:
## sp1 sp2 sp1_inc sp2_inc obs_cooccur prob_cooccur exp_cooccur p_lt p_gt sp1_name sp2_name
## 1 1 2 24 51 22 0.065 8.9 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_nodusky
## 2 1 3 24 102 22 0.130 17.9 0.99560 0.02403 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_twolined
## 27 1 43 24 40 1 0.051 7.0 0.00134 0.99990 streambioticsum_suff_mtdusky heptageniidae
## 31 1 47 24 68 18 0.087 11.9 0.99873 0.00548 streambioticsum_suff_mtdusky leuctridae
## 32 1 48 24 46 4 0.059 8.1 0.04100 0.98845 streambioticsum_suff_mtdusky nemouridae
## 33 1 49 24 44 3 0.056 7.7 0.01717 0.99635 streambioticsum_suff_mtdusky perlidae
## 38 1 55 24 45 1 0.058 7.9 0.00037 0.99998 streambioticsum_suff_mtdusky limnephilidae
## 41 1 60 24 56 15 0.072 9.8 0.99514 0.01657 streambioticsum_suff_mtdusky polycentropodidae
## 44 2 3 51 102 48 0.277 38.0 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_twolined
## 46 2 5 51 17 12 0.046 6.3 0.99945 0.00317 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_red
## 47 2 7 51 60 28 0.163 22.3 0.98593 0.03299 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_redback
## 48 2 8 51 8 7 0.022 3.0 0.99975 0.00424 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_slimy
## 55 2 21 51 4 4 0.011 1.5 1.00000 0.01779 streambioticsum_suff_nodusky sessile_animals
## 61 2 27 51 59 29 0.160 22.0 0.99643 0.00985 streambioticsum_suff_nodusky alderfly_larvae
## 63 2 29 51 104 46 0.283 38.7 0.99965 0.00177 streambioticsum_suff_nodusky crayfish
## 64 2 30 51 100 44 0.272 37.2 0.99864 0.00517 streambioticsum_suff_nodusky dragonfly_nymphs
## 69 2 35 51 52 29 0.141 19.4 0.99989 0.00045 streambioticsum_suff_nodusky fishfly_larvae
## 70 2 36 51 39 23 0.106 14.5 0.99976 0.00097 streambioticsum_suff_nodusky water_penny_beetles
## 73 2 39 51 117 48 0.318 43.6 0.99568 0.02029 streambioticsum_suff_nodusky baetidae
## 79 2 45 51 53 27 0.144 19.7 0.99754 0.00714 streambioticsum_suff_nodusky leptophlebiidae
## 81 2 47 51 68 36 0.185 25.3 0.99997 0.00014 streambioticsum_suff_nodusky leuctridae
## 82 2 48 51 46 23 0.125 17.1 0.99118 0.02262 streambioticsum_suff_nodusky nemouridae
## 85 2 52 51 107 48 0.291 39.8 0.99997 0.00025 streambioticsum_suff_nodusky hydropsychidae
## 87 2 54 51 30 17 0.082 11.2 0.99624 0.01210 streambioticsum_suff_nodusky lepidostomatidae
## 90 2 57 51 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00629 streambioticsum_suff_nodusky odontoceridae
## 91 2 58 51 62 30 0.168 23.1 0.99583 0.01128 streambioticsum_suff_nodusky philopotamidae
## 93 2 60 51 56 28 0.152 20.8 0.99700 0.00847 streambioticsum_suff_nodusky polycentropodidae
## 94 2 61 51 24 18 0.065 8.9 0.99999 0.00004 streambioticsum_suff_nodusky rhyacophilidae
## 95 2 62 51 46 27 0.125 17.1 0.99994 0.00024 streambioticsum_suff_nodusky uenoidae
## 97 3 5 102 17 16 0.092 12.7 0.99545 0.03606 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_red
## 101 3 9 102 19 19 0.103 14.1 1.00000 0.00228 streambioticsum_suff_twolined blacknose_dace
## 104 3 13 102 36 32 0.196 26.8 0.99643 0.01475 streambioticsum_suff_twolined creek_chub
## 116 3 27 102 59 52 0.321 43.9 0.99977 0.00105 streambioticsum_suff_twolined alderfly_larvae
## 118 3 29 102 104 90 0.565 77.4 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined crayfish
## 119 3 30 102 100 82 0.543 74.5 0.99971 0.00126 streambioticsum_suff_twolined dragonfly_nymphs
## 120 3 31 102 79 69 0.429 58.8 0.99999 0.00006 streambioticsum_suff_twolined riffle_beetles
## 124 3 35 102 52 48 0.283 38.7 0.99999 0.00009 streambioticsum_suff_twolined fishfly_larvae
## 125 3 36 102 39 39 0.212 29.0 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined water_penny_beetles
## 126 3 37 102 125 100 0.679 93.1 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_twolined cranefly_larvae
## 127 3 38 102 56 52 0.304 41.7 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_twolined ameletidae
## 128 3 39 102 117 95 0.636 87.1 0.99999 0.00006 streambioticsum_suff_twolined baetidae
## 132 3 43 102 40 35 0.217 29.8 0.99509 0.01788 streambioticsum_suff_twolined heptageniidae
## 134 3 45 102 53 52 0.288 39.5 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined leptophlebiidae
## 135 3 46 102 19 18 0.103 14.1 0.99772 0.02030 streambioticsum_suff_twolined chloroperlidae
## 136 3 47 102 68 64 0.370 50.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined leuctridae
## 137 3 48 102 46 43 0.250 34.2 0.99999 0.00013 streambioticsum_suff_twolined nemouridae
## 138 3 49 102 44 42 0.239 32.8 1.00000 0.00003 streambioticsum_suff_twolined perlidae
## 141 3 52 102 107 93 0.581 79.7 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined hydropsychidae
## 143 3 54 102 30 28 0.163 22.3 0.99941 0.00427 streambioticsum_suff_twolined lepidostomatidae
## 144 3 55 102 45 38 0.245 33.5 0.98388 0.04504 streambioticsum_suff_twolined limnephilidae
## 147 3 58 102 62 57 0.337 46.2 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_twolined philopotamidae
## 149 3 60 102 56 51 0.304 41.7 0.99998 0.00013 streambioticsum_suff_twolined polycentropodidae
## 150 3 61 102 24 23 0.130 17.9 0.99962 0.00440 streambioticsum_suff_twolined rhyacophilidae
## 151 3 62 102 46 42 0.250 34.2 0.99987 0.00077 streambioticsum_suff_twolined uenoidae
## 152 4 7 5 60 5 0.016 2.2 1.00000 0.01462 streambioticsum_suff_longtail streambioticsum_suff_redback
## 159 4 27 5 59 5 0.016 2.2 1.00000 0.01340 streambioticsum_suff_longtail alderfly_larvae
## 165 4 33 5 99 1 0.026 3.6 0.02091 0.99866 streambioticsum_suff_longtail snails
## 167 4 35 5 52 5 0.014 1.9 1.00000 0.00696 streambioticsum_suff_longtail fishfly_larvae
## 168 4 36 5 39 4 0.010 1.4 0.99846 0.02312 streambioticsum_suff_longtail water_penny_beetles
## 173 4 45 5 53 5 0.014 1.9 1.00000 0.00768 streambioticsum_suff_longtail leptophlebiidae
## 174 4 47 5 68 5 0.018 2.5 1.00000 0.02790 streambioticsum_suff_longtail leuctridae
## 175 4 48 5 46 5 0.012 1.7 1.00000 0.00367 streambioticsum_suff_longtail nemouridae
## 178 4 54 5 30 4 0.008 1.1 0.99962 0.00823 streambioticsum_suff_longtail lepidostomatidae
## 179 4 55 5 45 5 0.012 1.6 1.00000 0.00327 streambioticsum_suff_longtail limnephilidae
## 182 4 62 5 46 4 0.012 1.7 0.99633 0.04342 streambioticsum_suff_longtail uenoidae
## 183 5 7 17 60 16 0.054 7.4 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_red streambioticsum_suff_redback
## 185 5 13 17 36 0 0.033 4.5 0.00380 1.00000 streambioticsum_suff_red creek_chub
## 187 5 23 17 42 1 0.038 5.2 0.01222 0.99878 streambioticsum_suff_red sow_bugs
## 190 5 26 17 78 4 0.071 9.7 0.00328 0.99946 streambioticsum_suff_red damselfly_nymphs
## 193 5 29 17 104 16 0.094 12.9 0.99348 0.04809 streambioticsum_suff_red crayfish
## 194 5 30 17 100 16 0.091 12.4 0.99684 0.02679 streambioticsum_suff_red dragonfly_nymphs
## 195 5 31 17 79 6 0.072 9.8 0.04226 0.98778 streambioticsum_suff_red riffle_beetles
## 197 5 33 17 99 4 0.090 12.3 0.00001 1.00000 streambioticsum_suff_red snails
## 199 5 35 17 52 13 0.047 6.5 0.99991 0.00070 streambioticsum_suff_red fishfly_larvae
## 202 5 38 17 56 1 0.051 6.9 0.00095 0.99994 streambioticsum_suff_red ameletidae
## 207 5 45 17 53 16 0.048 6.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red leptophlebiidae
## 209 5 47 17 68 16 0.062 8.4 1.00000 0.00005 streambioticsum_suff_red leuctridae
## 210 5 48 17 46 14 0.042 5.7 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_red nemouridae
## 213 5 52 17 107 17 0.097 13.3 1.00000 0.01102 streambioticsum_suff_red hydropsychidae
## 215 5 54 17 30 16 0.027 3.7 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red lepidostomatidae
## 216 5 55 17 45 15 0.041 5.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red limnephilidae
## 217 5 58 17 62 13 0.056 7.7 0.99894 0.00586 streambioticsum_suff_red philopotamidae
## 219 5 61 17 24 11 0.022 3.0 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red rhyacophilidae
## 220 5 62 17 46 10 0.042 5.7 0.99478 0.02088 streambioticsum_suff_red uenoidae
## 232 7 8 60 8 7 0.026 3.5 0.99898 0.01292 streambioticsum_suff_redback streambioticsum_suff_slimy
## 241 7 23 60 42 12 0.134 18.4 0.01311 0.99547 streambioticsum_suff_redback sow_bugs
## 244 7 26 60 78 27 0.249 34.2 0.01020 0.99620 streambioticsum_suff_redback damselfly_nymphs
## 245 7 27 60 59 33 0.189 25.8 0.99620 0.01020 streambioticsum_suff_redback alderfly_larvae
## 251 7 33 60 99 32 0.316 43.4 0.00001 1.00000 streambioticsum_suff_redback snails
## 253 7 35 60 52 34 0.166 22.8 0.99999 0.00007 streambioticsum_suff_redback fishfly_larvae
## 254 7 36 60 39 24 0.125 17.1 0.99768 0.00720 streambioticsum_suff_redback water_penny_beetles
## 261 7 43 60 40 24 0.128 17.5 0.99589 0.01183 streambioticsum_suff_redback heptageniidae
## 263 7 45 60 53 36 0.169 23.2 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_redback leptophlebiidae
## 264 7 46 60 19 13 0.061 8.3 0.99515 0.01878 streambioticsum_suff_redback chloroperlidae
## 265 7 47 60 68 40 0.217 29.8 0.99990 0.00038 streambioticsum_suff_redback leuctridae
## 266 7 48 60 46 31 0.147 20.1 0.99998 0.00008 streambioticsum_suff_redback nemouridae
## 267 7 49 60 44 29 0.141 19.3 0.99992 0.00032 streambioticsum_suff_redback perlidae
## 271 7 54 60 30 23 0.096 13.1 0.99999 0.00004 streambioticsum_suff_redback lepidostomatidae
## 272 7 55 60 45 30 0.144 19.7 0.99996 0.00016 streambioticsum_suff_redback limnephilidae
## 273 7 56 60 4 4 0.013 1.8 1.00000 0.03472 streambioticsum_suff_redback molannidae
## 274 7 57 60 5 5 0.016 2.2 1.00000 0.01462 streambioticsum_suff_redback odontoceridae
## 278 7 61 60 24 16 0.077 10.5 0.99669 0.01200 streambioticsum_suff_redback rhyacophilidae
## 279 7 62 60 46 30 0.147 20.1 0.99992 0.00032 streambioticsum_suff_redback uenoidae
## 280 8 9 8 19 4 0.008 1.1 0.99868 0.01322 streambioticsum_suff_slimy blacknose_dace
## 285 8 25 8 52 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 streambioticsum_suff_slimy water_mites
## 295 8 35 8 52 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 streambioticsum_suff_slimy fishfly_larvae
## 296 8 36 8 39 5 0.017 2.3 0.99317 0.04187 streambioticsum_suff_slimy water_penny_beetles
## 301 8 45 8 53 7 0.023 3.1 0.99965 0.00554 streambioticsum_suff_slimy leptophlebiidae
## 303 8 47 8 68 7 0.029 4.0 0.99704 0.02972 streambioticsum_suff_slimy leuctridae
## 304 8 48 8 46 6 0.020 2.7 0.99795 0.01740 streambioticsum_suff_slimy nemouridae
## 310 8 58 8 62 7 0.026 3.6 0.99865 0.01611 streambioticsum_suff_slimy philopotamidae
## 311 8 60 8 56 7 0.024 3.3 0.99943 0.00808 streambioticsum_suff_slimy polycentropodidae
## 312 8 61 8 24 4 0.010 1.4 0.99566 0.03171 streambioticsum_suff_slimy rhyacophilidae
## 313 8 62 8 46 6 0.020 2.7 0.99795 0.01740 streambioticsum_suff_slimy uenoidae
## 314 9 13 19 36 12 0.036 5.0 0.99996 0.00028 blacknose_dace creek_chub
## 324 9 31 19 79 18 0.080 11.0 0.99999 0.00019 blacknose_dace riffle_beetles
## 329 9 36 19 39 9 0.039 5.4 0.98490 0.04884 blacknose_dace water_penny_beetles
## 331 9 38 19 56 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 blacknose_dace ameletidae
## 332 9 39 19 117 19 0.118 16.2 1.00000 0.03935 blacknose_dace baetidae
## 334 9 43 19 40 11 0.040 5.5 0.99903 0.00477 blacknose_dace heptageniidae
## 335 9 44 19 11 5 0.011 1.5 0.99903 0.00821 blacknose_dace leptohyphidae
## 336 9 45 19 53 12 0.054 7.4 0.99511 0.01862 blacknose_dace leptophlebiidae
## 337 9 46 19 19 8 0.019 2.6 0.99989 0.00093 blacknose_dace chloroperlidae
## 338 9 47 19 68 15 0.069 9.4 0.99899 0.00537 blacknose_dace leuctridae
## 339 9 48 19 46 12 0.047 6.4 0.99909 0.00450 blacknose_dace nemouridae
## 340 9 49 19 44 12 0.045 6.1 0.99947 0.00280 blacknose_dace perlidae
## 341 9 50 19 18 6 0.018 2.5 0.99598 0.02050 blacknose_dace perlodidae
## 342 9 52 19 107 18 0.108 14.8 0.99382 0.04576 blacknose_dace hydropsychidae
## 344 9 54 19 30 0 0.030 4.2 0.00618 1.00000 blacknose_dace lepidostomatidae
## 384 13 15 36 4 4 0.008 1.1 1.00000 0.00419 creek_chub johnny_darter
## 392 13 26 36 78 26 0.150 20.5 0.99158 0.02372 creek_chub damselfly_nymphs
## 396 13 30 36 100 32 0.192 26.3 0.99810 0.00851 creek_chub dragonfly_nymphs
## 397 13 31 36 79 34 0.152 20.8 1.00000 0.00000 creek_chub riffle_beetles
## 399 13 33 36 99 33 0.190 26.0 0.99979 0.00137 creek_chub snails
## 403 13 37 36 125 36 0.240 32.8 1.00000 0.02144 creek_chub cranefly_larvae
## 404 13 38 36 56 25 0.107 14.7 0.99999 0.00006 creek_chub ameletidae
## 408 13 43 36 40 16 0.077 10.5 0.99389 0.01808 creek_chub heptageniidae
## 412 13 47 36 68 23 0.130 17.9 0.98597 0.03571 creek_chub leuctridae
## 414 13 49 36 44 18 0.084 11.6 0.99770 0.00755 creek_chub perlidae
## 418 13 54 36 30 2 0.058 7.9 0.00326 0.99957 creek_chub lepidostomatidae
## 423 13 59 36 8 5 0.015 2.1 0.99571 0.02942 creek_chub phryganeidae
## 454 15 38 4 56 4 0.012 1.6 1.00000 0.02615 johnny_darter ameletidae
## 491 16 58 4 62 4 0.013 1.8 1.00000 0.03972 rainbow_darter philopotamidae
## 521 19 38 4 56 4 0.012 1.6 1.00000 0.02615 white_sucker ameletidae
## 565 22 27 122 59 49 0.384 52.5 0.04699 0.98718 aquatic_worms alderfly_larvae
## 568 22 30 122 100 86 0.650 89.1 0.04864 0.99347 aquatic_worms dragonfly_nymphs
## 585 22 47 122 68 56 0.442 60.6 0.01195 0.99787 aquatic_worms leuctridae
## 587 22 49 122 44 35 0.286 39.2 0.01790 0.99602 aquatic_worms perlidae
## 601 23 24 42 51 29 0.114 15.6 1.00000 0.00000 sow_bugs scuds
## 602 23 25 42 52 24 0.116 15.9 0.99942 0.00207 sow_bugs water_mites
## 603 23 26 42 78 31 0.175 23.9 0.99807 0.00625 sow_bugs damselfly_nymphs
## 604 23 27 42 59 13 0.132 18.1 0.04207 0.98261 sow_bugs alderfly_larvae
## 610 23 33 42 99 35 0.222 30.4 0.98585 0.04016 sow_bugs snails
## 612 23 35 42 52 7 0.116 15.9 0.00043 0.99991 sow_bugs fishfly_larvae
## 621 23 45 42 53 5 0.119 16.2 0.00001 1.00000 sow_bugs leptophlebiidae
## 623 23 47 42 68 15 0.152 20.8 0.02340 0.99097 sow_bugs leuctridae
## 624 23 48 42 46 6 0.103 14.1 0.00098 0.99980 sow_bugs nemouridae
## 625 23 49 42 44 6 0.098 13.5 0.00202 0.99955 sow_bugs perlidae
## 626 23 50 42 18 2 0.040 5.5 0.04229 0.99154 sow_bugs perlodidae
## 629 23 54 42 30 2 0.067 9.2 0.00058 0.99994 sow_bugs lepidostomatidae
## 630 23 55 42 45 6 0.101 13.8 0.00141 0.99970 sow_bugs limnephilidae
## 636 23 61 42 24 2 0.054 7.4 0.00570 0.99919 sow_bugs rhyacophilidae
## 637 23 62 42 46 9 0.103 14.1 0.03350 0.98763 sow_bugs uenoidae
## 638 24 25 51 52 27 0.141 19.4 0.99845 0.00476 scuds water_mites
## 640 24 27 51 59 15 0.160 22.0 0.01004 0.99644 scuds alderfly_larvae
## 648 24 35 51 52 12 0.141 19.4 0.00568 0.99820 scuds fishfly_larvae
## 656 24 43 51 40 7 0.109 14.9 0.00153 0.99965 scuds heptageniidae
## 657 24 44 51 11 0 0.030 4.1 0.00462 1.00000 scuds leptohyphidae
## 658 24 45 51 53 10 0.144 19.7 0.00031 0.99993 scuds leptophlebiidae
## 660 24 47 51 68 20 0.185 25.3 0.04416 0.98033 scuds leuctridae
## 661 24 48 51 46 10 0.125 17.1 0.00582 0.99825 scuds nemouridae
## 662 24 49 51 44 5 0.120 16.4 0.00001 1.00000 scuds perlidae
## 674 24 62 51 46 11 0.125 17.1 0.01650 0.99418 scuds uenoidae
## 678 25 29 52 104 44 0.288 39.5 0.98267 0.04663 water_mites crayfish
## 680 25 31 52 79 39 0.219 30.0 0.99972 0.00105 water_mites riffle_beetles
## 706 25 58 52 62 31 0.172 23.5 0.99763 0.00681 water_mites philopotamidae
## 714 26 30 78 100 65 0.416 56.9 0.99957 0.00166 damselfly_nymphs dragonfly_nymphs
## 715 26 31 78 79 57 0.328 45.0 0.99999 0.00003 damselfly_nymphs riffle_beetles
## 717 26 33 78 99 63 0.411 56.4 0.99698 0.00915 damselfly_nymphs snails
## 718 26 34 78 45 33 0.187 25.6 0.99836 0.00526 damselfly_nymphs clams
## 721 26 37 78 125 76 0.519 71.2 0.99959 0.00381 damselfly_nymphs cranefly_larvae
## 722 26 38 78 56 41 0.233 31.9 0.99969 0.00112 damselfly_nymphs ameletidae
## 723 26 39 78 117 72 0.486 66.6 0.99803 0.00855 damselfly_nymphs baetidae
## 724 26 40 78 13 12 0.054 7.4 0.99959 0.00521 damselfly_nymphs caenidae
## 729 26 45 78 53 25 0.220 30.2 0.04894 0.97776 damselfly_nymphs leptophlebiidae
## 736 26 52 78 107 67 0.445 60.9 0.99694 0.01012 damselfly_nymphs hydropsychidae
## 738 26 54 78 30 10 0.125 17.1 0.00306 0.99922 damselfly_nymphs lepidostomatidae
## 745 26 61 78 24 9 0.100 13.7 0.02977 0.99032 damselfly_nymphs rhyacophilidae
## 748 27 29 59 104 52 0.327 44.8 0.99933 0.00279 alderfly_larvae crayfish
## 749 27 30 59 100 53 0.314 43.1 0.99999 0.00007 alderfly_larvae dragonfly_nymphs
## 750 27 31 59 79 41 0.248 34.0 0.99573 0.01148 alderfly_larvae riffle_beetles
## 754 27 35 59 52 38 0.163 22.4 1.00000 0.00000 alderfly_larvae fishfly_larvae
## 755 27 36 59 39 28 0.123 16.8 1.00000 0.00002 alderfly_larvae water_penny_beetles
## 756 27 37 59 125 57 0.393 53.8 0.99096 0.04777 alderfly_larvae cranefly_larvae
## 757 27 38 59 56 30 0.176 24.1 0.98748 0.02944 alderfly_larvae ameletidae
## 758 27 39 59 117 55 0.368 50.4 0.99529 0.01979 alderfly_larvae baetidae
## 762 27 43 59 40 26 0.126 17.2 0.99979 0.00085 alderfly_larvae heptageniidae
## 763 27 44 59 11 10 0.035 4.7 0.99995 0.00098 alderfly_larvae leptohyphidae
## 764 27 45 59 53 34 0.167 22.8 0.99998 0.00007 alderfly_larvae leptophlebiidae
## 765 27 46 59 19 14 0.060 8.2 0.99925 0.00394 alderfly_larvae chloroperlidae
## 766 27 47 59 68 45 0.214 29.3 1.00000 0.00000 alderfly_larvae leuctridae
## 767 27 48 59 46 29 0.145 19.8 0.99980 0.00075 alderfly_larvae nemouridae
## 768 27 49 59 44 35 0.138 18.9 1.00000 0.00000 alderfly_larvae perlidae
## 770 27 52 59 107 54 0.336 46.1 0.99988 0.00067 alderfly_larvae hydropsychidae
## 773 27 55 59 45 27 0.141 19.4 0.99857 0.00448 alderfly_larvae limnephilidae
## 776 27 58 59 62 37 0.195 26.7 0.99992 0.00032 alderfly_larvae philopotamidae
## 777 27 59 59 8 7 0.025 3.4 0.99911 0.01153 alderfly_larvae phryganeidae
## 778 27 60 59 56 31 0.176 24.1 0.99525 0.01252 alderfly_larvae polycentropodidae
## 779 27 61 59 24 16 0.075 10.3 0.99742 0.00968 alderfly_larvae rhyacophilidae
## 780 27 62 59 46 35 0.145 19.8 1.00000 0.00000 alderfly_larvae uenoidae
## 781 28 29 105 104 85 0.582 79.7 0.99589 0.01389 other_beetles crayfish
## 782 28 30 105 100 82 0.559 76.6 0.99520 0.01543 other_beetles dragonfly_nymphs
## 786 28 34 105 45 39 0.252 34.5 0.98701 0.03918 other_beetles clams
## 801 28 49 105 44 38 0.246 33.7 0.98352 0.04799 other_beetles perlidae
## 807 28 55 105 45 41 0.252 34.5 0.99934 0.00338 other_beetles limnephilidae
## 815 29 30 104 100 83 0.554 75.9 0.99952 0.00201 crayfish dragonfly_nymphs
## 816 29 31 104 79 69 0.438 60.0 0.99994 0.00028 crayfish riffle_beetles
## 820 29 35 104 52 48 0.288 39.5 0.99996 0.00025 crayfish fishfly_larvae
## 821 29 36 104 39 37 0.216 29.6 0.99995 0.00046 crayfish water_penny_beetles
## 822 29 37 104 125 101 0.693 94.9 0.99999 0.00014 crayfish cranefly_larvae
## 823 29 38 104 56 49 0.310 42.5 0.99830 0.00638 crayfish ameletidae
## 824 29 39 104 117 94 0.648 88.8 0.99877 0.00588 crayfish baetidae
## 828 29 43 104 40 37 0.222 30.4 0.99967 0.00208 crayfish heptageniidae
## 829 29 44 104 11 11 0.061 8.4 1.00000 0.04213 crayfish leptohyphidae
## 830 29 45 104 53 51 0.294 40.2 1.00000 0.00000 crayfish leptophlebiidae
## 831 29 46 104 19 19 0.105 14.4 1.00000 0.00342 crayfish chloroperlidae
## 832 29 47 104 68 63 0.377 51.6 1.00000 0.00000 crayfish leuctridae
## 833 29 48 104 46 45 0.255 34.9 1.00000 0.00000 crayfish nemouridae
## 834 29 49 104 44 43 0.244 33.4 1.00000 0.00001 crayfish perlidae
## 835 29 50 104 18 17 0.100 13.7 0.99527 0.03700 crayfish perlodidae
## 837 29 52 104 107 91 0.593 81.2 1.00000 0.00001 crayfish hydropsychidae
## 839 29 54 104 30 29 0.166 22.8 0.99992 0.00108 crayfish lepidostomatidae
## 840 29 55 104 45 43 0.249 34.2 1.00000 0.00006 crayfish limnephilidae
## 843 29 58 104 62 56 0.344 47.1 0.99996 0.00024 crayfish philopotamidae
## 846 29 61 104 24 23 0.133 18.2 0.99936 0.00690 crayfish rhyacophilidae
## 847 29 62 104 46 43 0.255 34.9 0.99996 0.00031 crayfish uenoidae
## 848 30 31 100 79 65 0.421 57.7 0.99884 0.00396 dragonfly_nymphs riffle_beetles
## 851 30 34 100 45 38 0.240 32.8 0.99153 0.02579 dragonfly_nymphs clams
## 852 30 35 100 52 44 0.277 38.0 0.99616 0.01248 dragonfly_nymphs fishfly_larvae
## 853 30 36 100 39 37 0.208 28.5 0.99999 0.00010 dragonfly_nymphs water_penny_beetles
## 854 30 37 100 125 95 0.666 91.2 0.99688 0.01706 dragonfly_nymphs cranefly_larvae
## 855 30 38 100 56 48 0.298 40.9 0.99893 0.00403 dragonfly_nymphs ameletidae
## 856 30 39 100 117 92 0.623 85.4 0.99987 0.00079 dragonfly_nymphs baetidae
## 860 30 43 100 40 36 0.213 29.2 0.99952 0.00253 dragonfly_nymphs heptageniidae
## 862 30 45 100 53 47 0.282 38.7 0.99986 0.00069 dragonfly_nymphs leptophlebiidae
## 863 30 46 100 19 18 0.101 13.9 0.99850 0.01440 dragonfly_nymphs chloroperlidae
## 864 30 47 100 68 62 0.362 49.6 1.00000 0.00000 dragonfly_nymphs leuctridae
## 865 30 48 100 46 43 0.245 33.6 0.99999 0.00005 dragonfly_nymphs nemouridae
## 866 30 49 100 44 40 0.234 32.1 0.99989 0.00067 dragonfly_nymphs perlidae
## 867 30 50 100 18 18 0.096 13.1 1.00000 0.00218 dragonfly_nymphs perlodidae
## 869 30 52 100 107 88 0.570 78.1 1.00000 0.00001 dragonfly_nymphs hydropsychidae
## 871 30 54 100 30 28 0.160 21.9 0.99968 0.00248 dragonfly_nymphs lepidostomatidae
## 872 30 55 100 45 39 0.240 32.8 0.99775 0.00847 dragonfly_nymphs limnephilidae
## 875 30 58 100 62 54 0.330 45.3 0.99988 0.00056 dragonfly_nymphs philopotamidae
## 878 30 61 100 24 23 0.128 17.5 0.99978 0.00276 dragonfly_nymphs rhyacophilidae
## 879 30 62 100 46 44 0.245 33.6 1.00000 0.00001 dragonfly_nymphs uenoidae
## 881 31 33 79 99 65 0.417 57.1 0.99941 0.00214 riffle_beetles snails
## 882 31 34 79 45 32 0.189 25.9 0.99267 0.01964 riffle_beetles clams
## 884 31 36 79 39 28 0.164 22.5 0.99025 0.02628 riffle_beetles water_penny_beetles
## 885 31 37 79 125 76 0.526 72.1 0.99677 0.01838 riffle_beetles cranefly_larvae
## 886 31 38 79 56 47 0.236 32.3 1.00000 0.00000 riffle_beetles ameletidae
## 887 31 39 79 117 74 0.492 67.5 0.99974 0.00156 riffle_beetles baetidae
## 888 31 40 79 13 11 0.055 7.5 0.99395 0.03400 riffle_beetles caenidae
## 891 31 43 79 40 29 0.168 23.1 0.99351 0.01835 riffle_beetles heptageniidae
## 892 31 44 79 11 10 0.046 6.3 0.99829 0.01749 riffle_beetles leptohyphidae
## 894 31 46 79 19 15 0.080 11.0 0.99074 0.03526 riffle_beetles chloroperlidae
## 895 31 47 79 68 47 0.286 39.2 0.99802 0.00570 riffle_beetles leuctridae
## 897 31 49 79 44 34 0.185 25.4 0.99973 0.00108 riffle_beetles perlidae
## 900 31 52 79 107 73 0.450 61.7 1.00000 0.00000 riffle_beetles hydropsychidae
## 902 31 54 79 30 12 0.126 17.3 0.02280 0.99216 riffle_beetles lepidostomatidae
## 906 31 58 79 62 48 0.261 35.8 1.00000 0.00002 riffle_beetles philopotamidae
## 908 31 60 79 56 39 0.236 32.3 0.99470 0.01403 riffle_beetles polycentropodidae
## 910 31 62 79 46 32 0.194 26.5 0.98638 0.03341 riffle_beetles uenoidae
## 915 32 37 135 125 125 0.899 123.2 1.00000 0.00708 other_flies cranefly_larvae
## 917 32 39 135 117 117 0.842 115.3 1.00000 0.02040 other_flies baetidae
## 930 32 52 135 107 107 0.770 105.4 1.00000 0.04669 other_flies hydropsychidae
## 952 33 45 99 53 27 0.280 38.3 0.00001 1.00000 snails leptophlebiidae
## 954 33 47 99 68 43 0.359 49.1 0.01535 0.99461 snails leuctridae
## 955 33 48 99 46 25 0.243 33.2 0.00103 0.99975 snails nemouridae
## 961 33 54 99 30 10 0.158 21.7 0.00000 1.00000 snails lepidostomatidae
## 962 33 55 99 45 27 0.237 32.5 0.02187 0.99208 snails limnephilidae
## 964 33 57 99 5 0 0.026 3.6 0.00134 1.00000 snails odontoceridae
## 995 34 62 45 46 20 0.110 15.1 0.98034 0.04631 clams uenoidae
## 996 35 36 52 39 29 0.108 14.8 1.00000 0.00000 fishfly_larvae water_penny_beetles
## 1003 35 43 52 40 22 0.111 15.2 0.99754 0.00757 fishfly_larvae heptageniidae
## 1004 35 44 52 11 8 0.030 4.2 0.99725 0.01679 fishfly_larvae leptohyphidae
## 1005 35 45 52 53 35 0.147 20.1 1.00000 0.00000 fishfly_larvae leptophlebiidae
## 1006 35 46 52 19 12 0.053 7.2 0.99607 0.01551 fishfly_larvae chloroperlidae
## 1007 35 47 52 68 47 0.188 25.8 1.00000 0.00000 fishfly_larvae leuctridae
## 1008 35 48 52 46 32 0.127 17.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae nemouridae
## 1009 35 49 52 44 29 0.122 16.7 1.00000 0.00000 fishfly_larvae perlidae
## 1011 35 52 52 107 51 0.296 40.6 1.00000 0.00000 fishfly_larvae hydropsychidae
## 1013 35 54 52 30 21 0.083 11.4 0.99999 0.00006 fishfly_larvae lepidostomatidae
## 1014 35 55 52 45 27 0.125 17.1 0.99995 0.00022 fishfly_larvae limnephilidae
## 1016 35 57 52 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00696 fishfly_larvae odontoceridae
## 1017 35 58 52 62 38 0.172 23.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae philopotamidae
## 1018 35 59 52 8 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 fishfly_larvae phryganeidae
## 1019 35 60 52 56 31 0.155 21.3 0.99988 0.00046 fishfly_larvae polycentropodidae
## 1020 35 61 52 24 19 0.066 9.1 1.00000 0.00001 fishfly_larvae rhyacophilidae
## 1021 35 62 52 46 30 0.127 17.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae uenoidae
## 1023 36 38 39 56 25 0.116 15.9 0.99988 0.00051 water_penny_beetles ameletidae
## 1024 36 39 39 117 39 0.243 33.3 1.00000 0.00066 water_penny_beetles baetidae
## 1027 36 43 39 40 18 0.083 11.4 0.99816 0.00619 water_penny_beetles heptageniidae
## 1028 36 44 39 11 8 0.023 3.1 0.99980 0.00197 water_penny_beetles leptohyphidae
## 1029 36 45 39 53 25 0.110 15.1 0.99997 0.00014 water_penny_beetles leptophlebiidae
## 1030 36 46 39 19 11 0.039 5.4 0.99928 0.00372 water_penny_beetles chloroperlidae
## 1031 36 47 39 68 36 0.141 19.4 1.00000 0.00000 water_penny_beetles leuctridae
## 1032 36 48 39 46 25 0.096 13.1 1.00000 0.00000 water_penny_beetles nemouridae
## 1033 36 49 39 44 21 0.091 12.5 0.99983 0.00074 water_penny_beetles perlidae
## 1034 36 50 39 18 9 0.037 5.1 0.99089 0.03285 water_penny_beetles perlodidae
## 1035 36 52 39 107 37 0.222 30.5 0.99983 0.00141 water_penny_beetles hydropsychidae
## 1036 36 53 39 16 8 0.033 4.6 0.98740 0.04531 water_penny_beetles hydroptilidae
## 1037 36 54 39 30 14 0.062 8.5 0.99600 0.01328 water_penny_beetles lepidostomatidae
## 1038 36 55 39 45 18 0.094 12.8 0.98828 0.03057 water_penny_beetles limnephilidae
## 1041 36 58 39 62 30 0.129 17.6 1.00000 0.00000 water_penny_beetles philopotamidae
## 1043 36 60 39 56 25 0.116 15.9 0.99988 0.00051 water_penny_beetles polycentropodidae
## 1044 36 61 39 24 16 0.050 6.8 1.00000 0.00002 water_penny_beetles rhyacophilidae
## 1045 36 62 39 46 28 0.096 13.1 1.00000 0.00000 water_penny_beetles uenoidae
## 1046 37 38 125 56 55 0.373 51.1 0.99873 0.01349 cranefly_larvae ameletidae
## 1047 37 39 125 117 111 0.779 106.8 0.99975 0.00243 cranefly_larvae baetidae
## 1053 37 45 125 53 53 0.353 48.4 1.00000 0.00203 cranefly_larvae leptophlebiidae
## 1055 37 47 125 68 67 0.453 62.0 0.99984 0.00239 cranefly_larvae leuctridae
## 1056 37 48 125 46 45 0.306 42.0 0.99432 0.04484 cranefly_larvae nemouridae
## 1057 37 49 125 44 44 0.293 40.1 1.00000 0.00749 cranefly_larvae perlidae
## 1060 37 52 125 107 104 0.713 97.6 1.00000 0.00005 cranefly_larvae hydropsychidae
## 1066 37 58 125 62 61 0.413 56.6 0.99953 0.00593 cranefly_larvae philopotamidae
## 1068 37 60 125 56 55 0.373 51.1 0.99873 0.01349 cranefly_larvae polycentropodidae
## 1071 38 39 56 117 55 0.349 47.8 0.99999 0.00017 ameletidae baetidae
## 1072 38 40 56 13 9 0.039 5.3 0.99333 0.03026 ameletidae caenidae
## 1073 38 41 56 5 5 0.015 2.0 1.00000 0.01023 ameletidae ephemerellidae
## 1075 38 43 56 40 27 0.119 16.4 0.99999 0.00005 ameletidae heptageniidae
## 1076 38 44 56 11 9 0.033 4.5 0.99943 0.00521 ameletidae leptohyphidae
## 1077 38 45 56 53 28 0.158 21.7 0.99259 0.01877 ameletidae leptophlebiidae
## 1078 38 46 56 19 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 ameletidae chloroperlidae
## 1079 38 47 56 68 36 0.203 27.8 0.99883 0.00358 ameletidae leuctridae
## 1080 38 48 56 46 25 0.137 18.8 0.99301 0.01827 ameletidae nemouridae
## 1081 38 49 56 44 24 0.131 18.0 0.99217 0.02037 ameletidae perlidae
## 1082 38 50 56 18 14 0.054 7.4 0.99989 0.00080 ameletidae perlodidae
## 1083 38 52 56 107 51 0.319 43.7 0.99968 0.00162 ameletidae hydropsychidae
## 1089 38 58 56 62 32 0.185 25.3 0.99384 0.01572 ameletidae philopotamidae
## 1091 38 60 56 56 30 0.167 22.9 0.99643 0.00975 ameletidae polycentropodidae
## 1093 38 62 56 46 28 0.137 18.8 0.99982 0.00070 ameletidae uenoidae
## 1097 39 43 117 40 39 0.249 34.2 0.99948 0.00591 baetidae heptageniidae
## 1099 39 45 117 53 51 0.330 45.3 0.99964 0.00288 baetidae leptophlebiidae
## 1100 39 46 117 19 19 0.118 16.2 1.00000 0.03935 baetidae chloroperlidae
## 1101 39 47 117 68 65 0.424 58.1 0.99992 0.00066 baetidae leuctridae
## 1102 39 48 117 46 44 0.287 39.3 0.99827 0.01116 baetidae nemouridae
## 1103 39 49 117 44 42 0.274 37.6 0.99736 0.01592 baetidae perlidae
## 1104 39 50 117 18 18 0.112 15.4 1.00000 0.04730 baetidae perlodidae
## 1106 39 52 117 107 98 0.667 91.4 0.99994 0.00044 baetidae hydropsychidae
## 1112 39 58 117 62 58 0.386 52.9 0.99745 0.01174 baetidae philopotamidae
## 1114 39 60 117 56 54 0.349 47.8 0.99983 0.00153 baetidae polycentropodidae
## 1115 39 61 117 24 24 0.150 20.5 1.00000 0.01528 baetidae rhyacophilidae
## 1116 39 62 117 46 46 0.287 39.3 1.00000 0.00013 baetidae uenoidae
## 1118 40 44 13 11 4 0.008 1.0 0.99884 0.01133 caenidae leptohyphidae
## 1123 40 49 13 44 8 0.030 4.2 0.99546 0.02177 caenidae perlidae
## 1124 40 50 13 18 5 0.012 1.7 0.99783 0.01474 caenidae perlodidae
## 1132 40 62 13 46 8 0.032 4.4 0.99346 0.02925 caenidae uenoidae
## 1150 42 62 3 46 3 0.007 1.0 1.00000 0.03621 ephemeridae uenoidae
## 1151 43 44 40 11 8 0.023 3.2 0.99974 0.00240 heptageniidae leptohyphidae
## 1152 43 45 40 53 30 0.113 15.5 1.00000 0.00000 heptageniidae leptophlebiidae
## 1153 43 46 40 19 13 0.040 5.5 0.99998 0.00015 heptageniidae chloroperlidae
## 1154 43 47 40 68 32 0.145 19.9 1.00000 0.00000 heptageniidae leuctridae
## 1155 43 48 40 46 29 0.098 13.4 1.00000 0.00000 heptageniidae nemouridae
## 1156 43 49 40 44 30 0.094 12.8 1.00000 0.00000 heptageniidae perlidae
## 1157 43 50 40 18 14 0.038 5.3 1.00000 0.00001 heptageniidae perlodidae
## 1158 43 52 40 107 36 0.228 31.2 0.99422 0.02242 heptageniidae hydropsychidae
## 1160 43 54 40 30 13 0.064 8.8 0.98254 0.04697 heptageniidae lepidostomatidae
## 1161 43 55 40 45 23 0.096 13.1 0.99998 0.00011 heptageniidae limnephilidae
## 1165 43 59 40 8 6 0.017 2.3 0.99925 0.00790 heptageniidae phryganeidae
## 1167 43 61 40 24 13 0.051 7.0 0.99901 0.00430 heptageniidae rhyacophilidae
## 1168 43 62 40 46 27 0.098 13.4 1.00000 0.00000 heptageniidae uenoidae
## 1169 44 45 11 53 10 0.031 4.3 0.99999 0.00032 leptohyphidae leptophlebiidae
## 1170 44 46 11 19 7 0.011 1.5 1.00000 0.00008 leptohyphidae chloroperlidae
## 1171 44 47 11 68 11 0.040 5.5 1.00000 0.00029 leptohyphidae leuctridae
## 1172 44 48 11 46 11 0.027 3.7 1.00000 0.00000 leptohyphidae nemouridae
## 1173 44 49 11 44 11 0.026 3.5 1.00000 0.00000 leptohyphidae perlidae
## 1174 44 50 11 18 4 0.011 1.4 0.99369 0.03869 leptohyphidae perlodidae
## 1176 44 53 11 16 4 0.009 1.3 0.99651 0.02520 leptohyphidae hydroptilidae
## 1182 44 62 11 46 10 0.027 3.7 1.00000 0.00007 leptohyphidae uenoidae
## 1183 45 46 53 19 16 0.054 7.4 1.00000 0.00002 leptophlebiidae chloroperlidae
## 1184 45 47 53 68 47 0.192 26.3 1.00000 0.00000 leptophlebiidae leuctridae
## 1185 45 48 53 46 37 0.130 17.8 1.00000 0.00000 leptophlebiidae nemouridae
## 1186 45 49 53 44 36 0.124 17.0 1.00000 0.00000 leptophlebiidae perlidae
## 1187 45 50 53 18 14 0.051 7.0 0.99995 0.00038 leptophlebiidae perlodidae
## 1188 45 52 53 107 50 0.302 41.4 0.99999 0.00013 leptophlebiidae hydropsychidae
## 1190 45 54 53 30 26 0.085 11.6 1.00000 0.00000 leptophlebiidae lepidostomatidae
## 1191 45 55 53 45 31 0.127 17.4 1.00000 0.00000 leptophlebiidae limnephilidae
## 1192 45 56 53 4 4 0.011 1.5 1.00000 0.02085 leptophlebiidae molannidae
## 1193 45 57 53 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00768 leptophlebiidae odontoceridae
## 1196 45 60 53 56 29 0.158 21.7 0.99740 0.00741 leptophlebiidae polycentropodidae
## 1197 45 61 53 24 19 0.068 9.3 1.00000 0.00001 leptophlebiidae rhyacophilidae
## 1198 45 62 53 46 28 0.130 17.8 0.99996 0.00016 leptophlebiidae uenoidae
## 1199 46 47 19 68 18 0.069 9.4 1.00000 0.00001 chloroperlidae leuctridae
## 1200 46 48 19 46 19 0.047 6.4 1.00000 0.00000 chloroperlidae nemouridae
## 1201 46 49 19 44 16 0.045 6.1 1.00000 0.00000 chloroperlidae perlidae
## 1202 46 50 19 18 10 0.018 2.5 1.00000 0.00001 chloroperlidae perlodidae
## 1203 46 52 19 107 18 0.108 14.8 0.99382 0.04576 chloroperlidae hydropsychidae
## 1205 46 54 19 30 8 0.030 4.2 0.99283 0.02779 chloroperlidae lepidostomatidae
## 1207 46 58 19 62 15 0.063 8.6 0.99977 0.00152 chloroperlidae philopotamidae
## 1209 46 60 19 56 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 chloroperlidae polycentropodidae
## 1210 46 61 19 24 9 0.024 3.3 0.99985 0.00107 chloroperlidae rhyacophilidae
## 1211 46 62 19 46 15 0.047 6.4 1.00000 0.00002 chloroperlidae uenoidae
## 1212 47 48 68 46 41 0.167 22.8 1.00000 0.00000 leuctridae nemouridae
## 1213 47 49 68 44 38 0.159 21.8 1.00000 0.00000 leuctridae perlidae
## 1214 47 50 68 18 13 0.065 8.9 0.99049 0.03461 leuctridae perlodidae
## 1215 47 52 68 107 65 0.388 53.1 1.00000 0.00000 leuctridae hydropsychidae
## 1217 47 54 68 30 26 0.109 14.9 1.00000 0.00000 leuctridae lepidostomatidae
## 1218 47 55 68 45 34 0.163 22.3 1.00000 0.00002 leuctridae limnephilidae
## 1220 47 57 68 5 5 0.018 2.5 1.00000 0.02790 leuctridae odontoceridae
## 1221 47 58 68 62 46 0.225 30.8 1.00000 0.00000 leuctridae philopotamidae
## 1223 47 60 68 56 40 0.203 27.8 1.00000 0.00002 leuctridae polycentropodidae
## 1224 47 61 68 24 22 0.087 11.9 1.00000 0.00000 leuctridae rhyacophilidae
## 1225 47 62 68 46 38 0.167 22.8 1.00000 0.00000 leuctridae uenoidae
## 1226 48 49 46 44 31 0.108 14.8 1.00000 0.00000 nemouridae perlidae
## 1227 48 50 46 18 17 0.044 6.0 1.00000 0.00000 nemouridae perlodidae
## 1228 48 52 46 107 44 0.262 35.9 0.99998 0.00017 nemouridae hydropsychidae
## 1230 48 54 46 30 23 0.074 10.1 1.00000 0.00000 nemouridae lepidostomatidae
## 1231 48 55 46 45 29 0.110 15.1 1.00000 0.00000 nemouridae limnephilidae
## 1233 48 57 46 5 5 0.012 1.7 1.00000 0.00367 nemouridae odontoceridae
## 1234 48 58 46 62 31 0.152 20.8 0.99995 0.00020 nemouridae philopotamidae
## 1237 48 61 46 24 21 0.059 8.1 1.00000 0.00000 nemouridae rhyacophilidae
## 1238 48 62 46 46 31 0.113 15.4 1.00000 0.00000 nemouridae uenoidae
## 1239 49 50 44 18 13 0.042 5.8 0.99997 0.00022 perlidae perlodidae
## 1240 49 52 44 107 41 0.251 34.4 0.99969 0.00199 perlidae hydropsychidae
## 1242 49 54 44 30 16 0.070 9.6 0.99850 0.00551 perlidae lepidostomatidae
## 1243 49 55 44 45 26 0.105 14.5 1.00000 0.00001 perlidae limnephilidae
## 1246 49 58 44 62 28 0.145 19.9 0.99923 0.00261 perlidae philopotamidae
## 1247 49 59 44 8 6 0.019 2.6 0.99850 0.01358 perlidae phryganeidae
## 1249 49 61 44 24 12 0.056 7.7 0.98795 0.03632 perlidae rhyacophilidae
## 1250 49 62 44 46 29 0.108 14.8 1.00000 0.00000 perlidae uenoidae
## 1253 50 54 18 30 9 0.029 3.9 0.99919 0.00446 perlodidae lepidostomatidae
## 1259 50 62 18 46 14 0.044 6.0 1.00000 0.00005 perlodidae uenoidae
## 1262 52 54 107 30 28 0.171 23.4 0.99741 0.01529 hydropsychidae lepidostomatidae
## 1263 52 55 107 45 40 0.257 35.1 0.99302 0.02442 hydropsychidae limnephilidae
## 1266 52 58 107 62 59 0.353 48.4 1.00000 0.00000 hydropsychidae philopotamidae
## 1268 52 60 107 56 51 0.319 43.7 0.99968 0.00162 hydropsychidae polycentropodidae
## 1269 52 61 107 24 24 0.137 18.7 1.00000 0.00138 hydropsychidae rhyacophilidae
## 1270 52 62 107 46 43 0.262 35.9 0.99983 0.00113 hydropsychidae uenoidae
## 1274 53 60 16 56 11 0.048 6.5 0.99625 0.01664 hydroptilidae polycentropodidae
## 1277 54 55 30 45 23 0.072 9.9 1.00000 0.00000 lepidostomatidae limnephilidae
## 1278 54 57 30 5 5 0.008 1.1 1.00000 0.00038 lepidostomatidae odontoceridae
## 1282 54 61 30 24 16 0.038 5.3 1.00000 0.00000 lepidostomatidae rhyacophilidae
## 1283 54 62 30 46 17 0.074 10.1 0.99927 0.00291 lepidostomatidae uenoidae
## 1284 55 56 45 4 4 0.010 1.3 1.00000 0.01061 limnephilidae molannidae
## 1285 55 57 45 5 5 0.012 1.6 1.00000 0.00327 limnephilidae odontoceridae
## 1286 55 58 45 62 26 0.149 20.4 0.98754 0.03032 limnephilidae philopotamidae
## 1289 55 61 45 24 16 0.058 7.9 0.99997 0.00020 limnephilidae rhyacophilidae
## 1290 55 62 45 46 22 0.110 15.1 0.99759 0.00735 limnephilidae uenoidae
## 1294 57 58 5 62 5 0.017 2.3 1.00000 0.01732 odontoceridae philopotamidae
## 1298 58 60 62 56 36 0.185 25.3 0.99996 0.00018 philopotamidae polycentropodidae
## 1299 58 61 62 24 18 0.079 10.9 0.99976 0.00127 philopotamidae rhyacophilidae
## 1300 58 62 62 46 28 0.152 20.8 0.99742 0.00754 philopotamidae uenoidae
## 1303 59 62 8 46 7 0.020 2.7 0.99990 0.00205 phryganeidae uenoidae
## 1304 60 61 56 24 17 0.072 9.8 0.99978 0.00117 polycentropodidae rhyacophilidae
## 1305 60 62 56 46 26 0.137 18.8 0.99764 0.00699 polycentropodidae uenoidae
## 1306 61 62 24 46 18 0.059 8.1 1.00000 0.00001 rhyacophilidae uenoidae
co[, "sp1_name"] == rownames(streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3)[co$sp1]
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visNetwork(nodes = nodes, edges = edges) %>%
visIgraphLayout(layout = "layout_with_kk")
plot(cooc)
pair.attributes(cooc)
## pos neg rand num_pos num_neg num_rand sppname
## 1 9.30 9.30 81.40 4 4 35 streambioticsum_suff_mtdusky
## 10 41.51 0.00 58.49 22 0 31 streambioticsum_suff_nodusky
## 20 46.55 0.00 53.45 27 0 31 streambioticsum_suff_twolined
## 31 30.30 3.03 66.67 10 1 22 streambioticsum_suff_longtail
## 42 36.59 14.63 48.78 15 6 20 streambioticsum_suff_red
## 53 0.00 0.00 100.00 0 0 12 streambioticsum_suff_mole
## 57 35.85 5.66 58.49 19 3 31 streambioticsum_suff_redback
## 58 34.21 0.00 65.79 13 0 25 streambioticsum_suff_slimy
## 59 37.21 2.33 60.47 16 1 26 blacknose_dace
## 2 0.00 0.00 100.00 0 0 12 bluegill_sunfish
## 3 0.00 0.00 100.00 0 0 25 central_stoneroller_minnow
## 4 25.49 3.92 70.59 13 2 36 creek_chub
## 5 0.00 0.00 100.00 0 0 12 green_sunfish
## 6 6.25 0.00 93.75 2 0 30 johnny_darter
## 7 3.12 0.00 96.88 1 0 31 rainbow_darter
## 8 0.00 0.00 100.00 0 0 12 redbelly_dace
## 9 3.12 0.00 96.88 1 0 31 white_sucker
## 11 3.12 0.00 96.88 1 0 31 sessile_animals
## 12 0.00 6.90 93.10 0 4 54 aquatic_worms
## 13 7.84 25.49 66.67 4 13 34 sow_bugs
## 14 3.77 16.98 79.25 2 9 42 scuds
## 15 11.32 0.00 88.68 6 0 47 water_mites
## 16 18.97 8.62 72.41 11 5 42 damselfly_nymphs
## 17 49.06 5.66 45.28 26 3 24 alderfly_larvae
## 18 8.62 0.00 91.38 5 0 53 other_beetles
## 19 46.55 0.00 53.45 27 0 31 crayfish
## 21 48.28 1.72 50.00 28 1 29 dragonfly_nymphs
## 22 41.38 3.45 55.17 24 2 32 riffle_beetles
## 23 5.17 0.00 94.83 3 0 55 other_flies
## 24 6.90 15.52 77.59 4 9 45 snails
## 25 9.80 0.00 90.20 5 0 46 clams
## 26 49.06 3.77 47.17 26 2 25 fishfly_larvae
## 27 56.86 0.00 43.14 29 0 22 water_penny_beetles
## 28 29.31 0.00 70.69 17 0 41 cranefly_larvae
## 29 50.94 1.89 47.17 27 1 25 ameletidae
## 30 41.38 0.00 58.62 24 0 34 baetidae
## 32 17.07 0.00 82.93 7 0 34 caenidae
## 33 3.03 0.00 96.97 1 0 32 ephemerellidae
## 34 4.00 0.00 96.00 1 0 24 ephemeridae
## 35 49.02 3.92 47.06 25 2 24 heptageniidae
## 36 41.46 2.44 56.10 17 1 23 leptohyphidae
## 37 56.60 7.55 35.85 30 4 19 leptophlebiidae
## 38 55.81 0.00 44.19 24 0 19 chloroperlidae
## 39 62.26 7.55 30.19 33 4 16 leuctridae
## 40 54.72 7.55 37.74 29 4 20 nemouridae
## 41 56.86 7.84 35.29 29 4 18 perlidae
## 43 37.21 2.33 60.47 16 1 26 perlodidae
## 44 0.00 0.00 100.00 0 0 12 glossosomatidae
## 45 46.55 0.00 53.45 27 0 31 hydropsychidae
## 46 7.32 0.00 92.68 3 0 38 hydroptilidae
## 47 45.65 13.04 41.30 21 6 19 lepidostomatidae
## 48 43.14 5.88 50.98 22 3 26 limnephilidae
## 49 9.38 0.00 90.62 3 0 29 molannidae
## 50 27.27 3.03 69.70 9 1 23 odontoceridae
## 51 47.17 0.00 52.83 25 0 28 philopotamidae
## 52 15.79 0.00 84.21 6 0 32 phryganeidae
## 54 35.85 0.00 64.15 19 0 34 polycentropodidae
## 55 53.49 4.65 41.86 23 2 18 rhyacophilidae
## 56 60.38 3.77 35.85 32 2 19 uenoidae
pair.profile(cooc)
prob.table(cooc)
## sp1 sp2 sp1_inc sp2_inc obs_cooccur prob_cooccur exp_cooccur p_lt p_gt sp1_name sp2_name
## 1 1 2 24 51 22 0.065 8.9 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_nodusky
## 2 1 3 24 102 22 0.130 17.9 0.99560 0.02403 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_twolined
## 3 1 5 24 17 1 0.022 3.0 0.15631 0.96998 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_red
## 4 1 7 24 60 7 0.077 10.5 0.08500 0.96732 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_redback
## 5 1 8 24 8 0 0.010 1.4 0.20475 1.00000 streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_slimy
## 6 1 9 24 19 3 0.024 3.3 0.56475 0.69032 streambioticsum_suff_mtdusky blacknose_dace
## 7 1 13 24 36 3 0.046 6.3 0.07063 0.98020 streambioticsum_suff_mtdusky creek_chub
## 8 1 22 24 122 21 0.156 21.4 0.51086 0.74679 streambioticsum_suff_mtdusky aquatic_worms
## 9 1 23 24 42 10 0.054 7.4 0.93469 0.14836 streambioticsum_suff_mtdusky sow_bugs
## 10 1 24 24 51 11 0.065 8.9 0.88279 0.23168 streambioticsum_suff_mtdusky scuds
## 11 1 25 24 52 9 0.066 9.1 0.57625 0.60647 streambioticsum_suff_mtdusky water_mites
## 12 1 26 24 78 16 0.100 13.7 0.90212 0.20319 streambioticsum_suff_mtdusky damselfly_nymphs
## 13 1 27 24 59 12 0.075 10.3 0.83707 0.29720 streambioticsum_suff_mtdusky alderfly_larvae
## 14 1 28 24 105 18 0.134 18.4 0.50977 0.69077 streambioticsum_suff_mtdusky other_beetles
## 15 1 29 24 104 21 0.133 18.2 0.96499 0.11199 streambioticsum_suff_mtdusky crayfish
## 16 1 30 24 100 18 0.128 17.5 0.68288 0.51399 streambioticsum_suff_mtdusky dragonfly_nymphs
## 17 1 31 24 79 10 0.101 13.8 0.06502 0.97533 streambioticsum_suff_mtdusky riffle_beetles
## 18 1 32 24 135 24 0.173 23.6 1.00000 0.67926 streambioticsum_suff_mtdusky other_flies
## 19 1 33 24 99 20 0.127 17.3 0.94914 0.13826 streambioticsum_suff_mtdusky snails
## 20 1 34 24 45 7 0.058 7.9 0.43440 0.74225 streambioticsum_suff_mtdusky clams
## 21 1 35 24 52 12 0.066 9.1 0.94047 0.13452 streambioticsum_suff_mtdusky fishfly_larvae
## 22 1 36 24 39 10 0.050 6.8 0.96313 0.09415 streambioticsum_suff_mtdusky water_penny_beetles
## 23 1 37 24 125 23 0.160 21.9 0.91110 0.33991 streambioticsum_suff_mtdusky cranefly_larvae
## 24 1 38 24 56 13 0.072 9.8 0.95331 0.10996 streambioticsum_suff_mtdusky ameletidae
## 25 1 39 24 117 22 0.150 20.5 0.90672 0.27268 streambioticsum_suff_mtdusky baetidae
## 26 1 40 24 13 2 0.017 2.3 0.59393 0.70628 streambioticsum_suff_mtdusky caenidae
## 27 1 43 24 40 1 0.051 7.0 0.00134 0.99990 streambioticsum_suff_mtdusky heptageniidae
## 28 1 44 24 11 0 0.014 1.9 0.10982 1.00000 streambioticsum_suff_mtdusky leptohyphidae
## 29 1 45 24 53 6 0.068 9.3 0.09766 0.96263 streambioticsum_suff_mtdusky leptophlebiidae
## 30 1 46 24 19 3 0.024 3.3 0.56475 0.69032 streambioticsum_suff_mtdusky chloroperlidae
## 31 1 47 24 68 18 0.087 11.9 0.99873 0.00548 streambioticsum_suff_mtdusky leuctridae
## 32 1 48 24 46 4 0.059 8.1 0.04100 0.98845 streambioticsum_suff_mtdusky nemouridae
## 33 1 49 24 44 3 0.056 7.7 0.01717 0.99635 streambioticsum_suff_mtdusky perlidae
## 34 1 50 24 18 1 0.023 3.2 0.13211 0.97598 streambioticsum_suff_mtdusky perlodidae
## 35 1 52 24 107 21 0.137 18.7 0.94022 0.17087 streambioticsum_suff_mtdusky hydropsychidae
## 36 1 53 24 16 3 0.020 2.8 0.70244 0.56008 streambioticsum_suff_mtdusky hydroptilidae
## 37 1 54 24 30 4 0.038 5.3 0.35189 0.82913 streambioticsum_suff_mtdusky lepidostomatidae
## 38 1 55 24 45 1 0.058 7.9 0.00037 0.99998 streambioticsum_suff_mtdusky limnephilidae
## 39 1 58 24 62 13 0.079 10.9 0.88310 0.22928 streambioticsum_suff_mtdusky philopotamidae
## 40 1 59 24 8 0 0.010 1.4 0.20475 1.00000 streambioticsum_suff_mtdusky phryganeidae
## 41 1 60 24 56 15 0.072 9.8 0.99514 0.01657 streambioticsum_suff_mtdusky polycentropodidae
## 42 1 61 24 24 4 0.031 4.2 0.58531 0.64733 streambioticsum_suff_mtdusky rhyacophilidae
## 43 1 62 24 46 8 0.059 8.1 0.58944 0.59824 streambioticsum_suff_mtdusky uenoidae
## 44 2 3 51 102 48 0.277 38.0 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_twolined
## 45 2 4 51 5 2 0.014 1.9 0.73243 0.61686 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_longtail
## 46 2 5 51 17 12 0.046 6.3 0.99945 0.00317 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_red
## 47 2 7 51 60 28 0.163 22.3 0.98593 0.03299 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_redback
## 48 2 8 51 8 7 0.022 3.0 0.99975 0.00424 streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_slimy
## 49 2 9 51 19 8 0.052 7.1 0.76918 0.40791 streambioticsum_suff_nodusky blacknose_dace
## 50 2 11 51 3 1 0.008 1.1 0.68877 0.75588 streambioticsum_suff_nodusky central_stoneroller_minnow
## 51 2 13 51 36 10 0.098 13.4 0.12128 0.94325 streambioticsum_suff_nodusky creek_chub
## 52 2 15 51 4 1 0.011 1.5 0.52285 0.84879 streambioticsum_suff_nodusky johnny_darter
## 53 2 16 51 4 0 0.011 1.5 0.15121 1.00000 streambioticsum_suff_nodusky rainbow_darter
## 54 2 19 51 4 1 0.011 1.5 0.52285 0.84879 streambioticsum_suff_nodusky white_sucker
## 55 2 21 51 4 4 0.011 1.5 1.00000 0.01779 streambioticsum_suff_nodusky sessile_animals
## 56 2 22 51 122 46 0.332 45.4 0.72538 0.48889 streambioticsum_suff_nodusky aquatic_worms
## 57 2 23 51 42 15 0.114 15.6 0.48193 0.66618 streambioticsum_suff_nodusky sow_bugs
## 58 2 24 51 51 19 0.139 19.0 0.57607 0.56882 streambioticsum_suff_nodusky scuds
## 59 2 25 51 52 24 0.141 19.4 0.96910 0.06608 streambioticsum_suff_nodusky water_mites
## 60 2 26 51 78 27 0.212 29.0 0.29131 0.81742 streambioticsum_suff_nodusky damselfly_nymphs
## 61 2 27 51 59 29 0.160 22.0 0.99643 0.00985 streambioticsum_suff_nodusky alderfly_larvae
## 62 2 28 51 105 40 0.285 39.1 0.72000 0.43543 streambioticsum_suff_nodusky other_beetles
## 63 2 29 51 104 46 0.283 38.7 0.99965 0.00177 streambioticsum_suff_nodusky crayfish
## 64 2 30 51 100 44 0.272 37.2 0.99864 0.00517 streambioticsum_suff_nodusky dragonfly_nymphs
## 65 2 31 51 79 26 0.215 29.4 0.14909 0.91879 streambioticsum_suff_nodusky riffle_beetles
## 66 2 32 51 135 51 0.367 50.3 1.00000 0.39234 streambioticsum_suff_nodusky other_flies
## 67 2 33 51 99 36 0.269 36.9 0.44157 0.70520 streambioticsum_suff_nodusky snails
## 68 2 34 51 45 19 0.122 16.8 0.84941 0.25443 streambioticsum_suff_nodusky clams
## 69 2 35 51 52 29 0.141 19.4 0.99989 0.00045 streambioticsum_suff_nodusky fishfly_larvae
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## 82 2 48 51 46 23 0.125 17.1 0.99118 0.02262 streambioticsum_suff_nodusky nemouridae
## 83 2 49 51 44 17 0.120 16.4 0.66585 0.47952 streambioticsum_suff_nodusky perlidae
## 84 2 50 51 18 7 0.049 6.7 0.66666 0.53500 streambioticsum_suff_nodusky perlodidae
## 85 2 52 51 107 48 0.291 39.8 0.99997 0.00025 streambioticsum_suff_nodusky hydropsychidae
## 86 2 53 51 16 7 0.043 6.0 0.80341 0.37646 streambioticsum_suff_nodusky hydroptilidae
## 87 2 54 51 30 17 0.082 11.2 0.99624 0.01210 streambioticsum_suff_nodusky lepidostomatidae
## 88 2 55 51 45 17 0.122 16.8 0.61271 0.53551 streambioticsum_suff_nodusky limnephilidae
## 89 2 56 51 4 2 0.011 1.5 0.85468 0.47715 streambioticsum_suff_nodusky molannidae
## 90 2 57 51 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00629 streambioticsum_suff_nodusky odontoceridae
## 91 2 58 51 62 30 0.168 23.1 0.99583 0.01128 streambioticsum_suff_nodusky philopotamidae
## 92 2 59 51 8 4 0.022 3.0 0.87324 0.33909 streambioticsum_suff_nodusky phryganeidae
## 93 2 60 51 56 28 0.152 20.8 0.99700 0.00847 streambioticsum_suff_nodusky polycentropodidae
## 94 2 61 51 24 18 0.065 8.9 0.99999 0.00004 streambioticsum_suff_nodusky rhyacophilidae
## 95 2 62 51 46 27 0.125 17.1 0.99994 0.00024 streambioticsum_suff_nodusky uenoidae
## 96 3 4 102 5 5 0.027 3.7 1.00000 0.22296 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_longtail
## 97 3 5 102 17 16 0.092 12.7 0.99545 0.03606 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_red
## 98 3 6 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_mole
## 99 3 7 102 60 49 0.326 44.7 0.97288 0.06430 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_redback
## 100 3 8 102 8 8 0.043 6.0 1.00000 0.08774 streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_slimy
## 101 3 9 102 19 19 0.103 14.1 1.00000 0.00228 streambioticsum_suff_twolined blacknose_dace
## 102 3 10 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined bluegill_sunfish
## 103 3 11 102 3 2 0.016 2.2 0.59043 0.83962 streambioticsum_suff_twolined central_stoneroller_minnow
## 104 3 13 102 36 32 0.196 26.8 0.99643 0.01475 streambioticsum_suff_twolined creek_chub
## 105 3 14 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined green_sunfish
## 106 3 15 102 4 3 0.022 3.0 0.69741 0.73050 streambioticsum_suff_twolined johnny_darter
## 107 3 16 102 4 4 0.022 3.0 1.00000 0.30259 streambioticsum_suff_twolined rainbow_darter
## 108 3 17 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined redbelly_dace
## 109 3 19 102 4 3 0.022 3.0 0.69741 0.73050 streambioticsum_suff_twolined white_sucker
## 110 3 21 102 4 4 0.022 3.0 1.00000 0.30259 streambioticsum_suff_twolined sessile_animals
## 111 3 22 102 122 90 0.663 90.8 0.43373 0.79405 streambioticsum_suff_twolined aquatic_worms
## 112 3 23 102 42 27 0.228 31.3 0.05636 0.97710 streambioticsum_suff_twolined sow_bugs
## 113 3 24 102 51 35 0.277 38.0 0.15833 0.91932 streambioticsum_suff_twolined scuds
## 114 3 25 102 52 42 0.283 38.7 0.93848 0.12995 streambioticsum_suff_twolined water_mites
## 115 3 26 102 78 61 0.424 58.1 0.91207 0.16843 streambioticsum_suff_twolined damselfly_nymphs
## 116 3 27 102 59 52 0.321 43.9 0.99977 0.00105 streambioticsum_suff_twolined alderfly_larvae
## 117 3 28 102 105 82 0.571 78.2 0.97493 0.06445 streambioticsum_suff_twolined other_beetles
## 118 3 29 102 104 90 0.565 77.4 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined crayfish
## 119 3 30 102 100 82 0.543 74.5 0.99971 0.00126 streambioticsum_suff_twolined dragonfly_nymphs
## 120 3 31 102 79 69 0.429 58.8 0.99999 0.00006 streambioticsum_suff_twolined riffle_beetles
## 121 3 32 102 135 102 0.734 100.5 1.00000 0.06387 streambioticsum_suff_twolined other_flies
## 122 3 33 102 99 73 0.538 73.7 0.47021 0.69704 streambioticsum_suff_twolined snails
## 123 3 34 102 45 34 0.245 33.5 0.65727 0.50534 streambioticsum_suff_twolined clams
## 124 3 35 102 52 48 0.283 38.7 0.99999 0.00009 streambioticsum_suff_twolined fishfly_larvae
## 125 3 36 102 39 39 0.212 29.0 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined water_penny_beetles
## 126 3 37 102 125 100 0.679 93.1 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_twolined cranefly_larvae
## 127 3 38 102 56 52 0.304 41.7 1.00000 0.00002 streambioticsum_suff_twolined ameletidae
## 128 3 39 102 117 95 0.636 87.1 0.99999 0.00006 streambioticsum_suff_twolined baetidae
## 129 3 40 102 13 11 0.071 9.7 0.89403 0.30429 streambioticsum_suff_twolined caenidae
## 130 3 41 102 5 5 0.027 3.7 1.00000 0.22296 streambioticsum_suff_twolined ephemerellidae
## 131 3 42 102 3 2 0.016 2.2 0.59043 0.83962 streambioticsum_suff_twolined ephemeridae
## 132 3 43 102 40 35 0.217 29.8 0.99509 0.01788 streambioticsum_suff_twolined heptageniidae
## 133 3 44 102 11 10 0.060 8.2 0.96635 0.17448 streambioticsum_suff_twolined leptohyphidae
## 134 3 45 102 53 52 0.288 39.5 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined leptophlebiidae
## 135 3 46 102 19 18 0.103 14.1 0.99772 0.02030 streambioticsum_suff_twolined chloroperlidae
## 136 3 47 102 68 64 0.370 50.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined leuctridae
## 137 3 48 102 46 43 0.250 34.2 0.99999 0.00013 streambioticsum_suff_twolined nemouridae
## 138 3 49 102 44 42 0.239 32.8 1.00000 0.00003 streambioticsum_suff_twolined perlidae
## 139 3 50 102 18 16 0.098 13.4 0.97286 0.10749 streambioticsum_suff_twolined perlodidae
## 140 3 51 102 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.55292 streambioticsum_suff_twolined glossosomatidae
## 141 3 52 102 107 93 0.581 79.7 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_twolined hydropsychidae
## 142 3 53 102 16 12 0.087 11.9 0.62602 0.61297 streambioticsum_suff_twolined hydroptilidae
## 143 3 54 102 30 28 0.163 22.3 0.99941 0.00427 streambioticsum_suff_twolined lepidostomatidae
## 144 3 55 102 45 38 0.245 33.5 0.98388 0.04504 streambioticsum_suff_twolined limnephilidae
## 145 3 56 102 4 4 0.022 3.0 1.00000 0.30259 streambioticsum_suff_twolined molannidae
## 146 3 57 102 5 5 0.027 3.7 1.00000 0.22296 streambioticsum_suff_twolined odontoceridae
## 147 3 58 102 62 57 0.337 46.2 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_twolined philopotamidae
## 148 3 59 102 8 7 0.043 6.0 0.91226 0.34635 streambioticsum_suff_twolined phryganeidae
## 149 3 60 102 56 51 0.304 41.7 0.99998 0.00013 streambioticsum_suff_twolined polycentropodidae
## 150 3 61 102 24 23 0.130 17.9 0.99962 0.00440 streambioticsum_suff_twolined rhyacophilidae
## 151 3 62 102 46 42 0.250 34.2 0.99987 0.00077 streambioticsum_suff_twolined uenoidae
## 152 4 7 5 60 5 0.016 2.2 1.00000 0.01462 streambioticsum_suff_longtail streambioticsum_suff_redback
## 153 4 13 5 36 1 0.010 1.3 0.60550 0.78797 streambioticsum_suff_longtail creek_chub
## 154 4 22 5 122 5 0.033 4.5 1.00000 0.55489 streambioticsum_suff_longtail aquatic_worms
## 155 4 23 5 42 0 0.011 1.5 0.15510 1.00000 streambioticsum_suff_longtail sow_bugs
## 156 4 24 5 51 0 0.014 1.9 0.09323 1.00000 streambioticsum_suff_longtail scuds
## 157 4 25 5 52 1 0.014 1.9 0.36965 0.91219 streambioticsum_suff_longtail water_mites
## 158 4 26 5 78 3 0.021 2.8 0.71820 0.63024 streambioticsum_suff_longtail damselfly_nymphs
## 159 4 27 5 59 5 0.016 2.2 1.00000 0.01340 streambioticsum_suff_longtail alderfly_larvae
## 160 4 28 5 105 5 0.028 3.8 1.00000 0.25848 streambioticsum_suff_longtail other_beetles
## 161 4 29 5 104 5 0.028 3.8 1.00000 0.24617 streambioticsum_suff_longtail crayfish
## 162 4 30 5 100 4 0.027 3.6 0.79846 0.58992 streambioticsum_suff_longtail dragonfly_nymphs
## 163 4 31 5 79 3 0.021 2.9 0.70639 0.64353 streambioticsum_suff_longtail riffle_beetles
## 164 4 32 5 135 5 0.036 4.9 1.00000 0.92808 streambioticsum_suff_longtail other_flies
## 165 4 33 5 99 1 0.026 3.6 0.02091 0.99866 streambioticsum_suff_longtail snails
## 166 4 34 5 45 2 0.012 1.6 0.80103 0.53177 streambioticsum_suff_longtail clams
## 167 4 35 5 52 5 0.014 1.9 1.00000 0.00696 streambioticsum_suff_longtail fishfly_larvae
## 168 4 36 5 39 4 0.010 1.4 0.99846 0.02312 streambioticsum_suff_longtail water_penny_beetles
## 169 4 37 5 125 5 0.033 4.6 1.00000 0.62782 streambioticsum_suff_longtail cranefly_larvae
## 170 4 38 5 56 2 0.015 2.0 0.66972 0.68201 streambioticsum_suff_longtail ameletidae
## 171 4 39 5 117 4 0.031 4.3 0.55149 0.84543 streambioticsum_suff_longtail baetidae
## 172 4 43 5 40 3 0.011 1.5 0.97451 0.14863 streambioticsum_suff_longtail heptageniidae
## 173 4 45 5 53 5 0.014 1.9 1.00000 0.00768 streambioticsum_suff_longtail leptophlebiidae
## 174 4 47 5 68 5 0.018 2.5 1.00000 0.02790 streambioticsum_suff_longtail leuctridae
## 175 4 48 5 46 5 0.012 1.7 1.00000 0.00367 streambioticsum_suff_longtail nemouridae
## 176 4 49 5 44 3 0.012 1.6 0.96330 0.18837 streambioticsum_suff_longtail perlidae
## 177 4 52 5 107 5 0.029 3.9 1.00000 0.28458 streambioticsum_suff_longtail hydropsychidae
## 178 4 54 5 30 4 0.008 1.1 0.99962 0.00823 streambioticsum_suff_longtail lepidostomatidae
## 179 4 55 5 45 5 0.012 1.6 1.00000 0.00327 streambioticsum_suff_longtail limnephilidae
## 180 4 58 5 62 2 0.017 2.3 0.58974 0.75207 streambioticsum_suff_longtail philopotamidae
## 181 4 60 5 56 2 0.015 2.0 0.66972 0.68201 streambioticsum_suff_longtail polycentropodidae
## 182 4 62 5 46 4 0.012 1.7 0.99633 0.04342 streambioticsum_suff_longtail uenoidae
## 183 5 7 17 60 16 0.054 7.4 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_red streambioticsum_suff_redback
## 184 5 9 17 19 0 0.017 2.4 0.06632 1.00000 streambioticsum_suff_red blacknose_dace
## 185 5 13 17 36 0 0.033 4.5 0.00380 1.00000 streambioticsum_suff_red creek_chub
## 186 5 22 17 122 16 0.111 15.1 0.87814 0.41501 streambioticsum_suff_red aquatic_worms
## 187 5 23 17 42 1 0.038 5.2 0.01222 0.99878 streambioticsum_suff_red sow_bugs
## 188 5 24 17 51 8 0.046 6.3 0.87699 0.26200 streambioticsum_suff_red scuds
## 189 5 25 17 52 8 0.047 6.5 0.86244 0.28462 streambioticsum_suff_red water_mites
## 190 5 26 17 78 4 0.071 9.7 0.00328 0.99946 streambioticsum_suff_red damselfly_nymphs
## 191 5 27 17 59 8 0.053 7.3 0.73275 0.45919 streambioticsum_suff_red alderfly_larvae
## 192 5 28 17 105 14 0.095 13.0 0.81362 0.40238 streambioticsum_suff_red other_beetles
## 193 5 29 17 104 16 0.094 12.9 0.99348 0.04809 streambioticsum_suff_red crayfish
## 194 5 30 17 100 16 0.091 12.4 0.99684 0.02679 streambioticsum_suff_red dragonfly_nymphs
## 195 5 31 17 79 6 0.072 9.8 0.04226 0.98778 streambioticsum_suff_red riffle_beetles
## 196 5 32 17 135 17 0.122 16.8 1.00000 0.76642 streambioticsum_suff_red other_flies
## 197 5 33 17 99 4 0.090 12.3 0.00001 1.00000 streambioticsum_suff_red snails
## 198 5 34 17 45 7 0.041 5.6 0.85448 0.30083 streambioticsum_suff_red clams
## 199 5 35 17 52 13 0.047 6.5 0.99991 0.00070 streambioticsum_suff_red fishfly_larvae
## 200 5 36 17 39 7 0.035 4.8 0.93306 0.16919 streambioticsum_suff_red water_penny_beetles
## 201 5 37 17 125 17 0.113 15.5 1.00000 0.18966 streambioticsum_suff_red cranefly_larvae
## 202 5 38 17 56 1 0.051 6.9 0.00095 0.99994 streambioticsum_suff_red ameletidae
## 203 5 39 17 117 16 0.106 14.5 0.94323 0.24786 streambioticsum_suff_red baetidae
## 204 5 40 17 13 0 0.012 1.6 0.16387 1.00000 streambioticsum_suff_red caenidae
## 205 5 43 17 40 7 0.036 5.0 0.92263 0.18866 streambioticsum_suff_red heptageniidae
## 206 5 44 17 11 1 0.010 1.4 0.59196 0.78076 streambioticsum_suff_red leptohyphidae
## 207 5 45 17 53 16 0.048 6.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red leptophlebiidae
## 208 5 46 17 19 4 0.017 2.4 0.93790 0.19008 streambioticsum_suff_red chloroperlidae
## 209 5 47 17 68 16 0.062 8.4 1.00000 0.00005 streambioticsum_suff_red leuctridae
## 210 5 48 17 46 14 0.042 5.7 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_red nemouridae
## 211 5 49 17 44 8 0.040 5.5 0.95120 0.12971 streambioticsum_suff_red perlidae
## 212 5 50 17 18 3 0.016 2.2 0.83686 0.39216 streambioticsum_suff_red perlodidae
## 213 5 52 17 107 17 0.097 13.3 1.00000 0.01102 streambioticsum_suff_red hydropsychidae
## 214 5 53 17 16 2 0.014 2.0 0.68414 0.62343 streambioticsum_suff_red hydroptilidae
## 215 5 54 17 30 16 0.027 3.7 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red lepidostomatidae
## 216 5 55 17 45 15 0.041 5.6 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red limnephilidae
## 217 5 58 17 62 13 0.056 7.7 0.99894 0.00586 streambioticsum_suff_red philopotamidae
## 218 5 60 17 56 9 0.051 6.9 0.90975 0.20591 streambioticsum_suff_red polycentropodidae
## 219 5 61 17 24 11 0.022 3.0 1.00000 0.00000 streambioticsum_suff_red rhyacophilidae
## 220 5 62 17 46 10 0.042 5.7 0.99478 0.02088 streambioticsum_suff_red uenoidae
## 221 6 22 2 122 2 0.013 1.8 1.00000 0.79229 streambioticsum_suff_mole aquatic_worms
## 222 6 26 2 78 0 0.008 1.1 0.18366 1.00000 streambioticsum_suff_mole damselfly_nymphs
## 223 6 28 2 105 2 0.011 1.5 1.00000 0.58609 streambioticsum_suff_mole other_beetles
## 224 6 29 2 104 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 streambioticsum_suff_mole crayfish
## 225 6 30 2 100 1 0.011 1.5 0.46866 0.92851 streambioticsum_suff_mole dragonfly_nymphs
## 226 6 31 2 79 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 streambioticsum_suff_mole riffle_beetles
## 227 6 32 2 135 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 streambioticsum_suff_mole other_flies
## 228 6 33 2 99 0 0.011 1.4 0.07546 1.00000 streambioticsum_suff_mole snails
## 229 6 37 2 125 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 streambioticsum_suff_mole cranefly_larvae
## 230 6 39 2 117 1 0.012 1.7 0.27158 0.97960 streambioticsum_suff_mole baetidae
## 231 6 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 streambioticsum_suff_mole hydropsychidae
## 232 7 8 60 8 7 0.026 3.5 0.99898 0.01292 streambioticsum_suff_redback streambioticsum_suff_slimy
## 233 7 9 60 19 12 0.061 8.3 0.98122 0.05703 streambioticsum_suff_redback blacknose_dace
## 234 7 11 60 3 2 0.010 1.3 0.91837 0.40673 streambioticsum_suff_redback central_stoneroller_minnow
## 235 7 13 60 36 13 0.115 15.8 0.18794 0.89999 streambioticsum_suff_redback creek_chub
## 236 7 15 60 4 1 0.013 1.8 0.40888 0.90364 streambioticsum_suff_redback johnny_darter
## 237 7 16 60 4 2 0.013 1.8 0.77766 0.59112 streambioticsum_suff_redback rainbow_darter
## 238 7 19 60 4 0 0.013 1.8 0.09636 1.00000 streambioticsum_suff_redback white_sucker
## 239 7 21 60 4 0 0.013 1.8 0.09636 1.00000 streambioticsum_suff_redback sessile_animals
## 240 7 22 60 122 55 0.390 53.4 0.87390 0.28043 streambioticsum_suff_redback aquatic_worms
## 241 7 23 60 42 12 0.134 18.4 0.01311 0.99547 streambioticsum_suff_redback sow_bugs
## 242 7 24 60 51 23 0.163 22.3 0.66130 0.47594 streambioticsum_suff_redback scuds
## 243 7 25 60 52 23 0.166 22.8 0.60226 0.53795 streambioticsum_suff_redback water_mites
## 244 7 26 60 78 27 0.249 34.2 0.01020 0.99620 streambioticsum_suff_redback damselfly_nymphs
## 245 7 27 60 59 33 0.189 25.8 0.99620 0.01020 streambioticsum_suff_redback alderfly_larvae
## 246 7 28 60 105 50 0.336 46.0 0.96827 0.07527 streambioticsum_suff_redback other_beetles
## 247 7 29 60 104 50 0.332 45.5 0.97819 0.05453 streambioticsum_suff_redback crayfish
## 248 7 30 60 100 43 0.320 43.8 0.45296 0.69315 streambioticsum_suff_redback dragonfly_nymphs
## 249 7 31 60 79 32 0.253 34.6 0.23219 0.85989 streambioticsum_suff_redback riffle_beetles
## 250 7 32 60 135 58 0.432 59.1 0.19000 1.00000 streambioticsum_suff_redback other_flies
## 251 7 33 60 99 32 0.316 43.4 0.00001 1.00000 streambioticsum_suff_redback snails
## 252 7 34 60 45 19 0.144 19.7 0.47067 0.67019 streambioticsum_suff_redback clams
## 253 7 35 60 52 34 0.166 22.8 0.99999 0.00007 streambioticsum_suff_redback fishfly_larvae
## 254 7 36 60 39 24 0.125 17.1 0.99768 0.00720 streambioticsum_suff_redback water_penny_beetles
## 255 7 37 60 125 55 0.400 54.7 0.67329 0.56298 streambioticsum_suff_redback cranefly_larvae
## 256 7 38 60 56 23 0.179 24.5 0.36024 0.76070 streambioticsum_suff_redback ameletidae
## 257 7 39 60 117 50 0.374 51.2 0.35695 0.80241 streambioticsum_suff_redback baetidae
## 258 7 40 60 13 4 0.042 5.7 0.24401 0.90317 streambioticsum_suff_redback caenidae
## 259 7 41 60 5 1 0.016 2.2 0.27024 0.94711 streambioticsum_suff_redback ephemerellidae
## 260 7 42 60 3 3 0.010 1.3 1.00000 0.08163 streambioticsum_suff_redback ephemeridae
## 261 7 43 60 40 24 0.128 17.5 0.99589 0.01183 streambioticsum_suff_redback heptageniidae
## 262 7 44 60 11 7 0.035 4.8 0.95531 0.14341 streambioticsum_suff_redback leptohyphidae
## 263 7 45 60 53 36 0.169 23.2 1.00000 0.00001 streambioticsum_suff_redback leptophlebiidae
## 264 7 46 60 19 13 0.061 8.3 0.99515 0.01878 streambioticsum_suff_redback chloroperlidae
## 265 7 47 60 68 40 0.217 29.8 0.99990 0.00038 streambioticsum_suff_redback leuctridae
## 266 7 48 60 46 31 0.147 20.1 0.99998 0.00008 streambioticsum_suff_redback nemouridae
## 267 7 49 60 44 29 0.141 19.3 0.99992 0.00032 streambioticsum_suff_redback perlidae
## 268 7 50 60 18 11 0.058 7.9 0.96713 0.09155 streambioticsum_suff_redback perlodidae
## 269 7 52 60 107 49 0.342 46.9 0.86434 0.24859 streambioticsum_suff_redback hydropsychidae
## 270 7 53 60 16 7 0.051 7.0 0.60688 0.60361 streambioticsum_suff_redback hydroptilidae
## 271 7 54 60 30 23 0.096 13.1 0.99999 0.00004 streambioticsum_suff_redback lepidostomatidae
## 272 7 55 60 45 30 0.144 19.7 0.99996 0.00016 streambioticsum_suff_redback limnephilidae
## 273 7 56 60 4 4 0.013 1.8 1.00000 0.03472 streambioticsum_suff_redback molannidae
## 274 7 57 60 5 5 0.016 2.2 1.00000 0.01462 streambioticsum_suff_redback odontoceridae
## 275 7 58 60 62 30 0.198 27.2 0.87654 0.20842 streambioticsum_suff_redback philopotamidae
## 276 7 59 60 8 6 0.026 3.5 0.98708 0.07153 streambioticsum_suff_redback phryganeidae
## 277 7 60 60 56 27 0.179 24.5 0.85126 0.24446 streambioticsum_suff_redback polycentropodidae
## 278 7 61 60 24 16 0.077 10.5 0.99669 0.01200 streambioticsum_suff_redback rhyacophilidae
## 279 7 62 60 46 30 0.147 20.1 0.99992 0.00032 streambioticsum_suff_redback uenoidae
## 280 8 9 8 19 4 0.008 1.1 0.99868 0.01322 streambioticsum_suff_slimy blacknose_dace
## 281 8 13 8 36 2 0.015 2.1 0.64806 0.67139 streambioticsum_suff_slimy creek_chub
## 282 8 22 8 122 7 0.052 7.1 0.61474 0.78728 streambioticsum_suff_slimy aquatic_worms
## 283 8 23 8 42 1 0.018 2.5 0.23433 0.95137 streambioticsum_suff_slimy sow_bugs
## 284 8 24 8 51 4 0.022 3.0 0.87324 0.33909 streambioticsum_suff_slimy scuds
## 285 8 25 8 52 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 streambioticsum_suff_slimy water_mites
## 286 8 26 8 78 2 0.033 4.6 0.06567 0.98847 streambioticsum_suff_slimy damselfly_nymphs
## 287 8 27 8 59 4 0.025 3.4 0.78194 0.47782 streambioticsum_suff_slimy alderfly_larvae
## 288 8 28 8 105 7 0.045 6.1 0.88844 0.40298 streambioticsum_suff_slimy other_beetles
## 289 8 29 8 104 8 0.044 6.1 1.00000 0.10306 streambioticsum_suff_slimy crayfish
## 290 8 30 8 100 7 0.043 5.8 0.92554 0.31143 streambioticsum_suff_slimy dragonfly_nymphs
## 291 8 31 8 79 7 0.034 4.6 0.98956 0.07771 streambioticsum_suff_slimy riffle_beetles
## 292 8 32 8 135 8 0.058 7.9 1.00000 0.88622 streambioticsum_suff_slimy other_flies
## 293 8 33 8 99 5 0.042 5.8 0.38997 0.85144 streambioticsum_suff_slimy snails
## 294 8 34 8 45 3 0.019 2.6 0.75664 0.52257 streambioticsum_suff_slimy clams
## 295 8 35 8 52 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 streambioticsum_suff_slimy fishfly_larvae
## 296 8 36 8 39 5 0.017 2.3 0.99317 0.04187 streambioticsum_suff_slimy water_penny_beetles
## 297 8 37 8 125 8 0.053 7.3 1.00000 0.47060 streambioticsum_suff_slimy cranefly_larvae
## 298 8 38 8 56 4 0.024 3.3 0.81943 0.42507 streambioticsum_suff_slimy ameletidae
## 299 8 39 8 117 8 0.050 6.8 1.00000 0.27285 streambioticsum_suff_slimy baetidae
## 300 8 43 8 40 4 0.017 2.3 0.95328 0.17342 streambioticsum_suff_slimy heptageniidae
## 301 8 45 8 53 7 0.023 3.1 0.99965 0.00554 streambioticsum_suff_slimy leptophlebiidae
## 302 8 46 8 19 3 0.008 1.1 0.98678 0.08105 streambioticsum_suff_slimy chloroperlidae
## 303 8 47 8 68 7 0.029 4.0 0.99704 0.02972 streambioticsum_suff_slimy leuctridae
## 304 8 48 8 46 6 0.020 2.7 0.99795 0.01740 streambioticsum_suff_slimy nemouridae
## 305 8 49 8 44 4 0.019 2.6 0.93003 0.22855 streambioticsum_suff_slimy perlidae
## 306 8 50 8 18 1 0.008 1.1 0.71723 0.68621 streambioticsum_suff_slimy perlodidae
## 307 8 52 8 107 8 0.046 6.2 1.00000 0.13042 streambioticsum_suff_slimy hydropsychidae
## 308 8 54 8 30 3 0.013 1.8 0.93066 0.24203 streambioticsum_suff_slimy lepidostomatidae
## 309 8 55 8 45 4 0.019 2.6 0.92321 0.24336 streambioticsum_suff_slimy limnephilidae
## 310 8 58 8 62 7 0.026 3.6 0.99865 0.01611 streambioticsum_suff_slimy philopotamidae
## 311 8 60 8 56 7 0.024 3.3 0.99943 0.00808 streambioticsum_suff_slimy polycentropodidae
## 312 8 61 8 24 4 0.010 1.4 0.99566 0.03171 streambioticsum_suff_slimy rhyacophilidae
## 313 8 62 8 46 6 0.020 2.7 0.99795 0.01740 streambioticsum_suff_slimy uenoidae
## 314 9 13 19 36 12 0.036 5.0 0.99996 0.00028 blacknose_dace creek_chub
## 315 9 22 19 122 18 0.124 16.9 0.90681 0.34855 blacknose_dace aquatic_worms
## 316 9 23 19 42 8 0.043 5.8 0.92153 0.18324 blacknose_dace sow_bugs
## 317 9 24 19 51 7 0.052 7.1 0.59209 0.60914 blacknose_dace scuds
## 318 9 25 19 52 10 0.053 7.2 0.95144 0.12260 blacknose_dace water_mites
## 319 9 26 19 78 14 0.079 10.8 0.96968 0.08859 blacknose_dace damselfly_nymphs
## 320 9 27 19 59 11 0.060 8.2 0.95062 0.12398 blacknose_dace alderfly_larvae
## 321 9 28 19 105 15 0.106 14.6 0.69773 0.52981 blacknose_dace other_beetles
## 322 9 29 19 104 17 0.105 14.4 0.97168 0.11078 blacknose_dace crayfish
## 323 9 30 19 100 15 0.101 13.9 0.81637 0.37383 blacknose_dace dragonfly_nymphs
## 324 9 31 19 79 18 0.080 11.0 0.99999 0.00019 blacknose_dace riffle_beetles
## 325 9 32 19 135 19 0.137 18.7 1.00000 0.74098 blacknose_dace other_flies
## 326 9 33 19 99 14 0.100 13.7 0.65470 0.56213 blacknose_dace snails
## 327 9 34 19 45 4 0.046 6.2 0.18095 0.93001 blacknose_dace clams
## 328 9 35 19 52 10 0.053 7.2 0.95144 0.12260 blacknose_dace fishfly_larvae
## 329 9 36 19 39 9 0.039 5.4 0.98490 0.04884 blacknose_dace water_penny_beetles
## 330 9 37 19 125 19 0.127 17.3 1.00000 0.15348 blacknose_dace cranefly_larvae
## 331 9 38 19 56 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 blacknose_dace ameletidae
## 332 9 39 19 117 19 0.118 16.2 1.00000 0.03935 blacknose_dace baetidae
## 333 9 40 19 13 3 0.013 1.8 0.91624 0.26044 blacknose_dace caenidae
## 334 9 43 19 40 11 0.040 5.5 0.99903 0.00477 blacknose_dace heptageniidae
## 335 9 44 19 11 5 0.011 1.5 0.99903 0.00821 blacknose_dace leptohyphidae
## 336 9 45 19 53 12 0.054 7.4 0.99511 0.01862 blacknose_dace leptophlebiidae
## 337 9 46 19 19 8 0.019 2.6 0.99989 0.00093 blacknose_dace chloroperlidae
## 338 9 47 19 68 15 0.069 9.4 0.99899 0.00537 blacknose_dace leuctridae
## 339 9 48 19 46 12 0.047 6.4 0.99909 0.00450 blacknose_dace nemouridae
## 340 9 49 19 44 12 0.045 6.1 0.99947 0.00280 blacknose_dace perlidae
## 341 9 50 19 18 6 0.018 2.5 0.99598 0.02050 blacknose_dace perlodidae
## 342 9 52 19 107 18 0.108 14.8 0.99382 0.04576 blacknose_dace hydropsychidae
## 343 9 53 19 16 2 0.016 2.2 0.61229 0.68912 blacknose_dace hydroptilidae
## 344 9 54 19 30 0 0.030 4.2 0.00618 1.00000 blacknose_dace lepidostomatidae
## 345 9 55 19 45 5 0.046 6.2 0.35594 0.81905 blacknose_dace limnephilidae
## 346 9 58 19 62 12 0.063 8.6 0.97376 0.07498 blacknose_dace philopotamidae
## 347 9 59 19 8 1 0.008 1.1 0.69349 0.70731 blacknose_dace phryganeidae
## 348 9 60 19 56 10 0.057 7.8 0.91447 0.19113 blacknose_dace polycentropodidae
## 349 9 61 19 24 3 0.024 3.3 0.56475 0.69032 blacknose_dace rhyacophilidae
## 350 9 62 19 46 9 0.047 6.4 0.94630 0.13419 blacknose_dace uenoidae
## 351 10 22 2 122 1 0.013 1.8 0.20771 0.98873 bluegill_sunfish aquatic_worms
## 352 10 26 2 78 2 0.008 1.1 1.00000 0.32235 bluegill_sunfish damselfly_nymphs
## 353 10 28 2 105 2 0.011 1.5 1.00000 0.58609 bluegill_sunfish other_beetles
## 354 10 29 2 104 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 bluegill_sunfish crayfish
## 355 10 30 2 100 2 0.011 1.5 1.00000 0.53134 bluegill_sunfish dragonfly_nymphs
## 356 10 31 2 79 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 bluegill_sunfish riffle_beetles
## 357 10 32 2 135 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 bluegill_sunfish other_flies
## 358 10 33 2 99 2 0.011 1.4 1.00000 0.52072 bluegill_sunfish snails
## 359 10 37 2 125 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 bluegill_sunfish cranefly_larvae
## 360 10 39 2 117 1 0.012 1.7 0.27158 0.97960 bluegill_sunfish baetidae
## 361 10 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 bluegill_sunfish hydropsychidae
## 362 11 22 3 122 3 0.020 2.7 1.00000 0.70426 central_stoneroller_minnow aquatic_worms
## 363 11 24 3 51 2 0.008 1.1 0.95032 0.31123 central_stoneroller_minnow scuds
## 364 11 25 3 52 2 0.008 1.1 0.94728 0.32157 central_stoneroller_minnow water_mites
## 365 11 26 3 78 2 0.012 1.7 0.81853 0.60411 central_stoneroller_minnow damselfly_nymphs
## 366 11 27 3 59 2 0.009 1.3 0.92245 0.39589 central_stoneroller_minnow alderfly_larvae
## 367 11 28 3 105 3 0.017 2.3 1.00000 0.44716 central_stoneroller_minnow other_beetles
## 368 11 29 3 104 3 0.017 2.3 1.00000 0.43439 central_stoneroller_minnow crayfish
## 369 11 30 3 100 2 0.016 2.2 0.61428 0.82260 central_stoneroller_minnow dragonfly_nymphs
## 370 11 31 3 79 3 0.013 1.7 1.00000 0.18863 central_stoneroller_minnow riffle_beetles
## 371 11 32 3 135 3 0.022 3.0 1.00000 0.95653 central_stoneroller_minnow other_flies
## 372 11 33 3 99 3 0.016 2.2 1.00000 0.37414 central_stoneroller_minnow snails
## 373 11 35 3 52 1 0.008 1.1 0.67843 0.76440 central_stoneroller_minnow fishfly_larvae
## 374 11 37 3 125 3 0.020 2.7 1.00000 0.75796 central_stoneroller_minnow cranefly_larvae
## 375 11 38 3 56 2 0.009 1.2 0.93388 0.36368 central_stoneroller_minnow ameletidae
## 376 11 39 3 117 1 0.019 2.6 0.05575 0.99728 central_stoneroller_minnow baetidae
## 377 11 45 3 53 0 0.008 1.2 0.22729 1.00000 central_stoneroller_minnow leptophlebiidae
## 378 11 47 3 68 0 0.011 1.5 0.12498 1.00000 central_stoneroller_minnow leuctridae
## 379 11 48 3 46 0 0.007 1.0 0.28979 1.00000 central_stoneroller_minnow nemouridae
## 380 11 52 3 107 2 0.017 2.3 0.52654 0.87929 central_stoneroller_minnow hydropsychidae
## 381 11 58 3 62 1 0.010 1.4 0.57148 0.83893 central_stoneroller_minnow philopotamidae
## 382 11 60 3 56 0 0.009 1.2 0.20352 1.00000 central_stoneroller_minnow polycentropodidae
## 383 11 62 3 46 1 0.007 1.0 0.73912 0.71021 central_stoneroller_minnow uenoidae
## 384 13 15 36 4 4 0.008 1.1 1.00000 0.00419 creek_chub johnny_darter
## 385 13 16 36 4 3 0.008 1.1 0.99581 0.05554 creek_chub rainbow_darter
## 386 13 19 36 4 3 0.008 1.1 0.99581 0.05554 creek_chub white_sucker
## 387 13 21 36 4 3 0.008 1.1 0.99581 0.05554 creek_chub sessile_animals
## 388 13 22 36 122 30 0.234 32.1 0.16531 0.93947 creek_chub aquatic_worms
## 389 13 23 36 42 12 0.081 11.0 0.73356 0.41786 creek_chub sow_bugs
## 390 13 24 36 51 11 0.098 13.4 0.22379 0.87872 creek_chub scuds
## 391 13 25 36 52 14 0.100 13.7 0.63334 0.52308 creek_chub water_mites
## 392 13 26 36 78 26 0.150 20.5 0.99158 0.02372 creek_chub damselfly_nymphs
## 393 13 27 36 59 20 0.113 15.5 0.97464 0.05898 creek_chub alderfly_larvae
## 394 13 28 36 105 28 0.201 27.6 0.65524 0.52450 creek_chub other_beetles
## 395 13 29 36 104 31 0.199 27.3 0.97516 0.07135 creek_chub crayfish
## 396 13 30 36 100 32 0.192 26.3 0.99810 0.00851 creek_chub dragonfly_nymphs
## 397 13 31 36 79 34 0.152 20.8 1.00000 0.00000 creek_chub riffle_beetles
## 398 13 32 36 135 36 0.259 35.5 1.00000 0.54208 creek_chub other_flies
## 399 13 33 36 99 33 0.190 26.0 0.99979 0.00137 creek_chub snails
## 400 13 34 36 45 15 0.086 11.8 0.93422 0.13483 creek_chub clams
## 401 13 35 36 52 16 0.100 13.7 0.87133 0.23044 creek_chub fishfly_larvae
## 402 13 36 36 39 12 0.075 10.2 0.83392 0.29172 creek_chub water_penny_beetles
## 403 13 37 36 125 36 0.240 32.8 1.00000 0.02144 creek_chub cranefly_larvae
## 404 13 38 36 56 25 0.107 14.7 0.99999 0.00006 creek_chub ameletidae
## 405 13 39 36 117 34 0.224 30.7 0.98741 0.05789 creek_chub baetidae
## 406 13 40 36 13 6 0.025 3.4 0.97492 0.08776 creek_chub caenidae
## 407 13 41 36 5 3 0.010 1.3 0.98306 0.11346 creek_chub ephemerellidae
## 408 13 43 36 40 16 0.077 10.5 0.99389 0.01808 creek_chub heptageniidae
## 409 13 44 36 11 5 0.021 2.9 0.96337 0.12688 creek_chub leptohyphidae
## 410 13 45 36 53 18 0.102 13.9 0.96502 0.07796 creek_chub leptophlebiidae
## 411 13 46 36 19 6 0.036 5.0 0.80395 0.37675 creek_chub chloroperlidae
## 412 13 47 36 68 23 0.130 17.9 0.98597 0.03571 creek_chub leuctridae
## 413 13 48 36 46 13 0.088 12.1 0.72144 0.42867 creek_chub nemouridae
## 414 13 49 36 44 18 0.084 11.6 0.99770 0.00755 creek_chub perlidae
## 415 13 50 36 18 5 0.035 4.7 0.68031 0.53873 creek_chub perlodidae
## 416 13 52 36 107 32 0.205 28.1 0.98461 0.05140 creek_chub hydropsychidae
## 417 13 53 36 16 3 0.031 4.2 0.34763 0.84923 creek_chub hydroptilidae
## 418 13 54 36 30 2 0.058 7.9 0.00326 0.99957 creek_chub lepidostomatidae
## 419 13 55 36 45 16 0.086 11.8 0.97198 0.06578 creek_chub limnephilidae
## 420 13 56 36 4 0 0.008 1.1 0.29073 1.00000 creek_chub molannidae
## 421 13 57 36 5 0 0.010 1.3 0.21203 1.00000 creek_chub odontoceridae
## 422 13 58 36 62 20 0.119 16.3 0.94946 0.10559 creek_chub philopotamidae
## 423 13 59 36 8 5 0.015 2.1 0.99571 0.02942 creek_chub phryganeidae
## 424 13 60 36 56 14 0.107 14.7 0.46846 0.68254 creek_chub polycentropodidae
## 425 13 61 36 24 6 0.046 6.3 0.54976 0.65095 creek_chub rhyacophilidae
## 426 13 62 36 46 14 0.088 12.1 0.83938 0.27856 creek_chub uenoidae
## 427 14 22 2 122 2 0.013 1.8 1.00000 0.79229 green_sunfish aquatic_worms
## 428 14 26 2 78 2 0.008 1.1 1.00000 0.32235 green_sunfish damselfly_nymphs
## 429 14 28 2 105 2 0.011 1.5 1.00000 0.58609 green_sunfish other_beetles
## 430 14 29 2 104 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 green_sunfish crayfish
## 431 14 30 2 100 2 0.011 1.5 1.00000 0.53134 green_sunfish dragonfly_nymphs
## 432 14 31 2 79 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 green_sunfish riffle_beetles
## 433 14 32 2 135 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 green_sunfish other_flies
## 434 14 33 2 99 2 0.011 1.4 1.00000 0.52072 green_sunfish snails
## 435 14 37 2 125 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 green_sunfish cranefly_larvae
## 436 14 39 2 117 1 0.012 1.7 0.27158 0.97960 green_sunfish baetidae
## 437 14 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 green_sunfish hydropsychidae
## 438 15 22 4 122 3 0.026 3.6 0.37457 0.94077 johnny_darter aquatic_worms
## 439 15 23 4 42 1 0.009 1.2 0.64063 0.77331 johnny_darter sow_bugs
## 440 15 24 4 51 1 0.011 1.5 0.52285 0.84879 johnny_darter scuds
## 441 15 25 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 johnny_darter water_mites
## 442 15 26 4 78 3 0.017 2.3 0.89843 0.42117 johnny_darter damselfly_nymphs
## 443 15 27 4 59 2 0.013 1.7 0.78704 0.57883 johnny_darter alderfly_larvae
## 444 15 28 4 105 3 0.022 3.1 0.65962 0.76752 johnny_darter other_beetles
## 445 15 29 4 104 4 0.022 3.0 1.00000 0.32741 johnny_darter crayfish
## 446 15 30 4 100 4 0.021 2.9 1.00000 0.27921 johnny_darter dragonfly_nymphs
## 447 15 31 4 79 4 0.017 2.3 1.00000 0.10699 johnny_darter riffle_beetles
## 448 15 32 4 135 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 johnny_darter other_flies
## 449 15 33 4 99 4 0.021 2.9 1.00000 0.26804 johnny_darter snails
## 450 15 34 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 johnny_darter clams
## 451 15 35 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 johnny_darter fishfly_larvae
## 452 15 36 4 39 1 0.008 1.1 0.67959 0.74279 johnny_darter water_penny_beetles
## 453 15 37 4 125 4 0.027 3.6 1.00000 0.69008 johnny_darter cranefly_larvae
## 454 15 38 4 56 4 0.012 1.6 1.00000 0.02615 johnny_darter ameletidae
## 455 15 39 4 117 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 johnny_darter baetidae
## 456 15 43 4 40 3 0.009 1.2 0.99349 0.07475 johnny_darter heptageniidae
## 457 15 45 4 53 2 0.011 1.5 0.83903 0.50302 johnny_darter leptophlebiidae
## 458 15 47 4 68 4 0.014 2.0 1.00000 0.05799 johnny_darter leuctridae
## 459 15 48 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 johnny_darter nemouridae
## 460 15 49 4 44 2 0.009 1.3 0.90263 0.38554 johnny_darter perlidae
## 461 15 52 4 107 4 0.023 3.1 1.00000 0.36746 johnny_darter hydropsychidae
## 462 15 55 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 johnny_darter limnephilidae
## 463 15 58 4 62 3 0.013 1.8 0.96028 0.24170 johnny_darter philopotamidae
## 464 15 60 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 johnny_darter polycentropodidae
## 465 15 62 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 johnny_darter uenoidae
## 466 16 22 4 122 4 0.026 3.6 1.00000 0.62543 rainbow_darter aquatic_worms
## 467 16 23 4 42 0 0.009 1.2 0.22669 1.00000 rainbow_darter sow_bugs
## 468 16 24 4 51 2 0.011 1.5 0.85468 0.47715 rainbow_darter scuds
## 469 16 25 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 rainbow_darter water_mites
## 470 16 26 4 78 2 0.017 2.3 0.57883 0.78704 rainbow_darter damselfly_nymphs
## 471 16 27 4 59 3 0.013 1.7 0.96759 0.21296 rainbow_darter alderfly_larvae
## 472 16 28 4 105 3 0.022 3.1 0.65962 0.76752 rainbow_darter other_beetles
## 473 16 29 4 104 4 0.022 3.0 1.00000 0.32741 rainbow_darter crayfish
## 474 16 30 4 100 4 0.021 2.9 1.00000 0.27921 rainbow_darter dragonfly_nymphs
## 475 16 31 4 79 4 0.017 2.3 1.00000 0.10699 rainbow_darter riffle_beetles
## 476 16 32 4 135 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 rainbow_darter other_flies
## 477 16 33 4 99 3 0.021 2.9 0.73196 0.69245 rainbow_darter snails
## 478 16 34 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 rainbow_darter clams
## 479 16 35 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 rainbow_darter fishfly_larvae
## 480 16 36 4 39 2 0.008 1.1 0.93037 0.32041 rainbow_darter water_penny_beetles
## 481 16 37 4 125 4 0.027 3.6 1.00000 0.69008 rainbow_darter cranefly_larvae
## 482 16 38 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 rainbow_darter ameletidae
## 483 16 39 4 117 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 rainbow_darter baetidae
## 484 16 43 4 40 3 0.009 1.2 0.99349 0.07475 rainbow_darter heptageniidae
## 485 16 45 4 53 3 0.011 1.5 0.97915 0.16097 rainbow_darter leptophlebiidae
## 486 16 47 4 68 3 0.014 2.0 0.94201 0.30422 rainbow_darter leuctridae
## 487 16 48 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 rainbow_darter nemouridae
## 488 16 49 4 44 2 0.009 1.3 0.90263 0.38554 rainbow_darter perlidae
## 489 16 52 4 107 4 0.023 3.1 1.00000 0.36746 rainbow_darter hydropsychidae
## 490 16 55 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 rainbow_darter limnephilidae
## 491 16 58 4 62 4 0.013 1.8 1.00000 0.03972 rainbow_darter philopotamidae
## 492 16 60 4 56 3 0.012 1.6 0.97385 0.18603 rainbow_darter polycentropodidae
## 493 16 62 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 rainbow_darter uenoidae
## 494 17 22 2 122 1 0.013 1.8 0.20771 0.98873 redbelly_dace aquatic_worms
## 495 17 26 2 78 1 0.008 1.1 0.67765 0.81634 redbelly_dace damselfly_nymphs
## 496 17 28 2 105 0 0.011 1.5 0.05324 1.00000 redbelly_dace other_beetles
## 497 17 29 2 104 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 redbelly_dace crayfish
## 498 17 30 2 100 2 0.011 1.5 1.00000 0.53134 redbelly_dace dragonfly_nymphs
## 499 17 31 2 79 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 redbelly_dace riffle_beetles
## 500 17 32 2 135 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 redbelly_dace other_flies
## 501 17 33 2 99 2 0.011 1.4 1.00000 0.52072 redbelly_dace snails
## 502 17 37 2 125 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 redbelly_dace cranefly_larvae
## 503 17 39 2 117 2 0.012 1.7 1.00000 0.72842 redbelly_dace baetidae
## 504 17 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 redbelly_dace hydropsychidae
## 505 19 22 4 122 4 0.026 3.6 1.00000 0.62543 white_sucker aquatic_worms
## 506 19 23 4 42 1 0.009 1.2 0.64063 0.77331 white_sucker sow_bugs
## 507 19 24 4 51 2 0.011 1.5 0.85468 0.47715 white_sucker scuds
## 508 19 25 4 52 2 0.011 1.5 0.84696 0.49011 white_sucker water_mites
## 509 19 26 4 78 2 0.017 2.3 0.57883 0.78704 white_sucker damselfly_nymphs
## 510 19 27 4 59 0 0.013 1.7 0.10157 1.00000 white_sucker alderfly_larvae
## 511 19 28 4 105 2 0.022 3.1 0.23248 0.96036 white_sucker other_beetles
## 512 19 29 4 104 3 0.022 3.0 0.67259 0.75532 white_sucker crayfish
## 513 19 30 4 100 4 0.021 2.9 1.00000 0.27921 white_sucker dragonfly_nymphs
## 514 19 31 4 79 3 0.017 2.3 0.89301 0.43358 white_sucker riffle_beetles
## 515 19 32 4 135 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 white_sucker other_flies
## 516 19 33 4 99 4 0.021 2.9 1.00000 0.26804 white_sucker snails
## 517 19 34 4 45 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 white_sucker clams
## 518 19 35 4 52 0 0.011 1.5 0.14418 1.00000 white_sucker fishfly_larvae
## 519 19 36 4 39 1 0.008 1.1 0.67959 0.74279 white_sucker water_penny_beetles
## 520 19 37 4 125 3 0.027 3.6 0.30992 0.96159 white_sucker cranefly_larvae
## 521 19 38 4 56 4 0.012 1.6 1.00000 0.02615 white_sucker ameletidae
## 522 19 39 4 117 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 white_sucker baetidae
## 523 19 43 4 40 2 0.009 1.2 0.92525 0.33334 white_sucker heptageniidae
## 524 19 45 4 53 1 0.011 1.5 0.49698 0.86261 white_sucker leptophlebiidae
## 525 19 47 4 68 2 0.014 2.0 0.69578 0.68475 white_sucker leuctridae
## 526 19 48 4 46 2 0.010 1.3 0.89002 0.41177 white_sucker nemouridae
## 527 19 49 4 44 0 0.009 1.3 0.20790 1.00000 white_sucker perlidae
## 528 19 52 4 107 3 0.023 3.1 0.63254 0.79146 white_sucker hydropsychidae
## 529 19 55 4 45 1 0.010 1.3 0.60135 0.80104 white_sucker limnephilidae
## 530 19 58 4 62 3 0.013 1.8 0.96028 0.24170 white_sucker philopotamidae
## 531 19 60 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 white_sucker polycentropodidae
## 532 19 62 4 46 1 0.010 1.3 0.58823 0.80969 white_sucker uenoidae
## 533 21 22 4 122 4 0.026 3.6 1.00000 0.62543 sessile_animals aquatic_worms
## 534 21 23 4 42 2 0.009 1.2 0.91437 0.35937 sessile_animals sow_bugs
## 535 21 24 4 51 2 0.011 1.5 0.85468 0.47715 sessile_animals scuds
## 536 21 25 4 52 0 0.011 1.5 0.14418 1.00000 sessile_animals water_mites
## 537 21 26 4 78 3 0.017 2.3 0.89843 0.42117 sessile_animals damselfly_nymphs
## 538 21 27 4 59 1 0.013 1.7 0.42117 0.89843 sessile_animals alderfly_larvae
## 539 21 28 4 105 3 0.022 3.1 0.65962 0.76752 sessile_animals other_beetles
## 540 21 29 4 104 3 0.022 3.0 0.67259 0.75532 sessile_animals crayfish
## 541 21 30 4 100 3 0.021 2.9 0.72079 0.70523 sessile_animals dragonfly_nymphs
## 542 21 31 4 79 2 0.017 2.3 0.56642 0.79622 sessile_animals riffle_beetles
## 543 21 32 4 135 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 sessile_animals other_flies
## 544 21 33 4 99 4 0.021 2.9 1.00000 0.26804 sessile_animals snails
## 545 21 34 4 45 3 0.010 1.3 0.98939 0.10357 sessile_animals clams
## 546 21 35 4 52 1 0.011 1.5 0.50989 0.85582 sessile_animals fishfly_larvae
## 547 21 36 4 39 1 0.008 1.1 0.67959 0.74279 sessile_animals water_penny_beetles
## 548 21 37 4 125 4 0.027 3.6 1.00000 0.69008 sessile_animals cranefly_larvae
## 549 21 38 4 56 3 0.012 1.6 0.97385 0.18603 sessile_animals ameletidae
## 550 21 39 4 117 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 sessile_animals baetidae
## 551 21 43 4 40 0 0.009 1.2 0.24672 1.00000 sessile_animals heptageniidae
## 552 21 45 4 53 1 0.011 1.5 0.49698 0.86261 sessile_animals leptophlebiidae
## 553 21 47 4 68 2 0.014 2.0 0.69578 0.68475 sessile_animals leuctridae
## 554 21 48 4 46 0 0.010 1.3 0.19031 1.00000 sessile_animals nemouridae
## 555 21 49 4 44 0 0.009 1.3 0.20790 1.00000 sessile_animals perlidae
## 556 21 52 4 107 4 0.023 3.1 1.00000 0.36746 sessile_animals hydropsychidae
## 557 21 55 4 45 0 0.010 1.3 0.19896 1.00000 sessile_animals limnephilidae
## 558 21 58 4 62 3 0.013 1.8 0.96028 0.24170 sessile_animals philopotamidae
## 559 21 60 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 sessile_animals polycentropodidae
## 560 21 62 4 46 0 0.010 1.3 0.19031 1.00000 sessile_animals uenoidae
## 561 22 23 122 42 40 0.273 37.4 0.97504 0.10236 aquatic_worms sow_bugs
## 562 22 24 122 51 47 0.332 45.4 0.88286 0.27462 aquatic_worms scuds
## 563 22 25 122 52 47 0.338 46.3 0.74552 0.46398 aquatic_worms water_mites
## 564 22 26 122 78 71 0.507 69.5 0.86987 0.28104 aquatic_worms damselfly_nymphs
## 565 22 27 122 59 49 0.384 52.5 0.04699 0.98718 aquatic_worms alderfly_larvae
## 566 22 28 122 105 91 0.683 93.5 0.08997 0.98566 aquatic_worms other_beetles
## 567 22 29 122 104 90 0.676 92.6 0.07989 0.98771 aquatic_worms crayfish
## 568 22 30 122 100 86 0.650 89.1 0.04864 0.99347 aquatic_worms dragonfly_nymphs
## 569 22 31 122 79 71 0.514 70.4 0.73942 0.46265 aquatic_worms riffle_beetles
## 570 22 32 122 135 120 0.878 120.2 0.79229 1.00000 aquatic_worms other_flies
## 571 22 33 122 99 90 0.644 88.2 0.91988 0.20322 aquatic_worms snails
## 572 22 34 122 45 41 0.293 40.1 0.79414 0.41217 aquatic_worms clams
## 573 22 35 122 52 44 0.338 46.3 0.15424 0.94144 aquatic_worms fishfly_larvae
## 574 22 36 122 39 37 0.254 34.7 0.96251 0.14006 aquatic_worms water_penny_beetles
## 575 22 37 122 125 111 0.813 111.3 0.61218 0.76649 aquatic_worms cranefly_larvae
## 576 22 38 122 56 52 0.364 49.9 0.93177 0.18295 aquatic_worms ameletidae
## 577 22 39 122 117 104 0.761 104.2 0.62123 0.68174 aquatic_worms baetidae
## 578 22 40 122 13 11 0.085 11.6 0.43023 0.84544 aquatic_worms caenidae
## 579 22 41 122 5 4 0.033 4.5 0.44511 0.90757 aquatic_worms ephemerellidae
## 580 22 42 122 3 2 0.020 2.7 0.29574 0.96836 aquatic_worms ephemeridae
## 581 22 43 122 40 35 0.260 35.6 0.45794 0.75524 aquatic_worms heptageniidae
## 582 22 44 122 11 8 0.072 9.8 0.10253 0.98023 aquatic_worms leptohyphidae
## 583 22 45 122 53 45 0.345 47.2 0.16985 0.93356 aquatic_worms leptophlebiidae
## 584 22 46 122 19 17 0.124 16.9 0.65145 0.65500 aquatic_worms chloroperlidae
## 585 22 47 122 68 56 0.442 60.6 0.01195 0.99787 aquatic_worms leuctridae
## 586 22 48 122 46 40 0.299 41.0 0.38556 0.80356 aquatic_worms nemouridae
## 587 22 49 122 44 35 0.286 39.2 0.01790 0.99602 aquatic_worms perlidae
## 588 22 50 122 18 17 0.117 16.0 0.89337 0.38081 aquatic_worms perlodidae
## 589 22 51 122 2 2 0.013 1.8 1.00000 0.79229 aquatic_worms glossosomatidae
## 590 22 52 122 107 95 0.696 95.3 0.57565 0.68360 aquatic_worms hydropsychidae
## 591 22 53 122 16 15 0.104 14.2 0.86090 0.45111 aquatic_worms hydroptilidae
## 592 22 54 122 30 25 0.195 26.7 0.20561 0.92338 aquatic_worms lepidostomatidae
## 593 22 55 122 45 38 0.293 40.1 0.17861 0.93020 aquatic_worms limnephilidae
## 594 22 56 122 4 3 0.026 3.6 0.37457 0.94077 aquatic_worms molannidae
## 595 22 57 122 5 5 0.033 4.5 1.00000 0.55489 aquatic_worms odontoceridae
## 596 22 58 122 62 55 0.403 55.2 0.55997 0.65377 aquatic_worms philopotamidae
## 597 22 59 122 8 7 0.052 7.1 0.61474 0.78728 aquatic_worms phryganeidae
## 598 22 60 122 56 53 0.364 49.9 0.98227 0.06823 aquatic_worms polycentropodidae
## 599 22 61 122 24 22 0.156 21.4 0.78383 0.48914 aquatic_worms rhyacophilidae
## 600 22 62 122 46 41 0.299 41.0 0.61250 0.61444 aquatic_worms uenoidae
## 601 23 24 42 51 29 0.114 15.6 1.00000 0.00000 sow_bugs scuds
## 602 23 25 42 52 24 0.116 15.9 0.99942 0.00207 sow_bugs water_mites
## 603 23 26 42 78 31 0.175 23.9 0.99807 0.00625 sow_bugs damselfly_nymphs
## 604 23 27 42 59 13 0.132 18.1 0.04207 0.98261 sow_bugs alderfly_larvae
## 605 23 28 42 105 36 0.235 32.2 0.97397 0.07060 sow_bugs other_beetles
## 606 23 29 42 104 30 0.233 31.9 0.27155 0.84903 sow_bugs crayfish
## 607 23 30 42 100 30 0.224 30.7 0.46895 0.68859 sow_bugs dragonfly_nymphs
## 608 23 31 42 79 27 0.177 24.2 0.89122 0.19652 sow_bugs riffle_beetles
## 609 23 32 42 135 42 0.302 41.4 1.00000 0.47928 sow_bugs other_flies
## 610 23 33 42 99 35 0.222 30.4 0.98585 0.04016 sow_bugs snails
## 611 23 34 42 45 18 0.101 13.8 0.96720 0.07296 sow_bugs clams
## 612 23 35 42 52 7 0.116 15.9 0.00043 0.99991 sow_bugs fishfly_larvae
## 613 23 36 42 39 8 0.087 12.0 0.07579 0.96904 sow_bugs water_penny_beetles
## 614 23 37 42 125 37 0.280 38.3 0.28724 0.88187 sow_bugs cranefly_larvae
## 615 23 38 42 56 20 0.125 17.2 0.89512 0.18947 sow_bugs ameletidae
## 616 23 39 42 117 33 0.262 35.9 0.10866 0.95843 sow_bugs baetidae
## 617 23 40 42 13 3 0.029 4.0 0.39230 0.82474 sow_bugs caenidae
## 618 23 41 42 5 3 0.011 1.5 0.96926 0.16795 sow_bugs ephemerellidae
## 619 23 43 42 40 8 0.090 12.3 0.06024 0.97636 sow_bugs heptageniidae
## 620 23 44 42 11 2 0.025 3.4 0.28601 0.90508 sow_bugs leptohyphidae
## 621 23 45 42 53 5 0.119 16.2 0.00001 1.00000 sow_bugs leptophlebiidae
## 622 23 46 42 19 5 0.043 5.8 0.44104 0.75662 sow_bugs chloroperlidae
## 623 23 47 42 68 15 0.152 20.8 0.02340 0.99097 sow_bugs leuctridae
## 624 23 48 42 46 6 0.103 14.1 0.00098 0.99980 sow_bugs nemouridae
## 625 23 49 42 44 6 0.098 13.5 0.00202 0.99955 sow_bugs perlidae
## 626 23 50 42 18 2 0.040 5.5 0.04229 0.99154 sow_bugs perlodidae
## 627 23 52 42 107 33 0.239 32.8 0.61661 0.56027 sow_bugs hydropsychidae
## 628 23 53 42 16 8 0.036 4.9 0.97806 0.07040 sow_bugs hydroptilidae
## 629 23 54 42 30 2 0.067 9.2 0.00058 0.99994 sow_bugs lepidostomatidae
## 630 23 55 42 45 6 0.101 13.8 0.00141 0.99970 sow_bugs limnephilidae
## 631 23 56 42 4 0 0.009 1.2 0.22669 1.00000 sow_bugs molannidae
## 632 23 57 42 5 0 0.011 1.5 0.15510 1.00000 sow_bugs odontoceridae
## 633 23 58 42 62 18 0.139 19.0 0.42606 0.71195 sow_bugs philopotamidae
## 634 23 59 42 8 2 0.018 2.5 0.53373 0.76567 sow_bugs phryganeidae
## 635 23 60 42 56 19 0.125 17.2 0.81053 0.30677 sow_bugs polycentropodidae
## 636 23 61 42 24 2 0.054 7.4 0.00570 0.99919 sow_bugs rhyacophilidae
## 637 23 62 42 46 9 0.103 14.1 0.03350 0.98763 sow_bugs uenoidae
## 638 24 25 51 52 27 0.141 19.4 0.99845 0.00476 scuds water_mites
## 639 24 26 51 78 31 0.212 29.0 0.81018 0.30137 scuds damselfly_nymphs
## 640 24 27 51 59 15 0.160 22.0 0.01004 0.99644 scuds alderfly_larvae
## 641 24 28 51 105 42 0.285 39.1 0.92484 0.15679 scuds other_beetles
## 642 24 29 51 104 36 0.283 38.7 0.17958 0.90722 scuds crayfish
## 643 24 30 51 100 37 0.272 37.2 0.54021 0.61637 scuds dragonfly_nymphs
## 644 24 31 51 79 29 0.215 29.4 0.51206 0.62814 scuds riffle_beetles
## 645 24 32 51 135 51 0.367 50.3 1.00000 0.39234 scuds other_flies
## 646 24 33 51 99 39 0.269 36.9 0.85205 0.25955 scuds snails
## 647 24 34 51 45 21 0.122 16.8 0.96238 0.07977 scuds clams
## 648 24 35 51 52 12 0.141 19.4 0.00568 0.99820 scuds fishfly_larvae
## 649 24 36 51 39 10 0.106 14.5 0.05613 0.97701 scuds water_penny_beetles
## 650 24 37 51 125 46 0.340 46.5 0.48277 0.74430 scuds cranefly_larvae
## 651 24 38 51 56 18 0.152 20.8 0.19973 0.88587 scuds ameletidae
## 652 24 39 51 117 40 0.318 43.6 0.06478 0.97742 scuds baetidae
## 653 24 40 51 13 4 0.035 4.8 0.42754 0.78746 scuds caenidae
## 654 24 41 51 5 1 0.014 1.9 0.38314 0.90677 scuds ephemerellidae
## 655 24 42 51 3 0 0.008 1.1 0.24412 1.00000 scuds ephemeridae
## 656 24 43 51 40 7 0.109 14.9 0.00153 0.99965 scuds heptageniidae
## 657 24 44 51 11 0 0.030 4.1 0.00462 1.00000 scuds leptohyphidae
## 658 24 45 51 53 10 0.144 19.7 0.00031 0.99993 scuds leptophlebiidae
## 659 24 46 51 19 4 0.052 7.1 0.09148 0.97040 scuds chloroperlidae
## 660 24 47 51 68 20 0.185 25.3 0.04416 0.98033 scuds leuctridae
## 661 24 48 51 46 10 0.125 17.1 0.00582 0.99825 scuds nemouridae
## 662 24 49 51 44 5 0.120 16.4 0.00001 1.00000 scuds perlidae
## 663 24 50 51 18 5 0.049 6.7 0.26894 0.87662 scuds perlodidae
## 664 24 52 51 107 36 0.291 39.8 0.07831 0.96677 scuds hydropsychidae
## 665 24 53 51 16 7 0.043 6.0 0.80341 0.37646 scuds hydroptilidae
## 666 24 54 51 30 10 0.082 11.2 0.39156 0.76015 scuds lepidostomatidae
## 667 24 55 51 45 13 0.122 16.8 0.10989 0.94649 scuds limnephilidae
## 668 24 56 51 4 1 0.011 1.5 0.52285 0.84879 scuds molannidae
## 669 24 57 51 5 0 0.014 1.9 0.09323 1.00000 scuds odontoceridae
## 670 24 58 51 62 24 0.168 23.1 0.69317 0.44025 scuds philopotamidae
## 671 24 59 51 8 2 0.022 3.0 0.37072 0.86913 scuds phryganeidae
## 672 24 60 51 56 21 0.152 20.8 0.59380 0.54845 scuds polycentropodidae
## 673 24 61 51 24 7 0.065 8.9 0.25517 0.87209 scuds rhyacophilidae
## 674 24 62 51 46 11 0.125 17.1 0.01650 0.99418 scuds uenoidae
## 675 25 26 52 78 33 0.216 29.6 0.91734 0.15171 water_mites damselfly_nymphs
## 676 25 27 52 59 23 0.163 22.4 0.65343 0.48421 water_mites alderfly_larvae
## 677 25 28 52 105 41 0.291 39.9 0.75152 0.39747 water_mites other_beetles
## 678 25 29 52 104 44 0.288 39.5 0.98267 0.04663 water_mites crayfish
## 679 25 30 52 100 41 0.277 38.0 0.92141 0.15655 water_mites dragonfly_nymphs
## 680 25 31 52 79 39 0.219 30.0 0.99972 0.00105 water_mites riffle_beetles
## 681 25 32 52 135 52 0.374 51.2 1.00000 0.38321 water_mites other_flies
## 682 25 33 52 99 40 0.274 37.6 0.87541 0.22581 water_mites snails
## 683 25 34 52 45 18 0.125 17.1 0.70386 0.43555 water_mites clams
## 684 25 35 52 52 18 0.144 19.7 0.32792 0.79106 water_mites fishfly_larvae
## 685 25 36 52 39 16 0.108 14.8 0.74712 0.39052 water_mites water_penny_beetles
## 686 25 37 52 125 50 0.346 47.4 0.97767 0.09697 water_mites cranefly_larvae
## 687 25 38 52 56 25 0.155 21.3 0.93552 0.12275 water_mites ameletidae
## 688 25 39 52 117 47 0.324 44.4 0.94182 0.14823 water_mites baetidae
## 689 25 40 52 13 4 0.036 4.9 0.40504 0.80350 water_mites caenidae
## 690 25 41 52 5 2 0.014 1.9 0.72024 0.63035 water_mites ephemerellidae
## 691 25 42 52 3 1 0.008 1.1 0.67843 0.76440 water_mites ephemeridae
## 692 25 43 52 40 16 0.111 15.2 0.69656 0.44858 water_mites heptageniidae
## 693 25 44 52 11 5 0.030 4.2 0.80591 0.40880 water_mites leptohyphidae
## 694 25 45 52 53 22 0.147 20.1 0.80570 0.30778 water_mites leptophlebiidae
## 695 25 46 52 19 8 0.053 7.2 0.74653 0.43599 water_mites chloroperlidae
## 696 25 47 52 68 29 0.188 25.8 0.90317 0.17181 water_mites leuctridae
## 697 25 48 52 46 18 0.127 17.5 0.65234 0.49205 water_mites nemouridae
## 698 25 49 52 44 16 0.122 16.7 0.47204 0.67289 water_mites perlidae
## 699 25 50 52 18 5 0.050 6.8 0.24694 0.88977 water_mites perlodidae
## 700 25 52 52 107 44 0.296 40.6 0.95337 0.10837 water_mites hydropsychidae
## 701 25 53 52 16 8 0.044 6.1 0.90694 0.21541 water_mites hydroptilidae
## 702 25 54 52 30 12 0.083 11.4 0.68465 0.47694 water_mites lepidostomatidae
## 703 25 55 52 45 17 0.125 17.1 0.56445 0.58406 water_mites limnephilidae
## 704 25 56 52 4 1 0.011 1.5 0.50989 0.85582 water_mites molannidae
## 705 25 57 52 5 3 0.014 1.9 0.93144 0.27976 water_mites odontoceridae
## 706 25 58 52 62 31 0.172 23.5 0.99763 0.00681 water_mites philopotamidae
## 707 25 59 52 8 1 0.022 3.0 0.12195 0.98074 water_mites phryganeidae
## 708 25 60 52 56 24 0.155 21.3 0.87725 0.21055 water_mites polycentropodidae
## 709 25 61 52 24 12 0.066 9.1 0.94047 0.13452 water_mites rhyacophilidae
## 710 25 62 52 46 17 0.127 17.5 0.50795 0.63800 water_mites uenoidae
## 711 26 27 78 59 38 0.245 33.6 0.95682 0.08633 damselfly_nymphs alderfly_larvae
## 712 26 28 78 105 61 0.436 59.8 0.75897 0.38308 damselfly_nymphs other_beetles
## 713 26 29 78 104 60 0.432 59.2 0.69944 0.45185 damselfly_nymphs crayfish
## 714 26 30 78 100 65 0.416 56.9 0.99957 0.00166 damselfly_nymphs dragonfly_nymphs
## 715 26 31 78 79 57 0.328 45.0 0.99999 0.00003 damselfly_nymphs riffle_beetles
## 716 26 32 78 135 78 0.561 76.9 1.00000 0.18366 damselfly_nymphs other_flies
## 717 26 33 78 99 63 0.411 56.4 0.99698 0.00915 damselfly_nymphs snails
## 718 26 34 78 45 33 0.187 25.6 0.99836 0.00526 damselfly_nymphs clams
## 719 26 35 78 52 31 0.216 29.6 0.74922 0.37605 damselfly_nymphs fishfly_larvae
## 720 26 36 78 39 25 0.162 22.2 0.89674 0.19038 damselfly_nymphs water_penny_beetles
## 721 26 37 78 125 76 0.519 71.2 0.99959 0.00381 damselfly_nymphs cranefly_larvae
## 722 26 38 78 56 41 0.233 31.9 0.99969 0.00112 damselfly_nymphs ameletidae
## 723 26 39 78 117 72 0.486 66.6 0.99803 0.00855 damselfly_nymphs baetidae
## 724 26 40 78 13 12 0.054 7.4 0.99959 0.00521 damselfly_nymphs caenidae
## 725 26 41 78 5 4 0.021 2.8 0.94349 0.28180 damselfly_nymphs ephemerellidae
## 726 26 42 78 3 2 0.012 1.7 0.81853 0.60411 damselfly_nymphs ephemeridae
## 727 26 43 78 40 26 0.166 22.8 0.92211 0.15037 damselfly_nymphs heptageniidae
## 728 26 44 78 11 8 0.046 6.3 0.92557 0.21841 damselfly_nymphs leptohyphidae
## 729 26 45 78 53 25 0.220 30.2 0.04894 0.97776 damselfly_nymphs leptophlebiidae
## 730 26 46 78 19 11 0.079 10.8 0.63005 0.56603 damselfly_nymphs chloroperlidae
## 731 26 47 78 68 38 0.283 38.7 0.47038 0.66247 damselfly_nymphs leuctridae
## 732 26 48 78 46 22 0.191 26.2 0.08902 0.95647 damselfly_nymphs nemouridae
## 733 26 49 78 44 28 0.183 25.1 0.89922 0.18297 damselfly_nymphs perlidae
## 734 26 50 78 18 12 0.075 10.2 0.87575 0.26358 damselfly_nymphs perlodidae
## 735 26 51 78 2 1 0.008 1.1 0.67765 0.81634 damselfly_nymphs glossosomatidae
## 736 26 52 78 107 67 0.445 60.9 0.99694 0.01012 damselfly_nymphs hydropsychidae
## 737 26 53 78 16 11 0.066 9.1 0.90216 0.22941 damselfly_nymphs hydroptilidae
## 738 26 54 78 30 10 0.125 17.1 0.00306 0.99922 damselfly_nymphs lepidostomatidae
## 739 26 55 78 45 23 0.187 25.6 0.21774 0.87406 damselfly_nymphs limnephilidae
## 740 26 56 78 4 1 0.017 2.3 0.21296 0.96759 damselfly_nymphs molannidae
## 741 26 57 78 5 1 0.021 2.8 0.10843 0.98660 damselfly_nymphs odontoceridae
## 742 26 58 78 62 39 0.258 35.3 0.92759 0.13354 damselfly_nymphs philopotamidae
## 743 26 59 78 8 7 0.033 4.6 0.99062 0.07175 damselfly_nymphs phryganeidae
## 744 26 60 78 56 36 0.233 31.9 0.94789 0.10190 damselfly_nymphs polycentropodidae
## 745 26 61 78 24 9 0.100 13.7 0.02977 0.99032 damselfly_nymphs rhyacophilidae
## 746 26 62 78 46 28 0.191 26.2 0.80037 0.31699 damselfly_nymphs uenoidae
## 747 27 28 59 105 48 0.330 45.2 0.91048 0.17641 alderfly_larvae other_beetles
## 748 27 29 59 104 52 0.327 44.8 0.99933 0.00279 alderfly_larvae crayfish
## 749 27 30 59 100 53 0.314 43.1 0.99999 0.00007 alderfly_larvae dragonfly_nymphs
## 750 27 31 59 79 41 0.248 34.0 0.99573 0.01148 alderfly_larvae riffle_beetles
## 751 27 32 59 135 59 0.424 58.1 1.00000 0.32235 alderfly_larvae other_flies
## 752 27 33 59 99 43 0.311 42.6 0.62906 0.52232 alderfly_larvae snails
## 753 27 34 59 45 22 0.141 19.4 0.87406 0.21774 alderfly_larvae clams
## 754 27 35 59 52 38 0.163 22.4 1.00000 0.00000 alderfly_larvae fishfly_larvae
## 755 27 36 59 39 28 0.123 16.8 1.00000 0.00002 alderfly_larvae water_penny_beetles
## 756 27 37 59 125 57 0.393 53.8 0.99096 0.04777 alderfly_larvae cranefly_larvae
## 757 27 38 59 56 30 0.176 24.1 0.98748 0.02944 alderfly_larvae ameletidae
## 758 27 39 59 117 55 0.368 50.4 0.99529 0.01979 alderfly_larvae baetidae
## 759 27 40 59 13 8 0.041 5.6 0.95578 0.13180 alderfly_larvae caenidae
## 760 27 41 59 5 2 0.016 2.2 0.63024 0.71820 alderfly_larvae ephemerellidae
## 761 27 42 59 3 3 0.009 1.3 1.00000 0.07755 alderfly_larvae ephemeridae
## 762 27 43 59 40 26 0.126 17.2 0.99979 0.00085 alderfly_larvae heptageniidae
## 763 27 44 59 11 10 0.035 4.7 0.99995 0.00098 alderfly_larvae leptohyphidae
## 764 27 45 59 53 34 0.167 22.8 0.99998 0.00007 alderfly_larvae leptophlebiidae
## 765 27 46 59 19 14 0.060 8.2 0.99925 0.00394 alderfly_larvae chloroperlidae
## 766 27 47 59 68 45 0.214 29.3 1.00000 0.00000 alderfly_larvae leuctridae
## 767 27 48 59 46 29 0.145 19.8 0.99980 0.00075 alderfly_larvae nemouridae
## 768 27 49 59 44 35 0.138 18.9 1.00000 0.00000 alderfly_larvae perlidae
## 769 27 50 59 18 11 0.057 7.8 0.97185 0.08079 alderfly_larvae perlodidae
## 770 27 52 59 107 54 0.336 46.1 0.99988 0.00067 alderfly_larvae hydropsychidae
## 771 27 53 59 16 8 0.050 6.9 0.80679 0.36887 alderfly_larvae hydroptilidae
## 772 27 54 59 30 17 0.094 12.9 0.97163 0.06808 alderfly_larvae lepidostomatidae
## 773 27 55 59 45 27 0.141 19.4 0.99857 0.00448 alderfly_larvae limnephilidae
## 774 27 56 59 4 2 0.013 1.7 0.78704 0.57883 alderfly_larvae molannidae
## 775 27 57 59 5 2 0.016 2.2 0.63024 0.71820 alderfly_larvae odontoceridae
## 776 27 58 59 62 37 0.195 26.7 0.99992 0.00032 alderfly_larvae philopotamidae
## 777 27 59 59 8 7 0.025 3.4 0.99911 0.01153 alderfly_larvae phryganeidae
## 778 27 60 59 56 31 0.176 24.1 0.99525 0.01252 alderfly_larvae polycentropodidae
## 779 27 61 59 24 16 0.075 10.3 0.99742 0.00968 alderfly_larvae rhyacophilidae
## 780 27 62 59 46 35 0.145 19.8 1.00000 0.00000 alderfly_larvae uenoidae
## 781 28 29 105 104 85 0.582 79.7 0.99589 0.01389 other_beetles crayfish
## 782 28 30 105 100 82 0.559 76.6 0.99520 0.01543 other_beetles dragonfly_nymphs
## 783 28 31 105 79 63 0.442 60.5 0.88590 0.21199 other_beetles riffle_beetles
## 784 28 32 105 135 104 0.755 103.5 0.94676 0.41391 other_beetles other_flies
## 785 28 33 105 99 75 0.554 75.9 0.43983 0.72847 other_beetles snails
## 786 28 34 105 45 39 0.252 34.5 0.98701 0.03918 other_beetles clams
## 787 28 35 105 52 40 0.291 39.9 0.60253 0.56194 other_beetles fishfly_larvae
## 788 28 36 105 39 27 0.218 29.9 0.14273 0.93322 other_beetles water_penny_beetles
## 789 28 37 105 125 97 0.699 95.8 0.88446 0.29591 other_beetles cranefly_larvae
## 790 28 38 105 56 42 0.313 42.9 0.42910 0.72138 other_beetles ameletidae
## 791 28 39 105 117 90 0.655 89.7 0.69178 0.52418 other_beetles baetidae
## 792 28 40 105 13 11 0.073 10.0 0.85703 0.37417 other_beetles caenidae
## 793 28 41 105 5 4 0.028 3.8 0.74152 0.66796 other_beetles ephemerellidae
## 794 28 42 105 3 3 0.017 2.3 1.00000 0.44716 other_beetles ephemeridae
## 795 28 43 105 40 30 0.224 30.7 0.46566 0.70032 other_beetles heptageniidae
## 796 28 44 105 11 9 0.062 8.4 0.77856 0.50298 other_beetles leptohyphidae
## 797 28 45 105 53 44 0.296 40.6 0.94814 0.11539 other_beetles leptophlebiidae
## 798 28 46 105 19 14 0.106 14.6 0.47019 0.73984 other_beetles chloroperlidae
## 799 28 47 105 68 53 0.380 52.1 0.71150 0.43871 other_beetles leuctridae
## 800 28 48 105 46 36 0.257 35.3 0.69920 0.46345 other_beetles nemouridae
## 801 28 49 105 44 38 0.246 33.7 0.98352 0.04799 other_beetles perlidae
## 802 28 50 105 18 16 0.101 13.8 0.95695 0.15362 other_beetles perlodidae
## 803 28 51 105 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.58609 other_beetles glossosomatidae
## 804 28 52 105 107 85 0.599 82.0 0.95263 0.11343 other_beetles hydropsychidae
## 805 28 53 105 16 14 0.090 12.3 0.92925 0.22449 other_beetles hydroptilidae
## 806 28 54 105 30 26 0.168 23.0 0.96245 0.10750 other_beetles lepidostomatidae
## 807 28 55 105 45 41 0.252 34.5 0.99934 0.00338 other_beetles limnephilidae
## 808 28 56 105 4 3 0.022 3.1 0.65962 0.76752 other_beetles molannidae
## 809 28 57 105 5 4 0.028 3.8 0.74152 0.66796 other_beetles odontoceridae
## 810 28 58 105 62 44 0.347 47.5 0.11054 0.94830 other_beetles philopotamidae
## 811 28 59 105 8 7 0.045 6.1 0.88844 0.40298 other_beetles phryganeidae
## 812 28 60 105 56 44 0.313 42.9 0.74035 0.40845 other_beetles polycentropodidae
## 813 28 61 105 24 15 0.134 18.4 0.06593 0.97718 other_beetles rhyacophilidae
## 814 28 62 105 46 38 0.257 35.3 0.91957 0.16893 other_beetles uenoidae
## 815 29 30 104 100 83 0.554 75.9 0.99952 0.00201 crayfish dragonfly_nymphs
## 816 29 31 104 79 69 0.438 60.0 0.99994 0.00028 crayfish riffle_beetles
## 817 29 32 104 135 104 0.748 102.5 1.00000 0.05668 crayfish other_flies
## 818 29 33 104 99 73 0.549 75.2 0.23306 0.88350 crayfish snails
## 819 29 34 104 45 35 0.249 34.2 0.71233 0.44769 crayfish clams
## 820 29 35 104 52 48 0.288 39.5 0.99996 0.00025 crayfish fishfly_larvae
## 821 29 36 104 39 37 0.216 29.6 0.99995 0.00046 crayfish water_penny_beetles
## 822 29 37 104 125 101 0.693 94.9 0.99999 0.00014 crayfish cranefly_larvae
## 823 29 38 104 56 49 0.310 42.5 0.99830 0.00638 crayfish ameletidae
## 824 29 39 104 117 94 0.648 88.8 0.99877 0.00588 crayfish baetidae
## 825 29 40 104 13 10 0.072 9.9 0.65005 0.61638 crayfish caenidae
## 826 29 41 104 5 5 0.028 3.8 1.00000 0.24617 crayfish ephemerellidae
## 827 29 42 104 3 3 0.017 2.3 1.00000 0.43439 crayfish ephemeridae
## 828 29 43 104 40 37 0.222 30.4 0.99967 0.00208 crayfish heptageniidae
## 829 29 44 104 11 11 0.061 8.4 1.00000 0.04213 crayfish leptohyphidae
## 830 29 45 104 53 51 0.294 40.2 1.00000 0.00000 crayfish leptophlebiidae
## 831 29 46 104 19 19 0.105 14.4 1.00000 0.00342 crayfish chloroperlidae
## 832 29 47 104 68 63 0.377 51.6 1.00000 0.00000 crayfish leuctridae
## 833 29 48 104 46 45 0.255 34.9 1.00000 0.00000 crayfish nemouridae
## 834 29 49 104 44 43 0.244 33.4 1.00000 0.00001 crayfish perlidae
## 835 29 50 104 18 17 0.100 13.7 0.99527 0.03700 crayfish perlodidae
## 836 29 51 104 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.57492 crayfish glossosomatidae
## 837 29 52 104 107 91 0.593 81.2 1.00000 0.00001 crayfish hydropsychidae
## 838 29 53 104 16 10 0.089 12.1 0.15271 0.94496 crayfish hydroptilidae
## 839 29 54 104 30 29 0.166 22.8 0.99992 0.00108 crayfish lepidostomatidae
## 840 29 55 104 45 43 0.249 34.2 1.00000 0.00006 crayfish limnephilidae
## 841 29 56 104 4 3 0.022 3.0 0.67259 0.75532 crayfish molannidae
## 842 29 57 104 5 5 0.028 3.8 1.00000 0.24617 crayfish odontoceridae
## 843 29 58 104 62 56 0.344 47.1 0.99996 0.00024 crayfish philopotamidae
## 844 29 59 104 8 7 0.044 6.1 0.89694 0.38355 crayfish phryganeidae
## 845 29 60 104 56 45 0.310 42.5 0.88853 0.21026 crayfish polycentropodidae
## 846 29 61 104 24 23 0.133 18.2 0.99936 0.00690 crayfish rhyacophilidae
## 847 29 62 104 46 43 0.255 34.9 0.99996 0.00031 crayfish uenoidae
## 848 30 31 100 79 65 0.421 57.7 0.99884 0.00396 dragonfly_nymphs riffle_beetles
## 849 30 32 100 135 100 0.719 98.5 1.00000 0.07149 dragonfly_nymphs other_flies
## 850 30 33 100 99 72 0.527 72.3 0.54638 0.62316 dragonfly_nymphs snails
## 851 30 34 100 45 38 0.240 32.8 0.99153 0.02579 dragonfly_nymphs clams
## 852 30 35 100 52 44 0.277 38.0 0.99616 0.01248 dragonfly_nymphs fishfly_larvae
## 853 30 36 100 39 37 0.208 28.5 0.99999 0.00010 dragonfly_nymphs water_penny_beetles
## 854 30 37 100 125 95 0.666 91.2 0.99688 0.01706 dragonfly_nymphs cranefly_larvae
## 855 30 38 100 56 48 0.298 40.9 0.99893 0.00403 dragonfly_nymphs ameletidae
## 856 30 39 100 117 92 0.623 85.4 0.99987 0.00079 dragonfly_nymphs baetidae
## 857 30 40 100 13 12 0.069 9.5 0.98670 0.08602 dragonfly_nymphs caenidae
## 858 30 41 100 5 5 0.027 3.6 1.00000 0.20154 dragonfly_nymphs ephemerellidae
## 859 30 42 100 3 3 0.016 2.2 1.00000 0.38572 dragonfly_nymphs ephemeridae
## 860 30 43 100 40 36 0.213 29.2 0.99952 0.00253 dragonfly_nymphs heptageniidae
## 861 30 44 100 11 10 0.059 8.0 0.97325 0.14773 dragonfly_nymphs leptohyphidae
## 862 30 45 100 53 47 0.282 38.7 0.99986 0.00069 dragonfly_nymphs leptophlebiidae
## 863 30 46 100 19 18 0.101 13.9 0.99850 0.01440 dragonfly_nymphs chloroperlidae
## 864 30 47 100 68 62 0.362 49.6 1.00000 0.00000 dragonfly_nymphs leuctridae
## 865 30 48 100 46 43 0.245 33.6 0.99999 0.00005 dragonfly_nymphs nemouridae
## 866 30 49 100 44 40 0.234 32.1 0.99989 0.00067 dragonfly_nymphs perlidae
## 867 30 50 100 18 18 0.096 13.1 1.00000 0.00218 dragonfly_nymphs perlodidae
## 868 30 51 100 2 2 0.011 1.5 1.00000 0.53134 dragonfly_nymphs glossosomatidae
## 869 30 52 100 107 88 0.570 78.1 1.00000 0.00001 dragonfly_nymphs hydropsychidae
## 870 30 53 100 16 12 0.085 11.7 0.67771 0.55666 dragonfly_nymphs hydroptilidae
## 871 30 54 100 30 28 0.160 21.9 0.99968 0.00248 dragonfly_nymphs lepidostomatidae
## 872 30 55 100 45 39 0.240 32.8 0.99775 0.00847 dragonfly_nymphs limnephilidae
## 873 30 56 100 4 3 0.021 2.9 0.72079 0.70523 dragonfly_nymphs molannidae
## 874 30 57 100 5 5 0.027 3.6 1.00000 0.20154 dragonfly_nymphs odontoceridae
## 875 30 58 100 62 54 0.330 45.3 0.99988 0.00056 dragonfly_nymphs philopotamidae
## 876 30 59 100 8 8 0.043 5.8 1.00000 0.07446 dragonfly_nymphs phryganeidae
## 877 30 60 100 56 44 0.298 40.9 0.92309 0.15212 dragonfly_nymphs polycentropodidae
## 878 30 61 100 24 23 0.128 17.5 0.99978 0.00276 dragonfly_nymphs rhyacophilidae
## 879 30 62 100 46 44 0.245 33.6 1.00000 0.00001 dragonfly_nymphs uenoidae
## 880 31 32 79 135 79 0.568 77.8 1.00000 0.17744 riffle_beetles other_flies
## 881 31 33 79 99 65 0.417 57.1 0.99941 0.00214 riffle_beetles snails
## 882 31 34 79 45 32 0.189 25.9 0.99267 0.01964 riffle_beetles clams
## 883 31 35 79 52 35 0.219 30.0 0.97593 0.05323 riffle_beetles fishfly_larvae
## 884 31 36 79 39 28 0.164 22.5 0.99025 0.02628 riffle_beetles water_penny_beetles
## 885 31 37 79 125 76 0.526 72.1 0.99677 0.01838 riffle_beetles cranefly_larvae
## 886 31 38 79 56 47 0.236 32.3 1.00000 0.00000 riffle_beetles ameletidae
## 887 31 39 79 117 74 0.492 67.5 0.99974 0.00156 riffle_beetles baetidae
## 888 31 40 79 13 11 0.055 7.5 0.99395 0.03400 riffle_beetles caenidae
## 889 31 41 79 5 4 0.021 2.9 0.93967 0.29361 riffle_beetles ephemerellidae
## 890 31 42 79 3 3 0.013 1.7 1.00000 0.18863 riffle_beetles ephemeridae
## 891 31 43 79 40 29 0.168 23.1 0.99351 0.01835 riffle_beetles heptageniidae
## 892 31 44 79 11 10 0.046 6.3 0.99829 0.01749 riffle_beetles leptohyphidae
## 893 31 45 79 53 34 0.223 30.6 0.91941 0.14841 riffle_beetles leptophlebiidae
## 894 31 46 79 19 15 0.080 11.0 0.99074 0.03526 riffle_beetles chloroperlidae
## 895 31 47 79 68 47 0.286 39.2 0.99802 0.00570 riffle_beetles leuctridae
## 896 31 48 79 46 30 0.194 26.5 0.92789 0.13790 riffle_beetles nemouridae
## 897 31 49 79 44 34 0.185 25.4 0.99973 0.00108 riffle_beetles perlidae
## 898 31 50 79 18 12 0.076 10.4 0.86158 0.28599 riffle_beetles perlodidae
## 899 31 51 79 2 2 0.008 1.2 1.00000 0.33072 riffle_beetles glossosomatidae
## 900 31 52 79 107 73 0.450 61.7 1.00000 0.00000 riffle_beetles hydropsychidae
## 901 31 53 79 16 11 0.067 9.2 0.89101 0.24889 riffle_beetles hydroptilidae
## 902 31 54 79 30 12 0.126 17.3 0.02280 0.99216 riffle_beetles lepidostomatidae
## 903 31 55 79 45 29 0.189 25.9 0.90501 0.17395 riffle_beetles limnephilidae
## 904 31 56 79 4 2 0.017 2.3 0.56642 0.79622 riffle_beetles molannidae
## 905 31 57 79 5 2 0.021 2.9 0.35647 0.89801 riffle_beetles odontoceridae
## 906 31 58 79 62 48 0.261 35.8 1.00000 0.00002 riffle_beetles philopotamidae
## 907 31 59 79 8 7 0.034 4.6 0.98956 0.07771 riffle_beetles phryganeidae
## 908 31 60 79 56 39 0.236 32.3 0.99470 0.01403 riffle_beetles polycentropodidae
## 909 31 61 79 24 15 0.101 13.8 0.77368 0.38487 riffle_beetles rhyacophilidae
## 910 31 62 79 46 32 0.194 26.5 0.98638 0.03341 riffle_beetles uenoidae
## 911 32 33 135 99 98 0.712 97.6 0.92454 0.47928 other_flies snails
## 912 32 34 135 45 45 0.324 44.3 1.00000 0.44933 other_flies clams
## 913 32 35 135 52 52 0.374 51.2 1.00000 0.38321 other_flies fishfly_larvae
## 914 32 36 135 39 39 0.281 38.4 1.00000 0.51020 other_flies water_penny_beetles
## 915 32 37 135 125 125 0.899 123.2 1.00000 0.00708 other_flies cranefly_larvae
## 916 32 38 135 56 56 0.403 55.2 1.00000 0.34779 other_flies ameletidae
## 917 32 39 135 117 117 0.842 115.3 1.00000 0.02040 other_flies baetidae
## 918 32 40 135 13 13 0.094 12.8 1.00000 0.81859 other_flies caenidae
## 919 32 41 135 5 5 0.036 4.9 1.00000 0.92808 other_flies ephemerellidae
## 920 32 42 135 3 3 0.022 3.0 1.00000 0.95653 other_flies ephemeridae
## 921 32 43 135 40 40 0.288 39.4 1.00000 0.49979 other_flies heptageniidae
## 922 32 44 135 11 11 0.079 10.8 1.00000 0.84532 other_flies leptohyphidae
## 923 32 45 135 53 53 0.381 52.2 1.00000 0.37419 other_flies leptophlebiidae
## 924 32 46 135 19 19 0.137 18.7 1.00000 0.74098 other_flies chloroperlidae
## 925 32 47 135 68 68 0.489 67.0 1.00000 0.25182 other_flies leuctridae
## 926 32 48 135 46 46 0.331 45.3 1.00000 0.43957 other_flies nemouridae
## 927 32 49 135 44 44 0.316 43.4 1.00000 0.45921 other_flies perlidae
## 928 32 50 135 18 18 0.129 17.7 1.00000 0.75365 other_flies perlodidae
## 929 32 51 135 2 2 0.014 2.0 1.00000 0.97091 other_flies glossosomatidae
## 930 32 52 135 107 107 0.770 105.4 1.00000 0.04669 other_flies hydropsychidae
## 931 32 53 135 16 16 0.115 15.8 1.00000 0.77930 other_flies hydroptilidae
## 932 32 54 135 30 30 0.216 29.6 1.00000 0.60874 other_flies lepidostomatidae
## 933 32 55 135 45 45 0.324 44.3 1.00000 0.44933 other_flies limnephilidae
## 934 32 56 135 4 4 0.029 3.9 1.00000 0.94225 other_flies molannidae
## 935 32 57 135 5 5 0.036 4.9 1.00000 0.92808 other_flies odontoceridae
## 936 32 58 135 62 62 0.446 61.1 1.00000 0.29787 other_flies philopotamidae
## 937 32 59 135 8 8 0.058 7.9 1.00000 0.88622 other_flies phryganeidae
## 938 32 60 135 56 56 0.403 55.2 1.00000 0.34779 other_flies polycentropodidae
## 939 32 61 135 24 24 0.173 23.6 1.00000 0.67926 other_flies rhyacophilidae
## 940 32 62 135 46 46 0.331 45.3 1.00000 0.43957 other_flies uenoidae
## 941 33 34 99 45 37 0.237 32.5 0.98079 0.05048 snails clams
## 942 33 35 99 52 33 0.274 37.6 0.05529 0.97634 snails fishfly_larvae
## 943 33 36 99 39 29 0.206 28.2 0.70773 0.45205 snails water_penny_beetles
## 944 33 37 99 125 91 0.659 90.3 0.78987 0.43747 snails cranefly_larvae
## 945 33 38 99 56 45 0.295 40.5 0.97597 0.05747 snails ameletidae
## 946 33 39 99 117 85 0.617 84.5 0.70362 0.49851 snails baetidae
## 947 33 40 99 13 10 0.069 9.4 0.75692 0.48897 snails caenidae
## 948 33 41 99 5 5 0.026 3.6 1.00000 0.19146 snails ephemerellidae
## 949 33 42 99 3 3 0.016 2.2 1.00000 0.37414 snails ephemeridae
## 950 33 43 99 40 27 0.211 28.9 0.27502 0.84364 snails heptageniidae
## 951 33 44 99 11 6 0.058 7.9 0.15412 0.95212 snails leptohyphidae
## 952 33 45 99 53 27 0.280 38.3 0.00001 1.00000 snails leptophlebiidae
## 953 33 46 99 19 13 0.100 13.7 0.43787 0.75626 snails chloroperlidae
## 954 33 47 99 68 43 0.359 49.1 0.01535 0.99461 snails leuctridae
## 955 33 48 99 46 25 0.243 33.2 0.00103 0.99975 snails nemouridae
## 956 33 49 99 44 28 0.232 31.8 0.09010 0.95900 snails perlidae
## 957 33 50 99 18 11 0.095 13.0 0.19488 0.91838 snails perlodidae
## 958 33 51 99 2 1 0.011 1.4 0.47928 0.92454 snails glossosomatidae
## 959 33 52 99 107 79 0.564 77.3 0.84276 0.28880 snails hydropsychidae
## 960 33 53 99 16 14 0.084 11.6 0.96854 0.12172 snails hydroptilidae
## 961 33 54 99 30 10 0.158 21.7 0.00000 1.00000 snails lepidostomatidae
## 962 33 55 99 45 27 0.237 32.5 0.02187 0.99208 snails limnephilidae
## 963 33 56 99 4 1 0.021 2.9 0.06472 0.99474 snails molannidae
## 964 33 57 99 5 0 0.026 3.6 0.00134 1.00000 snails odontoceridae
## 965 33 58 99 62 45 0.327 44.8 0.60426 0.54724 snails philopotamidae
## 966 33 59 99 8 8 0.042 5.8 1.00000 0.06850 snails phryganeidae
## 967 33 60 99 56 37 0.295 40.5 0.12495 0.93767 snails polycentropodidae
## 968 33 61 99 24 14 0.127 17.3 0.07946 0.97014 snails rhyacophilidae
## 969 33 62 99 46 33 0.243 33.2 0.53769 0.62098 snails uenoidae
## 970 34 35 45 52 19 0.125 17.1 0.81802 0.29614 clams fishfly_larvae
## 971 34 36 45 39 16 0.094 12.8 0.93034 0.13940 clams water_penny_beetles
## 972 34 37 45 125 42 0.300 41.1 0.82154 0.40023 clams cranefly_larvae
## 973 34 38 45 56 22 0.134 18.4 0.93527 0.12540 clams ameletidae
## 974 34 39 45 117 42 0.281 38.4 0.98665 0.05188 clams baetidae
## 975 34 40 45 13 6 0.031 4.3 0.91416 0.21934 clams caenidae
## 976 34 41 45 5 2 0.012 1.6 0.80103 0.53177 clams ephemerellidae
## 977 34 43 45 40 15 0.096 13.1 0.82787 0.29085 clams heptageniidae
## 978 34 44 45 11 4 0.026 3.6 0.72995 0.51660 clams leptohyphidae
## 979 34 45 45 53 14 0.127 17.4 0.13841 0.92886 clams leptophlebiidae
## 980 34 46 45 19 4 0.046 6.2 0.18095 0.93001 clams chloroperlidae
## 981 34 47 45 68 24 0.163 22.3 0.78441 0.33601 clams leuctridae
## 982 34 48 45 46 12 0.110 15.1 0.15741 0.91909 clams nemouridae
## 983 34 49 45 44 15 0.105 14.5 0.66070 0.48941 clams perlidae
## 984 34 50 45 18 5 0.043 5.9 0.42123 0.77300 clams perlodidae
## 985 34 52 45 107 39 0.257 35.1 0.97558 0.06715 clams hydropsychidae
## 986 34 53 45 16 7 0.038 5.3 0.89631 0.23688 clams hydroptilidae
## 987 34 54 45 30 10 0.072 9.9 0.61669 0.55617 clams lepidostomatidae
## 988 34 55 45 45 17 0.108 14.8 0.85373 0.25154 clams limnephilidae
## 989 34 56 45 4 2 0.010 1.3 0.89643 0.39865 clams molannidae
## 990 34 57 45 5 1 0.012 1.6 0.46823 0.86836 clams odontoceridae
## 991 34 58 45 62 24 0.149 20.4 0.93454 0.12601 clams philopotamidae
## 992 34 59 45 8 5 0.019 2.6 0.98460 0.07679 clams phryganeidae
## 993 34 60 45 56 18 0.134 18.4 0.51716 0.62819 clams polycentropodidae
## 994 34 61 45 24 7 0.058 7.9 0.43440 0.74225 clams rhyacophilidae
## 995 34 62 45 46 20 0.110 15.1 0.98034 0.04631 clams uenoidae
## 996 35 36 52 39 29 0.108 14.8 1.00000 0.00000 fishfly_larvae water_penny_beetles
## 997 35 37 52 125 50 0.346 47.4 0.97767 0.09697 fishfly_larvae cranefly_larvae
## 998 35 38 52 56 26 0.155 21.3 0.96963 0.06448 fishfly_larvae ameletidae
## 999 35 39 52 117 48 0.324 44.4 0.98287 0.05818 fishfly_larvae baetidae
## 1000 35 40 52 13 5 0.036 4.9 0.63905 0.59496 fishfly_larvae caenidae
## 1001 35 41 52 5 2 0.014 1.9 0.72024 0.63035 fishfly_larvae ephemerellidae
## 1002 35 42 52 3 3 0.008 1.1 1.00000 0.05272 fishfly_larvae ephemeridae
## 1003 35 43 52 40 22 0.111 15.2 0.99754 0.00757 fishfly_larvae heptageniidae
## 1004 35 44 52 11 8 0.030 4.2 0.99725 0.01679 fishfly_larvae leptohyphidae
## 1005 35 45 52 53 35 0.147 20.1 1.00000 0.00000 fishfly_larvae leptophlebiidae
## 1006 35 46 52 19 12 0.053 7.2 0.99607 0.01551 fishfly_larvae chloroperlidae
## 1007 35 47 52 68 47 0.188 25.8 1.00000 0.00000 fishfly_larvae leuctridae
## 1008 35 48 52 46 32 0.127 17.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae nemouridae
## 1009 35 49 52 44 29 0.122 16.7 1.00000 0.00000 fishfly_larvae perlidae
## 1010 35 50 52 18 10 0.050 6.8 0.97057 0.08363 fishfly_larvae perlodidae
## 1011 35 52 52 107 51 0.296 40.6 1.00000 0.00000 fishfly_larvae hydropsychidae
## 1012 35 53 52 16 9 0.044 6.1 0.96829 0.09306 fishfly_larvae hydroptilidae
## 1013 35 54 52 30 21 0.083 11.4 0.99999 0.00006 fishfly_larvae lepidostomatidae
## 1014 35 55 52 45 27 0.125 17.1 0.99995 0.00022 fishfly_larvae limnephilidae
## 1015 35 56 52 4 3 0.011 1.5 0.98072 0.15304 fishfly_larvae molannidae
## 1016 35 57 52 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00696 fishfly_larvae odontoceridae
## 1017 35 58 52 62 38 0.172 23.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae philopotamidae
## 1018 35 59 52 8 6 0.022 3.0 0.99515 0.03393 fishfly_larvae phryganeidae
## 1019 35 60 52 56 31 0.155 21.3 0.99988 0.00046 fishfly_larvae polycentropodidae
## 1020 35 61 52 24 19 0.066 9.1 1.00000 0.00001 fishfly_larvae rhyacophilidae
## 1021 35 62 52 46 30 0.127 17.5 1.00000 0.00000 fishfly_larvae uenoidae
## 1022 36 37 39 125 38 0.260 35.6 0.98539 0.09322 water_penny_beetles cranefly_larvae
## 1023 36 38 39 56 25 0.116 15.9 0.99988 0.00051 water_penny_beetles ameletidae
## 1024 36 39 39 117 39 0.243 33.3 1.00000 0.00066 water_penny_beetles baetidae
## 1025 36 40 39 13 6 0.027 3.7 0.96026 0.12418 water_penny_beetles caenidae
## 1026 36 41 39 5 3 0.010 1.4 0.97688 0.13940 water_penny_beetles ephemerellidae
## 1027 36 43 39 40 18 0.083 11.4 0.99816 0.00619 water_penny_beetles heptageniidae
## 1028 36 44 39 11 8 0.023 3.1 0.99980 0.00197 water_penny_beetles leptohyphidae
## 1029 36 45 39 53 25 0.110 15.1 0.99997 0.00014 water_penny_beetles leptophlebiidae
## 1030 36 46 39 19 11 0.039 5.4 0.99928 0.00372 water_penny_beetles chloroperlidae
## 1031 36 47 39 68 36 0.141 19.4 1.00000 0.00000 water_penny_beetles leuctridae
## 1032 36 48 39 46 25 0.096 13.1 1.00000 0.00000 water_penny_beetles nemouridae
## 1033 36 49 39 44 21 0.091 12.5 0.99983 0.00074 water_penny_beetles perlidae
## 1034 36 50 39 18 9 0.037 5.1 0.99089 0.03285 water_penny_beetles perlodidae
## 1035 36 52 39 107 37 0.222 30.5 0.99983 0.00141 water_penny_beetles hydropsychidae
## 1036 36 53 39 16 8 0.033 4.6 0.98740 0.04531 water_penny_beetles hydroptilidae
## 1037 36 54 39 30 14 0.062 8.5 0.99600 0.01328 water_penny_beetles lepidostomatidae
## 1038 36 55 39 45 18 0.094 12.8 0.98828 0.03057 water_penny_beetles limnephilidae
## 1039 36 56 39 4 2 0.008 1.1 0.93037 0.32041 water_penny_beetles molannidae
## 1040 36 57 39 5 2 0.010 1.4 0.86060 0.44109 water_penny_beetles odontoceridae
## 1041 36 58 39 62 30 0.129 17.6 1.00000 0.00000 water_penny_beetles philopotamidae
## 1042 36 59 39 8 4 0.017 2.3 0.95813 0.16075 water_penny_beetles phryganeidae
## 1043 36 60 39 56 25 0.116 15.9 0.99988 0.00051 water_penny_beetles polycentropodidae
## 1044 36 61 39 24 16 0.050 6.8 1.00000 0.00002 water_penny_beetles rhyacophilidae
## 1045 36 62 39 46 28 0.096 13.1 1.00000 0.00000 water_penny_beetles uenoidae
## 1046 37 38 125 56 55 0.373 51.1 0.99873 0.01349 cranefly_larvae ameletidae
## 1047 37 39 125 117 111 0.779 106.8 0.99975 0.00243 cranefly_larvae baetidae
## 1048 37 40 125 13 13 0.087 11.9 1.00000 0.28648 cranefly_larvae caenidae
## 1049 37 41 125 5 5 0.033 4.6 1.00000 0.62782 cranefly_larvae ephemerellidae
## 1050 37 42 125 3 3 0.020 2.7 1.00000 0.75796 cranefly_larvae ephemeridae
## 1051 37 43 125 40 39 0.266 36.5 0.98718 0.08440 cranefly_larvae heptageniidae
## 1052 37 44 125 11 11 0.073 10.0 1.00000 0.35026 cranefly_larvae leptohyphidae
## 1053 37 45 125 53 53 0.353 48.4 1.00000 0.00203 cranefly_larvae leptophlebiidae
## 1054 37 46 125 19 19 0.127 17.3 1.00000 0.15348 cranefly_larvae chloroperlidae
## 1055 37 47 125 68 67 0.453 62.0 0.99984 0.00239 cranefly_larvae leuctridae
## 1056 37 48 125 46 45 0.306 42.0 0.99432 0.04484 cranefly_larvae nemouridae
## 1057 37 49 125 44 44 0.293 40.1 1.00000 0.00749 cranefly_larvae perlidae
## 1058 37 50 125 18 17 0.120 16.4 0.82930 0.51209 cranefly_larvae perlodidae
## 1059 37 51 125 2 2 0.013 1.8 1.00000 0.83190 cranefly_larvae glossosomatidae
## 1060 37 52 125 107 104 0.713 97.6 1.00000 0.00005 cranefly_larvae hydropsychidae
## 1061 37 53 125 16 14 0.107 14.6 0.42196 0.85118 cranefly_larvae hydroptilidae
## 1062 37 54 125 30 29 0.200 27.4 0.95541 0.21181 cranefly_larvae lepidostomatidae
## 1063 37 55 125 45 44 0.300 41.1 0.99347 0.05004 cranefly_larvae limnephilidae
## 1064 37 56 125 4 4 0.027 3.6 1.00000 0.69008 cranefly_larvae molannidae
## 1065 37 57 125 5 5 0.033 4.6 1.00000 0.62782 cranefly_larvae odontoceridae
## 1066 37 58 125 62 61 0.413 56.6 0.99953 0.00593 cranefly_larvae philopotamidae
## 1067 37 59 125 8 7 0.053 7.3 0.52940 0.85347 cranefly_larvae phryganeidae
## 1068 37 60 125 56 55 0.373 51.1 0.99873 0.01349 cranefly_larvae polycentropodidae
## 1069 37 61 125 24 24 0.160 21.9 1.00000 0.08890 cranefly_larvae rhyacophilidae
## 1070 37 62 125 46 44 0.306 42.0 0.95516 0.16450 cranefly_larvae uenoidae
## 1071 38 39 56 117 55 0.349 47.8 0.99999 0.00017 ameletidae baetidae
## 1072 38 40 56 13 9 0.039 5.3 0.99333 0.03026 ameletidae caenidae
## 1073 38 41 56 5 5 0.015 2.0 1.00000 0.01023 ameletidae ephemerellidae
## 1074 38 42 56 3 2 0.009 1.2 0.93388 0.36368 ameletidae ephemeridae
## 1075 38 43 56 40 27 0.119 16.4 0.99999 0.00005 ameletidae heptageniidae
## 1076 38 44 56 11 9 0.033 4.5 0.99943 0.00521 ameletidae leptohyphidae
## 1077 38 45 56 53 28 0.158 21.7 0.99259 0.01877 ameletidae leptophlebiidae
## 1078 38 46 56 19 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 ameletidae chloroperlidae
## 1079 38 47 56 68 36 0.203 27.8 0.99883 0.00358 ameletidae leuctridae
## 1080 38 48 56 46 25 0.137 18.8 0.99301 0.01827 ameletidae nemouridae
## 1081 38 49 56 44 24 0.131 18.0 0.99217 0.02037 ameletidae perlidae
## 1082 38 50 56 18 14 0.054 7.4 0.99989 0.00080 ameletidae perlodidae
## 1083 38 52 56 107 51 0.319 43.7 0.99968 0.00162 ameletidae hydropsychidae
## 1084 38 53 56 16 9 0.048 6.5 0.94432 0.14468 ameletidae hydroptilidae
## 1085 38 54 56 30 8 0.090 12.3 0.05512 0.97916 ameletidae lepidostomatidae
## 1086 38 55 56 45 16 0.134 18.4 0.24244 0.85805 ameletidae limnephilidae
## 1087 38 56 56 4 0 0.012 1.6 0.11847 1.00000 ameletidae molannidae
## 1088 38 57 56 5 0 0.015 2.0 0.06859 1.00000 ameletidae odontoceridae
## 1089 38 58 56 62 32 0.185 25.3 0.99384 0.01572 ameletidae philopotamidae
## 1090 38 59 56 8 5 0.024 3.3 0.94982 0.18057 ameletidae phryganeidae
## 1091 38 60 56 56 30 0.167 22.9 0.99643 0.00975 ameletidae polycentropodidae
## 1092 38 61 56 24 11 0.072 9.8 0.78098 0.37338 ameletidae rhyacophilidae
## 1093 38 62 56 46 28 0.137 18.8 0.99982 0.00070 ameletidae uenoidae
## 1094 39 40 117 13 12 0.081 11.1 0.88418 0.40260 baetidae caenidae
## 1095 39 41 117 5 5 0.031 4.3 1.00000 0.44851 baetidae ephemerellidae
## 1096 39 42 117 3 3 0.019 2.6 1.00000 0.62051 baetidae ephemeridae
## 1097 39 43 117 40 39 0.249 34.2 0.99948 0.00591 baetidae heptageniidae
## 1098 39 44 117 11 11 0.069 9.4 1.00000 0.16389 baetidae leptohyphidae
## 1099 39 45 117 53 51 0.330 45.3 0.99964 0.00288 baetidae leptophlebiidae
## 1100 39 46 117 19 19 0.118 16.2 1.00000 0.03935 baetidae chloroperlidae
## 1101 39 47 117 68 65 0.424 58.1 0.99992 0.00066 baetidae leuctridae
## 1102 39 48 117 46 44 0.287 39.3 0.99827 0.01116 baetidae nemouridae
## 1103 39 49 117 44 42 0.274 37.6 0.99736 0.01592 baetidae perlidae
## 1104 39 50 117 18 18 0.112 15.4 1.00000 0.04730 baetidae perlodidae
## 1105 39 51 117 2 2 0.012 1.7 1.00000 0.72842 baetidae glossosomatidae
## 1106 39 52 117 107 98 0.667 91.4 0.99994 0.00044 baetidae hydropsychidae
## 1107 39 53 117 16 15 0.100 13.7 0.93199 0.28136 baetidae hydroptilidae
## 1108 39 54 117 30 28 0.187 25.6 0.96397 0.13329 baetidae lepidostomatidae
## 1109 39 55 117 45 40 0.281 38.4 0.85760 0.29662 baetidae limnephilidae
## 1110 39 56 117 4 4 0.025 3.4 1.00000 0.52790 baetidae molannidae
## 1111 39 57 117 5 5 0.031 4.3 1.00000 0.44851 baetidae odontoceridae
## 1112 39 58 117 62 58 0.386 52.9 0.99745 0.01174 baetidae philopotamidae
## 1113 39 59 117 8 8 0.050 6.8 1.00000 0.27285 baetidae phryganeidae
## 1114 39 60 117 56 54 0.349 47.8 0.99983 0.00153 baetidae polycentropodidae
## 1115 39 61 117 24 24 0.150 20.5 1.00000 0.01528 baetidae rhyacophilidae
## 1116 39 62 117 46 46 0.287 39.3 1.00000 0.00013 baetidae uenoidae
## 1117 40 43 13 40 5 0.028 3.8 0.86198 0.31594 caenidae heptageniidae
## 1118 40 44 13 11 4 0.008 1.0 0.99884 0.01133 caenidae leptohyphidae
## 1119 40 45 13 53 6 0.037 5.0 0.81157 0.38298 caenidae leptophlebiidae
## 1120 40 46 13 19 4 0.013 1.8 0.98107 0.08376 caenidae chloroperlidae
## 1121 40 47 13 68 8 0.047 6.5 0.88406 0.27136 caenidae leuctridae
## 1122 40 48 13 46 6 0.032 4.4 0.90400 0.23784 caenidae nemouridae
## 1123 40 49 13 44 8 0.030 4.2 0.99546 0.02177 caenidae perlidae
## 1124 40 50 13 18 5 0.012 1.7 0.99783 0.01474 caenidae perlodidae
## 1125 40 52 13 107 11 0.074 10.2 0.82698 0.42519 caenidae hydropsychidae
## 1126 40 53 13 16 1 0.011 1.5 0.53394 0.81641 caenidae hydroptilidae
## 1127 40 54 13 30 3 0.021 2.8 0.69209 0.57481 caenidae lepidostomatidae
## 1128 40 55 13 45 2 0.031 4.3 0.13429 0.96528 caenidae limnephilidae
## 1129 40 58 13 62 7 0.043 5.9 0.82815 0.35713 caenidae philopotamidae
## 1130 40 60 13 56 6 0.039 5.3 0.76083 0.45040 caenidae polycentropodidae
## 1131 40 61 13 24 1 0.017 2.3 0.29372 0.92817 caenidae rhyacophilidae
## 1132 40 62 13 46 8 0.032 4.4 0.99346 0.02925 caenidae uenoidae
## 1133 41 43 5 40 3 0.011 1.5 0.97451 0.14863 ephemerellidae heptageniidae
## 1134 41 45 5 53 3 0.014 1.9 0.92647 0.29213 ephemerellidae leptophlebiidae
## 1135 41 47 5 68 4 0.018 2.5 0.97210 0.17833 ephemerellidae leuctridae
## 1136 41 48 5 46 3 0.012 1.7 0.95658 0.20982 ephemerellidae nemouridae
## 1137 41 49 5 44 3 0.012 1.6 0.96330 0.18837 ephemerellidae perlidae
## 1138 41 52 5 107 4 0.029 3.9 0.71542 0.69901 ephemerellidae hydropsychidae
## 1139 41 54 5 30 0 0.008 1.1 0.28458 1.00000 ephemerellidae lepidostomatidae
## 1140 41 55 5 45 2 0.012 1.6 0.80103 0.53177 ephemerellidae limnephilidae
## 1141 41 58 5 62 3 0.017 2.3 0.87068 0.41026 ephemerellidae philopotamidae
## 1142 41 60 5 56 2 0.015 2.0 0.66972 0.68201 ephemerellidae polycentropodidae
## 1143 41 62 5 46 2 0.012 1.7 0.79018 0.54641 ephemerellidae uenoidae
## 1144 42 45 3 53 2 0.008 1.2 0.94412 0.33199 ephemeridae leptophlebiidae
## 1145 42 47 3 68 3 0.011 1.5 1.00000 0.11955 ephemeridae leuctridae
## 1146 42 48 3 46 1 0.007 1.0 0.73912 0.71021 ephemeridae nemouridae
## 1147 42 52 3 107 3 0.017 2.3 1.00000 0.47346 ephemeridae hydropsychidae
## 1148 42 58 3 62 3 0.010 1.4 1.00000 0.09022 ephemeridae philopotamidae
## 1149 42 60 3 56 2 0.009 1.2 0.93388 0.36368 ephemeridae polycentropodidae
## 1150 42 62 3 46 3 0.007 1.0 1.00000 0.03621 ephemeridae uenoidae
## 1151 43 44 40 11 8 0.023 3.2 0.99974 0.00240 heptageniidae leptohyphidae
## 1152 43 45 40 53 30 0.113 15.5 1.00000 0.00000 heptageniidae leptophlebiidae
## 1153 43 46 40 19 13 0.040 5.5 0.99998 0.00015 heptageniidae chloroperlidae
## 1154 43 47 40 68 32 0.145 19.9 1.00000 0.00000 heptageniidae leuctridae
## 1155 43 48 40 46 29 0.098 13.4 1.00000 0.00000 heptageniidae nemouridae
## 1156 43 49 40 44 30 0.094 12.8 1.00000 0.00000 heptageniidae perlidae
## 1157 43 50 40 18 14 0.038 5.3 1.00000 0.00001 heptageniidae perlodidae
## 1158 43 52 40 107 36 0.228 31.2 0.99422 0.02242 heptageniidae hydropsychidae
## 1159 43 53 40 16 4 0.034 4.7 0.47296 0.74714 heptageniidae hydroptilidae
## 1160 43 54 40 30 13 0.064 8.8 0.98254 0.04697 heptageniidae lepidostomatidae
## 1161 43 55 40 45 23 0.096 13.1 0.99998 0.00011 heptageniidae limnephilidae
## 1162 43 56 40 4 3 0.009 1.2 0.99349 0.07475 heptageniidae molannidae
## 1163 43 57 40 5 2 0.011 1.5 0.85137 0.45648 heptageniidae odontoceridae
## 1164 43 58 40 62 22 0.132 18.1 0.95145 0.09992 heptageniidae philopotamidae
## 1165 43 59 40 8 6 0.017 2.3 0.99925 0.00790 heptageniidae phryganeidae
## 1166 43 60 40 56 17 0.119 16.4 0.67110 0.47528 heptageniidae polycentropodidae
## 1167 43 61 40 24 13 0.051 7.0 0.99901 0.00430 heptageniidae rhyacophilidae
## 1168 43 62 40 46 27 0.098 13.4 1.00000 0.00000 heptageniidae uenoidae
## 1169 44 45 11 53 10 0.031 4.3 0.99999 0.00032 leptohyphidae leptophlebiidae
## 1170 44 46 11 19 7 0.011 1.5 1.00000 0.00008 leptohyphidae chloroperlidae
## 1171 44 47 11 68 11 0.040 5.5 1.00000 0.00029 leptohyphidae leuctridae
## 1172 44 48 11 46 11 0.027 3.7 1.00000 0.00000 leptohyphidae nemouridae
## 1173 44 49 11 44 11 0.026 3.5 1.00000 0.00000 leptohyphidae perlidae
## 1174 44 50 11 18 4 0.011 1.4 0.99369 0.03869 leptohyphidae perlodidae
## 1175 44 52 11 107 10 0.063 8.6 0.94147 0.25764 leptohyphidae hydropsychidae
## 1176 44 53 11 16 4 0.009 1.3 0.99651 0.02520 leptohyphidae hydroptilidae
## 1177 44 54 11 30 5 0.018 2.4 0.98586 0.06279 leptohyphidae lepidostomatidae
## 1178 44 55 11 45 5 0.026 3.6 0.89452 0.27005 leptohyphidae limnephilidae
## 1179 44 58 11 62 7 0.036 5.0 0.94462 0.16829 leptohyphidae philopotamidae
## 1180 44 60 11 56 5 0.033 4.5 0.74188 0.49229 leptohyphidae polycentropodidae
## 1181 44 61 11 24 3 0.014 1.9 0.89817 0.29747 leptohyphidae rhyacophilidae
## 1182 44 62 11 46 10 0.027 3.7 1.00000 0.00007 leptohyphidae uenoidae
## 1183 45 46 53 19 16 0.054 7.4 1.00000 0.00002 leptophlebiidae chloroperlidae
## 1184 45 47 53 68 47 0.192 26.3 1.00000 0.00000 leptophlebiidae leuctridae
## 1185 45 48 53 46 37 0.130 17.8 1.00000 0.00000 leptophlebiidae nemouridae
## 1186 45 49 53 44 36 0.124 17.0 1.00000 0.00000 leptophlebiidae perlidae
## 1187 45 50 53 18 14 0.051 7.0 0.99995 0.00038 leptophlebiidae perlodidae
## 1188 45 52 53 107 50 0.302 41.4 0.99999 0.00013 leptophlebiidae hydropsychidae
## 1189 45 53 53 16 5 0.045 6.2 0.35903 0.82105 leptophlebiidae hydroptilidae
## 1190 45 54 53 30 26 0.085 11.6 1.00000 0.00000 leptophlebiidae lepidostomatidae
## 1191 45 55 53 45 31 0.127 17.4 1.00000 0.00000 leptophlebiidae limnephilidae
## 1192 45 56 53 4 4 0.011 1.5 1.00000 0.02085 leptophlebiidae molannidae
## 1193 45 57 53 5 5 0.014 1.9 1.00000 0.00768 leptophlebiidae odontoceridae
## 1194 45 58 53 62 29 0.175 24.0 0.97405 0.05581 leptophlebiidae philopotamidae
## 1195 45 59 53 8 3 0.023 3.1 0.62697 0.66239 leptophlebiidae phryganeidae
## 1196 45 60 53 56 29 0.158 21.7 0.99740 0.00741 leptophlebiidae polycentropodidae
## 1197 45 61 53 24 19 0.068 9.3 1.00000 0.00001 leptophlebiidae rhyacophilidae
## 1198 45 62 53 46 28 0.130 17.8 0.99996 0.00016 leptophlebiidae uenoidae
## 1199 46 47 19 68 18 0.069 9.4 1.00000 0.00001 chloroperlidae leuctridae
## 1200 46 48 19 46 19 0.047 6.4 1.00000 0.00000 chloroperlidae nemouridae
## 1201 46 49 19 44 16 0.045 6.1 1.00000 0.00000 chloroperlidae perlidae
## 1202 46 50 19 18 10 0.018 2.5 1.00000 0.00001 chloroperlidae perlodidae
## 1203 46 52 19 107 18 0.108 14.8 0.99382 0.04576 chloroperlidae hydropsychidae
## 1204 46 53 19 16 3 0.016 2.2 0.84003 0.38771 chloroperlidae hydroptilidae
## 1205 46 54 19 30 8 0.030 4.2 0.99283 0.02779 chloroperlidae lepidostomatidae
## 1206 46 55 19 45 9 0.046 6.2 0.95419 0.11844 chloroperlidae limnephilidae
## 1207 46 58 19 62 15 0.063 8.6 0.99977 0.00152 chloroperlidae philopotamidae
## 1208 46 59 19 8 1 0.008 1.1 0.69349 0.70731 chloroperlidae phryganeidae
## 1209 46 60 19 56 13 0.057 7.8 0.99796 0.00901 chloroperlidae polycentropodidae
## 1210 46 61 19 24 9 0.024 3.3 0.99985 0.00107 chloroperlidae rhyacophilidae
## 1211 46 62 19 46 15 0.047 6.4 1.00000 0.00002 chloroperlidae uenoidae
## 1212 47 48 68 46 41 0.167 22.8 1.00000 0.00000 leuctridae nemouridae
## 1213 47 49 68 44 38 0.159 21.8 1.00000 0.00000 leuctridae perlidae
## 1214 47 50 68 18 13 0.065 8.9 0.99049 0.03461 leuctridae perlodidae
## 1215 47 52 68 107 65 0.388 53.1 1.00000 0.00000 leuctridae hydropsychidae
## 1216 47 53 68 16 9 0.058 7.9 0.79613 0.38349 leuctridae hydroptilidae
## 1217 47 54 68 30 26 0.109 14.9 1.00000 0.00000 leuctridae lepidostomatidae
## 1218 47 55 68 45 34 0.163 22.3 1.00000 0.00002 leuctridae limnephilidae
## 1219 47 56 68 4 4 0.014 2.0 1.00000 0.05799 leuctridae molannidae
## 1220 47 57 68 5 5 0.018 2.5 1.00000 0.02790 leuctridae odontoceridae
## 1221 47 58 68 62 46 0.225 30.8 1.00000 0.00000 leuctridae philopotamidae
## 1222 47 59 68 8 6 0.029 4.0 0.97028 0.13246 leuctridae phryganeidae
## 1223 47 60 68 56 40 0.203 27.8 1.00000 0.00002 leuctridae polycentropodidae
## 1224 47 61 68 24 22 0.087 11.9 1.00000 0.00000 leuctridae rhyacophilidae
## 1225 47 62 68 46 38 0.167 22.8 1.00000 0.00000 leuctridae uenoidae
## 1226 48 49 46 44 31 0.108 14.8 1.00000 0.00000 nemouridae perlidae
## 1227 48 50 46 18 17 0.044 6.0 1.00000 0.00000 nemouridae perlodidae
## 1228 48 52 46 107 44 0.262 35.9 0.99998 0.00017 nemouridae hydropsychidae
## 1229 48 53 46 16 6 0.039 5.4 0.74156 0.46182 nemouridae hydroptilidae
## 1230 48 54 46 30 23 0.074 10.1 1.00000 0.00000 nemouridae lepidostomatidae
## 1231 48 55 46 45 29 0.110 15.1 1.00000 0.00000 nemouridae limnephilidae
## 1232 48 56 46 4 3 0.010 1.3 0.98838 0.10998 nemouridae molannidae
## 1233 48 57 46 5 5 0.012 1.7 1.00000 0.00367 nemouridae odontoceridae
## 1234 48 58 46 62 31 0.152 20.8 0.99995 0.00020 nemouridae philopotamidae
## 1235 48 59 46 8 4 0.020 2.7 0.91597 0.25853 nemouridae phryganeidae
## 1236 48 60 46 56 23 0.137 18.8 0.95769 0.08715 nemouridae polycentropodidae
## 1237 48 61 46 24 21 0.059 8.1 1.00000 0.00000 nemouridae rhyacophilidae
## 1238 48 62 46 46 31 0.113 15.4 1.00000 0.00000 nemouridae uenoidae
## 1239 49 50 44 18 13 0.042 5.8 0.99997 0.00022 perlidae perlodidae
## 1240 49 52 44 107 41 0.251 34.4 0.99969 0.00199 perlidae hydropsychidae
## 1241 49 53 44 16 5 0.038 5.1 0.59116 0.63251 perlidae hydroptilidae
## 1242 49 54 44 30 16 0.070 9.6 0.99850 0.00551 perlidae lepidostomatidae
## 1243 49 55 44 45 26 0.105 14.5 1.00000 0.00001 perlidae limnephilidae
## 1244 49 56 44 4 2 0.009 1.3 0.90263 0.38554 perlidae molannidae
## 1245 49 57 44 5 3 0.012 1.6 0.96330 0.18837 perlidae odontoceridae
## 1246 49 58 44 62 28 0.145 19.9 0.99923 0.00261 perlidae philopotamidae
## 1247 49 59 44 8 6 0.019 2.6 0.99850 0.01358 perlidae phryganeidae
## 1248 49 60 44 56 20 0.131 18.0 0.82545 0.28566 perlidae polycentropodidae
## 1249 49 61 44 24 12 0.056 7.7 0.98795 0.03632 perlidae rhyacophilidae
## 1250 49 62 44 46 29 0.108 14.8 1.00000 0.00000 perlidae uenoidae
## 1251 50 52 18 107 16 0.103 14.1 0.94216 0.19212 perlodidae hydropsychidae
## 1252 50 53 18 16 3 0.015 2.1 0.86355 0.35175 perlodidae hydroptilidae
## 1253 50 54 18 30 9 0.029 3.9 0.99919 0.00446 perlodidae lepidostomatidae
## 1254 50 55 18 45 9 0.043 5.9 0.97077 0.08404 perlodidae limnephilidae
## 1255 50 58 18 62 10 0.059 8.1 0.88397 0.24518 perlodidae philopotamidae
## 1256 50 59 18 8 3 0.008 1.1 0.98929 0.07034 perlodidae phryganeidae
## 1257 50 60 18 56 8 0.054 7.4 0.72373 0.46624 perlodidae polycentropodidae
## 1258 50 61 18 24 6 0.023 3.2 0.98179 0.06557 perlodidae rhyacophilidae
## 1259 50 62 18 46 14 0.044 6.0 1.00000 0.00005 perlodidae uenoidae
## 1260 51 52 2 107 2 0.011 1.6 1.00000 0.60874 glossosomatidae hydropsychidae
## 1261 52 53 107 16 15 0.091 12.5 0.98535 0.09107 hydropsychidae hydroptilidae
## 1262 52 54 107 30 28 0.171 23.4 0.99741 0.01529 hydropsychidae lepidostomatidae
## 1263 52 55 107 45 40 0.257 35.1 0.99302 0.02442 hydropsychidae limnephilidae
## 1264 52 56 107 4 4 0.023 3.1 1.00000 0.36746 hydropsychidae molannidae
## 1265 52 57 107 5 5 0.029 3.9 1.00000 0.28458 hydropsychidae odontoceridae
## 1266 52 58 107 62 59 0.353 48.4 1.00000 0.00000 hydropsychidae philopotamidae
## 1267 52 59 107 8 8 0.046 6.2 1.00000 0.13042 hydropsychidae phryganeidae
## 1268 52 60 107 56 51 0.319 43.7 0.99968 0.00162 hydropsychidae polycentropodidae
## 1269 52 61 107 24 24 0.137 18.7 1.00000 0.00138 hydropsychidae rhyacophilidae
## 1270 52 62 107 46 43 0.262 35.9 0.99983 0.00113 hydropsychidae uenoidae
## 1271 53 54 16 30 4 0.026 3.5 0.74777 0.48173 hydroptilidae lepidostomatidae
## 1272 53 55 16 45 3 0.038 5.3 0.16020 0.94683 hydroptilidae limnephilidae
## 1273 53 58 16 62 10 0.053 7.2 0.95930 0.11384 hydroptilidae philopotamidae
## 1274 53 60 16 56 11 0.048 6.5 0.99625 0.01664 hydroptilidae polycentropodidae
## 1275 53 61 16 24 4 0.020 2.8 0.87984 0.29756 hydroptilidae rhyacophilidae
## 1276 53 62 16 46 7 0.039 5.4 0.88328 0.25844 hydroptilidae uenoidae
## 1277 54 55 30 45 23 0.072 9.9 1.00000 0.00000 lepidostomatidae limnephilidae
## 1278 54 57 30 5 5 0.008 1.1 1.00000 0.00038 lepidostomatidae odontoceridae
## 1279 54 58 30 62 17 0.099 13.6 0.94812 0.11265 lepidostomatidae philopotamidae
## 1280 54 59 30 8 1 0.013 1.8 0.44342 0.86958 lepidostomatidae phryganeidae
## 1281 54 60 30 56 14 0.090 12.3 0.82661 0.29995 lepidostomatidae polycentropodidae
## 1282 54 61 30 24 16 0.038 5.3 1.00000 0.00000 lepidostomatidae rhyacophilidae
## 1283 54 62 30 46 17 0.074 10.1 0.99927 0.00291 lepidostomatidae uenoidae
## 1284 55 56 45 4 4 0.010 1.3 1.00000 0.01061 limnephilidae molannidae
## 1285 55 57 45 5 5 0.012 1.6 1.00000 0.00327 limnephilidae odontoceridae
## 1286 55 58 45 62 26 0.149 20.4 0.98754 0.03032 limnephilidae philopotamidae
## 1287 55 59 45 8 3 0.019 2.6 0.75664 0.52257 limnephilidae phryganeidae
## 1288 55 60 45 56 15 0.134 18.4 0.14195 0.92602 limnephilidae polycentropodidae
## 1289 55 61 45 24 16 0.058 7.9 0.99997 0.00020 limnephilidae rhyacophilidae
## 1290 55 62 45 46 22 0.110 15.1 0.99759 0.00735 limnephilidae uenoidae
## 1291 56 58 4 62 3 0.013 1.8 0.96028 0.24170 molannidae philopotamidae
## 1292 56 60 4 56 2 0.012 1.6 0.81397 0.54132 molannidae polycentropodidae
## 1293 56 62 4 46 3 0.010 1.3 0.98838 0.10998 molannidae uenoidae
## 1294 57 58 5 62 5 0.017 2.3 1.00000 0.01732 odontoceridae philopotamidae
## 1295 57 60 5 56 3 0.015 2.0 0.91014 0.33028 odontoceridae polycentropodidae
## 1296 57 62 5 46 2 0.012 1.7 0.79018 0.54641 odontoceridae uenoidae
## 1297 58 59 62 8 6 0.026 3.6 0.98389 0.08437 philopotamidae phryganeidae
## 1298 58 60 62 56 36 0.185 25.3 0.99996 0.00018 philopotamidae polycentropodidae
## 1299 58 61 62 24 18 0.079 10.9 0.99976 0.00127 philopotamidae rhyacophilidae
## 1300 58 62 62 46 28 0.152 20.8 0.99742 0.00754 philopotamidae uenoidae
## 1301 59 60 8 56 4 0.024 3.3 0.81943 0.42507 phryganeidae polycentropodidae
## 1302 59 61 8 24 1 0.010 1.4 0.57560 0.79525 phryganeidae rhyacophilidae
## 1303 59 62 8 46 7 0.020 2.7 0.99990 0.00205 phryganeidae uenoidae
## 1304 60 61 56 24 17 0.072 9.8 0.99978 0.00117 polycentropodidae rhyacophilidae
## 1305 60 62 56 46 26 0.137 18.8 0.99764 0.00699 polycentropodidae uenoidae
## 1306 61 62 24 46 18 0.059 8.1 1.00000 0.00001 rhyacophilidae uenoidae
# network stuff
library(asnipe)
library(igraph)
assoc=streambioticsum_suff_biotic_bin_t_3 #transpose the data into group-by-individual
mat=get_network(t(assoc), association_index="SRI") #create adjacency matrix with "simple ratio index"
## Generating 62 x 62 matrix
g.streams=graph_from_adjacency_matrix(mat, "undirected", weighted=T) #make into igraph object
plot(g.streams, edge.width=E(g.streams)$weight*5, vertex.label="")
com=cluster_louvain(g.streams)
com
## IGRAPH clustering multi level, groups: 3, mod: 0.1
## + groups:
## $`1`
## [1] "streambioticsum_suff_mtdusky" "streambioticsum_suff_nodusky" "streambioticsum_suff_twolined" "common_shiner" "aquatic_worms" "sow_bugs" "scuds" "water_mites" "damselfly_nymphs" "other_beetles" "crayfish" "dragonfly_nymphs" "riffle_beetles" "other_flies" "snails" "clams" "cranefly_larvae" "ameletidae"
## [19] "baetidae" "hydropsychidae" "philopotamidae" "polycentropodidae"
##
## $`2`
## [1] "streambioticsum_suff_longtail" "streambioticsum_suff_red" "streambioticsum_suff_mole" "streambioticsum_suff_redback" "streambioticsum_suff_slimy" "blacknose_dace" "alderfly_larvae" "fishfly_larvae" "water_penny_beetles" "heptageniidae" "leptohyphidae" "leptophlebiidae" "chloroperlidae" "leuctridae" "nemouridae" "perlidae" "perlodidae" "glossosomatidae"
## [19] "hydroptilidae" "lepidostomatidae" "limnephilidae" "molannidae" "odontoceridae" "rhyacophilidae" "uenoidae"
##
## $`3`
## [1] "bluegill_sunfish" "central_stoneroller_minnow" "creek_chub" "green_sunfish" "johnny_darter" "rainbow_darter" "redbelly_dace" "redside_dace" "white_sucker" "yellow_bullhead_catfish" "sessile_animals" "caenidae" "ephemerellidae" "ephemeridae" "phryganeidae"
## + ... omitted several groups/vertices
com$memberships
## [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10] [,11] [,12] [,13] [,14] [,15] [,16] [,17] [,18] [,19] [,20] [,21] [,22] [,23] [,24] [,25] [,26] [,27] [,28] [,29] [,30] [,31] [,32] [,33] [,34] [,35] [,36] [,37] [,38] [,39] [,40] [,41] [,42] [,43] [,44] [,45] [,46] [,47] [,48] [,49] [,50] [,51] [,52] [,53] [,54] [,55] [,56] [,57] [,58] [,59] [,60] [,61] [,62]
## [1,] 1 1 1 2 2 2 2 2 2 3 3 1 4 3 4 4 5 5 4 3 4 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 4 5 4 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 4 1 2 2
## [2,] 1 1 1 2 2 2 2 2 2 3 3 1 3 3 3 3 3 3 3 3 3 1 1 1 1 1 2 1 1 1 1 1 1 1 2 2 1 1 1 3 3 3 2 2 2 2 2 2 2 2 2 1 2 2 2 2 2 1 3 1 2 2
set.seed(2)
plot(com, g.streams, edge.width=E(g.streams)$weight*5)
library(RColorBrewer)
colors=brewer.pal(length(com),'Accent') #make a color palette
V(g.streams)$color=colors[membership(com)] #assign each vertex a color based on the community assignment
set.seed(2)
plot(g.streams, edge.width=E(g.streams)$weight*5)
# number of species
S <- vcount(g.streams)
# number of interactions
L <- ecount(g.streams)
# average number of interactions species
L.S <- L/S
# network connectance
C <- L/S^2
# Calculate connectance
connectance <- ecount(g.streams) / vcount(g.streams)^2
# Print connectance va
print(paste0('Connectance of stream network =', round(connectance,2)))
## [1] "Connectance of stream network =0.39"
links.per.species <- ecount(g.streams) / vcount(g.streams)
## Mean generality of species in the network
Generality <- function(M){
return(sum(colSums(M))/sum((colSums(M)!=0)));
}
Generality(mat)
## [1] 9.137971
## Mean vulnerability of the species in the network
Vulnerability <- function(M){
return(sum(rowSums(M))/sum((rowSums(M)!=0)));
}
Vulnerability(mat)
## [1] 9.137971
## In-degree or number of prey of all species in the network
InDegree <- function(M){
return(colSums(M));
}
InDegree(mat)
## streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_longtail streambioticsum_suff_red streambioticsum_suff_mole streambioticsum_suff_redback streambioticsum_suff_slimy blacknose_dace bluegill_sunfish central_stoneroller_minnow common_shiner creek_chub green_sunfish johnny_darter rainbow_darter redbelly_dace redside_dace white_sucker yellow_bullhead_catfish
## 5.7684429 12.6091201 18.1148539 2.6036502 6.9880317 0.8314151 13.2562505 4.3712446 6.8745118 1.2921030 1.6087976 0.2536703 9.7791805 1.7606198 1.9689797 2.0458670 1.0543417 0.7658198 1.8081731 0.6520434
## sessile_animals aquatic_worms sow_bugs scuds water_mites damselfly_nymphs alderfly_larvae other_beetles crayfish dragonfly_nymphs riffle_beetles other_flies snails clams fishfly_larvae water_penny_beetles cranefly_larvae ameletidae baetidae caenidae
## 1.5287731 16.3934254 7.9742613 9.0931701 11.3492770 14.0937051 14.6841860 16.0219490 17.8581053 17.6184242 15.9132396 17.7178975 14.4724936 10.3423900 14.5769653 12.7719430 17.9686099 13.6687473 17.8530641 4.7198128
## ephemerellidae ephemeridae heptageniidae leptohyphidae leptophlebiidae chloroperlidae leuctridae nemouridae perlidae perlodidae glossosomatidae hydropsychidae hydroptilidae lepidostomatidae limnephilidae molannidae odontoceridae philopotamidae phryganeidae polycentropodidae
## 2.5257326 1.7673071 12.4332667 5.6486398 14.9095868 8.4589938 17.2533323 14.5551439 13.6439999 7.3296146 1.3508963 18.2477425 5.0222787 9.9118894 12.1626754 2.1686248 2.6417555 15.0208323 3.8684341 13.0957294
## rhyacophilidae uenoidae
## 9.3303700 14.1798088
## Out-degree or number of predators of all species in the network
OutDegree <- function(M){
return(rowSums(M));
}
OutDegree(mat)
## streambioticsum_suff_mtdusky streambioticsum_suff_nodusky streambioticsum_suff_twolined streambioticsum_suff_longtail streambioticsum_suff_red streambioticsum_suff_mole streambioticsum_suff_redback streambioticsum_suff_slimy blacknose_dace bluegill_sunfish central_stoneroller_minnow common_shiner creek_chub green_sunfish johnny_darter rainbow_darter redbelly_dace redside_dace white_sucker yellow_bullhead_catfish
## 5.7684429 12.6091201 18.1148539 2.6036502 6.9880317 0.8314151 13.2562505 4.3712446 6.8745118 1.2921030 1.6087976 0.2536703 9.7791805 1.7606198 1.9689797 2.0458670 1.0543417 0.7658198 1.8081731 0.6520434
## sessile_animals aquatic_worms sow_bugs scuds water_mites damselfly_nymphs alderfly_larvae other_beetles crayfish dragonfly_nymphs riffle_beetles other_flies snails clams fishfly_larvae water_penny_beetles cranefly_larvae ameletidae baetidae caenidae
## 1.5287731 16.3934254 7.9742613 9.0931701 11.3492770 14.0937051 14.6841860 16.0219490 17.8581053 17.6184242 15.9132396 17.7178975 14.4724936 10.3423900 14.5769653 12.7719430 17.9686099 13.6687473 17.8530641 4.7198128
## ephemerellidae ephemeridae heptageniidae leptohyphidae leptophlebiidae chloroperlidae leuctridae nemouridae perlidae perlodidae glossosomatidae hydropsychidae hydroptilidae lepidostomatidae limnephilidae molannidae odontoceridae philopotamidae phryganeidae polycentropodidae
## 2.5257326 1.7673071 12.4332667 5.6486398 14.9095868 8.4589938 17.2533323 14.5551439 13.6439999 7.3296146 1.3508963 18.2477425 5.0222787 9.9118894 12.1626754 2.1686248 2.6417555 15.0208323 3.8684341 13.0957294
## rhyacophilidae uenoidae
## 9.3303700 14.1798088
#occupancy - all taxa
phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula <- ~scale(pool_depth_.cm.) + scale(per_sand) + scale(per_cobble) + scale(substrate_metric_total) +
scale(pool_metric_total)
phwhall_occobject_season.det.formula <- ~ scale(seasons)
# Number of species
N <- dim(phwhall_occobject$y)[1]
# Distances between sites
dist.phwh <- dist(phwhall_occobject$coords)
# Exponential covariance model
cov.model <- "exponential"
ms.inits <- list(alpha.comm = 0,
beta.comm = 0,
beta = 0,
alpha = 0,
tau.sq.beta = 1,
tau.sq.alpha = 1,
z = apply(phwhall_occobject$y, c(1, 2), max, na.rm = TRUE))
ms.priors <- list(beta.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
alpha.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
tau.sq.beta.ig = list(a = 0.1, b = 0.1),
tau.sq.alpha.ig = list(a = 0.1, b = 0.1))
out.alltax.allsigcor.ms <- msPGOcc(occ.formula = phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula,
det.formula = phwhsal_occobject_season.det.formula,
data = phwhall_occobject,
inits = ms.inits,
n.samples = 30000,
priors = ms.priors,
n.omp.threads = 4,
verbose = TRUE,
n.report = 60000,
n.burn = 10000,
n.thin = 50,
n.chains = 3)
summary(out.alltax.allsigcor.ms, level = 'both')
ppc.alltax.allsigcor.ms.out <- ppcOcc(out.alltax.allsigcor.ms, 'chi-squared', group = 1)
summary(ppc.alltax.allsigcor.ms.out, level = 'both')
waicOcc(out.alltax.allsigcor.ms)
phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula <- ~scale(pool_depth_.cm.) + scale(per_sand) + scale(per_cobble) + scale(substrate_metric_total) +
scale(pool_metric_total)
phwhall_occobject_dayyearseason.det.formula <- ~scale(seasons)+scale(dayyear)
# Number of species
N <- dim(phwhall_occobject$y)[1]
# Distances between sites
dist.phwh <- dist(phwhall_occobject$coords)
# Exponential covariance model
cov.model <- "exponential"
ms.inits <- list(alpha.comm = 0,
beta.comm = 0,
beta = 0,
alpha = 0,
tau.sq.beta = 1,
tau.sq.alpha = 1,
z = apply(phwhall_occobject$y, c(1, 2), max, na.rm = TRUE))
ms.priors <- list(beta.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
alpha.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
tau.sq.beta.ig = list(a = 0.1, b = 0.1),
tau.sq.alpha.ig = list(a = 0.1, b = 0.1))
out.alltax.allsigcor.impdet.ms <- msPGOcc(occ.formula = phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula,
det.formula = phwhall_occobject_dayyearseason.det.formula,
data = phwhall_occobject,
inits = ms.inits,
n.samples = 30000,
priors = ms.priors,
n.omp.threads = 4,
verbose = TRUE,
n.report = 60000,
n.burn = 10000,
n.thin = 50,
n.chains = 3)
summary(out.alltax.allsigcor.impdet.ms, level = 'both')
ppc.alltax.allsigcor.impdet.ms.out <- ppcOcc(out.alltax.allsigcor.impdet.ms, 'chi-squared', group = 1)
summary(ppc.alltax.allsigcor.impdet.ms.out, level = 'both')
waicOcc(out.alltax.allsigcor.impdet.ms)
write_rds(out.alltax.allsigcor.impdet.ms,"alltaxmodel_phwh.rds")
null <- ~1
# Number of species
N <- dim(phwhall_occobject$y)[1]
# Distances between sites
dist.phwh <- dist(phwhall_occobject$coords)
# Exponential covariance model
cov.model <- "exponential"
ms.inits <- list(alpha.comm = 0,
beta.comm = 0,
beta = 0,
alpha = 0,
tau.sq.beta = 1,
tau.sq.alpha = 1,
z = apply(phwhall_occobject$y, c(1, 2), max, na.rm = TRUE))
ms.priors <- list(beta.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
alpha.comm.normal = list(mean = 0, var = 2.72),
tau.sq.beta.ig = list(a = 0.1, b = 0.1),
tau.sq.alpha.ig = list(a = 0.1, b = 0.1))
out.null <- msPGOcc(occ.formula = null,
det.formula = null,
data = phwhall_occobject,
inits = ms.inits,
n.samples = 30000,
priors = ms.priors,
n.omp.threads = 4,
verbose = TRUE,
n.report = 60000,
n.burn = 10000,
n.thin = 50,
n.chains = 3)
summary(out.null, level = 'both')
ppc.out.null <- ppcOcc(out.null, 'chi-squared', group = 1)
summary(ppc.out.null, level = 'both')
waicOcc(out.null)
Will want to exclude species that did not fit as well.
out.alltax.allsigcor.impdet.ms<-readRDS("alltaxmodel_phwh.rds")
summary(out.alltax.allsigcor.impdet.ms,max.print=100000)
##
## Call:
## msPGOcc(occ.formula = phwhall_occobject_allsigcor.occ.formula, det.formula = phwhall_occobject_dayyearseason.det.formula, data = phwhall_occobject, inits = ms.inits, priors = ms.priors, n.samples = 30000, n.omp.threads = 4, verbose = TRUE, n.report = 60000, n.burn = 10000, n.thin = 50, n.chains = 3)
##
## Samples per Chain: 30000
## Burn-in: 10000
## Thinning Rate: 50
## Number of Chains: 3
## Total Posterior Samples: 1200
## Run Time (min): 52.2222
##
## ----------------------------------------
## Community Level
## ----------------------------------------
## Occurrence Means (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept) -2.8897 0.8106 -4.1358 -3.0216 -0.8177 1.3829 19
## scale(pool_depth_.cm.) -0.0189 0.1261 -0.2612 -0.0202 0.2446 1.0128 996
## scale(per_sand) 0.4350 0.0947 0.2540 0.4328 0.6232 1.0005 1264
## scale(per_cobble) 0.2455 0.0708 0.1068 0.2441 0.3797 1.0046 1200
## scale(substrate_metric_total) 0.3483 0.0759 0.1939 0.3484 0.4971 1.0016 1076
## scale(pool_metric_total) -0.0111 0.0659 -0.1415 -0.0112 0.1189 1.0040 1121
##
## Occurrence Variances (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept) 20.1277 6.2804 6.2490 19.9050 33.7245 1.2347 39
## scale(pool_depth_.cm.) 0.6635 0.1997 0.3567 0.6368 1.1398 1.0009 846
## scale(per_sand) 0.2564 0.0786 0.1299 0.2473 0.4325 1.0016 1200
## scale(per_cobble) 0.0880 0.0414 0.0304 0.0807 0.1884 1.0074 874
## scale(substrate_metric_total) 0.0931 0.0465 0.0323 0.0825 0.2054 1.0020 1088
## scale(pool_metric_total) 0.0986 0.0432 0.0357 0.0911 0.2026 1.0064 1261
##
## Detection Means (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept) -1.6660 0.6560 -3.5379 -1.5174 -0.8506 1.5221 15
## scale(seasons) -0.2099 0.0849 -0.3768 -0.2093 -0.0468 1.0000 1200
## scale(dayyear) 0.0430 0.0670 -0.0857 0.0408 0.1796 0.9997 1329
##
## Detection Variances (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept) 4.2489 2.8532 1.6422 3.4169 13.0521 1.8461 11
## scale(seasons) 0.3257 0.0801 0.1999 0.3122 0.5103 1.0039 1377
## scale(dayyear) 0.1949 0.0557 0.1075 0.1867 0.3228 1.0066 1200
##
## ----------------------------------------
## Species Level
## ----------------------------------------
## Occurrence (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept)-streambiotic_suff_mtdusky -1.6714 0.3158 -2.2931 -1.6676 -1.0738 1.0069 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_nodusky -0.2926 0.2490 -0.7606 -0.2946 0.2157 1.0019 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_twolined 1.3494 0.2331 0.9142 1.3450 1.8238 1.0085 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_longtail -2.7872 0.9864 -4.3067 -2.8829 -0.7278 1.0416 344
## (Intercept)-streambiotic_suff_red -2.1236 0.3988 -2.9360 -2.1125 -1.3427 1.0015 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_mole -2.8320 2.1500 -6.1460 -3.2241 2.8850 1.0121 87
## (Intercept)-streambiotic_suff_fourtoed -7.0579 3.5622 -14.7157 -6.9632 0.7699 1.1068 80
## (Intercept)-streambiotic_suff_redback 0.2688 0.2868 -0.2481 0.2551 0.8896 1.0116 1059
## (Intercept)-streambiotic_suff_slimy -2.6199 0.6411 -3.8349 -2.6258 -1.3496 1.0093 1200
## (Intercept)-blacknose_dace -1.2054 0.4735 -2.0231 -1.2426 -0.1994 1.0119 1200
## (Intercept)-bluegill_sunfish -3.7258 2.3377 -7.3622 -4.1296 2.0549 1.1298 79
## (Intercept)-bluntnose_minnow -6.8915 3.7733 -14.1115 -6.9540 2.4590 1.2352 70
## (Intercept)-brindled_madtom -7.0534 3.2793 -13.9572 -6.9878 0.3016 1.0210 111
## (Intercept)-brook_stickleback -7.1122 3.2834 -13.7670 -7.0479 0.1516 1.1848 123
## (Intercept)-brook_trout -7.1785 3.3522 -14.0238 -7.1069 -0.3317 1.1173 106
## (Intercept)-central_mudminnow -7.4677 3.1885 -14.4570 -7.2760 -1.3172 1.0883 88
## (Intercept)-central_stoneroller_minnow 0.2610 2.6950 -3.6953 -0.0168 6.3101 1.0429 153
## (Intercept)-common_shiner -3.7405 2.3847 -7.5003 -4.0724 2.3740 1.0714 145
## (Intercept)-creek_chub 0.2249 0.4715 -0.5601 0.1843 1.2506 1.0145 1200
## (Intercept)-eastern_sand_darter -7.1371 3.3839 -14.2057 -6.8568 -0.4857 1.1854 113
## (Intercept)-fantail_darter -7.3309 3.4109 -13.6478 -7.3197 0.2814 1.0633 74
## (Intercept)-fathead_minnow -7.0752 3.7493 -14.4893 -7.0690 1.8171 1.0938 78
## (Intercept)-golden_shiner -7.0745 3.4416 -14.1829 -7.0144 0.0641 1.1160 145
## (Intercept)-goldfish -6.7943 3.3873 -13.6019 -6.7761 0.4492 1.1215 93
## (Intercept)-grass_pickerel -7.0637 3.4071 -14.2590 -6.9380 -0.0003 1.0807 82
## (Intercept)-greenside_darter -7.0977 3.4632 -14.1352 -6.9934 0.4010 1.1293 112
## (Intercept)-green_sunfish -0.8145 2.8525 -5.0552 -1.3766 6.3994 1.0220 107
## (Intercept)-johnny_darter -1.1372 2.5547 -4.2377 -1.8215 5.8808 1.1016 89
## (Intercept)-largemouth_bass -7.0980 3.2337 -13.4376 -6.8887 -0.2490 1.0630 110
## (Intercept)-longear_sunfish -7.4140 3.2980 -14.9066 -7.0032 -1.7382 1.1130 144
## (Intercept)-longnose_dace -6.8785 3.2587 -13.3308 -6.8346 -0.2809 1.0859 127
## (Intercept)-mottled_sculpin -7.2003 3.2037 -14.1498 -6.9098 -0.5250 1.1300 111
## (Intercept)-northern_hog_sucker -6.8674 3.3454 -14.1051 -6.5850 -0.0535 1.0572 178
## (Intercept)-pumpkinseed_sunfish -7.1124 3.4247 -14.5798 -6.8443 -0.5439 1.1252 141
## (Intercept)-rainbow_darter -2.8952 1.3061 -4.8557 -3.1010 0.1429 1.0408 150
## (Intercept)-rainbow_trout -6.9916 3.3899 -14.2202 -6.8555 0.2404 1.0369 104
## (Intercept)-redbelly_dace -2.4819 2.2035 -5.7180 -2.9002 3.0511 1.0440 182
## (Intercept)-redside_dace -3.3292 2.4776 -7.2167 -3.7049 2.7117 1.0906 83
## (Intercept)-river_chub -6.8888 3.4570 -13.7146 -7.0238 1.8403 1.2002 85
## (Intercept)-silverjaw_minnow -7.4363 3.4387 -15.0933 -7.0283 -1.3192 1.1063 254
## (Intercept)-smallmouth_bass -7.1866 3.0710 -13.7327 -7.0961 -1.0083 1.1085 193
## (Intercept)-spotfin_shiner -7.0542 3.2570 -14.2424 -6.8545 -0.4446 1.1031 178
## (Intercept)-stonecat_madtom -7.2054 3.1927 -13.8734 -7.1343 -0.8378 1.1105 117
## (Intercept)-striped_shiner -7.1079 3.3263 -13.8537 -7.1191 0.0730 1.0957 77
## (Intercept)-trout_perch -7.0610 3.1221 -14.3304 -6.7461 -1.2735 1.0290 122
## (Intercept)-warmouth_sunfish -6.8193 3.3254 -13.0212 -6.8420 0.2631 1.0828 67
## (Intercept)-white_sucker -1.6229 2.0338 -4.3526 -2.0695 3.8386 1.0967 144
## (Intercept)-yellow_bullhead_catfish -3.4573 2.7157 -7.4249 -4.0641 3.5879 1.0420 82
## (Intercept)-sessile_animals -1.6096 2.0533 -4.3211 -2.1043 3.5089 1.0108 167
## (Intercept)-aquatic_worms 3.1021 0.6406 2.1854 3.0119 4.5790 1.0284 1003
## (Intercept)-sow_bugs -0.8697 0.2401 -1.3433 -0.8673 -0.4078 1.0136 1115
## (Intercept)-scuds -0.2922 0.2437 -0.7547 -0.3094 0.2216 1.0026 1200
## (Intercept)-water_mites 0.8918 0.6268 -0.0568 0.7870 2.3533 1.0032 1456
## (Intercept)-damselfly_nymphs 1.2825 0.4296 0.5423 1.2496 2.1956 1.0138 1200
## (Intercept)-alderfly_larvae 0.9982 0.5220 0.2616 0.9258 2.1611 1.0072 1200
## (Intercept)-other_beetles 2.3960 0.5824 1.5310 2.3072 3.7063 1.0123 1200
## (Intercept)-crayfish 1.7067 0.3134 1.1683 1.6755 2.3998 0.9998 1200
## (Intercept)-dragonfly_nymphs 2.1909 0.5235 1.3590 2.1165 3.3958 1.0131 1090
## (Intercept)-riffle_beetles 0.8138 0.3060 0.2840 0.7827 1.5518 1.0094 983
## (Intercept)-other_flies 5.3742 1.3067 3.5999 5.1581 8.4109 1.0189 335
## (Intercept)-midges 7.0682 1.8530 4.4088 6.7589 11.5066 1.0097 532
## (Intercept)-snails 2.2443 0.5670 1.3429 2.1747 3.4480 1.0238 884
## (Intercept)-clams 1.0285 1.2947 -0.2492 0.6834 4.8916 1.0049 387
## (Intercept)-fishfly_larvae 0.2736 0.3555 -0.3510 0.2447 1.0270 1.0014 1200
## (Intercept)-water_penny_beetles -0.3778 0.3146 -0.9740 -0.3852 0.2687 1.0134 1200
## (Intercept)-cranefly_larvae 3.5094 0.6563 2.4088 3.4274 4.9850 1.0090 1200
## (Intercept)-ameletidae 2.2774 1.2939 0.8079 1.9868 5.7393 1.0365 269
## (Intercept)-arthropleidae -6.9640 3.5273 -13.8095 -7.1280 1.2260 1.0377 79
## (Intercept)-baetidae 2.4801 0.4639 1.7742 2.4257 3.4994 1.0016 1200
## (Intercept)-baetiscidae -7.3073 3.3593 -14.5140 -7.0662 -0.9920 1.0949 197
## (Intercept)-caenidae -1.9179 0.4897 -2.8016 -1.9432 -0.9140 1.0055 1083
## (Intercept)-ephemerellidae 0.3600 2.6123 -3.2720 -0.0905 6.7463 1.0277 125
## (Intercept)-ephemeridae -0.9252 3.0957 -4.4288 -1.6916 7.7726 1.1372 96
## (Intercept)-heptageniidae -0.4805 0.3024 -1.0301 -0.4907 0.1644 1.0041 1200
## (Intercept)-isonychiidae -6.8291 3.4875 -13.2607 -6.9023 1.7498 1.0942 91
## (Intercept)-leptohyphidae 0.7116 2.4152 -2.1556 0.0602 6.7710 1.0148 175
## (Intercept)-leptophlebiidae -0.4340 0.2062 -0.8396 -0.4433 -0.0128 1.0010 1200
## (Intercept)-polymitarcyidae -7.0008 3.4940 -14.2122 -6.9362 1.1252 1.0595 135
## (Intercept)-potamanthidae -6.7182 3.5802 -14.0777 -6.6941 1.2172 1.0667 105
## (Intercept)-pseudironidae -7.2023 3.4675 -14.7931 -6.9349 -0.3905 1.2009 121
## (Intercept)-siphlonuridae -7.3228 3.2561 -13.7737 -7.0589 -0.8043 1.0723 81
## (Intercept)-capniidae -7.1588 3.3482 -14.1327 -7.2355 -0.5028 1.0430 111
## (Intercept)-chloroperlidae -0.8242 0.7049 -1.8431 -0.9236 0.8767 1.0383 784
## (Intercept)-leuctridae 0.0479 0.1864 -0.2760 0.0407 0.4252 1.0040 1200
## (Intercept)-nemouridae 0.2620 0.4565 -0.4265 0.2004 1.2542 1.0170 1281
## (Intercept)-peltoperlidae -6.8993 3.6425 -14.4221 -6.7738 0.4331 1.0945 155
## (Intercept)-perlidae -0.5157 0.2394 -0.9731 -0.5195 -0.0517 1.0021 1489
## (Intercept)-perlodidae 2.6890 2.3437 -0.3275 2.1992 8.1902 1.1052 259
## (Intercept)-pteronarcyidae -7.4993 3.2902 -15.0314 -7.1267 -1.1286 1.0375 232
## (Intercept)-taeniopterygidae -7.4550 3.0921 -13.7788 -7.3171 -1.5923 1.0829 163
## (Intercept)-brachycentridae -7.1579 3.0476 -13.6339 -7.0785 -0.9852 1.1407 102
## (Intercept)-dipseuodopsidae -7.0052 3.2048 -13.8019 -6.8476 -0.6929 1.0892 75
## (Intercept)-glossosomatidae -4.5174 0.9038 -6.4746 -4.4723 -2.9239 1.0120 1067
## (Intercept)-goeridae -7.1288 3.1598 -14.4513 -6.8562 -0.8039 1.1530 130
## (Intercept)-helicopsychidae -7.0960 3.3249 -14.0048 -6.9356 0.0352 1.0802 64
## (Intercept)-hydropsychidae 1.6188 0.2750 1.1073 1.6129 2.2024 1.0114 1200
## (Intercept)-hydroptilidae -1.1451 0.6431 -2.1779 -1.2053 0.3192 0.9996 888
## (Intercept)-lepidostomatidae -1.5017 0.2951 -2.1085 -1.4880 -0.9440 1.0006 1200
## (Intercept)-leptoceridae -7.3243 3.5354 -15.4596 -7.0670 -1.1162 1.1471 114
## (Intercept)-limnephilidae -0.4135 0.2696 -0.9207 -0.4217 0.1196 1.0106 1094
## (Intercept)-molannidae -3.7488 0.9263 -5.5739 -3.7192 -1.8769 1.0167 878
## (Intercept)-odontoceridae -3.0429 1.0115 -4.8007 -3.1240 -0.8342 1.0059 739
## (Intercept)-philopotamidae 0.6268 0.3545 0.0010 0.6167 1.3451 1.0047 1319
## (Intercept)-phryganeidae -1.2262 1.4137 -2.9907 -1.5792 2.7230 1.1993 217
## (Intercept)-polycentropodidae 0.1839 0.3187 -0.3635 0.1608 0.8722 1.0005 1345
## (Intercept)-psychomiidae -7.0248 3.5038 -13.3155 -7.0853 1.5167 1.1337 76
## (Intercept)-rhyacophilidae -1.1545 0.3760 -1.8427 -1.1751 -0.3484 1.0020 1257
## (Intercept)-uenoidae 0.3959 0.5554 -0.4218 0.3158 1.7402 1.0068 936
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## scale(pool_depth_.cm.)-largemouth_bass -0.0300 0.7910 -1.5812 -0.0329 1.5342 1.0052 1200
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## scale(pool_depth_.cm.)-northern_hog_sucker -0.0127 0.7867 -1.6250 0.0253 1.4802 1.0018 1008
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## scale(pool_depth_.cm.)-redside_dace -0.2126 0.7060 -1.6647 -0.2060 1.1618 1.0062 1099
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## scale(pool_depth_.cm.)-silverjaw_minnow -0.0356 0.8094 -1.6096 -0.0248 1.5726 1.0039 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-smallmouth_bass 0.0119 0.7873 -1.5953 0.0186 1.5768 1.0031 1414
## scale(pool_depth_.cm.)-spotfin_shiner 0.0239 0.7455 -1.3624 0.0188 1.5160 1.0024 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-stonecat_madtom -0.0216 0.7837 -1.5568 -0.0101 1.5292 1.0052 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-striped_shiner -0.0399 0.7729 -1.5243 -0.0367 1.5115 1.0008 1078
## scale(pool_depth_.cm.)-trout_perch -0.0278 0.7578 -1.4970 -0.0269 1.4849 1.0027 1663
## scale(pool_depth_.cm.)-warmouth_sunfish -0.0519 0.7558 -1.6268 -0.0662 1.3638 1.0097 1033
## scale(pool_depth_.cm.)-white_sucker 0.6162 0.6370 -0.6688 0.5890 1.8982 1.0058 1059
## scale(pool_depth_.cm.)-yellow_bullhead_catfish 0.0253 0.7096 -1.4565 0.0496 1.3573 1.0042 1200
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## scale(pool_depth_.cm.)-sow_bugs 0.7583 0.2480 0.2959 0.7456 1.2735 1.0006 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-scuds 0.1082 0.2236 -0.3420 0.0993 0.5576 1.0075 1327
## scale(pool_depth_.cm.)-water_mites 0.3881 0.3893 -0.3068 0.3471 1.2303 1.0022 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-damselfly_nymphs 1.8763 0.5027 1.0259 1.8276 2.9761 1.0142 1089
## scale(pool_depth_.cm.)-alderfly_larvae 0.0138 0.3669 -0.6618 -0.0023 0.8137 1.0031 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-other_beetles -0.4390 0.4387 -1.2307 -0.4436 0.4510 1.0049 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-crayfish -0.7319 0.2800 -1.3096 -0.7266 -0.2157 1.0027 1260
## scale(pool_depth_.cm.)-dragonfly_nymphs 0.5327 0.4620 -0.2877 0.4973 1.5345 1.0090 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-riffle_beetles 0.6434 0.3300 0.1102 0.6021 1.3725 1.0012 1200
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## scale(pool_depth_.cm.)-clams 0.2600 0.5150 -0.7002 0.2306 1.4267 1.0055 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-fishfly_larvae -0.8439 0.2902 -1.4699 -0.8277 -0.3167 1.0035 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-water_penny_beetles -0.4621 0.2786 -1.0124 -0.4561 0.0523 1.0020 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-cranefly_larvae 0.5872 0.5421 -0.3626 0.5409 1.7337 0.9994 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-ameletidae 1.0107 0.6725 -0.3677 0.9859 2.3581 1.0013 862
## scale(pool_depth_.cm.)-arthropleidae -0.0337 0.7990 -1.6697 -0.0473 1.4618 1.0025 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-baetidae 0.3418 0.4131 -0.3347 0.2815 1.3211 1.0016 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-baetiscidae -0.0522 0.7918 -1.5842 -0.0761 1.5067 0.9999 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-caenidae 0.5639 0.3012 -0.0242 0.5677 1.1699 1.0028 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-ephemerellidae 0.0922 0.7083 -1.2929 0.0837 1.5920 1.0257 896
## scale(pool_depth_.cm.)-ephemeridae 0.3737 0.7191 -1.0703 0.3908 1.7517 1.0599 437
## scale(pool_depth_.cm.)-heptageniidae 0.1435 0.2627 -0.3434 0.1349 0.7013 1.0072 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-isonychiidae -0.0171 0.7990 -1.4913 -0.0128 1.5263 1.0148 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-leptohyphidae 0.2254 0.6375 -1.0456 0.2255 1.5010 1.0010 961
## scale(pool_depth_.cm.)-leptophlebiidae -0.6252 0.2246 -1.0706 -0.6316 -0.1991 1.0000 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-polymitarcyidae -0.0425 0.7530 -1.6391 -0.0277 1.3684 0.9996 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-potamanthidae -0.0035 0.7371 -1.4756 0.0067 1.3912 1.0077 1019
## scale(pool_depth_.cm.)-pseudironidae -0.0533 0.7666 -1.5151 -0.0846 1.4163 1.0036 1588
## scale(pool_depth_.cm.)-siphlonuridae -0.0267 0.7894 -1.6992 -0.0062 1.5015 1.0188 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-capniidae -0.0111 0.8059 -1.6136 -0.0286 1.6281 1.0008 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-chloroperlidae 0.0537 0.3691 -0.6651 0.0521 0.7682 1.0088 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-leuctridae -0.4966 0.1975 -0.8866 -0.4872 -0.1428 1.0049 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-nemouridae -0.3199 0.2910 -0.8798 -0.3130 0.2642 1.0083 1413
## scale(pool_depth_.cm.)-peltoperlidae -0.0431 0.7812 -1.5270 -0.0546 1.4684 1.0019 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-perlidae -0.1929 0.2341 -0.6473 -0.1832 0.2510 1.0052 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-perlodidae -0.0858 0.7054 -1.4198 -0.1060 1.3162 1.0073 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-pteronarcyidae 0.0240 0.8037 -1.6344 0.0330 1.5746 1.0000 1141
## scale(pool_depth_.cm.)-taeniopterygidae -0.0250 0.7846 -1.5473 -0.0326 1.5411 1.0029 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-brachycentridae -0.0164 0.7713 -1.4592 -0.0315 1.5209 1.0018 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-dipseuodopsidae -0.0214 0.7743 -1.5572 -0.0097 1.4623 1.0083 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-glossosomatidae -0.6362 0.6297 -1.8978 -0.6173 0.5193 1.0033 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-goeridae -0.0209 0.7837 -1.5303 -0.0215 1.5492 1.0031 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-helicopsychidae -0.0834 0.7991 -1.6098 -0.0707 1.4864 0.9991 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-hydropsychidae -0.1457 0.2545 -0.6179 -0.1557 0.3428 1.0010 1330
## scale(pool_depth_.cm.)-hydroptilidae 0.5170 0.4096 -0.2662 0.4934 1.3736 0.9999 1048
## scale(pool_depth_.cm.)-lepidostomatidae -1.2124 0.3276 -1.8826 -1.2014 -0.6162 1.0022 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-leptoceridae -0.0574 0.7597 -1.5809 -0.0336 1.4168 1.0045 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-limnephilidae -0.3823 0.2455 -0.8713 -0.3832 0.1195 1.0007 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-molannidae -0.8066 0.5620 -1.9310 -0.7845 0.2203 1.0068 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-odontoceridae -1.0337 0.5910 -2.2649 -1.0067 0.0531 1.0009 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-philopotamidae -0.2216 0.2847 -0.7565 -0.2316 0.3767 1.0077 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-phryganeidae 0.5172 0.5112 -0.5364 0.5075 1.5256 1.0056 1206
## scale(pool_depth_.cm.)-polycentropodidae -0.2271 0.2569 -0.7201 -0.2275 0.3022 1.0063 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-psychomiidae -0.0645 0.8020 -1.6344 -0.0888 1.4950 1.0040 1095
## scale(pool_depth_.cm.)-rhyacophilidae -0.9063 0.3370 -1.5664 -0.9061 -0.2724 1.0123 1200
## scale(pool_depth_.cm.)-uenoidae -0.2066 0.3342 -0.8491 -0.2077 0.4331 1.0007 871
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## scale(per_sand)-streambiotic_suff_twolined 0.5868 0.2488 0.0971 0.5730 1.0860 1.0005 1200
## scale(per_sand)-streambiotic_suff_longtail 0.9938 0.3939 0.2583 0.9768 1.8217 1.0217 1200
## scale(per_sand)-streambiotic_suff_red 0.7818 0.3008 0.1956 0.7856 1.3931 1.0005 1200
## scale(per_sand)-streambiotic_suff_mole 0.5087 0.4496 -0.3977 0.5194 1.3751 1.0108 1200
## scale(per_sand)-streambiotic_suff_fourtoed 0.4138 0.5095 -0.5593 0.4133 1.4531 1.0008 1200
## scale(per_sand)-streambiotic_suff_redback 0.5509 0.2737 0.0488 0.5419 1.1473 1.0073 1200
## scale(per_sand)-streambiotic_suff_slimy 0.1019 0.3420 -0.5723 0.1071 0.7768 1.0026 1200
## scale(per_sand)-blacknose_dace 0.3719 0.3024 -0.2042 0.3691 0.9868 1.0048 1200
## scale(per_sand)-bluegill_sunfish 0.5103 0.4407 -0.3121 0.5010 1.4121 1.0033 1200
## scale(per_sand)-bluntnose_minnow 0.4056 0.4889 -0.5598 0.4052 1.3846 1.0034 1200
## scale(per_sand)-brindled_madtom 0.4121 0.4742 -0.5609 0.3938 1.3215 1.0053 1200
## scale(per_sand)-brook_stickleback 0.4091 0.5302 -0.6263 0.4269 1.3875 1.0053 1200
## scale(per_sand)-brook_trout 0.4423 0.5107 -0.5479 0.4420 1.4578 1.0021 1200
## scale(per_sand)-central_mudminnow 0.4218 0.5052 -0.5463 0.4132 1.4233 1.0197 1200
## scale(per_sand)-central_stoneroller_minnow 0.4118 0.4946 -0.5461 0.4049 1.3742 1.0018 1200
## scale(per_sand)-common_shiner 0.4871 0.4561 -0.4321 0.4938 1.3878 1.0074 1200
## scale(per_sand)-creek_chub 0.7388 0.3414 0.1218 0.7326 1.4541 0.9997 1200
## scale(per_sand)-eastern_sand_darter 0.4177 0.5066 -0.5574 0.4104 1.4417 1.0008 1200
## scale(per_sand)-fantail_darter 0.4235 0.5119 -0.6170 0.4133 1.4359 1.0045 1357
## scale(per_sand)-fathead_minnow 0.4188 0.5067 -0.6065 0.4230 1.3993 1.0011 1200
## scale(per_sand)-golden_shiner 0.4203 0.4975 -0.6039 0.4157 1.3731 1.0046 1302
## scale(per_sand)-goldfish 0.4414 0.4965 -0.5363 0.4422 1.4019 1.0027 1200
## scale(per_sand)-grass_pickerel 0.4418 0.4972 -0.5322 0.4638 1.4439 1.0071 1200
## scale(per_sand)-greenside_darter 0.4264 0.5048 -0.6079 0.4329 1.3943 1.0072 1200
## scale(per_sand)-green_sunfish 0.3924 0.4901 -0.5676 0.3997 1.3603 1.0062 1311
## scale(per_sand)-johnny_darter 0.5846 0.4425 -0.2272 0.5649 1.5239 1.0143 1166
## scale(per_sand)-largemouth_bass 0.4627 0.4960 -0.4644 0.4616 1.4421 1.0219 1200
## scale(per_sand)-longear_sunfish 0.4246 0.5035 -0.5009 0.4068 1.4500 1.0023 1216
## scale(per_sand)-longnose_dace 0.4317 0.5127 -0.5618 0.4617 1.4691 1.0093 1304
## scale(per_sand)-mottled_sculpin 0.4090 0.4818 -0.5461 0.4093 1.3157 1.0084 1200
## scale(per_sand)-northern_hog_sucker 0.4336 0.4756 -0.5308 0.4515 1.3549 1.0178 1200
## scale(per_sand)-pumpkinseed_sunfish 0.4175 0.5218 -0.6736 0.4465 1.4078 1.0029 1200
## scale(per_sand)-rainbow_darter 0.4073 0.4190 -0.3999 0.3965 1.2279 1.0009 1044
## scale(per_sand)-rainbow_trout 0.4146 0.4805 -0.6306 0.4292 1.3565 0.9997 1200
## scale(per_sand)-redbelly_dace 0.5144 0.4707 -0.3727 0.5069 1.5209 1.0004 1200
## scale(per_sand)-redside_dace 0.3104 0.4836 -0.6842 0.3253 1.2207 1.0038 1200
## scale(per_sand)-river_chub 0.4473 0.4831 -0.5082 0.4403 1.4010 1.0101 1359
## scale(per_sand)-silverjaw_minnow 0.4407 0.4963 -0.5138 0.4542 1.3854 1.0050 1200
## scale(per_sand)-smallmouth_bass 0.4376 0.5023 -0.5903 0.4490 1.3787 1.0005 1200
## scale(per_sand)-spotfin_shiner 0.4242 0.5009 -0.5736 0.4362 1.3842 1.0009 1200
## scale(per_sand)-stonecat_madtom 0.4334 0.4988 -0.5590 0.4225 1.4102 1.0111 1200
## scale(per_sand)-striped_shiner 0.4016 0.5002 -0.5712 0.4039 1.3859 1.0024 1200
## scale(per_sand)-trout_perch 0.4289 0.4835 -0.5544 0.4447 1.3575 1.0055 1076
## scale(per_sand)-warmouth_sunfish 0.4432 0.5062 -0.5711 0.4310 1.4665 1.0029 1338
## scale(per_sand)-white_sucker 0.5151 0.4279 -0.3694 0.5150 1.3285 1.0015 1200
## scale(per_sand)-yellow_bullhead_catfish 0.4388 0.4785 -0.5441 0.4452 1.3723 1.0054 1200
## scale(per_sand)-sessile_animals 0.1126 0.4469 -0.7989 0.1296 0.9526 1.0073 924
## scale(per_sand)-aquatic_worms -0.2854 0.3430 -0.9421 -0.2814 0.4034 1.0033 998
## scale(per_sand)-sow_bugs -0.3152 0.2827 -0.8839 -0.3137 0.2049 1.0005 1200
## scale(per_sand)-scuds -0.2759 0.2477 -0.7776 -0.2738 0.1976 1.0006 1200
## scale(per_sand)-water_mites 0.0189 0.3487 -0.7002 0.0308 0.6561 1.0157 1200
## scale(per_sand)-damselfly_nymphs 0.2651 0.2644 -0.2546 0.2606 0.7813 0.9996 1200
## scale(per_sand)-alderfly_larvae 0.3270 0.3188 -0.2681 0.3158 0.9929 1.0062 1200
## scale(per_sand)-other_beetles 0.8350 0.3689 0.1277 0.8363 1.5474 1.0032 1200
## scale(per_sand)-crayfish 0.5849 0.2884 0.0297 0.5758 1.1720 1.0018 1200
## scale(per_sand)-dragonfly_nymphs 0.6911 0.3229 0.1012 0.6775 1.3297 1.0079 1200
## scale(per_sand)-riffle_beetles 0.1993 0.2258 -0.2208 0.2007 0.6714 1.0171 1590
## scale(per_sand)-other_flies 0.4657 0.4521 -0.4179 0.4675 1.3712 1.0127 1200
## scale(per_sand)-midges 0.4480 0.4793 -0.5386 0.4581 1.3782 0.9995 1200
## scale(per_sand)-snails -0.3513 0.2871 -0.8953 -0.3510 0.2124 1.0001 1200
## scale(per_sand)-clams 0.3670 0.3779 -0.2849 0.3340 1.1881 1.0019 1200
## scale(per_sand)-fishfly_larvae 0.7447 0.2813 0.2188 0.7299 1.3135 1.0181 948
## scale(per_sand)-water_penny_beetles 0.1369 0.2805 -0.3955 0.1333 0.6889 1.0036 1200
## scale(per_sand)-cranefly_larvae 0.6893 0.3877 -0.0208 0.6868 1.4820 1.0003 1200
## scale(per_sand)-ameletidae 0.4053 0.3774 -0.3040 0.3997 1.1487 1.0075 1085
## scale(per_sand)-arthropleidae 0.4310 0.5072 -0.5733 0.4496 1.3745 1.0012 1200
## scale(per_sand)-baetidae 0.5222 0.3050 -0.0630 0.5167 1.1164 1.0101 1183
## scale(per_sand)-baetiscidae 0.4230 0.5045 -0.5693 0.4307 1.4127 1.0013 1200
## scale(per_sand)-caenidae 0.0729 0.3314 -0.5926 0.0685 0.7094 1.0101 1200
## scale(per_sand)-ephemerellidae 0.4391 0.4521 -0.3905 0.4285 1.3547 1.0001 1200
## scale(per_sand)-ephemeridae 0.3995 0.4648 -0.5196 0.3912 1.3470 1.0002 1200
## scale(per_sand)-heptageniidae 0.9981 0.2805 0.4550 0.9916 1.5394 1.0002 1200
## scale(per_sand)-isonychiidae 0.4259 0.5026 -0.5308 0.4288 1.4295 0.9998 1200
## scale(per_sand)-leptohyphidae 0.4154 0.4248 -0.3878 0.3990 1.3066 1.0010 1200
## scale(per_sand)-leptophlebiidae 0.8374 0.2356 0.3617 0.8329 1.3023 1.0073 1200
## scale(per_sand)-polymitarcyidae 0.4209 0.4927 -0.6083 0.4220 1.3947 1.0059 1200
## scale(per_sand)-potamanthidae 0.4117 0.5066 -0.5564 0.4154 1.4584 1.0013 1314
## scale(per_sand)-pseudironidae 0.4339 0.4975 -0.5414 0.4337 1.3759 1.0148 1200
## scale(per_sand)-siphlonuridae 0.4443 0.4878 -0.5034 0.4442 1.4051 1.0031 1200
## scale(per_sand)-capniidae 0.4126 0.5041 -0.5611 0.4120 1.3949 1.0073 1200
## scale(per_sand)-chloroperlidae 0.2650 0.3370 -0.4347 0.2569 0.9450 1.0112 1200
## scale(per_sand)-leuctridae 0.7323 0.2349 0.2971 0.7245 1.2031 1.0011 1200
## scale(per_sand)-nemouridae 0.8881 0.2944 0.3437 0.8754 1.5044 1.0021 1200
## scale(per_sand)-peltoperlidae 0.3803 0.4894 -0.6111 0.4016 1.3324 1.0057 1200
## scale(per_sand)-perlidae 0.8623 0.2716 0.3528 0.8611 1.4229 1.0043 1200
## scale(per_sand)-perlodidae 0.5867 0.4992 -0.3924 0.5914 1.5774 1.0030 952
## scale(per_sand)-pteronarcyidae 0.4276 0.5048 -0.5926 0.4236 1.3668 1.0071 1208
## scale(per_sand)-taeniopterygidae 0.4142 0.5015 -0.5777 0.4203 1.4237 1.0106 1200
## scale(per_sand)-brachycentridae 0.4226 0.4889 -0.5346 0.4331 1.4079 1.0214 1093
## scale(per_sand)-dipseuodopsidae 0.4190 0.5076 -0.5717 0.4296 1.3842 1.0012 1200
## scale(per_sand)-glossosomatidae 0.4833 0.3996 -0.3489 0.4973 1.2490 1.0059 1048
## scale(per_sand)-goeridae 0.4096 0.4949 -0.5589 0.4134 1.3566 1.0016 1200
## scale(per_sand)-helicopsychidae 0.4216 0.5058 -0.6244 0.4176 1.4687 1.0031 1200
## scale(per_sand)-hydropsychidae 0.5641 0.2746 0.0347 0.5500 1.1281 1.0025 1200
## scale(per_sand)-hydroptilidae -0.1727 0.3647 -0.9170 -0.1516 0.4719 0.9996 1200
## scale(per_sand)-lepidostomatidae 0.9913 0.2931 0.4282 0.9753 1.5907 1.0035 1200
## scale(per_sand)-leptoceridae 0.4135 0.5021 -0.6246 0.4374 1.3967 1.0031 1200
## scale(per_sand)-limnephilidae 1.3057 0.2943 0.7482 1.3006 1.8938 1.0042 1253
## scale(per_sand)-molannidae 1.0807 0.4147 0.3414 1.0634 1.9436 1.0010 1174
## scale(per_sand)-odontoceridae 0.6791 0.4039 -0.1066 0.6956 1.4446 1.0077 1005
## scale(per_sand)-philopotamidae 0.1392 0.2872 -0.4093 0.1399 0.7082 1.0032 1200
## scale(per_sand)-phryganeidae 0.6082 0.3787 -0.0924 0.5865 1.3492 1.0100 1200
## scale(per_sand)-polycentropodidae -0.0773 0.2572 -0.5720 -0.0763 0.4061 1.0093 1200
## scale(per_sand)-psychomiidae 0.4480 0.4959 -0.5192 0.4550 1.4066 1.0073 1200
## scale(per_sand)-rhyacophilidae 0.5940 0.2963 0.0334 0.5988 1.1805 1.0053 1200
## scale(per_sand)-uenoidae 0.6041 0.3371 -0.0312 0.5862 1.3118 0.9998 1200
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_mtdusky 0.2062 0.1964 -0.1551 0.2026 0.6083 0.9992 1200
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_nodusky 0.2514 0.2027 -0.1441 0.2465 0.6383 1.0040 1451
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_twolined 0.6377 0.2262 0.2251 0.6300 1.1214 1.0011 1200
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_longtail 0.2641 0.2777 -0.2735 0.2625 0.8261 1.0023 1082
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_red 0.3887 0.2321 -0.0409 0.3738 0.8462 0.9989 1200
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_mole 0.0957 0.3008 -0.5503 0.1106 0.6574 1.0031 1200
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_fourtoed 0.2508 0.3004 -0.3601 0.2520 0.8629 1.0021 1277
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_redback 0.0967 0.2092 -0.3371 0.1025 0.5098 1.0029 1200
## scale(per_cobble)-streambiotic_suff_slimy 0.2399 0.2536 -0.2735 0.2363 0.7532 1.0014 1200
## scale(per_cobble)-blacknose_dace 0.4232 0.2335 -0.0041 0.4171 0.9034 0.9996 1339
## scale(per_cobble)-bluegill_sunfish 0.2216 0.3036 -0.3827 0.2223 0.7852 1.0077 1200
## scale(per_cobble)-bluntnose_minnow 0.2517 0.2970 -0.3294 0.2604 0.8374 1.0063 1200
## scale(per_cobble)-brindled_madtom 0.2420 0.3007 -0.3762 0.2377 0.8490 1.0079 1097
## scale(per_cobble)-brook_stickleback 0.2401 0.3031 -0.3625 0.2326 0.8237 1.0130 1200
## scale(per_cobble)-brook_trout 0.2556 0.3060 -0.3358 0.2564 0.8287 1.0109 1200
## scale(per_cobble)-central_mudminnow 0.2352 0.2874 -0.3504 0.2293 0.8335 1.0026 1200
## scale(per_cobble)-central_stoneroller_minnow 0.1895 0.3071 -0.4393 0.1957 0.8073 1.0191 1200
## scale(per_cobble)-common_shiner 0.2403 0.3052 -0.3550 0.2474 0.8368 1.0040 1200
## scale(per_cobble)-creek_chub 0.1453 0.2286 -0.3235 0.1420 0.5688 1.0007 1200
## scale(per_cobble)-eastern_sand_darter 0.2360 0.3060 -0.3821 0.2480 0.8214 1.0081 1118
## scale(per_cobble)-fantail_darter 0.2482 0.2963 -0.3202 0.2511 0.8432 1.0029 1200
## scale(per_cobble)-fathead_minnow 0.2468 0.2954 -0.3387 0.2486 0.8532 1.0105 1200
## scale(per_cobble)-golden_shiner 0.2425 0.3010 -0.3579 0.2424 0.8288 0.9993 1200
## scale(per_cobble)-goldfish 0.2400 0.3036 -0.3910 0.2461 0.8446 1.0025 1200
## scale(per_cobble)-grass_pickerel 0.2462 0.2981 -0.3397 0.2458 0.8531 1.0041 1461
## scale(per_cobble)-greenside_darter 0.2454 0.2955 -0.3229 0.2449 0.8210 1.0109 1200
## scale(per_cobble)-green_sunfish 0.2223 0.2927 -0.3589 0.2216 0.8064 1.0013 1200
## scale(per_cobble)-johnny_darter 0.2600 0.2796 -0.3064 0.2643 0.8059 0.9999 1380
## scale(per_cobble)-largemouth_bass 0.2518 0.3057 -0.3530 0.2563 0.8448 1.0021 1050
## scale(per_cobble)-longear_sunfish 0.2464 0.2930 -0.3206 0.2473 0.8288 1.0069 1200
## scale(per_cobble)-longnose_dace 0.2380 0.2978 -0.3553 0.2252 0.8367 1.0038 1409
## scale(per_cobble)-mottled_sculpin 0.2407 0.2979 -0.3862 0.2444 0.8245 1.0123 1200
## scale(per_cobble)-northern_hog_sucker 0.2519 0.2940 -0.3489 0.2554 0.8149 1.0113 1200
## scale(per_cobble)-pumpkinseed_sunfish 0.2425 0.3074 -0.3742 0.2473 0.8135 0.9997 773
## scale(per_cobble)-rainbow_darter 0.3798 0.2697 -0.1299 0.3749 0.9059 1.0026 1200
## scale(per_cobble)-rainbow_trout 0.2469 0.3012 -0.3654 0.2474 0.8462 1.0013 1200
## scale(per_cobble)-redbelly_dace 0.2422 0.2784 -0.2978 0.2404 0.8065 1.0100 1037
## scale(per_cobble)-redside_dace 0.3638 0.3082 -0.1716 0.3554 0.9912 1.0013 839
## scale(per_cobble)-river_chub 0.2558 0.2950 -0.3058 0.2578 0.8440 1.0052 1200
## scale(per_cobble)-silverjaw_minnow 0.2367 0.3040 -0.3931 0.2421 0.8100 1.0033 1200
## scale(per_cobble)-smallmouth_bass 0.2488 0.3062 -0.3325 0.2466 0.8879 1.0120 1200
## scale(per_cobble)-spotfin_shiner 0.2491 0.2947 -0.3586 0.2578 0.8247 0.9998 1200
## scale(per_cobble)-stonecat_madtom 0.2500 0.2930 -0.3655 0.2457 0.8602 1.0028 1469
## scale(per_cobble)-striped_shiner 0.2480 0.2993 -0.3642 0.2443 0.8392 1.0093 1200
## scale(per_cobble)-trout_perch 0.2548 0.2905 -0.3178 0.2554 0.8109 1.0013 1591
## scale(per_cobble)-warmouth_sunfish 0.2443 0.2990 -0.3714 0.2579 0.8188 1.0232 1200
## scale(per_cobble)-white_sucker 0.3275 0.2696 -0.1769 0.3265 0.8786 1.0138 978
## scale(per_cobble)-yellow_bullhead_catfish 0.2454 0.2900 -0.3329 0.2454 0.8132 1.0115 1200
## scale(per_cobble)-sessile_animals 0.1688 0.2827 -0.4041 0.1605 0.7450 1.0101 1018
## scale(per_cobble)-aquatic_worms 0.2881 0.2606 -0.2093 0.2851 0.8444 1.0063 1200
## scale(per_cobble)-sow_bugs 0.2594 0.1902 -0.1028 0.2552 0.6481 1.0025 1200
## scale(per_cobble)-scuds 0.1169 0.1977 -0.2762 0.1167 0.4976 1.0020 1104
## scale(per_cobble)-water_mites 0.4795 0.2792 -0.0461 0.4722 1.0804 1.0004 1002
## scale(per_cobble)-damselfly_nymphs 0.3048 0.2302 -0.1535 0.3049 0.8031 1.0083 1322
## scale(per_cobble)-alderfly_larvae -0.1114 0.2526 -0.6186 -0.1017 0.3788 1.0106 1200
## scale(per_cobble)-other_beetles 0.1131 0.2426 -0.3766 0.1162 0.5751 1.0189 1200
## scale(per_cobble)-crayfish 0.4140 0.2280 -0.0100 0.4055 0.8887 1.0007 1200
## scale(per_cobble)-dragonfly_nymphs 0.1238 0.2552 -0.4338 0.1369 0.6048 1.0148 1200
## scale(per_cobble)-riffle_beetles 0.4058 0.2028 0.0218 0.3999 0.8379 1.0019 1061
## scale(per_cobble)-other_flies 0.2100 0.3031 -0.3640 0.2071 0.8107 0.9994 1200
## scale(per_cobble)-midges 0.2327 0.2894 -0.3331 0.2473 0.8020 1.0032 1791
## scale(per_cobble)-snails 0.0348 0.2600 -0.5080 0.0320 0.5303 1.0088 1030
## scale(per_cobble)-clams 0.0062 0.2689 -0.5431 0.0083 0.5179 1.0001 1064
## scale(per_cobble)-fishfly_larvae 0.3352 0.2207 -0.0943 0.3286 0.7635 1.0076 1200
## scale(per_cobble)-water_penny_beetles 0.4437 0.2230 0.0203 0.4407 0.8794 1.0006 1200
## scale(per_cobble)-cranefly_larvae 0.2391 0.2652 -0.2770 0.2361 0.7559 1.0038 1105
## scale(per_cobble)-ameletidae 0.2205 0.2739 -0.3339 0.2158 0.7868 1.0022 1529
## scale(per_cobble)-arthropleidae 0.2308 0.2950 -0.3884 0.2448 0.7853 1.0006 1200
## scale(per_cobble)-baetidae 0.3143 0.2531 -0.1722 0.3055 0.8202 1.0177 1200
## scale(per_cobble)-baetiscidae 0.2425 0.3109 -0.3665 0.2424 0.8998 1.0008 1200
## scale(per_cobble)-caenidae -0.2005 0.2628 -0.7624 -0.1883 0.2830 1.0001 1200
## scale(per_cobble)-ephemerellidae 0.2703 0.2817 -0.2961 0.2591 0.8270 0.9995 1200
## scale(per_cobble)-ephemeridae 0.2030 0.2931 -0.3968 0.2093 0.7869 1.0026 1200
## scale(per_cobble)-heptageniidae 0.2604 0.2014 -0.1290 0.2561 0.6796 1.0020 1200
## scale(per_cobble)-isonychiidae 0.2325 0.2964 -0.3742 0.2330 0.8224 1.0094 993
## scale(per_cobble)-leptohyphidae 0.0869 0.3095 -0.5382 0.0941 0.6954 1.0046 756
## scale(per_cobble)-leptophlebiidae 0.3437 0.1823 -0.0024 0.3431 0.6971 1.0006 1395
## scale(per_cobble)-polymitarcyidae 0.2328 0.3110 -0.4154 0.2351 0.8321 1.0092 1200
## scale(per_cobble)-potamanthidae 0.2441 0.3117 -0.3533 0.2341 0.9064 1.0055 1200
## scale(per_cobble)-pseudironidae 0.2359 0.3030 -0.3832 0.2373 0.8542 1.0015 1200
## scale(per_cobble)-siphlonuridae 0.2486 0.2946 -0.3144 0.2443 0.8350 1.0043 1200
## scale(per_cobble)-capniidae 0.2631 0.3085 -0.3054 0.2598 0.8957 1.0018 1200
## scale(per_cobble)-chloroperlidae 0.2849 0.2421 -0.1855 0.2837 0.7577 1.0061 1200
## scale(per_cobble)-leuctridae 0.4108 0.1820 0.0555 0.4154 0.7750 1.0002 1412
## scale(per_cobble)-nemouridae 0.3604 0.2203 -0.0659 0.3556 0.7974 1.0038 1084
## scale(per_cobble)-peltoperlidae 0.2430 0.3065 -0.3608 0.2416 0.8624 1.0013 1071
## scale(per_cobble)-perlidae 0.1059 0.1936 -0.2975 0.1117 0.4706 1.0033 1200
## scale(per_cobble)-perlodidae 0.2115 0.2921 -0.3658 0.2140 0.7979 1.0023 1200
## scale(per_cobble)-pteronarcyidae 0.2373 0.3086 -0.3763 0.2355 0.8325 1.0111 1101
## scale(per_cobble)-taeniopterygidae 0.2499 0.3048 -0.3598 0.2485 0.8408 1.0001 1200
## scale(per_cobble)-brachycentridae 0.2349 0.3175 -0.4371 0.2423 0.8978 1.0044 1200
## scale(per_cobble)-dipseuodopsidae 0.2385 0.3003 -0.3689 0.2396 0.8174 1.0038 1200
## scale(per_cobble)-glossosomatidae 0.3019 0.2783 -0.2534 0.3036 0.8513 1.0073 1200
## scale(per_cobble)-goeridae 0.2441 0.2986 -0.3808 0.2449 0.8378 1.0027 1200
## scale(per_cobble)-helicopsychidae 0.2395 0.2994 -0.3195 0.2334 0.8281 1.0026 1200
## scale(per_cobble)-hydropsychidae 0.2663 0.2092 -0.1489 0.2647 0.7038 1.0160 1200
## scale(per_cobble)-hydroptilidae 0.1683 0.2472 -0.3026 0.1712 0.6821 1.0018 1200
## scale(per_cobble)-lepidostomatidae 0.2161 0.2179 -0.2214 0.2211 0.6128 1.0032 1200
## scale(per_cobble)-leptoceridae 0.2442 0.3103 -0.4041 0.2524 0.8543 1.0004 1361
## scale(per_cobble)-limnephilidae 0.1752 0.2042 -0.2285 0.1797 0.5711 1.0031 1200
## scale(per_cobble)-molannidae 0.2071 0.2717 -0.3520 0.2126 0.7207 1.0094 1200
## scale(per_cobble)-odontoceridae 0.3321 0.2615 -0.1961 0.3236 0.8322 1.0074 1200
## scale(per_cobble)-philopotamidae 0.5303 0.2437 0.0946 0.5190 1.0736 1.0054 1101
## scale(per_cobble)-phryganeidae 0.0028 0.2927 -0.6084 0.0115 0.5469 1.0063 1014
## scale(per_cobble)-polycentropodidae 0.5448 0.2266 0.1332 0.5323 1.0323 1.0007 1200
## scale(per_cobble)-psychomiidae 0.2523 0.3092 -0.3375 0.2530 0.8308 1.0021 1200
## scale(per_cobble)-rhyacophilidae 0.4106 0.2243 -0.0025 0.3990 0.8768 1.0048 1200
## scale(per_cobble)-uenoidae 0.1198 0.2342 -0.3296 0.1184 0.5806 1.0048 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_mtdusky 0.4494 0.2298 0.0129 0.4366 0.9117 1.0054 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_nodusky 0.7050 0.2481 0.2531 0.6820 1.2354 1.0052 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_twolined 0.5463 0.2191 0.1407 0.5481 1.0151 1.0098 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_longtail 0.2580 0.2873 -0.3320 0.2695 0.8010 1.0002 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_red 0.3947 0.2507 -0.1000 0.3906 0.8853 1.0010 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_mole 0.1457 0.3033 -0.4961 0.1589 0.7081 1.0112 1048
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_fourtoed 0.3598 0.3014 -0.2210 0.3640 0.9677 1.0054 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_redback 0.3076 0.2276 -0.1660 0.3072 0.7396 1.0025 1200
## scale(substrate_metric_total)-streambiotic_suff_slimy 0.4793 0.2643 -0.0198 0.4706 1.0111 1.0099 1200
## scale(substrate_metric_total)-blacknose_dace 0.6599 0.2818 0.1637 0.6520 1.2390 0.9997 1200
## scale(substrate_metric_total)-bluegill_sunfish 0.2775 0.3167 -0.3750 0.2837 0.8861 1.0030 1200
## scale(substrate_metric_total)-bluntnose_minnow 0.3383 0.3252 -0.3220 0.3414 0.9337 1.0073 1313
## scale(substrate_metric_total)-brindled_madtom 0.3486 0.3042 -0.2685 0.3526 0.9240 0.9996 1200
## scale(substrate_metric_total)-brook_stickleback 0.3468 0.3036 -0.2790 0.3580 0.9229 1.0025 1308
## scale(substrate_metric_total)-brook_trout 0.3328 0.3312 -0.3664 0.3253 0.9706 1.0059 1200
## scale(substrate_metric_total)-central_mudminnow 0.3583 0.3005 -0.2448 0.3482 0.9613 1.0090 1574
## scale(substrate_metric_total)-central_stoneroller_minnow 0.2931 0.3054 -0.3622 0.2900 0.8962 1.0079 1200
## scale(substrate_metric_total)-common_shiner 0.2943 0.3081 -0.3222 0.3020 0.9081 1.0252 1099
## scale(substrate_metric_total)-creek_chub 0.2988 0.2511 -0.2136 0.2979 0.7763 1.0032 1238
## scale(substrate_metric_total)-eastern_sand_darter 0.3626 0.3144 -0.2527 0.3621 0.9963 1.0025 1338
## scale(substrate_metric_total)-fantail_darter 0.3380 0.3071 -0.2775 0.3444 0.9264 0.9999 1200
## scale(substrate_metric_total)-fathead_minnow 0.3465 0.3096 -0.2413 0.3411 0.9901 1.0023 1200
## scale(substrate_metric_total)-golden_shiner 0.3458 0.3090 -0.2963 0.3615 0.9416 1.0084 1200
## scale(substrate_metric_total)-goldfish 0.3549 0.3181 -0.2877 0.3520 1.0113 1.0075 1200
## scale(substrate_metric_total)-grass_pickerel 0.3371 0.3129 -0.2932 0.3398 0.9891 1.0026 925
## scale(substrate_metric_total)-greenside_darter 0.3474 0.3028 -0.2561 0.3508 0.9455 1.0022 1200
## scale(substrate_metric_total)-green_sunfish 0.3731 0.3038 -0.1908 0.3660 0.9881 1.0037 1022
## scale(substrate_metric_total)-johnny_darter 0.2636 0.3070 -0.3434 0.2783 0.8555 1.0124 1200
## scale(substrate_metric_total)-largemouth_bass 0.3420 0.3070 -0.2399 0.3403 0.9182 1.0100 1200
## scale(substrate_metric_total)-longear_sunfish 0.3365 0.2996 -0.2711 0.3380 0.9449 1.0059 1200
## scale(substrate_metric_total)-longnose_dace 0.3462 0.3108 -0.2665 0.3468 0.9402 1.0076 1200
## scale(substrate_metric_total)-mottled_sculpin 0.3317 0.3108 -0.2992 0.3360 0.9292 1.0067 1365
## scale(substrate_metric_total)-northern_hog_sucker 0.3431 0.3090 -0.2739 0.3486 0.9401 1.0004 1200
## scale(substrate_metric_total)-pumpkinseed_sunfish 0.3391 0.3237 -0.3518 0.3502 0.9872 1.0067 1029
## scale(substrate_metric_total)-rainbow_darter 0.2930 0.2922 -0.2959 0.2976 0.8556 1.0171 1200
## scale(substrate_metric_total)-rainbow_trout 0.3578 0.3109 -0.2389 0.3456 0.9912 1.0009 1200
## scale(substrate_metric_total)-redbelly_dace 0.2798 0.3058 -0.3365 0.2772 0.8454 1.0013 1200
## scale(substrate_metric_total)-redside_dace 0.4056 0.2974 -0.1704 0.4026 1.0304 1.0008 1200
## scale(substrate_metric_total)-river_chub 0.3518 0.3069 -0.2568 0.3502 0.9510 1.0025 1104
## scale(substrate_metric_total)-silverjaw_minnow 0.3521 0.3159 -0.2681 0.3540 0.9932 1.0064 1200
## scale(substrate_metric_total)-smallmouth_bass 0.3473 0.3097 -0.2290 0.3456 0.9813 1.0055 1200
## scale(substrate_metric_total)-spotfin_shiner 0.3404 0.3183 -0.2865 0.3326 0.9620 0.9994 1098
## scale(substrate_metric_total)-stonecat_madtom 0.3511 0.3091 -0.2679 0.3462 0.9425 1.0009 1200
## scale(substrate_metric_total)-striped_shiner 0.3474 0.3107 -0.3041 0.3572 0.9811 1.0004 1303
## scale(substrate_metric_total)-trout_perch 0.3573 0.3160 -0.2967 0.3577 0.9755 1.0108 1200
## scale(substrate_metric_total)-warmouth_sunfish 0.3410 0.3202 -0.2953 0.3409 1.0134 1.0035 1499
## scale(substrate_metric_total)-white_sucker 0.2575 0.2941 -0.3218 0.2560 0.8383 1.0053 1200
## scale(substrate_metric_total)-yellow_bullhead_catfish 0.3175 0.3083 -0.3105 0.3257 0.8952 1.0159 1200
## scale(substrate_metric_total)-sessile_animals 0.5067 0.2892 -0.0368 0.4871 1.1131 1.0067 1200
## scale(substrate_metric_total)-aquatic_worms 0.3661 0.2749 -0.1712 0.3605 0.9462 1.0060 1200
## scale(substrate_metric_total)-sow_bugs 0.1399 0.2163 -0.3099 0.1419 0.5652 1.0003 1285
## scale(substrate_metric_total)-scuds 0.3148 0.2053 -0.0799 0.3122 0.7045 1.0048 1200
## scale(substrate_metric_total)-water_mites 0.6143 0.2694 0.1125 0.6117 1.1693 0.9995 1200
## scale(substrate_metric_total)-damselfly_nymphs 0.2162 0.2285 -0.2665 0.2177 0.6526 0.9995 1200
## scale(substrate_metric_total)-alderfly_larvae 0.3402 0.2499 -0.1661 0.3477 0.8347 1.0076 1200
## scale(substrate_metric_total)-other_beetles 0.0118 0.2631 -0.4874 0.0232 0.5160 1.0009 1200
## scale(substrate_metric_total)-crayfish 0.2709 0.2238 -0.1774 0.2741 0.7190 1.0193 1294
## scale(substrate_metric_total)-dragonfly_nymphs 0.2976 0.2421 -0.1906 0.2949 0.7450 1.0178 1200
## scale(substrate_metric_total)-riffle_beetles 0.2316 0.2018 -0.1656 0.2321 0.6095 1.0012 1200
## scale(substrate_metric_total)-other_flies 0.3677 0.2774 -0.1946 0.3702 0.9137 1.0008 1200
## scale(substrate_metric_total)-midges 0.3239 0.3049 -0.2888 0.3138 0.9076 1.0111 1200
## scale(substrate_metric_total)-snails 0.3499 0.2224 -0.0746 0.3418 0.7905 1.0116 1200
## scale(substrate_metric_total)-clams 0.1908 0.2533 -0.2899 0.1817 0.7169 1.0023 1185
## scale(substrate_metric_total)-fishfly_larvae 0.3544 0.2425 -0.1222 0.3491 0.8300 1.0039 1100
## scale(substrate_metric_total)-water_penny_beetles 0.7010 0.2681 0.2251 0.6847 1.2850 1.0013 1200
## scale(substrate_metric_total)-cranefly_larvae 0.4434 0.2588 -0.0515 0.4305 0.9842 1.0391 1200
## scale(substrate_metric_total)-ameletidae 0.3212 0.2689 -0.1942 0.3275 0.8144 1.0283 1200
## scale(substrate_metric_total)-arthropleidae 0.3456 0.3141 -0.2928 0.3373 0.9580 1.0002 1729
## scale(substrate_metric_total)-baetidae 0.4640 0.2296 0.0307 0.4556 0.9279 1.0055 1200
## scale(substrate_metric_total)-baetiscidae 0.3492 0.3157 -0.2575 0.3397 1.0392 1.0002 1091
## scale(substrate_metric_total)-caenidae 0.1573 0.2578 -0.3706 0.1647 0.6429 1.0124 1200
## scale(substrate_metric_total)-ephemerellidae 0.3075 0.2949 -0.3076 0.3232 0.8742 1.0014 1200
## scale(substrate_metric_total)-ephemeridae 0.3523 0.3050 -0.2534 0.3644 0.9293 0.9996 1200
## scale(substrate_metric_total)-heptageniidae 0.1549 0.2428 -0.3373 0.1609 0.6120 0.9989 1200
## scale(substrate_metric_total)-isonychiidae 0.3492 0.3141 -0.3120 0.3408 1.0081 1.0018 1200
## scale(substrate_metric_total)-leptohyphidae 0.2992 0.2923 -0.3186 0.2941 0.8511 1.0109 1027
## scale(substrate_metric_total)-leptophlebiidae 0.1838 0.2012 -0.2059 0.1804 0.6021 1.0042 976
## scale(substrate_metric_total)-polymitarcyidae 0.3534 0.3118 -0.2871 0.3554 0.9771 1.0024 1200
## scale(substrate_metric_total)-potamanthidae 0.3489 0.3139 -0.2827 0.3440 0.9704 1.0161 1200
## scale(substrate_metric_total)-pseudironidae 0.3584 0.3151 -0.2649 0.3446 0.9925 1.0003 1200
## scale(substrate_metric_total)-siphlonuridae 0.3419 0.3129 -0.2980 0.3517 1.0101 1.0014 1200
## scale(substrate_metric_total)-capniidae 0.3492 0.3120 -0.2571 0.3528 0.9736 1.0093 1200
## scale(substrate_metric_total)-chloroperlidae 0.3372 0.2502 -0.1388 0.3283 0.8305 1.0103 1200
## scale(substrate_metric_total)-leuctridae 0.3978 0.2036 -0.0091 0.3974 0.7847 0.9993 1200
## scale(substrate_metric_total)-nemouridae 0.3457 0.2416 -0.1345 0.3516 0.8026 1.0005 1200
## scale(substrate_metric_total)-peltoperlidae 0.3530 0.3127 -0.2623 0.3557 0.9904 1.0051 1200
## scale(substrate_metric_total)-perlidae 0.0733 0.2266 -0.3832 0.0757 0.4898 1.0020 1200
## scale(substrate_metric_total)-perlodidae 0.3253 0.3029 -0.3155 0.3227 0.8988 1.0110 1200
## scale(substrate_metric_total)-pteronarcyidae 0.3402 0.3224 -0.3022 0.3417 0.9944 1.0239 1200
## scale(substrate_metric_total)-taeniopterygidae 0.3540 0.3098 -0.2746 0.3565 0.9461 1.0005 1200
## scale(substrate_metric_total)-brachycentridae 0.3407 0.3140 -0.2546 0.3385 0.9818 1.0225 1200
## scale(substrate_metric_total)-dipseuodopsidae 0.3433 0.2993 -0.2446 0.3428 0.9390 1.0013 1030
## scale(substrate_metric_total)-glossosomatidae 0.3316 0.2914 -0.2992 0.3308 0.8878 0.9994 1200
## scale(substrate_metric_total)-goeridae 0.3430 0.3114 -0.2942 0.3507 0.9579 1.0101 1200
## scale(substrate_metric_total)-helicopsychidae 0.3524 0.3015 -0.2559 0.3523 0.9320 1.0034 1200
## scale(substrate_metric_total)-hydropsychidae 0.6472 0.2276 0.2268 0.6325 1.0976 1.0037 1200
## scale(substrate_metric_total)-hydroptilidae 0.5885 0.2677 0.1244 0.5717 1.1474 1.0207 1200
## scale(substrate_metric_total)-lepidostomatidae 0.2080 0.2292 -0.2474 0.2139 0.6379 1.0155 1200
## scale(substrate_metric_total)-leptoceridae 0.3487 0.3174 -0.2802 0.3562 0.9661 1.0020 1200
## scale(substrate_metric_total)-limnephilidae 0.3009 0.2272 -0.1327 0.2982 0.7497 0.9990 1200
## scale(substrate_metric_total)-molannidae 0.3407 0.2888 -0.2423 0.3365 0.9301 1.0044 1200
## scale(substrate_metric_total)-odontoceridae 0.3163 0.2862 -0.2372 0.3139 0.8986 1.0010 1200
## scale(substrate_metric_total)-philopotamidae 0.6389 0.2566 0.1821 0.6255 1.1879 1.0041 1200
## scale(substrate_metric_total)-phryganeidae 0.2474 0.2968 -0.3541 0.2660 0.8129 1.0058 1200
## scale(substrate_metric_total)-polycentropodidae 0.3778 0.2287 -0.0352 0.3700 0.8524 1.0093 1200
## scale(substrate_metric_total)-psychomiidae 0.3410 0.3106 -0.2603 0.3365 0.9603 1.0017 1039
## scale(substrate_metric_total)-rhyacophilidae 0.5598 0.2534 0.0905 0.5553 1.0876 1.0124 1200
## scale(substrate_metric_total)-uenoidae 0.4026 0.2517 -0.1034 0.3973 0.8989 1.0273 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_mtdusky 0.2485 0.2124 -0.1457 0.2433 0.6714 1.0003 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_nodusky -0.0817 0.1909 -0.4610 -0.0796 0.2856 1.0081 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_twolined 0.2682 0.1895 -0.0799 0.2649 0.6671 1.0008 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_longtail -0.0455 0.2843 -0.6355 -0.0330 0.4811 1.0038 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_red -0.5066 0.2511 -1.0515 -0.4938 -0.0594 1.0025 1087
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_mole -0.1470 0.3096 -0.8091 -0.1418 0.4219 1.0042 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_fourtoed -0.0012 0.3249 -0.6194 0.0012 0.6388 1.0085 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_redback -0.4147 0.2438 -0.9194 -0.4076 0.0691 0.9989 1200
## scale(pool_metric_total)-streambiotic_suff_slimy -0.1293 0.2493 -0.5990 -0.1279 0.3531 1.0041 1200
## scale(pool_metric_total)-blacknose_dace 0.1040 0.2629 -0.3735 0.0921 0.6760 1.0052 1200
## scale(pool_metric_total)-bluegill_sunfish 0.0055 0.3075 -0.5871 0.0061 0.6292 1.0008 1200
## scale(pool_metric_total)-bluntnose_minnow -0.0037 0.3188 -0.6373 0.0044 0.6693 1.0038 1200
## scale(pool_metric_total)-brindled_madtom -0.0112 0.3210 -0.6640 0.0010 0.6055 1.0209 1392
## scale(pool_metric_total)-brook_stickleback -0.0149 0.3212 -0.6242 -0.0220 0.6157 1.0001 1037
## scale(pool_metric_total)-brook_trout -0.0275 0.3038 -0.6481 -0.0120 0.5531 1.0312 1200
## scale(pool_metric_total)-central_mudminnow -0.0152 0.3156 -0.6537 -0.0054 0.6013 1.0037 1327
## scale(pool_metric_total)-central_stoneroller_minnow 0.0108 0.3207 -0.6469 0.0144 0.6674 1.0056 1200
## scale(pool_metric_total)-common_shiner -0.0248 0.3278 -0.6875 -0.0133 0.6073 1.0058 1026
## scale(pool_metric_total)-creek_chub 0.1583 0.2584 -0.3372 0.1458 0.7010 1.0112 1247
## scale(pool_metric_total)-eastern_sand_darter 0.0003 0.3239 -0.6604 0.0105 0.6516 1.0004 1200
## scale(pool_metric_total)-fantail_darter -0.0111 0.3136 -0.6041 -0.0012 0.6081 1.0136 1081
## scale(pool_metric_total)-fathead_minnow -0.0128 0.3150 -0.6457 -0.0125 0.6364 1.0073 1200
## scale(pool_metric_total)-golden_shiner -0.0265 0.3078 -0.6155 -0.0353 0.5800 1.0002 1200
## scale(pool_metric_total)-goldfish -0.0048 0.3187 -0.6140 -0.0216 0.6492 1.0065 1200
## scale(pool_metric_total)-grass_pickerel -0.0071 0.3116 -0.6190 -0.0105 0.6440 1.0040 1200
## scale(pool_metric_total)-greenside_darter -0.0071 0.3307 -0.6773 -0.0082 0.6423 1.0029 1200
## scale(pool_metric_total)-green_sunfish 0.0302 0.3144 -0.5781 0.0347 0.6676 1.0004 1304
## scale(pool_metric_total)-johnny_darter -0.0904 0.3054 -0.7062 -0.0904 0.4804 1.0069 1200
## scale(pool_metric_total)-largemouth_bass -0.0098 0.3238 -0.6992 -0.0144 0.6026 1.0033 1200
## scale(pool_metric_total)-longear_sunfish -0.0178 0.3141 -0.6484 -0.0170 0.5922 1.0083 1200
## scale(pool_metric_total)-longnose_dace -0.0244 0.3187 -0.6554 -0.0278 0.6189 1.0054 1200
## scale(pool_metric_total)-mottled_sculpin -0.0224 0.3047 -0.5996 -0.0317 0.6125 1.0024 1200
## scale(pool_metric_total)-northern_hog_sucker -0.0141 0.3298 -0.6320 -0.0196 0.6661 1.0095 1066
## scale(pool_metric_total)-pumpkinseed_sunfish -0.0176 0.3163 -0.6883 -0.0066 0.6099 1.0026 1164
## scale(pool_metric_total)-rainbow_darter -0.1066 0.2958 -0.7434 -0.0955 0.4603 1.0006 1200
## scale(pool_metric_total)-rainbow_trout -0.0049 0.3216 -0.6252 -0.0005 0.6331 1.0080 1200
## scale(pool_metric_total)-redbelly_dace -0.0339 0.3199 -0.7037 -0.0272 0.5710 1.0008 1200
## scale(pool_metric_total)-redside_dace 0.0124 0.3109 -0.5890 0.0128 0.6411 1.0062 1011
## scale(pool_metric_total)-river_chub 0.0046 0.3273 -0.6588 -0.0064 0.6722 1.0019 1200
## scale(pool_metric_total)-silverjaw_minnow 0.0016 0.3090 -0.6242 -0.0039 0.6188 1.0142 1200
## scale(pool_metric_total)-smallmouth_bass -0.0230 0.3278 -0.6588 -0.0242 0.6340 0.9992 1084
## scale(pool_metric_total)-spotfin_shiner 0.0003 0.3226 -0.6463 0.0034 0.6321 1.0127 1440
## scale(pool_metric_total)-stonecat_madtom -0.0191 0.3127 -0.6433 -0.0054 0.5992 1.0061 1200
## scale(pool_metric_total)-striped_shiner -0.0011 0.2986 -0.6305 -0.0057 0.5946 1.0008 1200
## scale(pool_metric_total)-trout_perch 0.0048 0.3181 -0.6287 -0.0029 0.6363 1.0011 1331
## scale(pool_metric_total)-warmouth_sunfish -0.0106 0.3226 -0.6442 -0.0146 0.6095 1.0018 1200
## scale(pool_metric_total)-white_sucker -0.1158 0.3090 -0.7454 -0.1145 0.4673 1.0125 1200
## scale(pool_metric_total)-yellow_bullhead_catfish 0.0079 0.2981 -0.5610 0.0124 0.6076 1.0187 1200
## scale(pool_metric_total)-sessile_animals 0.0603 0.3054 -0.4856 0.0450 0.6666 1.0030 1200
## scale(pool_metric_total)-aquatic_worms -0.3389 0.2756 -0.9258 -0.3208 0.1778 1.0190 1200
## scale(pool_metric_total)-sow_bugs 0.0167 0.2048 -0.3861 0.0047 0.4193 1.0042 1310
## scale(pool_metric_total)-scuds -0.3650 0.1996 -0.7797 -0.3568 0.0048 1.0013 1098
## scale(pool_metric_total)-water_mites 0.1875 0.2541 -0.2929 0.1824 0.6937 1.0046 1274
## scale(pool_metric_total)-damselfly_nymphs 0.1646 0.2298 -0.2686 0.1532 0.6287 1.0032 1200
## scale(pool_metric_total)-alderfly_larvae 0.2169 0.2340 -0.2728 0.2243 0.6625 1.0065 1200
## scale(pool_metric_total)-other_beetles -0.0137 0.2608 -0.5352 -0.0156 0.5057 1.0006 1200
## scale(pool_metric_total)-crayfish 0.1031 0.2298 -0.3733 0.1032 0.5549 1.0085 1200
## scale(pool_metric_total)-dragonfly_nymphs -0.1952 0.2361 -0.6907 -0.1806 0.2425 1.0023 1200
## scale(pool_metric_total)-riffle_beetles 0.0835 0.1868 -0.2722 0.0853 0.4435 1.0185 1200
## scale(pool_metric_total)-other_flies 0.1752 0.2944 -0.3654 0.1667 0.7710 1.0017 1200
## scale(pool_metric_total)-midges -0.0289 0.3137 -0.6403 -0.0265 0.5447 1.0023 1200
## scale(pool_metric_total)-snails 0.2252 0.2292 -0.1993 0.2202 0.7228 1.0053 1200
## scale(pool_metric_total)-clams -0.0208 0.2666 -0.5694 -0.0065 0.4457 1.0011 1200
## scale(pool_metric_total)-fishfly_larvae -0.0295 0.2242 -0.4668 -0.0226 0.4098 1.0061 1200
## scale(pool_metric_total)-water_penny_beetles 0.0830 0.2086 -0.3040 0.0804 0.4905 1.0091 1200
## scale(pool_metric_total)-cranefly_larvae 0.2186 0.2600 -0.2919 0.2133 0.7333 1.0019 1200
## scale(pool_metric_total)-ameletidae 0.2320 0.2924 -0.3240 0.2191 0.8350 0.9995 1200
## scale(pool_metric_total)-arthropleidae -0.0159 0.3305 -0.6552 -0.0188 0.6579 1.0108 918
## scale(pool_metric_total)-baetidae 0.1930 0.2292 -0.2432 0.1914 0.6470 1.0136 1200
## scale(pool_metric_total)-baetiscidae -0.0047 0.3054 -0.6233 -0.0071 0.5846 1.0011 1085
## scale(pool_metric_total)-caenidae 0.1408 0.2638 -0.3401 0.1317 0.6788 1.0213 1200
## scale(pool_metric_total)-ephemerellidae 0.1058 0.3139 -0.5099 0.0908 0.7465 1.0072 806
## scale(pool_metric_total)-ephemeridae -0.0133 0.3014 -0.5670 -0.0170 0.5933 1.0020 1200
## scale(pool_metric_total)-heptageniidae -0.0218 0.2178 -0.4274 -0.0217 0.4231 1.0075 1054
## scale(pool_metric_total)-isonychiidae -0.0244 0.3164 -0.6559 -0.0227 0.6161 1.0142 1200
## scale(pool_metric_total)-leptohyphidae 0.1318 0.3099 -0.5004 0.1244 0.7414 1.0018 1200
## scale(pool_metric_total)-leptophlebiidae -0.1210 0.1768 -0.4688 -0.1200 0.2157 1.0117 1200
## scale(pool_metric_total)-polymitarcyidae -0.0215 0.3129 -0.6436 -0.0205 0.6129 1.0020 1467
## scale(pool_metric_total)-potamanthidae -0.0035 0.3157 -0.6166 -0.0101 0.6041 1.0029 1200
## scale(pool_metric_total)-pseudironidae -0.0133 0.3231 -0.6589 -0.0129 0.6034 1.0015 1200
## scale(pool_metric_total)-siphlonuridae -0.0161 0.3079 -0.5946 -0.0269 0.6423 1.0100 1200
## scale(pool_metric_total)-capniidae 0.0000 0.3119 -0.6008 0.0008 0.6320 1.0170 1200
## scale(pool_metric_total)-chloroperlidae 0.0760 0.2545 -0.4291 0.0826 0.5872 1.0045 1200
## scale(pool_metric_total)-leuctridae -0.1160 0.1751 -0.4640 -0.1150 0.2074 1.0023 1200
## scale(pool_metric_total)-nemouridae -0.0831 0.2286 -0.5295 -0.0832 0.3665 1.0218 1200
## scale(pool_metric_total)-peltoperlidae -0.0056 0.3035 -0.6336 -0.0144 0.5869 1.0055 1026
## scale(pool_metric_total)-perlidae 0.3449 0.2133 -0.0314 0.3308 0.8007 1.0012 1096
## scale(pool_metric_total)-perlodidae -0.0179 0.2966 -0.6046 -0.0085 0.5373 1.0159 1200
## scale(pool_metric_total)-pteronarcyidae -0.0050 0.3167 -0.6255 -0.0099 0.6041 1.0017 1211
## scale(pool_metric_total)-taeniopterygidae -0.0083 0.3187 -0.6570 -0.0162 0.6717 1.0046 1232
## scale(pool_metric_total)-brachycentridae -0.0007 0.3072 -0.6120 -0.0002 0.6167 1.0068 1242
## scale(pool_metric_total)-dipseuodopsidae -0.0040 0.3253 -0.6508 -0.0072 0.6202 1.0084 1200
## scale(pool_metric_total)-glossosomatidae -0.0558 0.2743 -0.6064 -0.0606 0.4958 1.0222 1101
## scale(pool_metric_total)-goeridae -0.0080 0.3191 -0.6168 -0.0128 0.6533 1.0014 1200
## scale(pool_metric_total)-helicopsychidae -0.0056 0.3183 -0.6151 -0.0146 0.6430 1.0002 1306
## scale(pool_metric_total)-hydropsychidae -0.0245 0.1930 -0.4014 -0.0245 0.3638 1.0151 1200
## scale(pool_metric_total)-hydroptilidae -0.0445 0.2591 -0.5655 -0.0483 0.4875 1.0174 1200
## scale(pool_metric_total)-lepidostomatidae -0.1171 0.1943 -0.5186 -0.1071 0.2343 1.0004 1220
## scale(pool_metric_total)-leptoceridae -0.0206 0.3292 -0.6601 -0.0248 0.6271 1.0029 1200
## scale(pool_metric_total)-limnephilidae -0.2047 0.2108 -0.6398 -0.1900 0.1788 1.0003 1200
## scale(pool_metric_total)-molannidae -0.1774 0.2787 -0.7613 -0.1676 0.3659 1.0053 1200
## scale(pool_metric_total)-odontoceridae -0.3154 0.2879 -0.9252 -0.3057 0.2102 1.0084 1200
## scale(pool_metric_total)-philopotamidae -0.2221 0.2255 -0.7130 -0.2044 0.1962 1.0006 1200
## scale(pool_metric_total)-phryganeidae -0.1644 0.2733 -0.7329 -0.1542 0.3642 1.0034 1200
## scale(pool_metric_total)-polycentropodidae -0.0530 0.1933 -0.4746 -0.0516 0.2994 1.0294 1200
## scale(pool_metric_total)-psychomiidae -0.0145 0.3120 -0.6120 -0.0111 0.5716 1.0052 1200
## scale(pool_metric_total)-rhyacophilidae -0.1035 0.2247 -0.5480 -0.0913 0.3480 1.0048 1200
## scale(pool_metric_total)-uenoidae 0.0628 0.2272 -0.3937 0.0631 0.5086 1.0044 1200
##
## Detection (logit scale):
## Mean SD 2.5% 50% 97.5% Rhat ESS
## (Intercept)-streambiotic_suff_mtdusky -0.2914 0.3078 -0.8823 -0.3007 0.3236 1.0100 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_nodusky -0.2558 0.1790 -0.6103 -0.2578 0.0880 1.0104 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_twolined 1.4451 0.1416 1.1720 1.4412 1.7236 1.0215 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_longtail -1.8625 0.8383 -3.6466 -1.7982 -0.3676 1.0052 772
## (Intercept)-streambiotic_suff_red -0.8582 0.3406 -1.5083 -0.8641 -0.1866 1.0020 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_mole -2.9449 1.4637 -5.9136 -2.8580 -0.4228 1.0349 114
## (Intercept)-streambiotic_suff_fourtoed -2.4440 2.5086 -8.3143 -2.1281 1.6399 1.1088 38
## (Intercept)-streambiotic_suff_redback -0.4285 0.1641 -0.7467 -0.4250 -0.1194 1.0035 1200
## (Intercept)-streambiotic_suff_slimy -1.6962 0.6748 -3.0118 -1.6839 -0.4629 0.9996 1200
## (Intercept)-blacknose_dace -1.9011 0.4428 -2.8552 -1.8904 -1.0864 1.0020 1200
## (Intercept)-bluegill_sunfish -2.6766 1.8041 -6.4054 -2.3838 0.2415 1.1059 59
## (Intercept)-bluntnose_minnow -2.4916 2.6427 -8.6599 -2.1462 1.9154 1.2410 41
## (Intercept)-brindled_madtom -2.3606 2.4936 -8.2588 -2.1136 1.8225 1.0778 76
## (Intercept)-brook_stickleback -2.4250 2.5262 -8.2330 -2.2046 1.8824 1.1898 73
## (Intercept)-brook_trout -2.4368 2.6132 -8.1440 -2.1353 1.6340 1.1910 73
## (Intercept)-central_mudminnow -2.1988 2.5748 -8.1423 -1.9547 2.2522 1.1559 44
## (Intercept)-central_stoneroller_minnow -4.1764 1.0953 -6.0463 -4.3117 -1.7766 1.0478 168
## (Intercept)-common_shiner -2.9831 1.6973 -6.5375 -2.8389 0.0159 1.0960 75
## (Intercept)-creek_chub -1.8477 0.2616 -2.3363 -1.8533 -1.3231 1.0165 1200
## (Intercept)-eastern_sand_darter -2.4486 2.4737 -8.0662 -2.3141 2.0632 1.1641 80
## (Intercept)-fantail_darter -2.4621 2.5101 -7.8373 -2.2349 1.7915 1.0989 78
## (Intercept)-fathead_minnow -2.4723 2.6290 -8.5944 -2.0776 1.9317 1.1516 36
## (Intercept)-golden_shiner -2.3984 2.5076 -8.2144 -2.1050 1.8264 1.0975 68
## (Intercept)-goldfish -2.5517 2.4666 -8.2571 -2.2695 1.6762 1.1073 68
## (Intercept)-grass_pickerel -2.3993 2.5378 -8.1277 -2.1712 1.9566 1.1506 68
## (Intercept)-greenside_darter -2.3624 2.5468 -7.9913 -2.1201 2.0741 1.1043 88
## (Intercept)-green_sunfish -4.1827 1.3169 -6.5877 -4.2588 -1.5651 1.0078 165
## (Intercept)-johnny_darter -3.2856 1.1297 -5.3953 -3.3127 -1.0551 1.0180 183
## (Intercept)-largemouth_bass -2.3234 2.4294 -7.9822 -2.0658 1.8450 1.0934 71
## (Intercept)-longear_sunfish -2.3466 2.4095 -7.6200 -2.1262 2.1507 1.1010 62
## (Intercept)-longnose_dace -2.5289 2.4990 -8.1012 -2.2800 1.9572 1.1219 70
## (Intercept)-mottled_sculpin -2.3371 2.5359 -8.1357 -2.0348 2.0491 1.1076 85
## (Intercept)-northern_hog_sucker -2.5142 2.4823 -8.0926 -2.3154 1.7104 1.0997 112
## (Intercept)-pumpkinseed_sunfish -2.3195 2.4301 -7.5600 -2.0708 1.9404 1.0819 83
## (Intercept)-rainbow_darter -2.0014 0.9941 -4.1952 -1.8907 -0.2793 1.0100 319
## (Intercept)-rainbow_trout -2.3874 2.5284 -8.1079 -2.1566 1.8102 1.1034 44
## (Intercept)-redbelly_dace -3.4341 1.4092 -6.1523 -3.3884 -0.9159 1.0426 254
## (Intercept)-redside_dace -3.2591 1.6892 -6.7621 -3.0568 -0.4367 1.0848 66
## (Intercept)-river_chub -2.4837 2.4681 -8.1890 -2.3056 1.5278 1.1575 47
## (Intercept)-silverjaw_minnow -2.3307 2.3479 -8.0135 -2.1353 1.8411 1.1308 57
## (Intercept)-smallmouth_bass -2.3410 2.4102 -7.8480 -2.1545 1.8437 1.0926 45
## (Intercept)-spotfin_shiner -2.3585 2.4561 -8.1076 -2.1394 1.9856 1.1190 69
## (Intercept)-stonecat_madtom -2.4520 2.5752 -8.4653 -2.2294 1.9326 1.2455 82
## (Intercept)-striped_shiner -2.3044 2.3965 -7.6039 -2.0895 1.9722 1.1216 76
## (Intercept)-trout_perch -2.2398 2.4065 -7.5753 -1.9360 1.8791 1.0707 61
## (Intercept)-warmouth_sunfish -2.4565 2.5343 -8.2805 -2.2178 1.6799 1.0936 43
## (Intercept)-white_sucker -2.9844 1.2165 -5.2154 -3.0055 -0.7442 1.0612 169
## (Intercept)-yellow_bullhead_catfish -2.8236 1.9484 -6.7769 -2.6077 0.4685 1.0604 102
## (Intercept)-sessile_animals -2.9783 1.2888 -5.2886 -3.0022 -0.5222 1.0012 288
## (Intercept)-aquatic_worms 0.6181 0.1108 0.4097 0.6180 0.8431 0.9994 1200
## (Intercept)-sow_bugs 0.0351 0.1962 -0.3493 0.0355 0.4155 0.9995 1200
## (Intercept)-scuds -0.2698 0.1817 -0.6343 -0.2687 0.0867 1.0102 1200
## (Intercept)-water_mites -1.2911 0.1975 -1.6772 -1.2924 -0.9024 1.0033 1200
## (Intercept)-damselfly_nymphs -0.2754 0.1382 -0.5615 -0.2697 0.0038 1.0106 1200
## (Intercept)-alderfly_larvae -1.0421 0.1891 -1.3984 -1.0401 -0.6844 1.0021 1307
## (Intercept)-other_beetles -0.0246 0.1201 -0.2547 -0.0261 0.2204 1.0067 1200
## (Intercept)-crayfish 0.6413 0.1214 0.4018 0.6441 0.8811 1.0041 1200
## (Intercept)-dragonfly_nymphs -0.1140 0.1236 -0.3584 -0.1156 0.1256 1.0067 1200
## (Intercept)-riffle_beetles 0.0677 0.1370 -0.1854 0.0698 0.3358 1.0135 1453
## (Intercept)-other_flies 1.6953 0.1330 1.4487 1.6916 1.9651 1.0147 1200
## (Intercept)-midges 1.7920 0.1379 1.5161 1.7889 2.0679 1.0039 1200
## (Intercept)-snails -0.0316 0.1190 -0.2517 -0.0299 0.1994 1.0041 1200
## (Intercept)-clams -1.3937 0.2908 -1.9730 -1.3854 -0.8416 1.0119 776
## (Intercept)-fishfly_larvae -0.7965 0.1914 -1.1995 -0.7970 -0.4230 1.0067 1200
## (Intercept)-water_penny_beetles -0.9121 0.2179 -1.3530 -0.9169 -0.4644 1.0317 1200
## (Intercept)-cranefly_larvae 0.9855 0.1174 0.7708 0.9810 1.2181 1.0029 1200
## (Intercept)-ameletidae -2.4044 0.2623 -2.9779 -2.3926 -1.9226 0.9997 1085
## (Intercept)-arthropleidae -2.4860 2.5392 -8.2959 -2.2300 1.6794 1.0810 59
## (Intercept)-baetidae 0.4092 0.1311 0.1476 0.4086 0.6593 1.0136 1200
## (Intercept)-baetiscidae -2.4159 2.4326 -7.8271 -2.1853 1.8803 1.1091 92
## (Intercept)-caenidae -1.0183 0.5029 -2.1489 -0.9827 -0.1586 1.0050 1200
## (Intercept)-ephemerellidae -4.0193 1.0853 -5.7958 -4.2026 -1.7746 1.0530 169
## (Intercept)-ephemeridae -3.3444 1.3751 -5.7248 -3.3904 -0.6845 1.1421 116
## (Intercept)-heptageniidae -0.6951 0.2260 -1.1541 -0.6875 -0.2616 1.0006 1200
## (Intercept)-isonychiidae -2.4865 2.4374 -7.9426 -2.1930 1.6888 1.1219 39
## (Intercept)-leptohyphidae -3.1989 0.8090 -4.5762 -3.2970 -1.5032 1.0190 262
## (Intercept)-leptophlebiidae 0.5817 0.1684 0.2675 0.5793 0.9155 1.0017 1200
## (Intercept)-polymitarcyidae -2.4090 2.4607 -8.0205 -2.2101 1.7337 1.0833 51
## (Intercept)-potamanthidae -2.5168 2.5528 -8.3855 -2.2856 1.7607 1.1255 74
## (Intercept)-pseudironidae -2.4157 2.5236 -7.7872 -2.1981 1.6838 1.1253 87
## (Intercept)-siphlonuridae -2.2606 2.4535 -7.4841 -2.0885 1.9264 1.0558 56
## (Intercept)-capniidae -2.3979 2.4413 -7.6042 -2.1606 1.6089 1.1048 74
## (Intercept)-chloroperlidae -1.5697 0.4259 -2.4468 -1.5524 -0.7894 1.0234 848
## (Intercept)-leuctridae 0.7916 0.1564 0.4920 0.7918 1.1001 0.9998 1200
## (Intercept)-nemouridae -1.2491 0.2449 -1.7594 -1.2422 -0.8109 1.0111 1315
## (Intercept)-peltoperlidae -2.5557 2.5538 -8.0919 -2.3327 1.7069 1.1291 66
## (Intercept)-perlidae -0.2311 0.1894 -0.5944 -0.2259 0.1214 1.0019 1165
## (Intercept)-perlodidae -3.2312 0.3845 -3.9276 -3.2507 -2.4047 1.0147 656
## (Intercept)-pteronarcyidae -2.2416 2.3968 -7.7128 -2.0586 2.0355 1.0890 42
## (Intercept)-taeniopterygidae -2.3336 2.5536 -8.4495 -2.1545 1.9275 1.1497 69
## (Intercept)-brachycentridae -2.3151 2.3445 -7.5422 -2.1183 1.7410 1.1496 74
## (Intercept)-dipseuodopsidae -2.4638 2.5645 -8.4706 -2.2159 2.0027 1.1222 107
## (Intercept)-glossosomatidae -0.6958 0.7425 -2.2693 -0.6708 0.6758 1.0011 1544
## (Intercept)-goeridae -2.2967 2.3659 -7.6550 -2.2005 1.6332 1.0908 55
## (Intercept)-helicopsychidae -2.4151 2.4361 -7.9637 -2.2285 1.7999 1.1111 36
## (Intercept)-hydropsychidae 0.9845 0.1235 0.7411 0.9886 1.2173 1.0011 1478
## (Intercept)-hydroptilidae -1.7222 0.4446 -2.6088 -1.7124 -0.8926 0.9994 1058
## (Intercept)-lepidostomatidae -0.0396 0.2138 -0.4597 -0.0334 0.3630 1.0039 1022
## (Intercept)-leptoceridae -2.3503 2.4481 -8.1601 -2.1322 1.6888 1.1810 59
## (Intercept)-limnephilidae -0.4565 0.1964 -0.8381 -0.4581 -0.0904 1.0022 1200
## (Intercept)-molannidae -1.2748 0.9122 -3.1035 -1.2469 0.4831 1.0071 989
## (Intercept)-odontoceridae -2.0221 0.9209 -3.9958 -1.9658 -0.3853 1.0008 877
## (Intercept)-philopotamidae -0.7041 0.1650 -1.0292 -0.7095 -0.3739 1.0025 1200
## (Intercept)-phryganeidae -2.6549 0.8377 -4.3007 -2.6346 -1.1960 1.0630 390
## (Intercept)-polycentropodidae -0.4526 0.1794 -0.7968 -0.4538 -0.0988 0.9999 1200
## (Intercept)-psychomiidae -2.3476 2.4979 -8.0579 -2.0057 1.7895 1.1135 58
## (Intercept)-rhyacophilidae -1.1480 0.3097 -1.7541 -1.1455 -0.5633 1.0043 1200
## (Intercept)-uenoidae -1.2592 0.2428 -1.7636 -1.2601 -0.7993 0.9996 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_mtdusky -0.9483 0.2300 -1.4407 -0.9381 -0.5424 1.0059 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_nodusky -0.4391 0.1477 -0.7468 -0.4372 -0.1691 1.0070 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_twolined -0.2331 0.1373 -0.5065 -0.2320 0.0263 1.0046 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_longtail -0.3800 0.3842 -1.1835 -0.3779 0.3540 1.0016 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_red -0.7282 0.2958 -1.3331 -0.7254 -0.1434 1.0087 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_mole -0.0778 0.4543 -0.9638 -0.0739 0.8260 1.0003 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_fourtoed -0.2313 0.5608 -1.3591 -0.2188 0.8668 1.0045 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_redback -0.5561 0.1389 -0.8452 -0.5523 -0.2877 1.0015 1200
## scale(seasons)-streambiotic_suff_slimy -0.7388 0.4130 -1.5970 -0.7236 -0.0033 1.0002 1318
## scale(seasons)-blacknose_dace -1.0679 0.2509 -1.5697 -1.0594 -0.5939 1.0015 1200
## scale(seasons)-bluegill_sunfish 0.0699 0.5126 -0.9251 0.0633 1.1312 1.0121 1200
## scale(seasons)-bluntnose_minnow -0.1938 0.5764 -1.3177 -0.1841 0.9488 1.0024 1296
## scale(seasons)-brindled_madtom -0.2307 0.5616 -1.3320 -0.1989 0.7906 1.0010 1572
## scale(seasons)-brook_stickleback -0.2055 0.5802 -1.3157 -0.2045 0.9245 1.0098 1200
## scale(seasons)-brook_trout -0.2024 0.5584 -1.2795 -0.2102 0.8934 1.0061 1200
## scale(seasons)-central_mudminnow -0.2184 0.5610 -1.3450 -0.2052 0.8461 1.0015 1200
## scale(seasons)-central_stoneroller_minnow -0.1696 0.4167 -0.9898 -0.1777 0.6639 1.0011 1200
## scale(seasons)-common_shiner -0.4334 0.4935 -1.4196 -0.4258 0.5259 1.0062 1308
## scale(seasons)-creek_chub -1.0593 0.2066 -1.4779 -1.0607 -0.6626 1.0005 1200
## scale(seasons)-eastern_sand_darter -0.1979 0.5650 -1.3591 -0.1885 0.8976 1.0002 1093
## scale(seasons)-fantail_darter -0.2186 0.5767 -1.3935 -0.2003 0.8707 1.0105 1200
## scale(seasons)-fathead_minnow -0.1851 0.5624 -1.2654 -0.1845 0.9097 1.0166 731
## scale(seasons)-golden_shiner -0.1866 0.5523 -1.2735 -0.1642 0.8850 1.0016 1200
## scale(seasons)-goldfish -0.2090 0.5747 -1.3509 -0.1947 0.8478 1.0005 1200
## scale(seasons)-grass_pickerel -0.2250 0.5627 -1.3558 -0.2285 0.9772 1.0049 1456
## scale(seasons)-greenside_darter -0.1770 0.5720 -1.2687 -0.1864 0.9002 1.0036 1200
## scale(seasons)-green_sunfish -0.4650 0.4276 -1.3411 -0.4635 0.3901 1.0090 1200
## scale(seasons)-johnny_darter 0.2365 0.3971 -0.5194 0.2240 1.0614 1.0030 1200
## scale(seasons)-largemouth_bass -0.2092 0.5748 -1.3042 -0.2179 0.9684 1.0012 1200
## scale(seasons)-longear_sunfish -0.1910 0.5681 -1.3383 -0.1999 0.8986 1.0004 1200
## scale(seasons)-longnose_dace -0.2145 0.5552 -1.3541 -0.1995 0.8626 1.0143 1200
## scale(seasons)-mottled_sculpin -0.1825 0.5679 -1.3525 -0.1805 0.9658 1.0015 1200
## scale(seasons)-northern_hog_sucker -0.1750 0.5581 -1.2779 -0.1885 0.9522 1.0024 1200
## scale(seasons)-pumpkinseed_sunfish -0.2287 0.5496 -1.3599 -0.2219 0.8735 1.0009 1301
## scale(seasons)-rainbow_darter -0.4499 0.4061 -1.2638 -0.4501 0.2832 0.9999 1200
## scale(seasons)-rainbow_trout -0.2272 0.5411 -1.2770 -0.2079 0.7987 1.0051 1200
## scale(seasons)-redbelly_dace -0.8027 0.4468 -1.7670 -0.7867 0.0406 1.0040 1197
## scale(seasons)-redside_dace -0.5211 0.4865 -1.5157 -0.5039 0.3817 1.0036 1200
## scale(seasons)-river_chub -0.2090 0.5561 -1.3016 -0.1899 0.7884 1.0006 1409
## scale(seasons)-silverjaw_minnow -0.1980 0.5581 -1.2958 -0.2097 0.8794 1.0305 1200
## scale(seasons)-smallmouth_bass -0.2192 0.5509 -1.3127 -0.2253 0.8644 1.0054 1200
## scale(seasons)-spotfin_shiner -0.1884 0.5550 -1.2859 -0.2006 0.8651 1.0091 1200
## scale(seasons)-stonecat_madtom -0.1828 0.5719 -1.2739 -0.1694 0.9372 1.0010 1200
## scale(seasons)-striped_shiner -0.1888 0.5716 -1.3014 -0.1868 0.9123 1.0042 1200
## scale(seasons)-trout_perch -0.2159 0.5727 -1.3134 -0.2150 0.9090 1.0041 1200
## scale(seasons)-warmouth_sunfish -0.2058 0.5612 -1.2884 -0.2043 0.9066 1.0035 1200
## scale(seasons)-white_sucker -0.3334 0.4030 -1.1594 -0.3305 0.4325 1.0419 1232
## scale(seasons)-yellow_bullhead_catfish -0.3894 0.5209 -1.4421 -0.3914 0.6377 1.0091 1200
## scale(seasons)-sessile_animals -0.2203 0.4234 -1.0867 -0.2137 0.5666 1.0046 1105
## scale(seasons)-aquatic_worms -0.0254 0.1032 -0.2166 -0.0270 0.1857 1.0004 1416
## scale(seasons)-sow_bugs 0.4887 0.1714 0.1753 0.4857 0.8304 1.0028 1200
## scale(seasons)-scuds 0.4519 0.1545 0.1566 0.4450 0.7785 1.0039 1200
## scale(seasons)-water_mites 0.3590 0.1514 0.0572 0.3582 0.6615 1.0081 964
## scale(seasons)-damselfly_nymphs -0.0906 0.1143 -0.3207 -0.0884 0.1280 1.0099 1200
## scale(seasons)-alderfly_larvae -0.1277 0.1398 -0.3931 -0.1263 0.1430 1.0072 1049
## scale(seasons)-other_beetles -0.4198 0.1113 -0.6419 -0.4167 -0.1981 1.0013 1200
## scale(seasons)-crayfish -0.4262 0.1184 -0.6579 -0.4290 -0.1926 1.0001 1200
## scale(seasons)-dragonfly_nymphs -0.1582 0.1028 -0.3585 -0.1558 0.0423 1.0044 1200
## scale(seasons)-riffle_beetles 0.0243 0.1128 -0.1960 0.0240 0.2419 1.0093 1200
## scale(seasons)-other_flies -0.1836 0.1355 -0.4516 -0.1817 0.0841 1.0125 822
## scale(seasons)-midges 0.3712 0.1343 0.1085 0.3654 0.6370 1.0015 974
## scale(seasons)-snails -0.1997 0.1134 -0.4207 -0.1976 0.0139 1.0044 1200
## scale(seasons)-clams -0.4151 0.1720 -0.7761 -0.4059 -0.1098 1.0050 1200
## scale(seasons)-fishfly_larvae -0.2194 0.1389 -0.4991 -0.2174 0.0586 1.0014 1100
## scale(seasons)-water_penny_beetles -0.0482 0.1617 -0.3495 -0.0532 0.2781 1.0032 1324
## scale(seasons)-cranefly_larvae 0.1343 0.1149 -0.1000 0.1345 0.3486 1.0045 1320
## scale(seasons)-ameletidae -1.8690 0.2363 -2.3641 -1.8555 -1.4522 1.0030 1056
## scale(seasons)-arthropleidae -0.1782 0.5551 -1.3165 -0.1598 0.8262 1.0004 1200
## scale(seasons)-baetidae 1.1663 0.1350 0.9063 1.1641 1.4353 1.0131 1200
## scale(seasons)-baetiscidae -0.2328 0.5699 -1.4133 -0.2439 0.9152 1.0008 1336
## scale(seasons)-caenidae 0.0762 0.2888 -0.5013 0.0732 0.6389 0.9998 1200
## scale(seasons)-ephemerellidae 0.8794 0.4324 0.0970 0.8606 1.7359 1.0327 1050
## scale(seasons)-ephemeridae 0.1353 0.4207 -0.6535 0.1192 1.0088 1.0082 1373
## scale(seasons)-heptageniidae 0.1134 0.1534 -0.1791 0.1145 0.4177 0.9998 1200
## scale(seasons)-isonychiidae -0.1834 0.5670 -1.2607 -0.1838 0.9895 1.0113 1200
## scale(seasons)-leptohyphidae -0.9456 0.3377 -1.7001 -0.9255 -0.3290 1.0037 1085
## scale(seasons)-leptophlebiidae -0.0300 0.1476 -0.3310 -0.0280 0.2508 1.0007 1253
## scale(seasons)-polymitarcyidae -0.1959 0.5548 -1.2278 -0.2084 0.9247 1.0168 1099
## scale(seasons)-potamanthidae -0.2074 0.5825 -1.3477 -0.2154 0.9372 1.0039 1200
## scale(seasons)-pseudironidae -0.2015 0.5770 -1.3225 -0.2226 0.9623 1.0122 1200
## scale(seasons)-siphlonuridae -0.2133 0.5811 -1.3364 -0.2185 1.0155 1.0030 1332
## scale(seasons)-capniidae -0.2050 0.5560 -1.3063 -0.2032 0.8588 1.0004 1051
## scale(seasons)-chloroperlidae -0.1170 0.1953 -0.4931 -0.1094 0.2842 1.0221 1037
## scale(seasons)-leuctridae 0.5099 0.1318 0.2532 0.5073 0.7619 1.0041 1200
## scale(seasons)-nemouridae -0.6125 0.1573 -0.9186 -0.6154 -0.3045 1.0109 1200
## scale(seasons)-peltoperlidae -0.2228 0.5684 -1.3217 -0.2198 0.8630 1.0165 1200
## scale(seasons)-perlidae -0.0860 0.1506 -0.3978 -0.0857 0.1949 1.0010 1200
## scale(seasons)-perlodidae -0.5449 0.2083 -0.9497 -0.5424 -0.1323 1.0080 1200
## scale(seasons)-pteronarcyidae -0.2161 0.5761 -1.3631 -0.2047 0.9229 1.0060 1200
## scale(seasons)-taeniopterygidae -0.1942 0.5933 -1.3449 -0.2018 0.9510 1.0031 1200
## scale(seasons)-brachycentridae -0.1882 0.5515 -1.3284 -0.1765 0.8874 1.0018 1200
## scale(seasons)-dipseuodopsidae -0.1888 0.5887 -1.3937 -0.1781 0.9565 1.0045 1200
## scale(seasons)-glossosomatidae 0.1690 0.4462 -0.6814 0.1673 1.0902 1.0041 1310
## scale(seasons)-goeridae -0.2325 0.5725 -1.3575 -0.2254 0.8548 1.0000 1362
## scale(seasons)-helicopsychidae -0.2187 0.5690 -1.3375 -0.1956 0.9149 1.0017 1200
## scale(seasons)-hydropsychidae 0.0524 0.1162 -0.1737 0.0535 0.2873 1.0009 1067
## scale(seasons)-hydroptilidae -0.1493 0.2418 -0.6221 -0.1514 0.3310 0.9992 979
## scale(seasons)-lepidostomatidae 0.0523 0.2054 -0.3378 0.0536 0.4569 1.0091 1325
## scale(seasons)-leptoceridae -0.1974 0.5887 -1.4024 -0.1935 0.9145 1.0016 1200
## scale(seasons)-limnephilidae -0.3237 0.1705 -0.6769 -0.3228 -0.0108 1.0012 1200
## scale(seasons)-molannidae 0.2643 0.4383 -0.5753 0.2704 1.1115 0.9993 1451
## scale(seasons)-odontoceridae -0.7630 0.4385 -1.6716 -0.7293 0.0072 1.0088 1200
## scale(seasons)-philopotamidae 0.2481 0.1293 -0.0111 0.2475 0.5075 1.0047 1348
## scale(seasons)-phryganeidae -0.6789 0.3720 -1.4360 -0.6616 -0.0108 1.0140 1086
## scale(seasons)-polycentropodidae 0.0126 0.1296 -0.2437 0.0132 0.2587 1.0084 1200
## scale(seasons)-psychomiidae -0.2188 0.5593 -1.3195 -0.2163 0.8131 1.0022 1391
## scale(seasons)-rhyacophilidae -0.3146 0.2048 -0.7099 -0.3173 0.1086 1.0037 1200
## scale(seasons)-uenoidae -0.7840 0.1723 -1.1208 -0.7851 -0.4561 1.0004 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_mtdusky -0.0321 0.2753 -0.5932 -0.0344 0.5000 1.0100 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_nodusky 0.0499 0.1602 -0.2626 0.0501 0.3702 1.0185 1042
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_twolined -0.1209 0.1386 -0.4038 -0.1210 0.1425 1.0070 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_longtail 0.1009 0.3712 -0.6348 0.0923 0.8278 1.0284 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_red -0.1272 0.2860 -0.6782 -0.1388 0.4478 0.9998 1384
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_mole 0.2099 0.4104 -0.6160 0.2130 1.0149 1.0094 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_fourtoed 0.0368 0.4507 -0.8928 0.0507 0.8822 1.0178 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_redback -0.0457 0.1276 -0.3051 -0.0465 0.2087 1.0036 1200
## scale(dayyear)-streambiotic_suff_slimy 0.7116 0.3430 0.0443 0.6925 1.4079 1.0024 1317
## scale(dayyear)-blacknose_dace 0.3673 0.2199 -0.0420 0.3643 0.8257 1.0147 1200
## scale(dayyear)-bluegill_sunfish -0.0125 0.4275 -0.8448 -0.0161 0.8175 1.0062 1200
## scale(dayyear)-bluntnose_minnow 0.0283 0.4585 -0.8361 0.0063 0.9576 1.0090 1200
## scale(dayyear)-brindled_madtom 0.0423 0.4414 -0.8365 0.0436 0.9358 1.0006 1200
## scale(dayyear)-brook_stickleback 0.0318 0.4475 -0.8470 0.0454 0.8753 1.0009 1344
## scale(dayyear)-brook_trout 0.0360 0.4451 -0.8447 0.0489 0.9078 0.9998 1200
## scale(dayyear)-central_mudminnow 0.0365 0.4321 -0.7992 0.0354 0.8907 1.0021 1200
## scale(dayyear)-central_stoneroller_minnow 0.3969 0.3139 -0.2193 0.4097 1.0365 0.9999 1200
## scale(dayyear)-common_shiner 0.0498 0.4022 -0.7111 0.0492 0.8339 1.0193 1200
## scale(dayyear)-creek_chub 0.3004 0.1766 -0.0263 0.2985 0.6645 1.0042 1200
## scale(dayyear)-eastern_sand_darter 0.0379 0.4428 -0.7841 0.0407 0.8883 1.0086 1352
## scale(dayyear)-fantail_darter 0.0441 0.4423 -0.8516 0.0500 0.9089 1.0039 1200
## scale(dayyear)-fathead_minnow 0.0458 0.4378 -0.8104 0.0662 0.9132 1.0035 1200
## scale(dayyear)-golden_shiner 0.0180 0.4378 -0.8596 0.0323 0.8989 1.0076 1200
## scale(dayyear)-goldfish 0.0278 0.4706 -0.8897 0.0287 0.9545 1.0070 1746
## scale(dayyear)-grass_pickerel 0.0446 0.4384 -0.8284 0.0453 0.8766 1.0073 1200
## scale(dayyear)-greenside_darter 0.0318 0.4379 -0.8098 0.0274 0.9043 1.0006 1365
## scale(dayyear)-green_sunfish 0.2658 0.3415 -0.4095 0.2690 0.9266 1.0173 1200
## scale(dayyear)-johnny_darter 0.5204 0.3403 -0.1183 0.5207 1.2014 0.9993 1123
## scale(dayyear)-largemouth_bass 0.0390 0.4504 -0.8575 0.0287 0.9314 1.0087 1200
## scale(dayyear)-longear_sunfish 0.0534 0.4282 -0.7677 0.0562 0.9121 1.0136 1200
## scale(dayyear)-longnose_dace 0.0401 0.4472 -0.8599 0.0243 0.9490 1.0161 1200
## scale(dayyear)-mottled_sculpin 0.0417 0.4381 -0.8350 0.0508 0.8701 1.0207 971
## scale(dayyear)-northern_hog_sucker 0.0297 0.4399 -0.8340 0.0236 0.8832 1.0006 1649
## scale(dayyear)-pumpkinseed_sunfish 0.0476 0.4354 -0.8374 0.0644 0.8511 1.0094 1200
## scale(dayyear)-rainbow_darter 0.0305 0.3735 -0.7582 0.0367 0.7180 1.0017 1200
## scale(dayyear)-rainbow_trout 0.0323 0.4279 -0.8064 0.0477 0.8870 1.0119 1200
## scale(dayyear)-redbelly_dace -0.1027 0.3875 -0.8651 -0.0969 0.7023 1.0051 1080
## scale(dayyear)-redside_dace 0.1096 0.4208 -0.6831 0.0921 0.9359 1.0107 1200
## scale(dayyear)-river_chub 0.0218 0.4279 -0.7867 0.0152 0.8805 1.0090 1200
## scale(dayyear)-silverjaw_minnow 0.0223 0.4480 -0.8527 0.0272 0.9186 1.0033 1200
## scale(dayyear)-smallmouth_bass 0.0725 0.4519 -0.8383 0.0758 0.9588 1.0014 1423
## scale(dayyear)-spotfin_shiner 0.0373 0.4566 -0.8989 0.0339 0.9087 1.0000 1200
## scale(dayyear)-stonecat_madtom 0.0437 0.4501 -0.8791 0.0456 0.9565 1.0223 1200
## scale(dayyear)-striped_shiner 0.0499 0.4411 -0.7971 0.0529 0.9139 1.0102 1211
## scale(dayyear)-trout_perch 0.0454 0.4335 -0.7786 0.0321 0.9228 1.0142 1200
## scale(dayyear)-warmouth_sunfish 0.0535 0.4341 -0.7892 0.0514 0.9213 1.0002 1200
## scale(dayyear)-white_sucker 0.2139 0.3605 -0.4607 0.2222 0.8887 1.0089 1200
## scale(dayyear)-yellow_bullhead_catfish 0.1972 0.4140 -0.6301 0.1911 0.9962 1.0022 1200
## scale(dayyear)-sessile_animals 0.4860 0.3716 -0.2202 0.4578 1.2716 1.0008 1200
## scale(dayyear)-aquatic_worms -0.1231 0.1024 -0.3165 -0.1299 0.0822 1.0004 1326
## scale(dayyear)-sow_bugs 0.1291 0.1679 -0.2126 0.1288 0.4521 1.0012 1009
## scale(dayyear)-scuds -0.0252 0.1510 -0.3190 -0.0184 0.2799 1.0078 1200
## scale(dayyear)-water_mites 0.0071 0.1444 -0.2845 0.0052 0.2999 1.0121 1200
## scale(dayyear)-damselfly_nymphs 0.1964 0.1140 -0.0175 0.1961 0.4195 1.0024 1200
## scale(dayyear)-alderfly_larvae 0.6684 0.1569 0.3802 0.6661 0.9709 1.0002 1200
## scale(dayyear)-other_beetles -0.0802 0.1063 -0.3009 -0.0781 0.1320 1.0009 1313
## scale(dayyear)-crayfish -0.0759 0.1169 -0.3018 -0.0755 0.1596 1.0037 1307
## scale(dayyear)-dragonfly_nymphs 0.0938 0.1085 -0.1119 0.0941 0.3064 1.0069 1200
## scale(dayyear)-riffle_beetles 0.1416 0.1251 -0.0959 0.1398 0.3945 1.0088 1200
## scale(dayyear)-other_flies -0.1825 0.1317 -0.4343 -0.1805 0.0770 0.9993 1200
## scale(dayyear)-midges -0.3404 0.1219 -0.5748 -0.3381 -0.1112 1.0011 1200
## scale(dayyear)-snails 0.1449 0.1088 -0.0625 0.1468 0.3529 1.0096 1200
## scale(dayyear)-clams 0.0302 0.1484 -0.2587 0.0395 0.3065 1.0017 1200
## scale(dayyear)-fishfly_larvae 0.4734 0.1533 0.1884 0.4689 0.7879 1.0075 1200
## scale(dayyear)-water_penny_beetles 0.8444 0.1955 0.4670 0.8439 1.2312 1.0024 1200
## scale(dayyear)-cranefly_larvae 0.4796 0.1270 0.2272 0.4777 0.7300 1.0013 1200
## scale(dayyear)-ameletidae -0.2326 0.1439 -0.5303 -0.2296 0.0423 1.0330 1200
## scale(dayyear)-arthropleidae 0.0460 0.4582 -0.9065 0.0437 0.9271 1.0185 1330
## scale(dayyear)-baetidae 0.0852 0.1294 -0.1592 0.0799 0.3447 1.0060 1200
## scale(dayyear)-baetiscidae 0.0434 0.4293 -0.8084 0.0446 0.8505 1.0001 1200
## scale(dayyear)-caenidae 0.0681 0.2899 -0.4970 0.0670 0.6226 1.0082 1200
## scale(dayyear)-ephemerellidae -0.5367 0.3675 -1.2828 -0.5315 0.1724 1.0045 1535
## scale(dayyear)-ephemeridae 0.1991 0.3584 -0.4911 0.1913 0.9245 1.0002 1200
## scale(dayyear)-heptageniidae -0.2386 0.1735 -0.5819 -0.2396 0.0986 1.0020 1200
## scale(dayyear)-isonychiidae 0.0383 0.4143 -0.7572 0.0357 0.8419 0.9996 1067
## scale(dayyear)-leptohyphidae 0.0671 0.2422 -0.4209 0.0655 0.5178 1.0006 1200
## scale(dayyear)-leptophlebiidae -0.4363 0.1666 -0.7666 -0.4321 -0.1046 1.0118 1200
## scale(dayyear)-polymitarcyidae 0.0530 0.4488 -0.8100 0.0466 0.9563 1.0035 1200
## scale(dayyear)-potamanthidae 0.0422 0.4532 -0.8594 0.0431 0.9825 1.0067 1200
## scale(dayyear)-pseudironidae 0.0367 0.4435 -0.8053 0.0282 0.9233 1.0045 1200
## scale(dayyear)-siphlonuridae 0.0341 0.4387 -0.8119 0.0203 0.9213 1.0020 1294
## scale(dayyear)-capniidae 0.0440 0.4413 -0.8476 0.0490 0.9335 1.0022 1200
## scale(dayyear)-chloroperlidae -0.3078 0.2210 -0.7341 -0.3149 0.1131 1.0011 1200
## scale(dayyear)-leuctridae -0.2411 0.1513 -0.5370 -0.2423 0.0524 1.0048 1012
## scale(dayyear)-nemouridae -0.8215 0.1863 -1.2043 -0.8107 -0.4872 0.9991 1200
## scale(dayyear)-peltoperlidae 0.0146 0.4226 -0.8292 0.0143 0.8263 1.0044 1200
## scale(dayyear)-perlidae -0.1291 0.1727 -0.4789 -0.1341 0.1915 1.0069 1200
## scale(dayyear)-perlodidae -1.1846 0.2726 -1.7471 -1.1712 -0.6809 1.0019 1200
## scale(dayyear)-pteronarcyidae 0.0501 0.4527 -0.8144 0.0373 0.9270 1.0048 1200
## scale(dayyear)-taeniopterygidae 0.0445 0.4493 -0.8697 0.0435 0.9719 1.0057 1200
## scale(dayyear)-brachycentridae 0.0303 0.4342 -0.8231 0.0377 0.8682 1.0088 1306
## scale(dayyear)-dipseuodopsidae 0.0372 0.4263 -0.8309 0.0280 0.8639 1.0052 1200
## scale(dayyear)-glossosomatidae -0.1751 0.4264 -1.0007 -0.1629 0.6160 1.0102 1183
## scale(dayyear)-goeridae 0.0395 0.4544 -0.8619 0.0224 0.9212 1.0086 1292
## scale(dayyear)-helicopsychidae 0.0421 0.4338 -0.8402 0.0453 0.8570 1.0004 1319
## scale(dayyear)-hydropsychidae 0.4611 0.1380 0.2039 0.4600 0.7477 1.0085 1560
## scale(dayyear)-hydroptilidae 0.1053 0.2141 -0.3163 0.0981 0.5156 1.0009 1200
## scale(dayyear)-lepidostomatidae -0.3813 0.2222 -0.8409 -0.3724 0.0459 1.0134 1071
## scale(dayyear)-leptoceridae 0.0282 0.4362 -0.8375 0.0301 0.8929 1.0047 1399
## scale(dayyear)-limnephilidae 0.1171 0.1642 -0.1886 0.1156 0.4375 1.0226 1350
## scale(dayyear)-molannidae 0.0216 0.3916 -0.7077 0.0236 0.7653 1.0017 1200
## scale(dayyear)-odontoceridae 0.1587 0.3948 -0.5830 0.1429 0.9929 1.0018 1093
## scale(dayyear)-philopotamidae 0.2924 0.1414 0.0039 0.2941 0.5570 1.0230 1062
## scale(dayyear)-phryganeidae 0.5464 0.3163 -0.0064 0.5315 1.1936 1.0041 1200
## scale(dayyear)-polycentropodidae 0.2357 0.1426 -0.0469 0.2387 0.5121 0.9989 1200
## scale(dayyear)-psychomiidae 0.0496 0.4368 -0.8491 0.0498 0.8901 0.9999 892
## scale(dayyear)-rhyacophilidae -0.4950 0.2213 -0.9482 -0.4893 -0.0839 1.0030 1200
## scale(dayyear)-uenoidae -0.3711 0.1622 -0.6941 -0.3665 -0.0588 1.0054 1200